a b s t r a c t Carnitine palmitoyl

a b s t r a c t Carnitine palmitoyl transferase 2 (CPT-2) is a key enzyme in the mitochondrial fatty acid metabolism. The active site is comprised of a Y-shaped tunnel with distinct binding sites for the substrate acylcarnitine and the cofactor CoA. We investigated the thermodynamics of binding of four inhibitors directed against either the CoA or the acylcarnitine binding sites using isothermal titration calorimetry (ITC). CPT-2 is a monotopic membrane protein and was solubilized by β-octylglucoside ( β-OG) above its critical micellar concentration (CMC) to perform inhibitor titrations in solutions containing detergent micelles. The CMC of β-OG in the presence of inhibitors was measured with ITC and small variations were observed. The inhibitors bound to rat CPT-2 (rCPT-2) with 1:1 stoichiometry and the dissociation constants were in the range of K D = 2–20 μM. New X-ray structures and docking models of rCPT-2 in complex with inhibitors enable an analysis of the thermodynamic data in the context of the interaction observed for the individual binding sites of the ligands. For all ligands the binding enthalpy was exothermic, and enthalpy as well as entropy contributed to the binding reaction, with the exception of ST1326 for which binding was solely enthalpy-driven. The substrate analog ST1326 binds to the acylcarnitine binding site and a heat capacity change close to zero suggests a balance of electrostatic and hydrophobic interactions. An excellent correlation of the thermodynamic (ITC) and structural (X-ray crystallography, models) data was observed suggesting that ITC measurements provide valuable information for optimizing inhibitor binding in drug discovery. C 2013 The Authors. Published by Elsevier B.V. on behalf of Federation of European Biochemical

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

แบบ b s t r c t คาร์นิที palmitoyl transferase 2 (CPT-2) เป็นเอนไซม์ที่สำคัญในการเผาผลาญกรดไขมัน mitochondrial ใช้ประกอบด้วยอุโมงค์รูปตัว Y กับไซต์ทั้งหมดรวม acylcarnitine พื้นผิวและ cofactor CoA เราตรวจสอบอุณหพลศาสตร์ของผูก inhibitors สี่ตรงกับ CoA หรือไซต์ผูก acylcarnitine ใช้การไทเทรต isothermal calorimetry (ซี) CPT-2 เป็นการ monotopic เมมเบรนโปรตีน และ solubilized โดยβ-octylglucoside (β-ออก) ด้านบนของสมาธิ micellar สำคัญ (CMC) การผล titrations ในโซลูชั่นที่ประกอบด้วยผงซักฟอก micelles CMC ของβ-ออกในต่อหน้าของ inhibitors ถูกวัด ด้วยซี และรูปแบบขนาดเล็กสุภัค Inhibitors ที่ผูกไว้กับหนู CPT-2 (แบบ 2) กับ 1:1 stoichiometry และคง dissociation ถูกในช่วง K D = μM 2-20 โครงสร้างเอ็กซ์เรย์ใหม่และแบบที่ 2 ในคอมเพล็กซ์กับ inhibitors ให้สังเกตการวิเคราะห์ข้อมูลทางอุณหพลศาสตร์ในบริบทของการโต้ตอบสำหรับเว็บไซต์แต่ละผูกของ ligands เทียบรุ่น สำหรับทั้งหมด ligands ความร้อนแฝงผูกถูก exothermic และความร้อนแฝงเป็น entropy ส่วนปฏิกิริยารวม ยกเว้น ST1326 ซึ่งผูกมีเพียงความร้อนแฝงขับ กับพื้นผิวแบบแอนะล็อก ST1326 binds ไปผูก acylcarnitine และความจุความร้อนเปลี่ยนแปลงใกล้ศูนย์แนะนำของสถิต และ hydrophobic โต้ตอบ ความสัมพันธ์ที่ดีของทางอุณหพลศาสตร์ (ซี) และโครงสร้าง (เอกซเรย์ผลิกศาสตร์ ข้อมูลแบบจำลอง) ถูกสังเกตแนะนำให้ วัดซีให้ข้อมูลให้เหมาะสมรวมผลในการค้นพบยาเสพติด C 2013 ผู้เขียน ประกาศในนามของสหพันธ์ของยุโรปชีวเคมี โดย Elsevier b.v

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

นามธรรม transferase Carnitine Palmitoyl 2 (CPT-2) ซึ่งเป็นเอนไซม์สำคัญในการเผาผลาญกรดไขมันยล เว็บไซต์ที่ใช้งานจะประกอบด้วยอุโมงค์ Y รูปกับเว็บไซต์ที่มีผลผูกพันแตกต่างกันสำหรับ acylcarnitine สารตั้งต้นและปัจจัย CoA เราตรวจสอบอุณหพลศาสตร์ของผูกพันของสี่ยับยั้งพุ่งทั้ง CoA หรือ acylcarnitine ผูกพันเว็บไซต์โดยใช้ไตเตรท isothermal calorimetry (ITC) CPT-2 เป็นโปรตีนเมมเบรน monotopic และถูกละลายโดยβ-octylglucoside (β-OG) เหนือความเข้มข้นไมเซลล์ที่สำคัญ (CMC) ในการดำเนินการไตเตรทยับยั้งในการแก้ปัญหาที่มี micelles ผงซักฟอก CMC ของβ-OG ในการปรากฏตัวของโปรตีนเป็นวัดที่มี ITC และรูปแบบขนาดเล็กถูกตั้งข้อสังเกต สารยับยั้งผูกพันกับหนู CPT-2 (RCPT-2) 1: 1 ปริมาณสัมพันธ์และค่าคงที่แยกออกจากกันอยู่ในช่วงของ KD = 2-20 ไมโครโมลาร์ โครงสร้างใหม่ X-ray และรูปแบบการเชื่อมต่อของ RCPT-2 ในที่ซับซ้อนที่มีโปรตีนช่วยให้การวิเคราะห์ข้อมูลทางอุณหพลศาสตร์ในบริบทของการทำงานร่วมกันตั้งข้อสังเกตสำหรับแต่ละเว็บไซต์ที่มีผลผูกพันของลิแกนด์ สำหรับทุกเอนทัลลิแกนด์ผูกพันคายความร้อนและเอนทัลเช่นเดียวกับเอนโทรปีมีส่วนทำให้เกิดปฏิกิริยาที่มีผลผูกพันยกเว้น ST1326 ที่ผูกพันเป็น แต่เพียงผู้เดียวเอนทัลที่ขับเคลื่อนด้วย ST1326 ตั้งต้นอนาล็อกผูกกับ acylcarnitine เว็บไซต์มีผลผูกพันและการเปลี่ยนแปลงความจุความร้อนใกล้กับศูนย์แสดงให้เห็นความสมดุลของการปฏิสัมพันธ์ไฟฟ้าสถิตและไม่ชอบน้ำ ความสัมพันธ์ที่ดีของความร้อน (ITC) และสิ่งก่อสร้าง (X-ray ผลึกรุ่น) ข้อมูลที่พบแสดงให้เห็นว่าการวัด ITC ให้ข้อมูลที่มีค่าเพื่อเพิ่มประสิทธิภาพการยับยั้งที่มีผลผูกพันในการค้นพบยาเสพติด C? 2013 ผู้เขียน จัดทำโดย Elsevier BV ในนามของสภายุโรปทางชีวเคมี

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

B S T R A C T คาร์นิทีน palmitoyl ทรานเฟอเรส 2 ( cpt-2 ) เป็นเอนไซม์ที่สำคัญในอุตสาหกรรมกรดไขมัน . เว็บไซต์ที่ใช้งานประกอบด้วย y-shaped อุโมงค์กับเว็บไซต์รวมที่แตกต่างกันสำหรับพื้นผิว acylcarnitine และโคแฟกเตอร์ COA .เราศึกษาพลศาสตร์ของผูกสี่การกำกับกับ COA หรือ acylcarnitine ผูกพันการใช้เว็บไซต์ที่มีความร้อนคงที่ ( ITC ) cpt-2 คือโปรตีนเมมเบรน monotopic และถูกสร้างโดยบีตา - octylglucoside ( บีตา - โอก ) ข้างต้นมีความเข้มข้นของไมเซล ( CMC ) แสดงโดย titrations ในสารละลายผงซักฟอกมั .บริษัทของบีตา - และในการแสดงตนของการวัดด้วย ICT และการเปลี่ยนแปลงขนาดเล็กพบว่า โปรตีนผูกพันกับหนู cpt-2 ( rcpt-2 ) กับ 1 : 1 ปริมาณสารสัมพันธ์และค่าคงที่การแตกตัวในช่วง K D = 2 – 20 μม.โครงสร้างและรูปแบบของ rcpt-2 เอ็กซ์เรย์ใหม่เทียบท่าในที่ซับซ้อนด้วยการทำให้การวิเคราะห์ข้อมูลทางอุณหพลศาสตร์ในบริบทของการตรวจสอบสำหรับแต่ละเว็บไซต์ของลิแกนด์ผูกพัน . สำหรับเอนเป็นลิแกนด์ผูกพันและคายความร้อนความร้อนเช่นเดียวกับเอนโทรปีส่วนปฏิกิริยาผูกด้วยข้อยกเว้นของ st1326 ซึ่งผูกเป็นเรื่องพลังงานขับเคลื่อน พื้นผิวแบบแอนะล็อก st1326 ที่ผูกกับ acylcarnitine มัดเว็บไซต์และการเปลี่ยนแปลงความจุความร้อนใกล้ศูนย์แสดงให้เห็นความสมดุลของไฟฟ้าสถิต ) และการมีปฏิสัมพันธ์ มีความสัมพันธ์ที่ยอดเยี่ยมของอุณหพลศาสตร์ ( ITC ) และโครงสร้าง ( รังสีเอกซ์รุ่น ) ข้อมูลจากการวัด 2 แนะนำว่าให้ข้อมูลที่มีคุณค่าสำหรับการเพิ่มประสิทธิภาพและความผูกพันในการค้นพบยา C  2013 ผู้ประพันธ์ ที่ตีพิมพ์โดยเอลส์นอกจากนี้ในนามของสหพันธ์ยุโรปทางชีวเคมี