Variation of RAPD loci
Among the primers tested, OPA01, OPA02, OPA03, OPA4, OPA6, OPAF04, OPAF12 and OPAS18 gave non-reproducible amplification products and were therefore excluded from the analysis. The remaining eight selected primers showed reliable banding patterns and generated a total of 204 consistent and differential amplification products, ranging in size from 170 to 990 bp. Each primer amplified between 15 (OPA10) and 30 (OPA19) fragments, with a mean number of scored bands per primer of 25.5 (Table 2). Almost all these bands were polymorphic, being monomorphic only three, OPA10-4, OPA12-1 and OPA19-1. Many of the bands were fixed at the population level, and several even at the subspecific level (16 within subsp.moggridgei and 4 within var. burnatii). Five bands were unique to a single population: OPA05-19, OPA05-30, OPA05-21 and OPA09-27 in GAL, OPA05-22 in ROS. All bands fulfilled the Lynch and Milligan criterion [14], and were therefore included in further analyses. No band pair showed any correlation with any other, as indicated by Spearman's rho correlation coefficients (data not showed). Therefore, each of the 201 polymorphic bands was considered as an independent locus
รูปแบบของ loci อาร์เอพีดีระหว่างไพรเมอร์ที่ทดสอบ OPA01, OPA02, OPA03, OPA4, OPA6, OPAF04, OPAF12 และ OPAS18 ให้ไม่จำลองขยายผลิตภัณฑ์ และถูกแยกออกจากการวิเคราะห์ดังนั้น เหลือแปดเลือกไพรเมอร์ที่แสดงให้เห็นรูปแบบ banding ที่เชื่อถือได้ และสร้างขึ้นทั้งหมดของผลิตภัณฑ์อย่างสม่ำเสมอ และส่วนขยาย 204 ตั้งแต่ขนาด 170 990 bp แต่ละพื้นที่ขยายระหว่าง 15 (OPA10) และ 30 (OPA19) การกระจายตัว มีจำนวนเฉลี่ยของวงคะแนนต่อรองพื้นของ 25.5 (ตาราง 2) วงเหล่านี้เกือบทั้งหมดมี polymorphic เป็น monomorphic เท่า 3, OPA10-4, OPA12-1 และ OPA19-1 หลายวงการอยู่คงที่ระดับประชากร และหลายแม้ในระดับ subspecific (16 ภายใน subsp.moggridgei) และ 4 ภายใน burnatii เพียง วงที่ห้าได้เฉพาะประชากรเดียว: OPA05-19, OPA05 30, OPA05-21 และ 27 OPA09 ใน GAL, OPA05-22 ใน ROS วงดนตรีทั้งหมดปฏิบัติตามเกณฑ์ Lynch และ Milligan [14], และรวมอยู่ในการวิเคราะห์เพิ่มเติมดังนั้น วงคู่ไม่พบความสัมพันธ์ใด ๆ กับอื่น ๆ ตามที่ระบุ โดยค่าสัมประสิทธิ์สหสัมพันธ์ครอของ Spearman (ไม่พบข้อมูล) ดังนั้น แต่ละวง polymorphic 201 ถูกถือว่าเป็นโลกัสโพลเป็นอิสระ
การแปล กรุณารอสักครู่..
การเปลี่ยนแปลงของตำแหน่ง RAPD
ท่ามกลางไพรเมอร์ที่ผ่านการทดสอบ, OPA01, OPA02, OPA03, OPA4, OPA6, OPAF04, OPAF12 และ OPAS18 ให้ขยายผลิตภัณฑ์ที่ไม่สามารถทำซ้ำและจึงได้รับการยกเว้นจากการวิเคราะห์ ส่วนที่เหลืออีกแปดไพรเมอร์ที่เลือกแสดงให้เห็นรูปแบบที่น่าเชื่อถือและสร้างแถบทั้งหมด 204 สอดคล้องและผลิตภัณฑ์เครื่องขยายเสียงที่แตกต่างกันตั้งแต่ขนาด 170-990 bp ไพรเมอร์แต่ละขยายระหว่าง 15 (OPA10) และ 30 (OPA19) ชิ้นส่วนที่มีจำนวนเฉลี่ยของวงดนตรีที่ทำคะแนนต่อไพรเมอร์ 25.5 (ตารางที่ 2) เกือบทุกวงดนตรีเหล่านี้เป็น polymorphic เป็น monomorphic เพียงสาม OPA10-4, OPA12-1 และ OPA19-1 หลายวงได้รับการแก้ไขในระดับประชากรและหลายแม้ในระดับ subspecific นี้ (16 ภายใน subsp.moggridgei และ 4 ภายใน var. burnatii) ห้าวงดนตรีที่เป็นเอกลักษณ์ให้กับประชากรเดียว: OPA05-19, OPA05-30, OPA05-21 และ OPA09-27 ใน GAL, OPA05-22 ใน ROS วงดนตรีทั้งหมดปฏิบัติตามเกณฑ์ลินช์และมัลลิแกน [14] และถูกรวมอยู่ดังนั้นในการวิเคราะห์ต่อไป คู่ไม่มีวงมีความสัมพันธ์ใด ๆ กับการอื่น ๆ ตามที่ระบุโดยค่าสัมประสิทธิ์สหสัมพันธ์โรสเปียร์แมน (ข้อมูลที่ไม่ได้แสดงให้เห็น) ดังนั้นแต่ละ 201 วงดนตรีที่ได้รับการพิจารณา polymorphic เป็นสถานที่ที่เป็นอิสระ
การแปล กรุณารอสักครู่..
การเปลี่ยนแปลงของ RAPD ตามลำดับ
ระหว่างชนิดทดสอบ opa01 opa02 opa03 opa4 , , , , opaf04 opa6 , และ , opaf12 opas18 ให้ผลิตภัณฑ์ ( ไม่ ) และจึงแยกออกจากการวิเคราะห์ ที่เหลือเลือกไพรเมอร์ พบได้แถบลวดลายและสร้างทั้งหมด 204 ที่สอดคล้องกันและค่าผลิตภัณฑ์ขยายขนาดตั้งแต่ 170 ถึง 990 BP .ไพรเมอร์เบสแต่ละระหว่าง 15 ( opa10 ) และ 30 ( opa19 ) เศษ กับหมายถึงจำนวนคะแนนวงต่อรองพื้นของ 25.5 ( ตารางที่ 2 ) เกือบทุกวงเหล่านี้มีจำนวนการ monomorphic เพียงสาม opa10-4 opa12-1 opa19-1 , และ . หลายวงได้รับการแก้ไขในระดับประชากรและหลายแม้ในระดับซึ่งเป็นชนิดย่อย ( 16 ) และภายใน subsp.moggridgei 4 ภายใน burnatii )5 วง เป็นเฉพาะกับประชากรเดียว : opa05-19 opa05-30 opa05-21 opa09-27 ใน , และ , สาว , opa05-22 ในดอกกุหลาบ ทุกวง ปฏิบัติตาม ลินช์ และ มิลลิแกนเกณฑ์ [ 14 ] , และดังนั้นจึงรวมอยู่ในการวิเคราะห์ต่อไป ไม่มีวงดนตรีใด ๆคู่มีความสัมพันธ์กับ อื่น ๆ , ตามที่ระบุโดยการใช้ค่าสัมประสิทธิ์สหสัมพันธ์ ( โรข้อมูลไม่พบ ) ดังนั้นแต่ละ 201 เกิดแถบดีเอ็นเอถูกถือเป็น
-
อิสระ
การแปล กรุณารอสักครู่..