as previously described
(Theel et al., 2012). Library version 4110 was used from April 2012 to
September 2012, and library version 4613 was used for the remainder
of the study period. The manufacturer's recommended cutoffs were
used to determine genus and species levels of identification, with the
exception of Corynebacterium species and viridans group streptococci,
where a lowered species-level cutoff of ≥1.700 was applied (Alatoom
et al., 2012). The species with the highest score was considered the species
of record with a minimum difference of 10% between the top score
and next closest species' or genera's score required (Saffert et al., 2011).
In addition to MALDI-TOF MS, other rapid biochemical tests performed
included rapid coagulase testing to identify Staphylococcus aureus; rapid
oxidase testing to identify Pseudomonas aeruginosa; rapid indole, rapid
PYR, rapid oxidase, motility, and lysine testing to identify Escherichia
coli and differentiate it from Shigella species; rapid catalase and rapid
indole testing to identify most Propionibacterium acnes; rapid
desoxycholate or optochin testing to differentiate Streptococcus
pneumoniae from Streptococcus mitis species group; and Lancefield typing
to identify β-hemolytic Streptococcus species. 16S rRNA gene PCR/
sequencing was performed if MALDI-TOF MS and/or biochemical testing
ตามที่อธิบายไว้ก่อนหน้านี้
(Theel et al., 2012) รุ่นห้องสมุด 4110 ถูกนำมาใช้ตั้งแต่เดือนเมษายน 2012 ถึง
เดือนกันยายน 2012, และรุ่น 4613 ห้องสมุดที่ใช้สำหรับส่วนที่เหลือ
ของระยะเวลาการศึกษา ผู้ผลิตแต่งตัวแนะนำที่ถูก
ใช้ในการกำหนดประเภทและระดับสปีชีส์ของประชาชนที่มี
ข้อยกเว้นของสายพันธุ์และ Corynebacterium streptococci กลุ่ม viridans,
ที่ลดลงตัดสายพันธุ์ระดับ≥1.700ถูกนำมาใช้ (Alatoom
et al., 2012) สายพันธุ์ที่มีคะแนนสูงสุดได้รับการพิจารณาชนิด
ของการบันทึกมีความแตกต่างอย่างน้อย 10% ระหว่างคะแนนสูงสุด
และสายพันธุ์ที่ใกล้เคียงที่สุดต่อไปหรือคะแนนจำพวกของที่ต้องการ (Saffert et al., 2011).
นอกจาก MALDI-TOF MS, อื่น ๆ การทดสอบทางชีวเคมีอย่างรวดเร็วดำเนินการ
รวมถึงการทดสอบ coagulase อย่างรวดเร็วในการระบุเชื้อ Staphylococcus aureus; อย่างรวดเร็ว
การทดสอบ oxidase เพื่อระบุ aeruginosa พ; อินโดอย่างรวดเร็วอย่างรวดเร็ว
PYR, oxidase อย่างรวดเร็ว, การเคลื่อนที่, และการทดสอบไลซีนเพื่อระบุ Escherichia
coli และแตกต่างจากสายพันธุ์ Shigella; catalase อย่างรวดเร็วและรวดเร็ว
การทดสอบเพื่อระบุอินโดมากที่สุดสิว Propionibacterium; อย่างรวดเร็ว
desoxycholate หรือการทดสอบความแตกต่าง optochin Streptococcus
pneumoniae จาก Streptococcus mitis กลุ่มสปีชีส์; และ Lancefield พิมพ์
เพื่อระบุชนิด Streptococcus β-hemolytic 16S rRNA ยีน PCR /
ลำดับที่ได้ดำเนินการถ้า MALDI-TOF MS และ / หรือการทดสอบทางชีวเคมี
การแปล กรุณารอสักครู่..
ตามที่อธิบายไว้ก่อนหน้านี้
( theel et al . , 2012 ) ห้องสมุดรุ่น 4110 ถูกใช้ตั้งแต่เดือนเมษายน 2012
กันยายน 2555 และห้องสมุดรุ่น 4613 ใช้ส่วนที่เหลือ
ของระยะเวลาการศึกษา ของผู้ผลิตแนะนำ cutoffs ถูก
ใช้เพื่อตรวจสอบระดับของการจำแนกสกุลและสปีชีส์ ด้วยข้อยกเว้นของแผนจูงใจให้ลาออก และ viridans
กลุ่มเชื้อชนิด ,ที่ระดับลดลงชนิดนี้≥ 1.700 ประยุกต์ ( alatoom
et al . , 2012 ) ชนิดที่มีคะแนนสูงสุดได้รับการพิจารณาชนิดของระเบียนที่มีความแตกต่าง
อย่างน้อย 10% ระหว่างคะแนนสูงสุดต่อไปใกล้ชนิดหรือสกุลของคะแนนที่จำเป็น ( saffert et al . , 2011 ) .
นอกจาก maldi-tof MS อื่น ๆการทดสอบการปฏิบัติ
อย่างรวดเร็วชีวเคมีรวมอย่างรวดเร็วโคกูเลสการทดสอบเพื่อระบุเชื้อ Staphylococcus aureus อย่างรวดเร็วโดยการระบุ ;
การทดสอบ Pseudomonas aeruginosa ; อย่างรวดเร็วอินโดลอย่างรวดเร็ว
pyr อย่างรวดเร็ว , การเคลื่อนที่ , และเอนไซม์ไลซีนการทดสอบเพื่อระบุและ Escherichia coli
ความแตกต่างจากชิเกลลาชนิดสามารถอย่างรวดเร็ว และอย่างรวดเร็ว
อินโดลการทดสอบเพื่อระบุ Propionibacterium acnes
อย่างรวดเร็วที่สุดdesoxycholate หรือ optochin การทดสอบแยก Streptococcus pneumoniae
จากกลุ่ม Streptococcus ทิสสายพันธุ์ และแลนส์ฟิลด์ พิมพ์บีตา - hemolytic Streptococcus
เพื่อระบุชนิด ลำดับเบส 16S rRNA ยีน PCR /
ได้ถ้า maldi-tof MS และ / หรือทดสอบทางชีวเคมี
การแปล กรุณารอสักครู่..