Next, we examined transgenic sample

Next, we examined transgenic samples containing the insertion of elements foreign to the mouse genome. Since these sequences are not native to the mouse genome, the associated ChIP-seq reads were not expected to align to the mouse reference genome. These unmapped reads were thus realigned to a new reference sequence collection corresponding to the exogenous inserted sequence (Section 2). If these reads align to this custom reference sequence, then the presence of the sequence has been identified in the sample of interest.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ถัดไป เราตรวจสอบตัวอย่างจำลองที่ประกอบด้วยการแทรกองค์ประกอบต่างกับจีโนเมาส์ ตั้งแต่ลำดับเหล่านี้จะไม่พื้นเมืองกลุ่มเมาส์ อ่านชิ seq เกี่ยวข้องไม่คาดว่าจัดจีโนเรทเมาส์ จึงได้การปรับแต่งเหล่านี้อ่านไม่ได้แม็ปเก็บลำดับอ้างอิงใหม่ที่สอดคล้องกับลำดับการแทรกจากภายนอก (ส่วนที่ 2) ถ้าอ่านเหล่านี้จัดลำดับนี้อ้างอิงที่กำหนดเอง แล้วการปรากฏตัวของลำดับพบในตัวอย่างที่น่าสนใจ

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ต่อไปเราจะตรวจสอบตัวอย่างดัดแปรพันธุกรรมที่มีการแทรกขององค์ประกอบต่างประเทศให้กับจีโนมของเมาส์ ตั้งแต่ลำดับเหล่านี้ไม่ได้ถิ่นกำเนิดในจีโนมของเมาส์ที่เกี่ยวข้องชิป seq อ่านไม่ได้คาดว่าจะจัดไปอ้างอิงจีโนมของเมาส์ unmapped เหล่านี้อ่านตั้งหลักที่จะทำให้คอลเลกชันลำดับอ้างอิงใหม่ที่สอดคล้องกับภายนอกแทรกลำดับ (ส่วนที่ 2) ถ้าสิ่งเหล่านี้อ่านจัดลำดับการอ้างอิงที่กำหนดเองนี้แล้วการปรากฏตัวของลำดับที่ได้รับการระบุไว้ในตัวอย่างที่น่าสนใจ