Due to the high importance of the s

Due to the high importance of the structural properties of peptides, the conformational behavior of one of their elementary building blocks, asparagine, has been investigated in this work. Matrix-isolation FT-IR spectroscopy is a suitable technique to investigate the intrinsic properties of small molecules. Asparagine has been subjected to matrix-isolation FT-IR spectroscopy supported with DFT and MP2 calculations. DFT optimization of asparagine resulted in 10 stable conformations with ∆EDFT < 10 kJ.mol− 1. Compared to a previous study, one new conformation has been revealed. Further optimization at the MP2/6-31++G** level resulted in seven conformations with ∆EMP < 10 kJ.mol− 1. A conformation containing the three intramolecular H-bonds, i.e. C = Osc…HNbb, C = Obb…HNsc and OHbb…Nbb appeared to be the most stable one at both levels despite the large negative entropy contribution due to these 3 H-bonds. At the sublimation temperature of 353 K, the DFT method predicts four and the MP2 method six conformations to be present in the experimental matrix-isolation spectrum. These conformations have different intramolecular H-bonds, which has allowed to identify at least 4 low energy conformations in the FT-IR spectrum. Detailed comparison between theory and experiment resulted in a mean frequency deviation of 7.6 cm− 1.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

เนื่องจากความสำคัญสูงคุณสมบัติโครงสร้างของเปปไทด์ โครงสร้างการทำงานหนึ่งในบล็อกของอาคารประถม asparagine ได้รับการตรวจสอบในงานนี้ สเปกโทรสโก IR ฟุตแยกเมทริกซ์เป็นเทคนิคเหมาะในการตรวจสอบคุณสมบัติแท้จริงของโมเลกุลขนาดเล็ก Asparagine ได้รับภายใต้การสนับสนุน ด้วยการคำนวณ DFT และ MP2 สเปกโทรสโก IR ฟุตแยกเมทริกซ์ เพิ่มประสิทธิภาพ DFT ของ asparagine ผลใน 10 เสถียร conformations กับ ∆EDFT < 10 kJ.mol− 1 เมื่อเทียบกับการศึกษาก่อนหน้านี้ หนึ่งโครงสร้างใหม่ได้ถูกเปิดเผย การเพิ่มประสิทธิภาพ MP2 ที่ 6-31 ++ G ** ระดับส่งผลให้เจ็ด conformations กับ ∆EMP < 10 kJ.mol− 1 โครงสร้างที่ประกอบด้วยความสาม intramolecular H-พันธะ เช่น C = Osc ... HNbb, C = Obb ... HNsc และ OHbb ... Nbb ปรากฏจะ มากที่สุดมีเสถียรภาพในระดับทั้งสองแม้มี entropy ลบขนาดใหญ่การมีส่วนร่วมเนื่องจากพันธบัตรเหล่านี้ 3 ชม ที่อุณหภูมิระเหิด 353 K, DFT วิธีคาดการณ์สี่และวิธี MP2 หก conformations ที่มีอยู่ในเมทริกซ์แยกทดลองสเปกตรัม Conformations เหล่านี้มีแตกต่างกัน intramolecular H-พันธะ ซึ่งได้อนุญาตให้ระบุน้อย 4 พลังงานต่ำ conformations ในสเปกตรัมฟุต-IR เปรียบเทียบรายละเอียดระหว่างทฤษฎีและการทดลองทำให้ค่าเบี่ยงเบนความถี่เฉลี่ยของ 7.6 cm− 1

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

เนื่องจากความสำคัญสูงของคุณสมบัติของโครงสร้างของเปปไทด์พฤติกรรมโครงสร้างของหนึ่งในการก่อสร้างตึกประถมศึกษาของพวกเขา asparagine ได้รับการตรวจสอบในงานนี้ เมทริกซ์แยก FT-IR สเปกโทรสโกเป็นเทคนิคที่เหมาะสมในการตรวจสอบคุณสมบัติที่แท้จริงของโมเลกุลขนาดเล็ก asparagine ถูกยัดเยียดให้แยกเมทริกซ์สเปกโทรสโก FT-IR สนับสนุนด้วย DFT และการคำนวณ MP2 การเพิ่มประสิทธิภาพของ DFT asparagine ผลใน 10 conformations มั่นคงกับΔEDFT <10 kJ.mol- 1. เมื่อเทียบกับการศึกษาก่อนหน้าหนึ่งรูปแบบใหม่ที่ได้รับการเปิดเผย การเพิ่มประสิทธิภาพเพิ่มเติมได้ที่ MP2 / การ 31/6 ++ G ** ระดับผลในเจ็ด conformations กับΔEMP <10 kJ.mol- 1. โครงสร้างที่มีสาม intramolecular H-พันธบัตรคือ C = Osc ... HNbb, C = Obb ... HNsc และ OHbb ... Nbb ดูเหมือนจะเป็นหนึ่งที่มีเสถียรภาพมากที่สุดทั้งในระดับแม้จะมีผลงานของเอนโทรปีเชิงลบที่มีขนาดใหญ่เนื่องจากทั้ง 3 H-พันธบัตร ที่อุณหภูมิระเหิด 353 K, วิธี DFT คาดการณ์สี่และวิธี MP2 หก conformations ที่จะนำเสนอในการทดลองสเปกตรัมเมทริกซ์แยก conformations เหล่านี้มี intramolecular H-พันธบัตรที่แตกต่างกันซึ่งได้รับอนุญาตให้ระบุอย่างน้อย 4 conformations พลังงานต่ำในสเปกตรัม FT-IR เปรียบเทียบรายละเอียดระหว่างทฤษฎีและการทดลองผลในการเบี่ยงเบนความถี่ 7.6 ซม 1

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

เนื่องจากความสำคัญสูงของสมบัติเชิงโครงสร้างของเปปไทด์ พฤติกรรมในหนึ่งในบล็อก , อาคารเบื้องต้นของแอสพาราจีน ได้ถูกศึกษาในงานนี้ เมทริกซ์การแยกอินฟราเรดสเปกโทรสโกปี เป็นเทคนิคที่เหมาะสมในการตรวจสอบคุณสมบัติภายในของโมเลกุลขนาดเล็ก แอสพาราจีนได้รับภายใต้เมทริกซ์การแยกอินฟราเรดสเปกโทรสโกปีได้รับการสนับสนุนกับ DFT และการคำนวณ MP2 . การเพิ่มประสิทธิภาพของ DFT asparagine ( 10 โครงสร้างที่มั่นคงกับ∆ edft < 10 kJ mol . − 1 เมื่อเปรียบเทียบกับการศึกษาก่อนหน้านี้ หนึ่งโครงสร้างใหม่ได้รับการเปิดเผย เพิ่มเติมการเพิ่มประสิทธิภาพที่ MP2 / 6-31++G + + G * * ระดับมีผลใน 7 โครงสร้างกับ∆ EMP < 10 kJ mol . − 1 เป็นโครงสร้างที่ประกอบด้วยสาม intramolecular h-bonds ได้แก่ C = Osc . . . . . . . hnbb , C = obb hnsc ohbb และ . . . . . . . . . . . . . . nbb ปรากฏเป็นมีเสถียรภาพมากที่สุดในทั้ง 2 ระดับมีขนาดใหญ่ลบเอนโทรปีบริจาคเนื่องจากทั้ง 3 h-bonds . ที่ระเหิดอุณหภูมิ 353 K , DFT วิธีการคาดการณ์สี่และ MP2 วิธีการหกโครงสร้างมาให้ทดลองเมทริกซ์การแยกสเปกตรัม โครงสร้างเหล่านี้มี h-bonds intramolecular ที่แตกต่างกันซึ่งได้รับอนุญาตที่จะระบุอย่างน้อย 4 พลังงานต่ำโครงสร้างในอินฟราเรดสเปกตรัม เปรียบเทียบรายละเอียดระหว่างทฤษฎีและการทดลองส่งผลหมายถึงความถี่เบี่ยงเบน 7.6 cm − 1