The key features of AliView include

The key features of AliView include the ability to swiftly handle large alignments with low memory impact (see Table 1 for comparison with other popular free cross-platform alignment viewers). AliView loads large alignment files 2–14 times faster and demands less than half of the memory resources than comparable alignment editors (Table 1; Supplementary Table S1A–C). AliView will read unlimited size alignment files in FASTA, Phylip, Nexus, Clustal and MSF-format (Table 2). This works through an indexing process where the sequences in the file initially are indexed and only cached in memory when viewed. Aside from the built-in indexing of large files, the program also reads and saves Fasta index files (.fai) as implemented by Samtools (Li et al., 2009). The program either reads the whole alignment into memory or leaves parts on file, depending on memory resources available on the specific computer. This way any alignment file can be opened regardless of the memory resources of the computer.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

คุณสมบัติที่สำคัญของ AliView มีความสามารถในการจัดการจัดแนวขนาดใหญ่ มีหน่วยความจำที่ต่ำอย่างรวดเร็วผลกระทบ (ดูตารางที่ 1 เปรียบเทียบกับผู้ชมอื่น ๆ ยอดนิยมฟรีข้ามแพลตฟอร์มตำแหน่ง) AliView โหลดไฟล์ตำแหน่งใหญ่เร็ว 2 – 14 ครั้ง และต้องน้อยกว่าครึ่งหนึ่งของทรัพยากรหน่วยความจำมากกว่าเทียบเท่าตำแหน่งบรรณาธิการ (ตารางที่ 1 ตารางเสริม S1A – C) AliView จะอ่านแฟ้มการจัดตำแหน่งไม่จำกัดขนาด FASTA, Phylip, Nexus, Clustal และ MSF-รูปแบบ (ตารางที่ 2) นี้ทำงานกระบวนการทำดัชนีที่ลำดับในแฟ้มเริ่มต้นมีการทำดัชนีและเพียงเก็บไว้ในหน่วยความจำเมื่อดู นอกเหนือจากมีการทำดัชนีของไฟล์ขนาดใหญ่ โปรแกรมยังอ่าน แล้วบันทึกแฟ้มดัชนี Fasta (.fai) ที่ดำเนินการ โดย Samtools (Li et al., 2009) โปรแกรมอ่านการจัดตำแหน่งลงในหน่วยความจำทั้งหมด หรือใบส่วนบนแฟ้ม ขึ้นอยู่กับทรัพยากรหน่วยความจำบนคอมพิวเตอร์เฉพาะ วิธีนี้สามารถสามารถเปิดแฟ้มจัดว่าทรัพยากรหน่วยความจำของคอมพิวเตอร์

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

คุณสมบัติที่สำคัญของ AliView รวมถึงความสามารถในการจัดการกับการจัดแนวอย่างรวดเร็วขนาดใหญ่ที่มีผลกระทบต่อหน่วยความจำต่ำ (ดูตารางที่ 1 การเปรียบเทียบกับคนอื่น ๆ ได้รับความนิยมฟรีจัดตำแหน่งข้ามแพลตฟอร์มผู้ชม) AliView โหลดไฟล์ที่มีขนาดใหญ่การจัดตำแหน่ง 2-14 ครั้งเร็วและความต้องการน้อยกว่าครึ่งหนึ่งของทรัพยากรหน่วยความจำกว่าบรรณาธิการจัดตำแหน่งเทียบเคียง (ตารางที่ 1 ตารางที่เสริม S1A-C) AliView จะอ่านไฟล์ไม่ จำกัด ขนาดการจัดตำแหน่งใน FASTA, Phylip, Nexus, Clustal และชายรูปแบบ (ตารางที่ 2) นี้ทำงานได้ผ่านขั้นตอนการจัดทำดัชนีที่วนเวียนอยู่ในไฟล์แรกจะมีการจัดทำดัชนีและเก็บไว้ในหน่วยความจำเท่านั้นเมื่อมอง นอกเหนือจากการจัดทำดัชนีในตัวของไฟล์ที่มีขนาดใหญ่โปรแกรมยังสามารถอ่านและบันทึกไฟล์ดัชนี Fasta (.fai) ในขณะที่ดำเนินการโดย Samtools (Li et al., 2009) โปรแกรมทั้งอ่านทั้งการจัดตำแหน่งในหน่วยความจำหรือใบส่วนในไฟล์ขึ้นอยู่กับทรัพยากรหน่วยความจำที่มีอยู่ในเครื่องคอมพิวเตอร์ที่เฉพาะเจาะจง วิธีนี้ไฟล์การจัดตำแหน่งใด ๆ ที่สามารถเปิดได้โดยไม่คำนึงถึงทรัพยากรหน่วยความจำของคอมพิวเตอร์