This genome was sequenced as a part

This genome was sequenced as a part of the large-scale multi-genome JGI CSP Saprotrophic Agaricomycotina Project (SAP), which focuses on the diversity and evolution of decay mechanisms, organismal phylogenetic relationships, and developmental evolution. A large collaborative effort led by PI of this project, David Hibbett (Clark University) aims for master publication(s) of the SAP data analysis. Researchers who wish to publish analyses using data from unpublished SAP genomes are respectfully required to contact the PI and JGI to avoid potential conflicts on data use and coordinate other publications with the SAP master paper(s).

Jaapia argillacea produces scattered fruiting bodies composed of loosely intertwined hyphae. This fungus is largely distributed in the northern hemisphere and thrives in old grown forests, especially where admissible moisture levels exist. The genus Jaapia consists of only two species (J. argillacea and J. ochroleuca) and has sometimes been referred to as the sister to the Boletales. More recent findings indicate that Jaapia is sister to the rest of the Agaricomycetidae, which is the largest radiation of mushroom-forming fungi including approximately 15,000 species. Jaapia argillacea lives on decaying wood of conifers and is thought to produce a type of brown rot that has not been characterized in more detail. Nevertheless, the phylogenetic position of J. argillacea makes this fungus an excellent benchmark reference to evaluate evolutionary expansions and contractions of the enzymatic decay apparatus in all of Agaricomycetidae.

Genome Reference(s)

Please cite the following publication(s) if you use the data from this genome in your research:

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

จีโนมนี้ถูกติดใจเป็นส่วนหนึ่งของ saprotrophic ขนาดใหญ่จีโนมหลาย JGI CSP Agaricomycotina โครงการ (SAP) ซึ่งมุ่งเน้นไปที่ความหลากหลายและวิวัฒนาการของกลไกการสลายตัวของความสัมพันธ์ของสายวิวัฒนาการมีชีวิตและวิวัฒนาการการพัฒนา ความพยายามร่วมกันที่มีขนาดใหญ่นำโดย PI ของโครงการนี้ดาวิด Hibbett (มหาวิทยาลัยคลาร์ก) มีจุดมุ่งหมายสำหรับการตีพิมพ์ต้นแบบ (s) ของการวิเคราะห์ข้อมูล SAP นักวิจัยที่มีความประสงค์ที่จะเผยแพร่การวิเคราะห์โดยใช้ข้อมูลจากจีโนมที่ไม่ได้เผยแพร่ SAP จะต้องกราบที่จะติดต่อ PI และ JGI เพื่อหลีกเลี่ยงความขัดแย้งที่อาจเกิดขึ้นกับข้อมูลที่ใช้และประสานงานสิ่งพิมพ์อื่น ๆ ที่มีกระดาษ SAP ต้นแบบ (s). Jaapia argillacea ผลิตกระจายผลร่างประกอบด้วยหลวม เส้นใยพัน เชื้อรานี้จะกระจายส่วนใหญ่ในซีกโลกเหนือและเจริญเติบโตในป่าที่ปลูกเก่าโดยเฉพาะอย่างยิ่งที่ระดับความชื้นที่ยอมรับอยู่ สกุล Jaapia ประกอบด้วยเพียงสองสปีชีส์ (เจ argillacea เจ ochroleuca) และได้รับการบางครั้งเรียกว่าน้องสาว Boletales ผลการวิจัยล่าสุดแสดงให้เห็นว่าเพิ่มเติม Jaapia เป็นน้องสาวที่เหลือของ Agaricomycetidae ซึ่งเป็นรังสีที่ใหญ่ที่สุดของเห็ดเห็ดราขึ้นรูปรวมประมาณ 15,000 ชนิด Jaapia argillacea อาศัยอยู่บนไม้ผุของพระเยซูเจ้าและคิดว่าจะผลิตประเภทของสีน้ำตาลเน่าที่ยังไม่ได้โดดเด่นในรายละเอียดเพิ่มเติม อย่างไรก็ตาม phylogenetic ตำแหน่งของเจ argillacea ทำให้เชื้อราชนิดนี้อ้างอิงมาตรฐานที่ดีในการประเมินการขยายตัวและการหดตัวของวิวัฒนาการของอุปกรณ์การสลายตัวของเอนไซม์ในทุก Agaricomycetidae. จีโนม (s) อ้างอิงกรุณาอ้างอิงสิ่งพิมพ์ดังต่อไปนี้ (s) ถ้าคุณใช้ข้อมูล จากจีโนมในการวิจัยของคุณ:

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ลำดับจีโนมนี้เป็นส่วนหนึ่งของขนาดใหญ่หลายโครงการจีโนม jgi CSP แซโพรทรอฟิก agaricomycotina ( SAP ) ที่เน้นความหลากหลายและวิวัฒนาการของกลไกการสลายตัว organismal ยืนยันความสัมพันธ์และวิวัฒนาการพัฒนาการ ขนาดใหญ่ความพยายามร่วมกัน นำโดย พี ของโครงการนี้ เดวิด hibbett ( มหาวิทยาลัยคลาร์ก ) มีวัตถุประสงค์เพื่อเผยแพร่หลัก ( s ) ของเอสเอพี การวิเคราะห์ข้อมูลนักวิจัยที่ประสงค์จะเผยแพร่วิเคราะห์โดยใช้ข้อมูลจาก SAP ประกาศหาอยู่เลยต้องติดต่อ พี และ jgi เพื่อหลีกเลี่ยงความขัดแย้งที่อาจเกิดขึ้นในการใช้ข้อมูลและประสานงานสิ่งพิมพ์อื่น ๆ กับ SAP ต้นแบบกระดาษ ( s )

jaapia argillacea ผลิตกระจายอยู่เต็มร่างกายประกอบด้วยหลวมสานเส้นใยเชื้อรานี้ไปกระจายในซีกโลกเหนือ และ thrives ในเก่าที่ปลูกป่า โดยเฉพาะอย่างยิ่งที่ความชื้นระดับที่ยอมรับได้อยู่ สกุล jaapia ประกอบด้วยเพียงสองชนิด ( เจเจและ argillacea ochroleuca ) และมีบางครั้งถูกเรียกว่าพี่สาวไป boletales . ผลการวิจัยล่าสุด ระบุว่า jaapia เป็นน้องสาว agaricomycetidae ที่เหลือ ,ซึ่งรังสีที่ใหญ่ที่สุดของการขึ้นรูป รวมประมาณ 15 , 000 ชนิด เชื้อรา เห็ด jaapia argillacea อาศัยอยู่ในไม้ผุของตลกและเป็นความคิดที่ผลิตชนิดของเน่าสีน้ำตาล ที่ไม่ได้มีลักษณะในรายละเอียดเพิ่มเติม อย่างไรก็ตาม ตำแหน่งต่างๆของargillacea ทำให้เชื้อรานี้ยอดเยี่ยมมาตรฐานอ้างอิงเพื่อประเมิน และการหดตัวของการวิวัฒนาการเครื่องมือสลายเอนไซม์ในทั้งหมดของ agaricomycetidae

) อ้างอิง ( s )

กรุณาอ้างอิงสิ่งพิมพ์ต่อไปนี้ ( s ) ถ้าคุณใช้ข้อมูลจากจีโนมนี้ในการวิจัยของคุณ :