3. DiscussionAcidobacteria is one o

3. Discussion
Acidobacteria is one of the most dominant and abundant phyla in soils and 26 major subdivisions have been definedbased on 16S rRNA gene sequences (Barns et al., 2007). A large number of reports showed that the most dominant subdivisions in different soil environments are different.Barns et al. (2007) surveyed two soil samples in New Mexico and Utah and showed that Subdivisions 4 and 6 comprised 42.8% and 45.6% of sequences in Acidobacteria 16S rRNA gene libraries. Eichorst et al. (2011)found that the proportion of subdivision 4 sequences was the highest in agricultural soil that contained less carbon than grassland soils. Our results showed that Subdivision 6 is the most dominant in Shennongjia Mountain soils, and the prevalence of Subdivision 6 is consistent with the previous studies (Eichorst et al., 2007; Hansel et al., 2008). Sang-Hoon and Cho (2009)revealed that Acidobacterial Subdivision 1 could be globally distributed and has been frequently observed at high abundance in soil environments, indicating that this subdivision might be well adapted to various soil environments. Therefore, the Acidobacterial Subdivisions of 1, 4, and 6 may be the most dominant groups in the soil environment. Microbial diversity patterns along elevational gradients are an extremely interesting and widely debated topic for ecologists, as they are among the fundamental rules underlying microbial biogeography (Martiny et al., 2011). At present, several studies on acidobacterial elevation patterns at phylum level have been reported and the trends were variable (Fierer et al., 2011; Wang et al., 2012). In this study, we found different trends at the subdivision level and this is the first time, to our knowledge, that the elevation patterns have been analyzed at the subdivision level. Three trends for Acidobacteria elevational patterns at the subdivision level can be summarized: no significant influence (Subdivisions 7 and 10), a monotonous decrease (Subdivisions 1, 2 and 3) and increase (Subdivisions 4, 5, 6, 16 and 17) with an increase in elevation. The acidobacterial elevation patterns are determined by different trends in the subdivision elevational patterns. In diverse soil environments, the most dominant subdivision is variable, which leads to different elevational patterns for Acidobacteria. Further study is needed to analyze the subdivision elevational pattern in
different soil environments. Based on the phylogenetic diversity and ecological distribution, Acidobacteria is expected to have a wide range of metabolic and genetic functions (Hugenholtz et al., 1998; Barns et al., 1999). Genomic evidence from cultured bacteria suggested that the role of Acidobacteria Subdivisions 1 and 3 in nitrogen cycling in soil and sediment is to facilitate the reduction of nitrate, nitrite, and possibly nitric oxide based on three complete genome sequences of isolates of “Solibacter usitatus”(Subdivision 3), “Korebacter versatilis”(Subdivision 1), and“Acidobacterium capsulatum”(Subdivision 1) (Ward et al., 2009).Eichorst et al. (2011)revealed that Subdivisions 1 and 3 have the potential to play an active role in the degradation of plant polymers in bulk soil and in utilization of sugars from plant root exudates at various concentrations in the rhizosphere. However, the ecological roles and metabolic activities of uncultured bacteria in the natural environment are still unknown, especially in soil (Lee et al., 2008). Soil enzymes, mainly from soil microorganisms, play a crucial role in maintaining nutrient cycling and can reflect the circumstances of biological metabolism and substance transformation in soil environments. Our results showed that different soil Acidobacteria subdivisions have various correlations with several key soil enzyme activities. Subdivisions 4, 5 and 6 are only correlated (P< 0.1) with amylase activity, which are hydrolytic enzymes that promote the decomposition of starch. Subdivisions 2, 3, 7 and 16 are correlated (P< 0.1) with the sucrase activity, which is an extracellular enzyme that catalyzes the hydrolysis of sucrose and fructose, and the increased activity of sucrase may be ascribed to the increased total organic carbon and soil fertility in soil (Ge et al., 2009). Therefore, soil Acidobacteria at the subdivision level may be involved in different ecosystem functions in global elemental cycles. Elevational patterns on mountainsides could be influenced by other environmental driving factors (Singh et al., 2012), and climatic and biotic factors may be the major drivers (Bryant et al., 2008; Rahbek, 2005). Soil pH is one of the key factors to influence Acidobacteria community composition and structure. Our studies showed that the responses of subdivisions to soil pH are different. Subdivisions 1, 2 and 3 are significantly positively correlated (P< 0.01) with soil pH, and the other subdivisions are significantly negatively correlated (P< 0.01) with soil pH, except for Subdivision 7. The previous studies also showed that soil pH is a strong indicator of Acidobacteria community composition (Yin et al., 2010). Sait et al. (2006) found that Subdivision 1 was strongly related to soil pH, and these bacteria appear to be numerically abundant in soils with pH below 6.Bryant et al. (2007)observed that Subdivision 4 was more abundant in arid soils, and was not detected in soils with pH of less than 4.0 (Barn et al., 1999). The abundance of Subdivisions 1, 2, 3, 12, and 13 was negatively correlated with pH, while Subdivisions 4, 6, 7, 10, 11, 16, 17, 18, 22 and 25 had positive correlations with pH (Jones et al., 2009; Lauber et al., 2009). In addition, multiple members of the Acidobacteria have been found to be abundant in alkaline soils (Dunbar et al., 1999, 2002). Plant communities can influence associated soil microbial communities through the types and amounts of carbon and nutrient inputs, and by changing temperature and water content of the soil (Myers et al., 2001; Waldrop and Firestone, 2004). Different plant species can be associated with different communities as evidenced by fatty acid (Myers et al., 2001), and physiological (Waldrop and Firestone, 2004) and DNA techniques (Kuske et al., 2002). Therefore, the different plant types along elevation gradient are an important factor in shaping the microbial elevation patterns. Recent studies showed that the Acidobacteria is in general oligotrophic. For example, the proportions of Acidobacteria were reported to be significantly lower in nutrient-rich rhizosphere soils than in bulk soils (Kielak et al., 2009), and were less abundant in more nutrient-rich agricultural soils (Lopez-Lozano et al., 2013). Eichorst et al. (2011) examined correlations between the percentages of Subdivision 4 with various edaphic properties and found that carbon availability appeared to be one of the factors influencing the Acidobacteria community composition. Our studies showed that Acidobacteria is significantly correlated with plant diversity.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

3. สนทนาAcidobacteria เป็นหนึ่ง phyla หลักมากที่สุด และอุดมสมบูรณ์ในดินเนื้อปูน และแบ่งย่อยหลัก 26 มี definedbased บน 16S rRNA ยีนลำดับ (บ่ม et al., 2007) รายงานจำนวนมากพบว่า แบ่งย่อยหลักมากที่สุดในสภาพแวดล้อมของดินแตกต่างกันบาร์นส์ et al. (2007) สำรวจดินตัวอย่างที่สองในนิวเม็กซิโกยูทาห์ และแสดงให้เห็นว่า แบ่งย่อย 4 และ 6 โดย 42.8% และ 45.6% ลำดับในยีน Acidobacteria 16S rRNA ไลบรารี Eichorst et al. (2011) พบว่า สัดส่วนอำเภอ 4 ลำดับคือ สูงสุดในดินเกษตรที่ประกอบด้วยคาร์บอนน้อยกว่าดินเนื้อปูนกราสแลนด์ ผลของเราแสดงให้เห็นว่า 6 อำเภอเป็นที่โดดเด่นที่สุดในดินเนื้อปูนภูเขา Shennongjia และความชุกของ 6 อำเภอสอดคล้องกับการศึกษาก่อนหน้านี้ (Eichorst et al., 2007 Hansel et al., 2008) Hoon สังข์และช่อ (2009) เปิดเผยว่า Acidobacterial อำเภอ 1 สามารถแจกจ่ายได้ทั่วโลก และได้ถูกบ่อย ๆ สังเกตที่ความอุดมสมบูรณ์สูงในสภาพแวดล้อมดิน บอกว่า อำเภอนี้อาจดีปรับสภาพแวดล้อมต่าง ๆ ของดิน ดังนั้น แบ่งย่อย Acidobacterial ของ 1, 4 และ 6 อาจเป็นกลุ่มโดดเด่นที่สุดในสภาพแวดล้อมดิน จุลินทรีย์หลากหลายรูปแบบพร้อมไล่ระดับสี elevational จะมีหัวข้อน่าสนใจมาก และยังคงแพร่หลายใน ecologists ตามที่พวกเขามีกฎพื้นฐานต้น biogeography จุลินทรีย์ (Martiny et al., 2011) ปัจจุบัน รายงานการศึกษาหลายรูปแบบยกระดับ acidobacterial ในระดับไฟลัม และแนวโน้มมีตัวแปร (Fierer et al., 2011 วัง et al., 2012) ในการศึกษานี้ เราพบแนวโน้มต่าง ๆ ในระดับอำเภอ และเป็นครั้งแรก การเพิ่ม ที่ได้รับการวิเคราะห์รูปแบบยกระดับอำเภอ สามแนวโน้มสำหรับสามารถสรุปรูปแบบ elevational Acidobacteria ระดับอำเภอ: อิทธิพลไม่สำคัญ (แบ่งย่อย 7 และ 10), หยุดลด (แบ่งย่อย 1, 2 และ 3) และเพิ่ม (แบ่งย่อย 4, 5, 6, 16 และ 17) ด้วยการเพิ่มความสูง รูปแบบระดับ acidobacterial จะถูกกำหนด โดยแนวโน้มต่าง ๆ ในรูปแบบ elevational อำเภอ ในดินที่มีสภาพแวดล้อม อำเภอโดดเด่นที่สุดเป็นตัวแปร ซึ่งนำไปสู่รูปแบบ elevational สำหรับ Acidobacteria ศึกษาต่อที่จำเป็นสำหรับการวิเคราะห์รูปแบบอำเภอ elevational ในdifferent soil environments. Based on the phylogenetic diversity and ecological distribution, Acidobacteria is expected to have a wide range of metabolic and genetic functions (Hugenholtz et al., 1998; Barns et al., 1999). Genomic evidence from cultured bacteria suggested that the role of Acidobacteria Subdivisions 1 and 3 in nitrogen cycling in soil and sediment is to facilitate the reduction of nitrate, nitrite, and possibly nitric oxide based on three complete genome sequences of isolates of “Solibacter usitatus”(Subdivision 3), “Korebacter versatilis”(Subdivision 1), and“Acidobacterium capsulatum”(Subdivision 1) (Ward et al., 2009).Eichorst et al. (2011)revealed that Subdivisions 1 and 3 have the potential to play an active role in the degradation of plant polymers in bulk soil and in utilization of sugars from plant root exudates at various concentrations in the rhizosphere. However, the ecological roles and metabolic activities of uncultured bacteria in the natural environment are still unknown, especially in soil (Lee et al., 2008). Soil enzymes, mainly from soil microorganisms, play a crucial role in maintaining nutrient cycling and can reflect the circumstances of biological metabolism and substance transformation in soil environments. Our results showed that different soil Acidobacteria subdivisions have various correlations with several key soil enzyme activities. Subdivisions 4, 5 and 6 are only correlated (P< 0.1) with amylase activity, which are hydrolytic enzymes that promote the decomposition of starch. Subdivisions 2, 3, 7 and 16 are correlated (P< 0.1) with the sucrase activity, which is an extracellular enzyme that catalyzes the hydrolysis of sucrose and fructose, and the increased activity of sucrase may be ascribed to the increased total organic carbon and soil fertility in soil (Ge et al., 2009). Therefore, soil Acidobacteria at the subdivision level may be involved in different ecosystem functions in global elemental cycles. Elevational patterns on mountainsides could be influenced by other environmental driving factors (Singh et al., 2012), and climatic and biotic factors may be the major drivers (Bryant et al., 2008; Rahbek, 2005). Soil pH is one of the key factors to influence Acidobacteria community composition and structure. Our studies showed that the responses of subdivisions to soil pH are different. Subdivisions 1, 2 and 3 are significantly positively correlated (P< 0.01) with soil pH, and the other subdivisions are significantly negatively correlated (P< 0.01) with soil pH, except for Subdivision 7. The previous studies also showed that soil pH is a strong indicator of Acidobacteria community composition (Yin et al., 2010). Sait et al. (2006) found that Subdivision 1 was strongly related to soil pH, and these bacteria appear to be numerically abundant in soils with pH below 6.Bryant et al. (2007)observed that Subdivision 4 was more abundant in arid soils, and was not detected in soils with pH of less than 4.0 (Barn et al., 1999). The abundance of Subdivisions 1, 2, 3, 12, and 13 was negatively correlated with pH, while Subdivisions 4, 6, 7, 10, 11, 16, 17, 18, 22 and 25 had positive correlations with pH (Jones et al., 2009; Lauber et al., 2009). In addition, multiple members of the Acidobacteria have been found to be abundant in alkaline soils (Dunbar et al., 1999, 2002). Plant communities can influence associated soil microbial communities through the types and amounts of carbon and nutrient inputs, and by changing temperature and water content of the soil (Myers et al., 2001; Waldrop and Firestone, 2004). Different plant species can be associated with different communities as evidenced by fatty acid (Myers et al., 2001), and physiological (Waldrop and Firestone, 2004) and DNA techniques (Kuske et al., 2002). Therefore, the different plant types along elevation gradient are an important factor in shaping the microbial elevation patterns. Recent studies showed that the Acidobacteria is in general oligotrophic. For example, the proportions of Acidobacteria were reported to be significantly lower in nutrient-rich rhizosphere soils than in bulk soils (Kielak et al., 2009), and were less abundant in more nutrient-rich agricultural soils (Lopez-Lozano et al., 2013). Eichorst et al. (2011) examined correlations between the percentages of Subdivision 4 with various edaphic properties and found that carbon availability appeared to be one of the factors influencing the Acidobacteria community composition. Our studies showed that Acidobacteria is significantly correlated with plant diversity.

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

3. คำอธิบาย
Acidobacteria เป็นหนึ่งในไฟลัมที่โดดเด่นมากที่สุดและอุดมสมบูรณ์ในดินและ 26 เขตการปกครองที่สำคัญได้รับการ definedbased ใน 16S rRNA ลำดับยีน (Barns et al., 2007) จำนวนมากรายงานแสดงให้เห็นว่าการปกครองที่โดดเด่นมากที่สุดในสภาพแวดล้อมที่แตกต่างกันของดิน different.Barns และคณะ (2007) สำรวจสองตัวอย่างดินในนิวเม็กซิโกและยูทาห์และแสดงให้เห็นว่าเขตการปกครอง 4 และ 6 ประกอบด้วย 42.8% และ 45.6% ของลำดับใน Acidobacteria 16S rRNA ห้องสมุดยีน Eichorst และคณะ (2011) พบว่าสัดส่วนของการแบ่งเป็น 4 ลำดับที่สูงที่สุดในดินทางการเกษตรที่มีคาร์บอนน้อยกว่าดินทุ่งหญ้า ผลของเราแสดงให้เห็นว่า 6 แบ่งเป็นส่วนใหญ่ที่โดดเด่นใน Shennongjia ดินภูเขาและความชุกของแผนก 6 มีความสอดคล้องกับการศึกษาก่อนหน้า (Eichorst, et al, 2007;.. ฮันเซลและคณะ, 2008) Sang-Hoon และ Cho (2009) เปิดเผยว่า Acidobacterial แบ่ง 1 จะได้รับการเผยแพร่ไปทั่วโลกและได้รับการสังเกตเห็นบ่อยครั้งที่ความอุดมสมบูรณ์สูงในสภาพแวดล้อมดินแสดงให้เห็นว่าการแบ่งนี้อาจจะมีการปรับตัวได้ดีกับสภาพแวดล้อมดินต่างๆ ดังนั้น Acidobacterial เขตการปกครองของ 1, 4, 6 และอาจจะเป็นกลุ่มที่โดดเด่นมากที่สุดในสภาพแวดล้อมของดิน รูปแบบความหลากหลายของจุลินทรีย์พร้อมการไล่ระดับสี elevational มีหัวข้อที่น่าสนใจมากและถกเถียงกันอย่างกว้างขวางสำหรับนักนิเวศวิทยาเช่นที่พวกเขาเป็นหนึ่งในกฎพื้นฐานพื้นฐานจุลินทรีย์ว (Martiny et al., 2011) ในปัจจุบันการศึกษาหลายรูปแบบสูง acidobacterial ในระดับไฟลัมที่ได้รับรายงานและแนวโน้มเป็นตัวแปร (Fierer et al, 2011;.. วังและคณะ, 2012) ในการศึกษานี้เราพบว่าแนวโน้มที่แตกต่างกันในระดับแผนกและนี่คือครั้งแรกที่เรารู้ว่ารูปแบบความสูงได้รับการวิเคราะห์ในระดับแผนก สามแนวโน้มรูปแบบ elevational Acidobacteria ในระดับแผนกสามารถสรุป: ไม่มีอิทธิพลอย่างมีนัยสำคัญ (เขตการปกครอง 7 และ 10) ลดลงน่าเบื่อ (1 เขตการปกครอง, 2 และ 3) และการเพิ่มขึ้น (เขตการปกครอง 4, 5, 6, 16 และ 17) ด้วย เพิ่มขึ้นในระดับความสูง รูปแบบสูง acidobacterial จะถูกกำหนดโดยแนวโน้มที่แตกต่างกันในรูปแบบ elevational แผนก ในสภาพแวดล้อมที่มีความหลากหลายของดิน, การแบ่งที่โดดเด่นที่สุดคือตัวแปรซึ่งนำไปสู่รูปแบบที่แตกต่างกันสำหรับ elevational Acidobacteria ศึกษาเพิ่มเติมเป็นสิ่งจำเป็นในการวิเคราะห์รูปแบบการแบ่ง elevational ใน
สภาพแวดล้อมที่แตกต่างกันของดิน บนพื้นฐานของความหลากหลายทางสายวิวัฒนาการและการจัดจำหน่ายระบบนิเวศ Acidobacteria คาดว่าจะมีความหลากหลายของการเผาผลาญอาหารและฟังก์ชั่นทางพันธุกรรม (Hugenholtz et al, 1998;.. Barns, et al, 1999) หลักฐานจากจีโนมแบคทีเรียที่เพาะเลี้ยงชี้ให้เห็นว่าบทบาทของเขตการปกครอง Acidobacteria 1 และ 3 ในการขี่จักรยานไนโตรเจนในดินและตะกอนดินคือการอำนวยความสะดวกในการลดไนเตรท, ไนไตรท์และไนตริกออกไซด์อาจจะขึ้นอยู่กับสามลำดับจีโนมที่สมบูรณ์ของสายพันธุ์ของ "Solibacter usitatus" ( แบ่ง 3), "Korebacter Versatilis" (แบ่ง 1) และ "Acidobacterium capsulatum" (แบ่ง 1) (วอร์ด et al., 2009) .Eichorst และคณะ (2011) เปิดเผยว่าเขตการปกครอง 1 และ 3 มีศักยภาพที่จะมีบทบาทที่สำคัญในการย่อยสลายของโพลิเมอร์พืชในดินจำนวนมากและในการใช้ประโยชน์ของน้ำตาลจากสารที่หลั่งรากพืชที่ระดับความเข้มข้นต่าง ๆ ในบริเวณราก อย่างไรก็ตามบทบาทของระบบนิเวศและกิจกรรมการเผาผลาญอาหารของแบคทีเรียที่ไม่มีมารยาทในสภาพแวดล้อมทางธรรมชาติที่ยังคงไม่เป็นที่รู้จักโดยเฉพาะอย่างยิ่งในดิน (Lee et al., 2008) เอนไซม์ดินส่วนใหญ่มาจากจุลินทรีย์ในดินมีบทบาทสำคัญในการรักษาและการขี่จักรยานสารอาหารที่สามารถสะท้อนให้เห็นถึงสถานการณ์ของการเผาผลาญอาหารและการเปลี่ยนแปลงทางชีวภาพสารในสภาพแวดล้อมของดิน ผลของเราแสดงให้เห็นว่าดินที่แตกต่างกันแบ่ง Acidobacteria มีความสัมพันธ์ต่างๆที่มีการทำงานของเอนไซม์ดินที่สำคัญหลาย เขตการปกครอง 4, 5 และ 6 มีความสัมพันธ์อย่างเดียว (p <0.1) ที่มีกิจกรรมอะไมเลสซึ่งเป็นเอนไซม์ที่ย่อยสลายที่ส่งเสริมการสลายตัวของแป้ง เขตการปกครอง 2, 3, 7 และ 16 มีความสัมพันธ์ (p <0.1) กับกิจกรรมซูเครสซึ่งเป็นเอนไซม์สารที่ย่อยสลายน้ำตาลซูโครสและฟรุกโตสและกิจกรรมที่เพิ่มขึ้นของซูเครสอาจจะกำหนดอินทรีย์คาร์บอนทั้งหมดที่เพิ่มขึ้นและ อุดมสมบูรณ์ของดินในดิน (Ge et al., 2009) ดังนั้นดิน Acidobacteria ในระดับแผนกอาจจะมีส่วนร่วมในการทำงานของระบบนิเวศที่แตกต่างกันในรอบธาตุทั่วโลก รูปแบบ Elevational บนเชิงเขาอาจจะได้รับอิทธิพลจากปัจจัยด้านสิ่งแวดล้อมอื่น ๆ และปัจจัยภูมิอากาศและสิ่งมีชีวิตอาจจะเป็นปัจจัยสำคัญ (ไบรอันท์และคณะ, 2008. Rahbek, 2005) (ซิงห์และคณะ, 2012.) pH ของดินเป็นหนึ่งในปัจจัยสำคัญที่มีอิทธิพลต่อองค์ประกอบชุมชน Acidobacteria และโครงสร้าง การศึกษาของเราแสดงให้เห็นว่าการตอบสนองของเขตการปกครองที่จะ pH ของดินมีความแตกต่าง เขตการปกครองที่ 1, 2 และ 3 จะมีความสัมพันธ์ทางบวกอย่างมีนัยสำคัญ (P <0.01) โดยมีค่า pH ของดินและเขตการปกครองอื่น ๆ ที่มีความสัมพันธ์ทางลบอย่างมีนัยสำคัญ (P <0.01) โดยมีค่า pH ของดินยกเว้นแบ่ง 7. ศึกษาก่อนหน้านี้ยังพบว่าค่า pH ของดินคือ ตัวบ่งชี้ที่แข็งแกร่งขององค์ประกอบชุมชน Acidobacteria (หยิน et al., 2010) Sait และคณะ (2006) พบว่าการแบ่ง 1 มีความสัมพันธ์อย่างยิ่งกับ pH ของดินและแบคทีเรียเหล่านี้ดูเหมือนจะเป็นตัวเลขที่อุดมสมบูรณ์ในดินที่มีค่า pH ต่ำกว่า 6.Bryant และคณะ (2007) พบว่าแบ่งเป็น 4 อีกมากมายในดินแห้งแล้งและไม่ได้ตรวจพบในดินที่มีค่า pH ต่ำกว่า 4.0 (ยุ้งข้าว et al., 1999) ความอุดมสมบูรณ์ของเขตการปกครอง 1, 2, 3, 12, และ 13 มีความสัมพันธ์เชิงลบกับค่า pH ในขณะที่เขตการปกครอง 4, 6, 7, 10, 11, 16, 17, 18, ​​22 และ 25 มีความสัมพันธ์เชิงบวกกับความเป็นกรดด่าง (โจนส์และคณะ .. 2009; Lauber et al, 2009) นอกจากนี้สมาชิกหลาย Acidobacteria ได้รับพบว่ามีความอุดมสมบูรณ์ในดินด่าง (ดันบาร์ et al., 1999, 2002) สังคมพืชจะมีผลต่อการเชื่อมโยงกลุ่มจุลินทรีย์ดินผ่านประเภทและปริมาณของปัจจัยการผลิตคาร์บอนและสารอาหารและการเปลี่ยนแปลงของอุณหภูมิและปริมาณน้ำของดิน (ไมเออร์, et al, 2001;. Waldrop และไฟร์สโตน, 2004) พันธุ์พืชที่แตกต่างกันสามารถเชื่อมโยงกับชุมชนที่แตกต่างกันเป็นหลักฐานโดยกรดไขมัน (ไมเออร์ et al., 2001) และทางสรีรวิทยา (Waldrop และไฟร์สโตน, 2004) และเทคนิคดีเอ็นเอ (Kuske et al., 2002) ดังนั้นชนิดพืชที่แตกต่างกันไปตามความลาดชันสูงเป็นปัจจัยสำคัญในการสร้างรูปแบบการยกระดับของจุลินทรีย์ การศึกษาล่าสุดแสดงให้เห็นว่า Acidobacteria อยู่ในทั่วไป oligotrophic ตัวอย่างเช่นสัดส่วนของ Acidobacteria ได้รับรายงานอย่างมีนัยสำคัญลดลงในดินบริเวณรากอุดมด้วยสารอาหารกว่าในกลุ่มดิน (Kielak et al., 2009) และมีน้อยมากในดินทางการเกษตรอื่น ๆ อุดมด้วยสารอาหาร (โลเปซซาโนและคณะ , 2013) Eichorst และคณะ (2011) การตรวจสอบความสัมพันธ์ระหว่างเปอร์เซ็นต์แบ่ง 4 ที่มีคุณสมบัติทางดินต่าง ๆ และพบว่าความพร้อมคาร์บอนที่ดูเหมือนจะเป็นหนึ่งในปัจจัยที่มีอิทธิพลต่อองค์ประกอบชุมชน Acidobacteria การศึกษาของเราแสดงให้เห็นว่า Acidobacteria มีความสัมพันธ์กับความหลากหลายของพืช

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

3 . การอภิปราย
acidobacteria เป็นหนึ่งของเด่นมากที่สุด และพบมากในดินและ 26 เขตการปกครองหลักได้รับ definedbased ในลำดับเบส 16S rRNA ยีน ( โรงนา et al . , 2007 ) เป็นจำนวนมากของรายงานที่แสดงให้เห็นว่าเขตการปกครองเด่นที่สุดในสภาพแวดล้อมของดินที่แตกต่างกันจะแตกต่างกัน อาทิ et al .( 2007 ) จำนวน 2 ตัวอย่างดินในเม็กซิโก และยูทาห์พบว่าเขตการปกครอง 4 และ 6 จำนวน 42.8 เท่า % ของลำดับเบส 16S rRNA ยีนใน acidobacteria ห้องสมุด eichorst et al . ( 2011 ) พบว่า สัดส่วนของการจัดสรร 4 ลำดับได้สูงสุดในด้านการเกษตรดินที่ประกอบด้วยคาร์บอนน้อยกว่าดินทุ่งหญ้าผลของเราแสดงให้เห็นว่าการจัดสรร 6 เป็นที่โดดเด่นมากที่สุดในดินภูเขา shennongjia และความชุกของการจัดสรร 6 สอดคล้องกับการศึกษาก่อนหน้านี้ ( eichorst et al . , 2007 ; Hansel et al . , 2008 ) ซังฮุน และ โช ( 2009 ) เปิดเผยว่า ฝ่าย acidobacterial 1 อาจจะกระจายทั่วโลกและมีบ่อยขึ้นสูงความอุดมสมบูรณ์ในสภาพแวดล้อมของดินระบุว่า กองนี้อาจจะปรับตัวได้ดีกับสภาพแวดล้อมต่าง ๆในดิน ดังนั้น การแบ่ง acidobacterial 1 , 4 , และ 6 อาจจะกลุ่มเด่นที่สุดในสิ่งแวดล้อม ดิน จุลินทรีย์หลากหลายรูปแบบตาม elevational ไล่เป็นหัวข้อถกเถียงกันอย่างกว้างขวาง และน่าสนใจมากสำหรับ ecologists ,เช่นที่พวกเขามีในกฎพื้นฐาน ( วจุลินทรีย์ ( มาร์ตินี่ et al . , 2011 ) ปัจจุบัน การศึกษาหลายในรูปแบบ acidobacterial ความสูงระดับไฟลัมได้รับรายงานและแนวโน้มคือตัวแปร ( ไฟเยอร์ et al . , 2011 ; Wang et al . , 2012 ) ในการศึกษาครั้งนี้เราพบแนวโน้มที่แตกต่างกันในระดับกอง และนี่เป็นครั้งแรก เพื่อความรู้ของเราที่เพิ่มลวดลายได้ถูกวิเคราะห์ในระดับกอง . 3 แนวโน้มรูปแบบ elevational acidobacteria ในระดับย่อยสามารถสรุปได้ : ไม่พบอิทธิพล ( เขตการปกครอง 7 และ 10 ) ลดลง น่าเบื่อ ( เขตการปกครองที่ 1 , 2 และ 3 ) และเพิ่ม ( เขตการปกครอง 4 , 5 , 6 , 16 และ 17 ) กับการเพิ่มขึ้นในระดับความสูงรูปแบบการ acidobacterial ถูกกำหนดโดยแนวโน้มต่าง ๆ ในกอง elevational รูปแบบ ในสภาพแวดล้อมดินหลากหลาย ย่านเด่นที่สุดคือ ตัวแปร ซึ่งจะนำไปสู่รูปแบบ elevational แตกต่างกัน acidobacteria . ต้องมีการศึกษาเพิ่มเติมอีก เพื่อวิเคราะห์รูปแบบในดินจัดสรร elevational
สภาพแวดล้อมแตกต่างกันบนพื้นฐานของความหลากหลายและการแพร่กระจายทางนิเวศวิทยา acidobacteria คาดว่าจะมีช่วงกว้างของฟังก์ชันการเผาผลาญอาหารและพันธุกรรม ( hugenholtz et al . , 1998 ; โรงนา et al . , 1999 ) พบหลักฐานจากการเพาะเชื้อแบคทีเรีย พบว่า บทบาทของ acidobacteria เขตการปกครองที่ 1 และ 3 ในไนโตรเจนจักรยานในดินและดินตะกอน เพื่ออำนวยความสะดวกในการลดไนเตรต ไนไตรท์และอาจไนตริกออกไซด์จากสามสมบูรณ์จีโนมลำดับของสายพันธุ์ของ " solibacter usitatus " ( แบ่ง 3 ) " korebacter versatilis " ( ฝ่าย 1 ) และ " acidobacterium capsulatum " ( ฝ่าย 1 ) ( Ward et al . , 2009 ) eichorst et al .( มหาชน ) เปิดเผยว่า เขตการปกครองที่ 1 และ 3 มีศักยภาพที่จะมีบทบาทในการเสื่อมสภาพของพอลิเมอร์ พืชที่ปลูกในกลุ่มและในการใช้น้ำตาลสารที่หลั่งจากรากพืชที่ความเข้มข้นต่าง ๆ ในเขต . อย่างไรก็ตาม บทบาททางนิเวศวิทยาและการสลายของแบคทีเรียต่างๆ ไร้การศึกษาในธรรมชาติยังไม่ทราบ โดยเฉพาะในดิน ( ลี et al . , 2008 )เอนไซม์จากจุลินทรีย์ดินส่วนใหญ่เป็นดินมีบทบาทสำคัญในการรักษาธาตุอาหารและสามารถสะท้อนสถานการณ์ของการเผาผลาญทางชีวภาพและสารการเปลี่ยนแปลงในสภาพแวดล้อมของดิน ผลของเราแสดงให้เห็นว่าแตกต่างดิน acidobacteria ส่วนย่อยมีความสัมพันธ์ต่าง ๆ มีหลายคีย์ดินเอนไซม์ต่างๆ เขตการปกครอง 4 , 5 และ 6 มีความสัมพันธ์ ( p < 01 ) มีกิจกรรมเอนไซม์อะไมเลส ซึ่งเป็นเอนไซม์ที่ช่วยย่อยสลายในการสลายตัวของแป้ง เขตการปกครอง 2 , 3 , 7 และ 16 มีความสัมพันธ์กัน ( P < 0.1 ) กับตรงกิจกรรมซึ่งเป็นเอนไซม์สำคัญที่กระตุ้นการย่อยสลายของซูโครสและฟรักโทส และเพิ่มกิจกรรมของซูเครส อาจถูก ascribed ไปเพิ่มปริมาณอินทรีย์คาร์บอน และความอุดมสมบูรณ์ของดินในดิน ( GE et al . ,2009 ) ดังนั้น acidobacteria ระดับดินจัดสรรอาจเกี่ยวข้องกับการทำงานของระบบนิเวศที่แตกต่างกันในรอบธาตุโลก รูปแบบ elevational ใน mountainsides อาจจะได้รับอิทธิพลจากปัจจัยสิ่งแวดล้อมขับรถอื่น ๆ ( Singh et al . , 2012 ) , และสภาพภูมิอากาศและปัจจัยทางชีวภาพอาจเป็นไดรเวอร์ที่สำคัญ ( Bryant et al . , 2008 ; rahbek , 2005 )ดินเป็นหนึ่งในปัจจัยที่มีอิทธิพลต่อองค์ประกอบชุมชน acidobacteria และโครงสร้าง จากการศึกษาของเราพบว่า การตอบสนองของเขตการปกครองในดินที่แตกต่างกัน เขตการปกครองที่ 1 , 2 และ 3 มีความสัมพันธ์ทางบวก ( p < 0.05 ) กับดินและเขตการปกครองอื่น ๆมีความสัมพันธ์ทางลบอย่างมีนัยสำคัญทางสถิติ ( P < 0.05 ) กับดิน ยกเว้นกอง 7การศึกษายังพบว่าดินเป็นตัวบ่งชี้ที่แข็งแกร่งขององค์ประกอบชุมชน acidobacteria ( หยิน et al . , 2010 ) sait et al . ( 2006 ) พบว่า ฝ่าย 1 เป็นอย่างยิ่งที่เกี่ยวข้องกับดิน และแบคทีเรียเหล่านี้ดูเหมือนจะเป็นตัวเลขดาษดื่นในดินที่มี pH ต่ำกว่า 6 . Bryant et al . ( 2007 ) พบว่า แบ่ง 4 มากขึ้นมากในดินแห้งและไม่ได้ถูกตรวจพบในดินที่มี pH น้อยกว่า 4.0 ( ยุ้งข้าว et al . , 1999 ) ความอุดมสมบูรณ์ของเขตการปกครองที่ 1 , 2 , 3 , 12 และ 13 มีความสัมพันธ์เชิงลบกับอ ในขณะที่ประชากร 4 , 6 , 7 , 10 , 11 , 16 , 17 , 18 , 22 และ 25 มีความสัมพันธ์ทางบวกกับ pH ( Jones et al . , 2009 ; เลาเบอร์ et al . , 2009 ) นอกจากนี้สมาชิกหลายคนของ acidobacteria ได้รับพบได้มากมายในดินด่าง ( ดันบาร์ et al . , 1999 , 2002 ) ชุมชนพืชสามารถมีอิทธิพลต่อความสัมพันธ์ของจุลินทรีย์ดินชุมชนผ่านชนิดและปริมาณของคาร์บอนและปัจจัยการผลิตสารอาหาร , และโดยการเปลี่ยนอุณหภูมิและปริมาณน้ำในดิน ( Myers et al . , 2001 ; วอลดร็อป และไฟร์สโตน , 2004 )พืชชนิดต่างๆ สามารถเชื่อมโยงกับชุมชนต่าง ๆเป็นหลักฐานโดยกรดไขมัน ( Myers et al . , 2001 ) และสรีรวิทยา ( วอลดร็อป และไฟร์สโตน , 2004 ) และเทคนิคดีเอ็นเอ ( kuske et al . , 2002 ) ดังนั้น พืชที่แตกต่างกันประเภทตามความสูงไล่ระดับเป็นปัจจัยสำคัญในการสร้างรูปแบบการเพิ่มจุลินทรีย์การศึกษาล่าสุดพบว่า acidobacteria โดยทั่วไปโอลิโกโทรฟิก . ตัวอย่างเช่น สัดส่วนของ acidobacteria มีลดลงในดินบริเวณรากพืช ในดินที่อุดมไปด้วยสารอาหารมากกว่าเป็นกลุ่ม ( kielak et al . , 2009 ) , และมากน้อยในสารอาหารมากขึ้นรวยเกษตรดิน ( โลเปซ โลซาโน่ et al . , 2013 ) eichorst et al .( 2011 ) ตรวจสอบความสัมพันธ์ระหว่างเปอร์เซ็นต์ของผู้ที่มีคุณสมบัติต่าง ๆ 4 ครั้งนี้ และพบว่า คาร์บอน พร้อมปรากฏเป็นหนึ่งในปัจจัยที่มีอิทธิพลต่อ acidobacteria ชุมชนองค์ประกอบ จากการศึกษาของเราพบว่า acidobacteria มีความสัมพันธ์กับความหลากหลายของพืช