Assembly of the springtail transcri

Assembly of the springtail transcriptomes resulted in 37,730 transcripts with predicted open reading frames for F. candida and 32,154 for O. cincta, of which 34.2% were functionally annotated for F. candida and 38.4% for O. cincta. Subsequently, we predicted orthologous clusters among eight species and applied the branch-site test to detect episodic positive selection in the Hexapoda and Collembola lineages. A subset of 250 genes showed significant positive selection along the Hexapoda branch and 57 in the Collembola lineage. Gene Ontology categories enriched in these genes include metabolism, stress response (i.e. DNA repair, immune response), ion transport, ATP metabolism, regulation and development-related processes (i.e. eye development, neurological development).

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ของ transcriptomes เร็นผลในใบ 37,730 เฟรมเปิดอ่านทำนายสำหรับแคน F. และ 32,154 สำหรับโอ cincta ที่ 34.2% มีหน้าที่คำอธิบายประกอบสำหรับแคน F. และ 38.4% สำหรับโอ cincta ต่อมา เรา orthologous คลัสเตอร์ระหว่างแปดชนิดการคาดการณ์ และใช้การทดสอบไซต์สาขาการตรวจสอบเลือกบวกฟเกมในชาติ Hexapoda และ Collembola ชุดย่อยของยีน 250 แสดงนัยสำคัญบวกเลือกสาขา Hexapoda และ 57 ใน Collembola ประเภทภววิทยา Gene อุดมในยีนเหล่านี้ได้แก่เผาผลาญ ตอบสนองความเครียด (เช่นดีเอ็นเอ การตอบสนองภูมิคุ้มกัน), การขนส่งไอออน เผาผลาญ ATP ระเบียบ และกระบวนการที่เกี่ยวข้องกับการพัฒนา (เช่นตาพัฒนา พัฒนาระบบประสาท)

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

สภาทราน springtail ผลใน 37,730 ยีนที่มีการคาดการณ์กรอบการแสดงกำลังเปิดให้บริการสำหรับเอฟ Candida และ 32,154 สำหรับทุม cincta ซึ่ง 34.2% มีข้อเขียนหน้าที่สำหรับเอฟ Candida และ 38.4% สำหรับทุม cincta ต่อจากนั้นเราคาดการณ์กลุ่ม orthologous หมู่แปดสายพันธุ์และนำไปใช้ทดสอบสาขาสถานที่ในการตรวจสอบการเลือกบวกหลักการใน Hexapoda และ Collembola lineages เป็นส่วนหนึ่งของ 250 แสดงให้เห็นว่ายีนตัวเลือกในเชิงบวกอย่างมีนัยสำคัญตามสาขา Hexapoda และ 57 ในสายเลือด Collembola ประเภทยีนอภิปรัชญาอุดมในยีนเหล่านี้รวมถึงการเผาผลาญตอบสนองต่อความเครียด (เช่นซ่อมแซมดีเอ็นเอการตอบสนองของระบบภูมิคุ้มกัน), การขนส่งไอออนการเผาผลาญของเอทีพีควบคุมและการพัฒนากระบวนการที่เกี่ยวข้อง (เช่นการพัฒนาตาพัฒนาระบบประสาท)

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

แอสเซมบลีของแมลงหางดีด transcriptomes ส่งผลให้เกิด 37730 transcripts ด้วยคาดการณ์เปิดอ่านเฟรม F สำหรับ Candida และ 32154 . bauensis ซึ่งร้อยละ 34.2 ติดบันทึกย่อสำหรับ Candida และ 38.4 % F . o . bauensis . ต่อมา เราคาดการณ์กลุ่ม orthologous ในหมู่แปดชนิดและสาขาเว็บไซต์ทดสอบเพื่อตรวจหาตอนบวกเลือกใน hexapoda คอลเลมโบลา และเมื่อใช้ เป็นเซตย่อยของ 250 ยีนอย่างมีนัยสำคัญบวกเลือกตาม hexapoda สาขาและ 57 ในคอลเลมโบลาเชื้อสาย ประเภทอภิปรัชญาจีนอุดมในยีนเหล่านี้รวมถึงการเผาผลาญอาหาร , การตอบสนองต่อความเครียด ( ภูมิคุ้มกัน เช่น การซ่อมแซมดีเอ็นเอ ) ไอออนขนส่ง เมแทบอลิซึม เอทีพี การควบคุมและพัฒนากระบวนการที่เกี่ยวข้อง ( เช่นตาพัฒนาระบบประสาทพัฒนา )