We designed a panel of four 16S rRN

We designed a panel of four 16S rRNA-targeted oligonucleotide probes specific for bacteria of the phylum cytophaga-flavobacter-bacteroides (CFB). Probes CF319a and CF319b are targeted to members of the flavobacteria-cytophaga group and the genus Porphyromonas, whereas probe BAC303 has a target region characteristic for the genera Prevotella and Bacteroides within the bacteroides group. The probe FFE8b was developed for species-specific hybridizations with Flavobacterium ferrugineum. All probes were designed by computer-assisted sequence analysis and compared to all currently accessible 16S and 23S rRNA sequences. The oligonucleotides were further evaluated by whole-cell and non-radioactive dot-blot hybridization against reference strains of the CFB phylum and other major lineages of Bacteria. The newly developed probes were used together with other higher-order probes to analyse the structure and community composition in complex environments. In activated sludge samples, members of the flavobacteria-cytophaga group were revealed by in situ hybridization as important constituents of sludge flocs and characteristic colonizers of filamentous bacteria. By application of fluorescent probe BAC303, members of the genera Bacteroides and Prevotella could be visualized without prior cultivation as an important part of the human faecal microflora.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

เราออกแบบแผงของสี่ 16S rRNA เป้าหมาย oligonucleotide คลิปปากตะเข้เฉพาะสำหรับแบคทีเรียในไฟลัม cytophaga-flavobacter-bacteroides (CFB) คลิปปากตะเข้ CF319a และ CF319b มีเป้าหมายให้สมาชิกของกลุ่ม flavobacteria cytophaga และ Porphyromonas ตระกูลนี้ในขณะที่โพรบ BAC303 มีลักษณะภูมิภาคเป้าหมายสำหรับการสกุล Prevotella และ Bacteroides ภายในกลุ่ม bacteroides โพรบ FFE8b ถูกพัฒนาขึ้นสำหรับ hybridizations species-specific กับความ Flavobacterium ferrugineum คลิปปากตะเข้ทั้งหมดถูกออกแบบ โดยคอมพิวเตอร์ช่วยการวิเคราะห์ และเปรียบเทียบกับลำดับทั้งหมดสามารถเข้าถึงได้ในขณะนี้ 16S และ 23S rRNA Oligonucleotides มีประเมินเพิ่มเติม โดย hybridization ทั้งเซลล์ และ กัมมันตรังสีไม่จุดคืนในตาสายพันธุ์อ้างอิงของไฟลัม CFB และเชื้อชาติที่สำคัญอื่น ๆ ของแบคทีเรีย คลิปปากตะเข้ใหม่ถูกใช้พร้อมคลิปปากตะเข้ขั้นสูงอื่น ๆ เพื่อวิเคราะห์องค์ประกอบโครงสร้างและชุมชนสภาพแวดล้อมที่ซับซ้อน ในการเปิดใช้งานตัวอย่าง สมาชิกของกลุ่ม flavobacteria cytophaga ถูกเปิดเผย โดยใน situ hybridization เป็นสำคัญ constituents flocs ตะกอนและ colonizers ลักษณะของแบคทีเรีย filamentous สมาชิกของสกุล Bacteroides และ Prevotella สามารถ visualized โดยก่อนการเพาะปลูกเป็นส่วนสำคัญของ microflora faecal มนุษย์ โดยโปรแกรมประยุกต์ของโพรบเรืองแสง BAC303

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

เราได้ออกแบบแผงสี่ 16S rRNA oligonucleotide probes การกำหนดเป้​​าหมายที่เฉพาะเจาะจงสำหรับแบคทีเรียของประเภท cytophaga-flavobacter-Bacteroides (CFB) พร็อบ CF319a CF319b และมีการกำหนดเป้​​าหมายให้กับสมาชิกของกลุ่ม flavobacteria-cytophaga และสกุล Porphyromonas ในขณะที่การสอบสวน BAC303 มีลักษณะพื้นที่เป้าหมายสำหรับจำพวก Prevotella และ Bacteroides ภายในกลุ่ม Bacteroides สอบสวน FFE8b ได้รับการพัฒนาสำหรับ hybridizations สายพันธุ์เฉพาะที่มี Flavobacterium ferrugineum ยานสำรวจทั้งหมดได้รับการออกแบบโดยการวิเคราะห์ลำดับคอมพิวเตอร์ช่วยและเมื่อเทียบกับทั้งหมดที่สามารถเข้าถึงได้ในขณะนี้ 16S และ 23S rRNA ลำดับ oligonucleotides ได้รับการประเมินต่อไปโดยเซลล์ทั้งหมดและไม่มีกัมมันตภาพรังสีผสมพันธุ์-dot blot กับสายพันธุ์อ้างอิงประเภท CFB และ lineages สำคัญอื่น ๆ ของแบคทีเรีย โพรบที่พัฒนาขึ้นใหม่ถูกนำมาใช้ร่วมกับโพรบขั้นสูงอื่น ๆ ในการวิเคราะห์โครงสร้างและองค์ประกอบของชุมชนในสภาพแวดล้อมที่ซับซ้อน ในตัวอย่างตะกอนสมาชิกของกลุ่ม flavobacteria-cytophaga ได้รับการเปิดเผยโดยในแหล่งกำเนิดพันธุ์เป็นองค์ประกอบที่สำคัญของกลุ่มแบคทีเรียตะกอนและ colonizers ลักษณะของแบคทีเรียใย โดยการประยุกต์ใช้ BAC303 สอบสวนเรืองสมาชิกของจำพวก Bacteroides และ Prevotella สามารถมองเห็นได้โดยไม่ต้องเพาะปลูกก่อนในฐานะที่เป็นส่วนสำคัญของจุลินทรีย์ในอุจจาระของมนุษย์

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

เราได้ออกแบบแผงสี่เบส 16S rRNA ซึ่งวิธีการที่เฉพาะเจาะจงสำหรับแบคทีเรียในไฟลัม cytophaga flavobacter bacteroides เป้าหมาย ( cfb ) cf319a cf319b ) และมีเป้าหมายให้สมาชิกของกลุ่มและ flavobacteria cytophaga สกุลพอร์ไฟโรโมนาส และสอบสวน bac303 มีเป้าหมายเขตลักษณะสกุล prevotella bacteroides bacteroides และภายในกลุ่มการสอบสวน ffe8b ถูกพัฒนาสำหรับ hybridizations เผ่าพันธุ์ - เฉพาะกับฟลาโวแบคทีเรียม ferrugineum . ทั้งหมดจึงถูกออกแบบโดยการวิเคราะห์ลำดับเบสด้วย และเมื่อเปรียบเทียบกับปัจจุบันได้ทั้งหมด ( 23s rRNA และลำดับโอลิโกนิวคลีโอไทด์ที่ได้ประเมิน โดยเซลล์ทั้งหมดและ dot blot hybridization ปลอดสารกัมมันตรังสีกับสายพันธุ์อ้างอิงของ cfb ไฟลัม และพันธุ์ใหญ่อื่น ๆ ของแบคทีเรีย ที่พัฒนาขึ้นใหม่และใช้ร่วมกับฟิวส์ขั้นสูงอื่น ๆเพื่อวิเคราะห์โครงสร้างและองค์ประกอบชุมชนในสภาพแวดล้อมที่ซับซ้อน ในตัวอย่างสลัดจ์กัมมันต์ ,สมาชิกของกลุ่มที่ถูกเปิดเผยโดย flavobacteria cytophaga ใน situ hybridization เป็นองค์ประกอบสำคัญและลักษณะของเม็ดตะกอนที่จะเป็นแบคทีเรีย โดยการประยุกต์ใช้ bac303 โพรบเรืองแสง , สมาชิกของสกุล bacteroides prevotella สามารถมองเห็นโดยไม่แจ้ง และการเป็นส่วนหนึ่งที่สำคัญของไมโคร
ในมนุษย์