We attempted to resolve phylogenetic relationships
among members of the subfamily Delphininae using
two approaches. Both use complete taxon sampling for
the subfamily (sensu LeDuc et al.[3]) and incorporate
multiple individuals per species to capture the intraspecific
variation inherent within the species. First, phylogenetic
analysis was performed using mitochondrial
DNA control region sequences. The control region was
chosen for comparison because it is commonly relied
upon for studies of cetacean systematics [1,8,22,28,29]
and species identification [1,30,31]. The higher mutation
rate may allow the control region locus to resolve
relationships that the cytochrome b gene sequences
could not [3,21,24,25]. However, mtDNA sequences
represent a single locus gene tree and phylogenetic
reconstruction of species trees can be greatly improved
through multi-locus analyses. To address this problem,
we employed an alternate approach to phylogenetic
reconstruction targeting multiple polymorphic markers
from anonymous sites across the genome.
เราพยายามที่จะแก้ไขความสัมพันธ์ phylogeneticสมาชิกของ subfamily Delphininae ใช้วิธีที่สอง ทั้งสองใช้สุ่ม taxon สมบูรณ์สำหรับใน subfamily (sensu LeDuc et al.[3]) และรวมบุคคลหลายต่อชนิดการจับภาพที่ intraspecificความผันแปรโดยธรรมชาติภายในสายพันธุ์ แรก phylogeneticทำการวิเคราะห์โดยใช้ mitochondrialลำดับดีเอ็นเอควบคุมภูมิภาคนี้ มีพื้นที่ควบคุมเลือกเปรียบเทียบ เพราะมันจะอาศัยโดยทั่วไปเมื่อมีการศึกษาอนุกรมวิธานของ cetacean [1,8,22,28,29]และการระบุพันธุ์ [1,30,31] การกลายพันธุ์สูงอัตราให้โลกัสโพลภาคควบคุมการแก้ไขความสัมพันธ์ที่ลำดับยีน b cytochromeไม่ [3,21,24,25] อย่างไรก็ตาม mtDNA ลำดับแทนโลกัสโพลเดียวยีนต้นไม้ และ phylogeneticฟื้นฟูพันธุ์ต้นไม้สามารถมากเพิ่มขึ้นผ่านหลายโลกัสโพลวิเคราะห์ เพื่อแก้ไขปัญหานี้เราจ้างวิธีการอื่นเพื่อ phylogeneticฟื้นฟูการกำหนดเครื่องหมาย polymorphic หลายเป้าหมายจากเว็บไซต์ที่ไม่ระบุชื่อในกลุ่ม
การแปล กรุณารอสักครู่..
เราพยายามที่จะแก้ปัญหาความสัมพันธ์ของสายวิวัฒนาการในหมู่สมาชิกของอนุวงศ์ Delphininae ใช้สองวิธี ทั้งสองใช้การสุ่มตัวอย่างแท็กซอนที่สมบูรณ์แบบสำหรับอนุวงศ์ (sensu LeDuc et al. [3]) และรวมบุคคลหลายต่อสายพันธุ์ที่จะจับสำนวนการเปลี่ยนแปลงโดยธรรมชาติภายในสายพันธุ์ ครั้งแรกที่สายวิวัฒนาการการวิเคราะห์ถูกดำเนินการโดยใช้ยลลำดับภูมิภาคควบคุมดีเอ็นเอ ภูมิภาคควบคุมเลือกสำหรับการเปรียบเทียบเพราะมันอาศัยทั่วไปเมื่อการศึกษาของระบบปลาวาฬ[1,8,22,28,29] และบัตรประจำตัวสายพันธุ์ [1,30,31] การกลายพันธุ์ที่สูงกว่าอัตราดอกเบี้ยอาจช่วยให้การควบคุมสถานที่ภูมิภาคเพื่อแก้ไขความสัมพันธ์ว่าcytochrome ขลำดับยีนไม่ได้[3,21,24,25] อย่างไรก็ตามลำดับ mtDNA เป็นตัวแทนของยีนสถานที่เดียวต้นไม้สายวิวัฒนาการและการฟื้นฟูของต้นไม้ชนิดสามารถดีขึ้นอย่างมากผ่านการวิเคราะห์แบบหลายสถานที่ การแก้ไขปัญหานี้เราจ้างวิธีการอื่นเพื่อ phylogenetic ฟื้นฟูกำหนดเป้าหมายตัวบ่งชี้หลาย polymorphic จากเว็บไซต์ที่ไม่ระบุชื่อทั่วจีโนม
การแปล กรุณารอสักครู่..
เราพยายามที่จะแก้ปัญหา ซึ่งความสัมพันธ์ระหว่างสมาชิกของ delphininae
subfamily โดยใช้สองวิธี ใช้ทั้งสมบูรณ์ชนิดคน
subfamily ( เซ็นสุ Leduc et al . [ 3 ] ) และรวม
บุคคลหลายต่อ ชนิดจับเซ็นต์
ความผันแปรโดยธรรมชาติภายในชนิด ก่อนการวิเคราะห์ phylogenetic
การใช้อุตสาหกรรมเขตควบคุมลำดับ DNA เขตควบคุม
เลือกเปรียบเทียบเพราะมันมักอาศัย
เมื่อการศึกษาปลาวาฬชนิดย่อย [ 1,8,22,28,29 ]
[ ชนิดและการ 1,30,31 ] สูงกว่าอัตราการกลายพันธุ์
อาจอนุญาตให้ควบคุมเขตตนเพื่อแก้ไขความสัมพันธ์ที่ยีน B
-
อาจไม่ลำดับ [ 3,21,24,25 ] อย่างไรก็ตาม แสดงลำดับ
เป็นตัวแทนของตนและสร้าง phylogenetic ต้นไม้เดี่ยวยีน
ชนิดต้นไม้สามารถได้รับการปรับปรุงอย่างมาก
ด้วย Multi - วิเคราะห์ข้อมูล เพื่อแก้ไขปัญหานี้ ใช้วิธีการสลับกับเรา
ซึ่งฟื้นฟูเป้าหมายหลายที่มีเครื่องหมาย
จากนิรนามเว็บไซต์ทั่วจีโนม .
การแปล กรุณารอสักครู่..