Zwille), MID (middle) and PIWI doma

Zwille), MID (middle) and PIWI domains, the later being related
to RNase H (Carthew and Sontheimer, 2009; Meister, 2013;
Burroughs et al., 2014). Some AGO-Piwi polypeptides function as
sRNA-guided endonucleases that cleave complementary transcripts,
whereas others lack endonucleolytic activity and may be
part of complexes involved in non-degradative RNAi mechanisms
such as translation repression (Cerutti and Casas-Mollano, 2006;
Carthew and Sontheimer, 2009; Meister, 2013; Rogers and Chen,
2013). In certain species, RDRs also play an important role in RNAi,
either by producing an initiating dsRNA trigger from singlestranded
transcripts or by enhancing the RNAi response through
amplification of the sRNA amount (Cerutti and Casas-Mollano,
2006; Burroughs et al., 2014).
The presence of Dicer, AGO-Piwi, and RDR polypeptides was
examined in the 14 microalgae with sequenced genomes belonging
to the Archaeplastida supergroup (Table 1). As previously reported
(Cerutti and Casas-Mollano, 2006; Cerutti et al., 2011), core RNAi
machinery components seem to be entirely absent from several
algae with small nuclear genomes such as the red algae C. merolae
and G. sulphuraria and the green algae O. lucimarinus, Ostreococcus
tauri, B. prasinos, and M. pusilla CCMP1545 (Table 1). Micromonas
sp. RCC299 appears to code for an AGO-Piwi related protein
(Table 1). Yet, the corresponding gene is located in a region of
the genome with no detectable homology to the closely related
M. pusilla CCMP1545 (data not shown) and it is no clear if the
encoded protein is actually functional. These observations are consistent
with the hypothesis that the RNAi machinery appeared
early during eukaryotic evolution and it has been lost independently
in multiple lineages (Cerutti and Casas-Mollano, 2006;
Cerutti et al., 2011). As a consequence, RNAi machinery components
are present in algal species of each of the Glaucophyta,
Rhodophyta, and Chlorophyta clades but with patchy distribution
(Table 1).
AGO-Piwi proteins can often be identified in microalgae that
also contain Dicer-like proteins (Table 1) and the domain organization
of AGO-Piwi polypeptides has been well conserved in these
species (Fig. 4). In contrast, the multidomain structure of the Dicer
enzymes of higher eukaryotes is not well maintained among protists
(Cerutti and Casas-Mollano, 2006) and an RNaseIII motif
might be all that is strictly required for function (Cerutti and
Casas-Mollano, 2006; Patrick et al., 2009). RDR related proteins
are structurally conserved but, consistent with an ancillary role
in typical RNAi (Cerutti and Casas-Mollano, 2006), they appear to
have a fairly limited taxonomic distribution among the examined
microalgae (Table 1). Intriguingly, the glaucophyte C. paradoxa only
seems to contain an RDR protein but its incomplete genome prevents
a definitive assessment of the RNAi machinery components.
Conversely, the red alga Porphyridium purpureum and, possibly, the
green alga C. subellipsoidea encode all three core components of the
RNAi machinery (Table 1), although the putative Coccomyxa Dicer
is highly diverged (data not shown). In addition, AGO-Piwi encoding
genes have undergone duplication in several microalgae
(Fig. 4), perhaps associated with diversification of functions as
reported in land plants and metazoans (Casas-Mollano et al.,
2008; Ghildiyal and Zamore, 2009; Meister, 2013).
In many eukaryotes, at least two major classes of small RNAs
have been recognized: microRNAs (miRNAs) and small interfering
RNAs (siRNAs) (Bartel, 2009; Ghildiyal and Zamore, 2009; Axtell,
2013; Rogers and Chen, 2013). MicroRNAs often modulate gene
expression and originate from endogenous, single-stranded noncoding
RNA transcripts or introns that fold into imperfect hairpin
structures (Bartel, 2009; Ghildiyal and Zamore, 2009; Axtell,
2013; Rogers and Chen, 2013). siRNAs are produced from long,
near-perfect complementarity dsRNAs of diverse origins (including
dsRNAs experimentally introduced into cells) and play various roles
in post-transcriptional regulation of gene expression, suppression

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

Zwille), กลาง (กลาง) และโด เมน PIWI การต่อกำลังที่เกี่ยวข้องกับ RNase H (Carthew และ Sontheimer, 2009 Meister, 2013Burroughs et al., 2014) เปปไทด์บาง Piwi ที่ผ่านมาทำงานเป็นendonucleases แนะนำ sRNA ที่ cleave เสริมใบแสดงผลในขณะที่คนอื่นขาดกิจกรรม endonucleolytic และอาจส่วนหนึ่งของสิ่งอำนวยความสะดวกที่เกี่ยวข้องกับกลไกการ RNAi ไม่ degradativeเช่นปราบปรามแปล (Cerutti และ Mollano Casas, 2006Carthew และ Sontheimer, 2009 Meister, 2013 โรเจอร์สและเฉิน2013) ในบางชนิด RDRs ยังมีบทบาทสำคัญใน RNAiการผลิตการทริก dsRNA initiating จาก singlestrandedใบแสดงผลหรือ โดยการเพิ่มการตอบสนองของ RNAi ผ่านขยายจำนวน sRNA (Cerutti และ Casas Mollanoปี 2006 Burroughs et al., 2014)การสถิตอยู่ของเปปไทด์ Dicer, Piwi ที่ผ่านมา และ RDRตรวจสอบใน 14 microalgae กับ genomes ตามลำดับของการ supergroup Archaeplastida (ตารางที่ 1) รายงานว่า ก่อนหน้านี้(Cerutti และ Mollano Casas, 2006 Cerutti et al., 2011), หลัก RNAiเครื่องจักรส่วนประกอบดูเหมือนจะขาดงานทั้งหมดจากหลายสาหร่ายกับ genomes นิวเคลียร์ขนาดเล็กเช่น merolae สาหร่ายแดง C.และ sulphuraria กรัมและเขียวสาหร่ายโอ lucimarinus, Ostreococcustauri เกิด prasinos และ M. pusilla CCMP1545 (ตารางที่ 1) Micromonassp. RCC299 ปรากฏรหัสสำหรับ Piwi ที่ผ่านมาเป็นโปรตีนที่เกี่ยวข้อง(ตาราง 1) ยัง มียีนที่เกี่ยวข้องอยู่ในขอบเขตของจีโนม มี homology ไม่สามารถไปเกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดม. pusilla CCMP1545 (ไม่ได้แสดงข้อมูล) และถ้าไม่ชัดเจนการโปรตีนเข้าทำงานจริงได้ ข้อสังเกตเหล่านี้จะสอดคล้องกันมีทฤษฏีที่ปรากฏเครื่องจักร RNAiช่วงระหว่างวิวัฒนาการ eukaryotic และหายได้อย่างอิสระในหลายเชื้อชาติ (Cerutti และ Mollano Casas, 2006Cerutti et al., 2011) เป็นสัจจะ ส่วนประกอบเครื่องจักร RNAiอยู่ในสปีชีส์ algal Glaucophyta แต่ละRhodophyta และ Chlorophyta clades แต่กระจายรำลึก(ตาราง 1)โปรตีน Piwi ที่ผ่านมามักจะถูกระบุไว้ใน microalgae ที่ประกอบด้วยโปรตีนเหมือน Dicer (ตาราง 1) และองค์กรโดเมนของเปปไทด์ Piwi ที่ผ่านมามีได้ดีอยู่ในนี้พันธุ์ (Fig. 4) ในทางตรงข้าม โครงสร้างของ Dicer ที่ multidomainเอนไซม์ของ eukaryotes สูงเป็นอับระหว่าง protists(Cerutti และ Casas Mollano, 2006) และมีแปลน RNaseIIIอาจจะทั้งหมดที่จำเป็นอย่างเคร่งครัดสำหรับฟังก์ชัน (Cerutti และMollano Casas, 2006 Patrick et al., 2009) RDR ที่เกี่ยวข้องกับโปรตีนstructurally นำ แต่ สอดคล้องกับบทบาทพิเศษใน RNAi ทั่วไป (Cerutti และ Casas Mollano, 2006), พวกเขาจะมีการกระจายอนุกรมวิธานค่อนข้างจำกัดในการกล่าวถึงmicroalgae (ตาราง 1) Intriguingly, glaucophyte C. paradoxa เท่านั้นดูเหมือนว่า จะประกอบด้วยโปรตีนเป็น RDR แต่กลุ่มไม่สมบูรณ์ทำให้ประเมินทั่วไปส่วนประกอบเครื่องจักร RNAiในทางกลับกัน สีแดง alga Porphyridium purpureum และ อาจ จะ การกรี alga C. subellipsoidea เข้ารหัสส่วนประกอบหลักสามทั้งหมดของการเครื่องจักร RNAi (ตาราง 1), แม้ว่า putative Coccomyxa Dicerdiverged สูง (ข้อมูลไม่แสดง) นอกจากนี้ การเข้ารหัสที่ผ่านมา-Piwiยีนมีระดับซ้ำในหลาย microalgae(Fig. 4), อาจจะเกี่ยวข้องกับวิสาหกิจของฟังก์ชันเป็นในดินพืชและ metazoans (Casas Mollano et al.,2008 Ghildiyal และ Zamore, 2009 Meister, 2013)ในหลาย eukaryotes, RNAs เล็กน้อยสองประเภทที่สำคัญได้รับรู้: microRNAs (miRNAs) และขนาดเล็กรบกวนRNAs (siRNAs) (Bartel, 2009 Ghildiyal และ Zamore, 2009 Axtell2013 โรเจอร์สและเฉิน 2013) MicroRNAs มัก modulate ยีนนิพจน์ และมาจาก endogenous เดี่ยวควั่น noncodingใบแสดงผลอาร์เอ็นเอหรือ introns ที่พับเป็นกิ๊บไม่สมบูรณ์โครงสร้าง (Bartel, 2009 Ghildiyal และ Zamore, 2009 Axtell2013 โรเจอร์สและเฉิน 2013) siRNAs ผลิตจากยาวdsRNAs complementarity ใกล้สมบูรณ์ (รวมถึงต้นกำเนิดที่หลากหลายdsRNAs experimentally นำเข้าสู่เซลล์) และบทบาทต่าง ๆในการควบคุมของยีน ปราบปราม post-transcriptional

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

Zwille), กลาง (กลาง) และโดเมน Piwi, ต่อมาถูกที่เกี่ยวข้อง
เพื่อ RNase H (CARTHEW และ Sontheimer 2009; เตอร์, 2013;
. โรห์, et al, 2014) บาง polypeptides Ago-Piwi ทำงานเป็น
endonucleases sRNA แนะนำที่ตัดจิตบำบัดเสริม
ขณะที่คนอื่นขาดกิจกรรม endonucleolytic และอาจเป็น
ส่วนหนึ่งของการมีส่วนร่วมในคอมเพล็กซ์ที่ไม่ย่อยสลายกลไก RNAi
เช่นการปราบปรามการแปล (Cerutti และ Casas-Mollano 2006;
CARTHEW และ Sontheimer 2009; เตอร์, 2013; โรเจอร์สและ Chen,
2013) ในบางชนิด, RDRs ยังมีบทบาทสำคัญในการ RNAi,
อย่างใดอย่างหนึ่งโดยการผลิตเริ่มต้นทริกเกอร์ dsRNA จาก singlestranded
จิตบำบัดหรือโดยการเพิ่มการตอบสนอง RNAi ผ่าน
เครื่องขยายเสียงของจำนวนเงินที่น่า (Cerutti และ Casas-Mollano,
2006. โรห์, et al, 2014 ).
การปรากฏตัวของ Dicer, Ago-Piwi และ polypeptides RDR ได้รับการ
ตรวจสอบใน 14 สาหร่ายที่มีจีโนมติดใจอยู่
กับ Archaeplastida หินใหญ่ (ตารางที่ 1) ตามที่รายงานก่อนหน้านี้
(Cerutti และ Casas-Mollano 2006;. Cerutti et al, 2011) แกน RNAi
ส่วนประกอบเครื่องจักรที่ดูเหมือนจะขาดจากกันอย่างสิ้นเชิงหลาย
สาหร่ายที่มีจีโนมของนิวเคลียร์ขนาดเล็กเช่นสาหร่ายสีแดง C. merolae
กรัมและ sulphuraria และ สาหร่ายสีเขียวแกมทุม lucimarinus, Ostreococcus
Tauri บี Prasinos และ M. pusilla CCMP1545 (ตารางที่ 1) Micromonas
SP RCC299 ปรากฏโค้ดสำหรับ Ago-Piwi โปรตีนที่เกี่ยวข้อง
(ตารางที่ 1) แต่การแสดงออกของยีนที่เกี่ยวข้องตั้งอยู่ในภาคกลางของ
จีโนมที่ไม่มีที่คล้ายคลึงกันที่ตรวจพบจะเกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิด
M. pusilla CCMP1545 (ไม่ได้แสดงข้อมูล) และมันก็ไม่ชัดเจนว่า
โปรตีนเข้ารหัสทำงานจริง ข้อสังเกตเหล่านี้มีความสอดคล้อง
กับสมมติฐานที่ว่าเครื่องจักร RNAi ปรากฏ
ในช่วงต้นยูคาริโอวิวัฒนาการและได้รับการสูญเสียความเป็นอิสระ
ใน lineages หลาย (Cerutti และ Casas-Mollano 2006;
. Cerutti et al, 2011) เป็นผลให้ RNAi ส่วนประกอบเครื่องจักร
ที่มีอยู่ในสาหร่ายสายพันธุ์ของแต่ละ Glaucophyta,
Rhodophyta และ clades Chlorophyta แต่มีการกระจายเป็นหย่อม
(ตารางที่ 1).
โปรตีน Ago-Piwi มักจะสามารถระบุได้ในสาหร่ายที่
ยังมีโปรตีน Dicer เหมือน ( ตารางที่ 1) และองค์กรโดเมน
ของ polypeptides Ago-Piwi ได้รับการอนุรักษ์เป็นอย่างดีในเหล่านี้
สายพันธุ์ (รูปที่ 4). ในทางตรงกันข้ามโครงสร้าง multidomain ของ Dicer
เอนไซม์ของยูคาริโอที่สูงขึ้นจะไม่รักษากันดีในหมู่ protists
(Cerutti และ Casas-Mollano 2006) และบรรทัดฐาน RNaseIII
อาจจะมีสิ่งที่จำเป็นอย่างเคร่งครัดสำหรับฟังก์ชั่น (Cerutti และ
Casas-Mollano, 2006; แพทริค et al., 2009) RDR โปรตีนที่เกี่ยวข้องกับ
ป่าสงวน แต่โครงสร้างให้สอดคล้องกับบทบาทเสริม
ใน RNAi ทั่วไป (Cerutti และ Casas-Mollano, 2006) พวกเขาดูเหมือนจะ
มีการกระจายอนุกรมวิธานค่อนข้าง จำกัด อยู่ในหมู่ผู้ตรวจสอบ
สาหร่าย (ตารางที่ 1) น่าประหลาดใจ glaucophyte C. paradoxa เท่านั้น
ดูเหมือนว่าจะมีโปรตีน RDR แต่จีโนมที่ไม่สมบูรณ์ของป้องกันไม่ให้
การประเมินที่ชัดเจนของชิ้นส่วนเครื่องจักร RNAi.
ตรงกันข้ามสาหร่ายสีแดง purpureum Porphyridium และอาจ
สาหร่ายสีเขียว C. subellipsoidea เข้ารหัสทั้งสามองค์ประกอบหลัก ของ
เครื่องจักร RNAi (ตารางที่ 1) แม้ว่าสมมุติ Coccomyxa Dicer
ถูกแยกออกอย่างมาก (ไม่ได้แสดงข้อมูล) นอกจากนี้ที่ผ่านมา-Piwi เข้ารหัส
ยีนได้เกิดการซ้ำซ้อนในหลายสาหร่าย
(รูปที่ 4.) ที่เกี่ยวข้องอาจจะมีความหลากหลายของฟังก์ชั่นเป็น
รายงานในพืชบกและ metazoans (Casas-Mollano, et al.
2008; Ghildiyal และ Zamore 2009; เตอร์ ., 2013)
ในยูคาริโอหลายอย่างน้อยสองชั้นที่สำคัญของ RNAs ขนาดเล็ก
ได้รับการยอมรับ: microRNAs (miRNAs) และเล็ก ๆ รบกวน
RNAs (siRNAs) (Bartel 2009; Ghildiyal และ Zamore 2009; Axtell,
2013; โรเจอร์สและเฉิน 2013) microRNAs มักจะปรับเปลี่ยนยีน
การแสดงออกและการมาจากภายนอก noncoding เดียวควั่น
จิตบำบัด RNA หรือ introns ที่พับเป็นกิ๊บไม่สมบูรณ์
โครงสร้าง (Bartel 2009; Ghildiyal และ Zamore 2009; Axtell,
2013; โรเจอร์สและ Chen, 2013) siRNAs ผลิตจากนาน
complementarity ใกล้สมบูรณ์ dsRNAs ของต้นกำเนิดที่แตกต่างกัน (รวมถึง
dsRNAs แนะนำทดลองเข้าสู่เซลล์) และเล่นหลายบทบาท
ในการควบคุมการโพสต์การถอดรหัสการแสดงออกของยีนปราบปราม

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

zwille ) , กลาง ( กลาง ) และ piwi โดเมนใหม่ที่เกี่ยวข้องกับเลส
H ( คาร์ทิว และ sontheimer , 2009 ; Meister , 2013 ;
Burroughs et al . , 2010 ) บางชนิดแล้ว piwi ฟังก์ชันเป็นสรณะแนวทางสงบเงียบที่ตัดเก็บไว้

" ในขณะที่คนอื่น ๆ การขาดกิจกรรม endonucleolytic และอาจจะมีส่วนเกี่ยวข้องในไม่ซับซ้อน

degradative หากลไกเช่น การแปลและ mollano Cerutti Casas , 2006 ;
คาร์ทิว และ sontheimer , 2009 ; Meister , 2013 ; โรเจอร์ และเฉิน
2013 ) ในบางชนิด rdrs มีบทบาทสำคัญหา
โดยผลิต , การกระตุ้นจาก singlestranded
transcripts dsRNA หรือโดยการตอบสนองผ่าน
( หาของเซอร์น่าจํานวน ( และ mollano
Cerutti Casas , 2006 ;โรห์ et al . , 2010 ) .
มีพระจริยวัตรที่แล้ว piwi , และ rdr โปรตีนคือ
ตรวจสอบใน Server กับลำดับเบสจีโนมของ 14
กับแคพลาสติดา supergroup ( ตารางที่ 1 ) ตามที่รายงานก่อนหน้านี้
( เซรุตติ และ mollano Casas , 2006 ; Cerutti et al . , 2011 ) , แกนหา
เครื่องจักรส่วนประกอบดูเหมือนจะทั้งหมดไม่อยู่จากสาหร่ายหลาย
กับจีโนมนิวเคลียร์ขนาดเล็ก เช่น สาหร่ายสีแดง Cmerolae
G sulphuraria และสาหร่ายสีเขียว lucimarinus ostreococcus O ,
tauri พ. prasinos และม. pusilla ccmp1545 ( ตารางที่ 1 ) micromonas
sp . rcc299 ปรากฏรหัสสำหรับที่ผ่านมา piwi โปรตีนเกี่ยวข้องกับ
( ตารางที่ 1 ) แต่ ยีน ซึ่งตั้งอยู่ในเขตของ
จีโนมกับยังไม่พบตัวที่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิด
M pusilla ccmp1545 ( ข้อมูลไม่แสดง ) และมันไม่เคลียร์ถ้า
เข้ารหัสโปรตีนเป็นหน้าที่ ข้อสังเกตเหล่านี้สอดคล้องกับสมมติฐานที่หา

แรกปรากฏในเครื่องจักรและวิวัฒนาการเข้ามาได้สูญหายไปอย่างอิสระ
หลายเผ่าพันธุ์ ( และ mollano Cerutti Casas , 2006 ;
Cerutti et al . , 2011 ) ผลที่ตามมา , หาส่วนประกอบเครื่องจักร
มีอยู่ในสาหร่ายชนิดของแต่ละ glaucophyta
โรโดไฟตา , ,คลอโรไฟตา clades และแต่กับ
กระจายเป็นหย่อมๆ ( ตารางที่ 1 ) .
แล้ว piwi โปรตีนมักจะสามารถระบุได้ในสาหร่ายขนาดเล็กที่
ยังมีพระจริยวัตรเหมือนโปรตีน ( ตารางที่ 1 ) และโดเมนขององค์กร
ที่แล้ว piwi โปรตีนได้รับการอนุรักษ์ในสายพันธุ์เหล่านี้
( รูปที่ 4 ) ในทางตรงกันข้าม , โครงสร้าง multidomain แห่งพระจริยวัตร
เอนไซม์ของยูแคริโอตที่สูงไม่ได้เป็นอย่างดีในหมู่โพรทิสต์
( เซรุตติ และ mollano Casas , 2006 ) และ rnaseiii แม่ลาย
อาจจะทั้งหมดที่จำเป็นอย่างเคร่งครัดสำหรับฟังก์ชัน ( Cerutti และ
mollano Casas , 2006 ; แพทริค et al . , 2009 ) โปรตีนที่เกี่ยวข้องกับโครงสร้าง rdr
อนุรักษ์ แต่สอดคล้องกับการเสริมบทบาท
ในทั่วไป ( Cerutti RNAi และ mollano Casas , 2006 ) พวกเขาปรากฏ
มีค่อนข้างจำกัดและการกระจายระหว่างการตรวจสอบ
สาหร่ายขนาดเล็ก ( ตารางที่ 1 ) ฟังดู glaucophyte C ,
แต่ดูเหมือนว่ามีพาราด็ ซา rdr โปรตีนแต่มันไม่สมบูรณ์ ( ป้องกัน
การประเมินที่ชัดเจนของ RNAi เครื่องจักรส่วนประกอบ
ในทางกลับกัน porphyridium สาหร่ายสีแดง 3 และอาจ
สีเขียวสาหร่าย C subellipsoidea เข้ารหัสทั้งสามองค์ประกอบหลักของ
RNAi เครื่องจักร ( ตารางที่ 1 ) , ถึงแม้ว่า ซึ่ง coccomyxa
ไดเซอร์ขอแยกออก ( ข้อมูลไม่แสดง ) นอกจากนี้ ที่ผ่านมา piwi การเข้ารหัสยีนได้รับการทำซ้ำในหลาย ๆ

( รูปที่ 4 ) คาดว่าอาจจะเกี่ยวข้องกับความหลากหลายของฟังก์ชั่น
รายงานในพืชที่ดินและ metazoans ( Casas mollano et al . ,
2008 ; และ ghildiyal zamore , 2009 ; Meister , 2013 ) .
ในหลายยูแคริโอต อย่างน้อยสองคลาส หลักของ RNAs ขนาดเล็ก
ได้รับการยอมรับ :micrornas ( mirnas ) และเล็กยุ่ง
RNAs ( sirnas ) ( บาร์เทิล , 2009 ; และ ghildiyal zamore , 2009 ; แอกซ์เทลล์
, 2013 ; โรเจอร์ และ เฉิน , 2013 ) micrornas มักจะผันยีน
การแสดงออกและมาจากภายนอกเดียวควั่น RNA transcripts noncoding
หรือ introns ที่พับเป็นโครงสร้างที่กิ๊บ
ไม่สมบูรณ์ ( บาร์เทิล , 2009 ; และ ghildiyal zamore , 2009 ; แอกซ์เทลล์
, 2013 ; โรเจอร์ และ เฉิน , 2013 )sirnas ผลิตจากนาน
ใกล้สมบูรณ์ dsrnas complementarity ของต้นกำเนิดที่หลากหลาย ( รวมถึง
dsrnas เพื่อนำเข้าสู่เซลล์ ) และเล่นหลายบทบาท
ในกระทู้ลองการควบคุมการแสดงออกของยีน , การปราบปราม