On the basis of alignment of differ

On the basis of alignment of different sequences
related to S. stercoralis, deposited in GenBank (accession
nos.: AB526297, AB526298, AB526299, AB526300), two sets
of primer pairs were designed for nested PCR using DNASIS
software (Hitachi, Tokyo, Japan) to enable amplification of a
509-bp target in the first PCR round and a 261-bp target in
the second PCR round in the mitochondrial cytochrome c oxidase
subunit 1 (cox1) gene. PCR reactions were performed
in 20 μL volumes containing 2 × red PCR premix (Ampliqon,
Odense, Denmark), 10 pmol of each primer and 4 μL of
DNA template for the first amplification round, and 1 μL of
1/40 diluted first-round PCR product for the second amplification
round. For the first amplification round, the primers cox
F (5′TGG TTT GGG TAC TAG TTG-3′) and cox R (5′-
GAT GAG CTC AAA CTA CAC A-3′) were used and for
the second amplification round, the primers CNF (5′-TTC
TAG TGT TGA TTT GGC T-3′) and CNR (5′-TTA CCA
CCA AAA CTA GGATC-3′) were used. Three negative controls
(distilled water) and one positive control (DNA extracted
from filariform larvae of S. stercoralis) were included in each
round.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

บนพื้นฐานของการจัดลำดับที่แตกต่างกันที่เกี่ยวข้องกับ S. stercoralis ฝากใน GenBank (ภาคยานุวัติชุด: AB526297, AB526298, AB526299, AB526300), สองชุดของไพรเมอร์ คู่ออกแบบมาสำหรับซ้อน PCR โดยใช้ DNASISซอฟต์แวร์ (ฮิตาชิ โตเกียว ญี่ปุ่น) เพื่อเปิดใช้งานการขยายของการ509-bp เป้าหมายใน PCR แรกที่กลมและในเป้าหมาย 261-bpPCR สองรอบในการยล cytochrome c oxidaseย่อย 1 (cox1) ยีน ดำเนินการปฏิกิริยา PCRในปริมาณ μL 20 ที่ประกอบด้วยแป้งผสม PCR 2 ×แดง (Ampliqonโอเดนเซ เดนมาร์ก), 10 pmol พื้นแต่ละและ μL 4 ของดีเอ็นเอแม่แบบสำหรับการขยายสัญญาณแรกรอบ และ μL 1 ของผลิตภัณฑ์ PCR รอบแรกเจือจาง 1/40 สำหรับขยายสองรอบ สำหรับที่แรกขยายรอบ ค็อกซ์ไพรเมอร์F (5′TGG TTT GGG TAC แท็กทั้ง-3′) และ R (5 ′-ค็อกซ์สมาคมปิดปาก CTC AAA CTA CAC A-3′) ถูกนำมาใช้และขยายสองรอบ ไพรเมอร์ CNF (5 ′-TTCแท็ก TGT TGA TTT GGC T-3′) และซีเอ็นอาร์ (5 ′-TTA CCACCA AAA CTA GGATC-3′) ถูกนำมาใช้ สามลบตัวควบคุม(น้ำกลั่น) และควบคุมบวกหนึ่ง (สกัดดีเอ็นเอจาก filariform อ่อนของ S. stercoralis) รวมอยู่ในแต่ละรอบ

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

บนพื้นฐานของการจัดตำแหน่งของลำดับที่แตกต่างกัน
ที่เกี่ยวข้องกับเอส stercoralis ฝากใน GenBank (ภาคยานุวัติ
Nos .: AB526297, AB526298, AB526299, AB526300) สองชุด
ของคู่ไพรเมอร์ได้รับการออกแบบสำหรับใช้ที่ซ้อนกัน PCR DNASIS
ซอฟแวร์ (ฮิตาชิกรุงโตเกียวประเทศญี่ปุ่น ) เพื่อให้สามารถใช้เครื่องขยายเสียงของ
เป้าหมาย 509-BP ในรอบแรก PCR และเป้าหมายที่ 261 ความดันโลหิตใน
ครั้งที่สองในรอบ PCR ยล cytochrome c เด
subunit 1 (cox1) ยีน ปฏิกิริยา PCR ได้ดำเนินการ
ใน 20 เล่มไมโครลิตรมี 2 ×แดง PCR พรีมิกซ์ (Ampliqon,
Odense, เดนมาร์ก), 10 pmol ของแต่ละไพรเมอร์และ 4 ไมโครลิตรของ
แม่แบบดีเอ็นเอสำหรับรอบการขยายแรกและ 1 ไมโครลิตรของ
1/40 ปรับลดครั้งแรกในรอบ ผลิตภัณฑ์ PCR สำหรับการขยายตัวที่สอง
รอบ สำหรับรอบการขยายแรก, ไพรเมอร์ค็อกซ์
F (5'TGG TTT GGG TAC TAG TTG-3) และ Cox R (5'-
GAT GAG CTC AAA CTA CAC A-3 ') ถูกนำมาใช้และ
รอบเครื่องขยายเสียงที่สอง ไพรเมอร์ CNF (5'-TTC
TAG TGT TGA TTT GGC T-3) และ CNR (5'-TTA CCA
CCA AAA CTA GGATC-3 ') ถูกนำมาใช้ สามการควบคุมเชิงลบ
(น้ำกลั่น) และการควบคุมในเชิงบวกหนึ่ง (DNA ที่สกัด
จากตัวอ่อน filariform เอส stercoralis) ถูกรวมไว้ในแต่ละ
รอบ

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

บนพื้นฐานของการเรียงตัวของลำดับต่าง ๆความสัมพันธ์กับเอส Strongyloides stercoralis ฝากเงินบริเวณ ( สูเลขที่ : ab526297 ab526298 ab526299 , , , , ab526300 ) 2 ชุดไพรเมอร์คู่ถูกออกแบบให้สามารถใช้ dnasis ซ้อนกันซอฟต์แวร์ ( ฮิตาชิ โตเกียว ประเทศญี่ปุ่น เพื่อให้เพิ่มปริมาณเป็น509 BP ในเป้าหมายแรก และเป้าหมายโดยรอบเป็น 261 BP ในรอบสองตัด PCR เอ็นไซม์ไซโตโครมซีออกซิเดสหน่วยย่อยที่ 1 ( cox1 ) ยีน ปฏิกิริยา PCR ได้ใน 20 μ L ปริมาณบรรจุ 2 × PCR ( ampliqon สีแดง , รวมOdense , เดนมาร์ก ) , 10 pmol ของแต่ละคู่ และ 4 μล.แม่แบบ DNA amplification ในรอบแรก และ 1 μล.1 / 40 ซึ่งรอบแรกสำหรับการเพิ่มปริมาณดีเอ็นเอผลิตภัณฑ์ 2รอบ สำหรับรอบ ( ครั้งแรกด้วย คอกซ์F ( 5 ’ tgg TTT GGG TAC แท็ก ttg-3 School ) และค็อกซ์ R ( 5 ’ -รับมุข CTC AAA CTA the A-3 นั้น ) ใช้สำหรับรอบ ( สอง บน CNF ( 5 ’ - บริษัท ทีทีซีแท็กรูปแบบ TGA TTT ggc t-3 School ) และ CNR ( 5 ’ - TTA CCACCA CTA AAA ggatc-3 School ) สถิติที่ใช้ 3 ควบคุมลบ( น้ำ ) และการควบคุม ( DNA ) บวกจากตัวอ่อนไฟลาริฟอร์ม S . Strongyloides stercoralis ) ถูกรวมอยู่ในแต่ละรอบ