Viroids were extensively studied in

Viroids were extensively studied in the past few years, and new
insights not only into their propagation, in vivo replication, processing,
trafficking, and pathogenesis, but also into their tertiary structure and
interactions with cellular proteins or small RNA were reported.However,
several questions regarding the mechanisms by which these viroids
enter and leave the cell, the nucleus or the chloroplast and escape the
host degradation system, remain unclear. Indeed the prevention of
viroid infections in plants is so far based on barely biological means
and no chemicals are available to control or prevent plant diseases
caused by viroids. The current approaches used to combat viroids are
the elimination of source inoculum, prevention of secondary spread,
cross-protection, and the use of crops bearing resistance traits [9].
Nevertheless, one way of preventing Avsunviroidae infection could be
to break their rolling circle replication by inhibiting their hammerhead
self-cleavage, perturbing thus the equilibrium between linear, circular,
and polymeric viroids in infected cells, and allowing the defense mechanism of the cell, in particular the nucleases, to recognize and
degrade them. This idea has been put forward by Murray and Arnold
who showed that tetracycline is a potent inhibitor of HHR

Over the past two decades, many studies have reported on the
inhibition of the HHR by variable metabolites such as aminoglycoside
antibiotics [11], terbium (III)[12], and cobalt hexamine [13], in vitro as
well as in vivo [14], but none of the ribozymes used in these studies
was from a hammerhead viroid. In addition, most of these ribozymes
were minimal trans-acting constructs although the physiological reaction
is cis-acting. Furthermore, this reaction involves the native peripheral
regions of the ribozyme [15,16] which, by interacting with each other,
facilitate and stabilize folding into a single active structure. These
regions are necessary for optimal activity in physiological conditions,
although they are not directly involved in the catalysis [17].
Consequently, the present investigation made use of the HHR of the
Chrysanthemum chlorotic mottle viroid (CChMVd). The structure and
function of the peripheral loops of this ribozyme were previously studied
using a combination of NMR spectroscopy, site-direct mutagenesis,
kinetic studies and infectivity analyses [18]. The results obtained
provided insights into the three-dimensional folding of the HHR and
emphasize the importance of almost all the nucleotides in the terminal
loops for self-cleavage of the ribozyme in vitro and for infectivity of the
viroid in vivo. Recently, our laboratory investigated the cis-cleavage
reaction of a CChMVd-HHR (Fig. 1) by the high pressure approach on
the over-all cleavage reaction [19]. Two different conformations of
active molecules were identified in the reactionmixture corresponding
to fast and slow cleaving ribozymes.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

Viroids ได้ศึกษาอย่างกว้างขวาง ในช่วงไม่กี่ปี และใหม่ความเข้าใจไม่เพียงแต่เป็นการเผยแพร่ จำลองในสัตว์ทดลอง ประมวล ผลการค้า และพยาธิกำเนิด แต่ยังเป็นโครงสร้างระดับตติยภูมิ และมีรายงานโต้ตอบกับโปรตีนเซลลูลาร์หรืออาร์เอ็นเอขนาดเล็กอย่างไรก็ตามคำถามที่ถามเกี่ยวกับกลไกโดยที่นี่ viroidsป้อน และออกจากเซลล์ นิวเคลียส หรือคลอโรพลาสต์ และหลบหนีการโฮสต์ระบบย่อยสลาย ยังคงชัดเจน แน่นอนการป้องกันการเชื้อไวรอยด์ในพืชจนตามแทบชีวภาพหมายถึงและสารเคมีไม่มี การควบคุมป้องกันโรคพืชเกิดจาก viroids มีแนวทางปัจจุบันที่ใช้ในการต่อสู้กับ viroidsการกำจัดแหล่ง inoculum ป้องกันการแพร่กระจาย รองข้ามป้องกัน และการใช้พืชเรืองลักษณะต้านทาน [9]อย่างไรก็ตาม อาจเป็นวิธีหนึ่งของการป้องกันการติดเชื้อ Avsunviroidaeการจำลองความกลมกลิ้ง โดย inhibiting ของฉลามหัวค้อนตนเองปริ perturbing ดังนั้นสมดุลระหว่างเส้น กลมและชนิด viroids ในเซลล์ที่ติดเชื้อ และช่วยให้กลไกการป้องกันของเซลล์ โดยเฉพาะอย่างยิ่ง nucleases การรับรู้ และย่อยสลายได้ ความคิดนี้ได้ถูกนำมา โดยเมอร์เรย์และอาร์โนลด์ที่แสดงให้เห็นว่าเตตราไซคลีนเป็นผลที่มีศักยภาพของ HHRกว่าสองทศวรรษ ศึกษาจำนวนมากได้รายงานในยับยั้ง HHR โดย metabolites ผันแปรเช่น aminoglycosideยาปฏิชีวนะ [11], เทอร์เบียม (III) [12], และโคบอลต์ hexamine [13], การเพาะเลี้ยงเป็นใน vivo [14], แต่ ribozymes ที่ใช้ในการศึกษานี้ไม่มีดีได้จากไวรอยด์เป็นฉลามหัวค้อน นอกจากนี้ ส่วนใหญ่ของ ribozymes เหล่านี้มีโครงสร้างทำหน้าที่ธุรกรรมน้อยที่สุดแม้ว่าปฏิกิริยาสรีรวิทยาจะทำหน้าที่ cis นอกจากนี้ ปฏิกิริยานี้เกี่ยวข้องกับอุปกรณ์ต่อพ่วงในพื้นเมืองภูมิภาคของไรโบไซม์ [15,16] ที่ โดยการโต้ตอบกันอำนวยความสะดวก และอาพับลงในโครงสร้างการใช้งานอยู่เดียว เหล่านี้ภูมิภาคเป็นสิ่งจำเป็นสำหรับกิจกรรมเหมาะสมสภาพสรีรวิทยาแม้ว่าจะไม่เกี่ยวข้องโดยตรงในการเร่งปฏิกิริยา [17]ดังนั้น การสอบสวนปัจจุบันทำใช้ HHR ของไวรอยด์ mottle ปากในเบญจมาศ (CChMVd) โครงสร้าง และก่อนหน้านี้ได้ศึกษาฟังก์ชันของลูปต่อพ่วงของไรโบไซม์นี้ใช้ก NMR ไซต์ตรง mutagenesisศึกษาการเคลื่อนไหวและวิเคราะห์ infectivity [18] ผลได้รับให้ลึกในการพับสามมิติของ HHR และเน้นความสำคัญของเกือบทั้งหมดนิวคลีโอไทด์ในเทอร์มินัลวนรอบ และ infectivity ของตนเองความแตกแยกของไรโบไซม์ในการไวรอยด์ในสัตว์ทดลอง ล่าสุด ห้องปฏิบัติการของเราตรวจสอบปริ cisปฏิกิริยาของการ CChMVd-HHR (Fig. 1) โดยวิธีความดันสูงในปฏิกิริยาความแตกแยกทั้งหมด [19] Conformations แตกต่างกันสองของโมเลกุลที่ใช้ระบุในตรง reactionmixtureรวดเร็ว และช้า cleaving ribozymes

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ไวรอยด์ได้รับการศึกษาอย่างกว้างขวางในช่วงไม่กี่ปีที่ผ่านมาและใหม่
ไม่เพียง แต่ข้อมูลเชิงลึกในการขยายพันธุ์ของพวกเขาในการทำแบบจำลองร่างกาย, การประมวลผล,
การค้ามนุษย์และการเกิดโรค แต่ยังเป็นโครงสร้างในระดับอุดมศึกษาของพวกเขาและ
การมีปฏิสัมพันธ์กับโปรตีนของเซลล์หรือ RNA ขนาดเล็กเป็น reported.However,
หลาย คำถามเกี่ยวกับกลไกที่ไวรอยด์เหล่านี้
เข้าและออกจากเซลล์นิวเคลียสหรือคลอโรพลาและหลบหนี
ระบบการย่อยสลายเจ้าภาพยังไม่ชัดเจน อันที่จริงการป้องกันการ
ติดเชื้อไวรอยด์ในพืชเพื่อให้ไกลขึ้นอยู่กับวิธีการทางชีวภาพแทบ
และไม่มีสารเคมีที่มีอยู่ในการควบคุมหรือป้องกันโรคพืช
ที่เกิดจากไวรอยด์ วิธีการที่ใช้ในปัจจุบันเพื่อต่อสู้ไวรอยด์มี
การกำจัดเชื้อแหล่งที่มาการป้องกันการแพร่กระจายรอง
ป้องกันข้ามและการใช้พืชที่มีลักษณะต้านทาน [9].
แต่วิธีหนึ่งในการป้องกันการติดเชื้อ Avsunviroidae อาจจะเป็น
ที่จะทำลายวงกลมกลิ้งของพวกเขา การจำลองแบบโดยการยับยั้งการแฮมเมอร์ของพวกเขา
ด้วยตัวเองความแตกแยกทำให้เกิดการรบกวนจึงสมดุลระหว่างเส้นวงกลม
และพอลิเมอไวรอยด์ในเซลล์ที่ติดเชื้อและช่วยให้กลไกการป้องกันของเซลล์โดยเฉพาะอย่างยิ่ง nucleases, การรับรู้และ
การย่อยสลายพวกเขา ความคิดนี้ได้ถูกนำมาโดยเมอร์เรและอาร์โนล
ที่แสดงให้เห็นว่ายาเป็นตัวยับยั้งที่มีศักยภาพของ HHR ที่ผ่านมาสองทศวรรษที่ผ่านมาการศึกษาจำนวนมากได้มีการรายงานเกี่ยวกับการยับยั้งการ HHR โดยสารตัวแปรเช่น aminoglycoside ยาปฏิชีวนะ [11], เทอร์เบียม (III ) [12] และโคบอลต์ Hexamine [13] ในหลอดทดลองเช่นเดียวกับในร่างกาย [14] แต่ไม่มีไรโบไซที่ใช้ในการศึกษาเหล่านี้มาจากไวรอยด์แฮมเมอร์ นอกจากนี้ส่วนใหญ่ของไรโบไซเหล่านี้ได้สร้างทรานส์น้อยที่สุดแม้ว่าการแสดงปฏิกิริยาทางสรีรวิทยาเป็น CIS-แสดง นอกจากนี้ปฏิกิริยานี้เกี่ยวข้องกับอุปกรณ์ต่อพ่วงพื้นเมืองของภูมิภาคของ ribozyme [15,16] ซึ่งโดยการโต้ตอบกับแต่ละอื่น ๆ , อำนวยความสะดวกและสร้างความมั่นคงพับเป็นโครงสร้างที่ใช้งานเพียงครั้งเดียว เหล่านี้ภูมิภาคเป็นสิ่งจำเป็นสำหรับกิจกรรมที่เหมาะสมในสภาพทางสรีรวิทยาแม้ว่าพวกเขาจะไม่ได้มีส่วนเกี่ยวข้องโดยตรงในการเร่งปฏิกิริยา [17]. ดังนั้นการใช้การตรวจสอบทำปัจจุบันของ HHR ของดอกเบญจมาศซีด mottle ไวรอยด์ (CChMVd) โครงสร้างและการทำงานของลูปต่อพ่วงของ ribozyme นี้มีการศึกษาก่อนหน้านี้โดยใช้การรวมกันของสเปคโทร NMR, ฉับเว็บไซต์โดยตรงการศึกษาเกี่ยวกับการเคลื่อนไหวและการวิเคราะห์การติดเชื้อ [18] ผลที่ได้รับข้อมูลเชิงลึกให้เป็นพับสามมิติของ HHR และเน้นความสำคัญของนิวคลีโอเกือบทั้งหมดในสถานีลูปสำหรับตัวเองความแตกแยกของ ribozyme ในหลอดทดลองและการติดเชื้อของไวรอยด์ในร่างกาย เมื่อเร็ว ๆ นี้ห้องปฏิบัติการของเราตรวจสอบถูกต้อง-แตกแยกปฏิกิริยาของ CChMVd-HHR (รูปที่ 1). โดยวิธีการที่ความดันสูงกว่าทุกปฏิกิริยาความแตกแยก [19] สอง conformations แตกต่างกันของโมเลกุลที่ใช้งานที่ถูกระบุใน reactionmixture สอดคล้องกับไรโบไซ Cleaving เร็วและช้า

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

viroids เป็นอย่างกว้างขวางใช้ในไม่กี่ปีที่ผ่านมา และข้อมูลเชิงลึกใหม่
ไม่เพียงแต่ในการขยายพันธุ์ในหลอดทดลอง , การ , ประมวลผล ,
การค้าและการศึกษา แต่ยังเป็นโครงสร้างตติยภูมิของตนเอง และการมีปฏิสัมพันธ์กับโปรตีนของเซลล์หรือยีน

เล็กรายงาน อย่างไรก็ตาม คำถามหลายเกี่ยวกับกลไกซึ่งเหล่านี้ viroids
ระบุและออกจากเซลล์นิวเคลียสและคลอโรพลาสต์และหนี
โฮสต์ระบบการย่อยสลาย ยังคงไม่ชัดเจน แน่นอน การป้องกัน
เชื้อไวรอยด์ในพืชเพื่อให้ห่างไกลโดยวิธีชีวภาพ และแทบไม่มีสารเคมี
สามารถควบคุมหรือป้องกันโรคพืชที่เกิดจาก viroids
. แนวทางปัจจุบันใช้ viroids รบมี
การขจัดแหล่งเชื้อ การป้องกันทุติยภูมิแพร่กระจาย
ข้ามป้องกัน และใช้พืชที่มีคุณสมบัติต้านทาน [ 9 ] .
แต่วิธีหนึ่งในการป้องกันการติดเชื้อ avsunviroidae สามารถที่จะทำลายวงกลมกลิ้งซ้ำ

ของหัวค้อนโดยยับยั้งตนเองคนอื่นในใจงั้นจึงสมดุลระหว่างเส้น , วงกลม ,
และพอลิเมอร์ viroids ในเซลล์ที่ติดเชื้อ และให้กลไกการป้องกันของ เซลล์โดยเฉพาะ nucleases เพื่อรับรู้และ
ลดพวกเขา ความคิดนี้ได้ถูกหยิบยก โดย เมอร์เรย์ และ อาร์โนลด์
ที่พบว่าเป็นสารที่มีศักยภาพยับยั้งไซคลินของ HHR

ที่ผ่านมาสองทศวรรษที่ผ่านมา การศึกษาหลายได้รายงานบน
การยับยั้งของ HHR โดยตัวแปรหลายชนิด เช่น ยาปฏิชีวนะกลุ่มอะมิโนกลัยโคไซด์
[ 11 ] , เทอร์เบียม ( 3 ) [ 12 ] และมีน [ โคบอลต์ 13 ) ในหลอดทดลองเป็น
อย่างดีโดย [ 14 ]แต่ไม่มีของ ribozymes ใช้ในการศึกษา
เหล่านี้จากหัวค้อน ไวรอยด์ . นอกจากนี้ส่วนใหญ่ของ ribozymes
เหล่านี้น้อยที่สุด ทรานส์ทำโครงสร้างแม้ว่า
ปฏิกิริยาทางร่างกายเป็น CIS การแสดง นอกจากนี้ ปฏิกิริยานี้เกี่ยวข้องกับพื้นเมืองภาคต่อพ่วง
ของเน็ตแวร์ [ 15,16 ] ซึ่งโดยการโต้ตอบกับแต่ละอื่น ๆ ,
อํานวยความสะดวกและพับเป็นทรงเดียวที่ใช้งานโครงสร้างภูมิภาคเหล่านี้
เป็นสิ่งจำเป็นสำหรับกิจกรรมที่เหมาะสมในเงื่อนไขทางสรีรวิทยา
ถึงแม้ว่าพวกเขาจะไม่ได้มีส่วนเกี่ยวข้องโดยตรงในการเร่งปฏิกิริยา [ 17 ] .
ดังนั้น การสืบสวน ปัจจุบันใช้ของ HHR ของเบญจมาศ chlorotic mottle viroid (
cchmvd ) โครงสร้างและการทำงานของอุปกรณ์ต่อพ่วงของลูป
ไรโบไซม์นี้เคยเรียน
โดยใช้การรวมกันของ NMR spectroscopy ,เว็บไซต์ของการติดเชื้อและตรง
การศึกษาจลนศาสตร์การวิเคราะห์ [ 18 ] ผลลัพธ์ที่ได้ให้ข้อมูลเชิงลึกในการพับ

ของ HHR สามมิติและเน้นความสำคัญของเกือบทุกคู่ใน terminal
ลูปสำหรับรองตนเองของเน็ตแวร์ในหลอดทดลอง และการติดเชื้อของ
ไวรอยด์ในสิ่งมีชีวิต เมื่อเร็วๆนี้ห้องปฏิบัติการของเราตรวจสอบ CIS แตกแยก
ปฏิกิริยาของ cchmvd HHR ( รูปที่ 1 ) โดยวิธีความดันสูง
กว่าตัวปฏิกิริยา [ 19 ] สองโครงสร้างที่แตกต่างกันของโมเลกุลที่ถูกระบุในงาน

reactionmixture ที่รวดเร็ว และ ช้า สามารถ ribozymes .