Global alignments, which attempt to

Global alignments, which attempt to align every residue in every sequence, are most useful when the sequences in the query set are similar and of roughly equal size. (This does not mean global alignments cannot start and/or end in gaps.) A general global alignment technique is the Needleman–Wunsch algorithm, which is based on dynamic programming. Local alignments are more useful for dissimilar sequences that are suspected to contain regions of similarity or similar sequence motifs within their larger sequence context. The Smith–Waterman algorithm is a general local alignment method also based on dynamic programming.[4]

Hybrid methods, known as semiglobal or "glocal" (short for global-local) methods, attempt to find the best possible alignment that includes the start and end of one or the other sequence. This can be especially useful when the downstream part of one sequence overlaps with the upstream part of the other sequence. In this case, neither global nor local alignment is entirely appropriate: a global alignment would attempt to force the alignment to extend beyond the region of overlap, while a local alignment might not fully cover the region of overlap.[6] Another case where semiglobal alignment is useful is when one sequence is short (for example a gene sequence) and the other is very long (for example a chromosome sequence). In that case, the short sequence should be globally aligned but only a local alignment is desired for the long sequence.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

จัดแนวสากล ที่พยายามที่จะจัดทุกสารตกค้างในทุกลำดับ มีประโยชน์มากที่สุดเมื่อลำดับในชุดแบบสอบถามคล้ายกัน และขนาดประมาณเท่ากับ (แต่ไม่ได้ จัดแนวสากลไม่สามารถเริ่มต้น หรือลงท้ายด้วยช่องว่าง) เทคนิคจัดตำแหน่งทั่วไประดับโลกเป็น Needleman – วานซ์อัลกอริทึม ซึ่งตามการเขียนโปรแกรมแบบไดนามิก จัดแนวท้องถิ่นมีประโยชน์มากสำหรับลำดับแตกต่างกันที่สงสัยว่าจะประกอบด้วยภาคของความคล้ายคลึงหรือลำดับคล้ายมีลวดลายภายในบริบทของลำดับใหญ่ อัลกอริทึมสมิธ – ฝีพายเป็นวิธีจัดตำแหน่งท้องถิ่นทั่วไปขึ้นอยู่กับการเขียนโปรแกรมแบบไดนามิก [4]วิธีไฮบริด เรียกว่า semiglobal หรือวิธี "อิ" (สั้นสำหรับส่วนกลางท้องถิ่น) พยายามที่จะค้นหาการจัดตำแหน่งได้ดีที่สุดที่มีการเริ่มต้นและสิ้นสุดหนึ่งหรือลำดับที่ นี้จะเป็นประโยชน์โดยเฉพาะอย่างยิ่งเมื่อส่วนปลายของลำดับที่หนึ่งทับซ้อนกับส่วนต้นน้ำของตามลำดับ ในกรณีนี้ จัดตำแหน่งทั้งส่วนกลาง และท้องถิ่นเหมาะสมทั้งหมด: การจัดตำแหน่งทั่วโลกพยายามที่จะบังคับการจัดตำแหน่งจะขยายนอกภูมิภาคที่ทับซ้อน ในขณะที่การจัดตำแหน่งภายในอาจเต็มครอบคลุมพื้นที่ของทับซ้อนกัน [6] อีกกรณีหนึ่งที่ตำแหน่ง semiglobal จะเป็นประโยชน์คือเมื่อหนึ่งลำดับมีสั้น (ตัวอย่างเช่นลำดับยีน) และอื่น ๆ ที่มีความยาวมาก (ตัวอย่างเช่นลำดับโครโมโซม) ในกรณีที่ ลำดับสั้น ๆ ควรสอดคล้องทั่วโลก แต่เฉพาะตำแหน่งในท้องถิ่นเป็นที่ต้องการสำหรับลำดับยาว

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

การจัดแนวทั่วโลกซึ่งพยายามที่จะปรับทุกตกค้างในลำดับทุกที่มีประโยชน์มากที่สุดเมื่อวนเวียนอยู่ในชุดแบบสอบถามมีความคล้ายคลึงกันและมีขนาดเท่ากับ (นี่ไม่ได้หมายความว่าการจัดแนวทั่วโลกไม่สามารถเริ่มต้นและ / หรือสิ้นสุดในช่องว่าง.) เทคนิคการจัดตำแหน่งทั่วไประดับโลกเป็นอัลกอริทึม Needleman-Wunsch ซึ่งจะขึ้นอยู่กับการเขียนโปรแกรมแบบไดนามิก การจัดแนวท้องถิ่นเป็นประโยชน์มากสำหรับลำดับที่แตกต่างกันที่สงสัยว่าจะมีความคล้ายคลึงกันของภูมิภาคหรือลวดลายลำดับที่คล้ายกันในบริบทลำดับของพวกเขาที่มีขนาดใหญ่ อัลกอริทึมสมิ ธ ฝีพายเป็นวิธีการจัดตำแหน่งในท้องถิ่นทั่วไปนอกจากนี้ยังขึ้นอยู่กับการเขียนโปรแกรมแบบไดนามิก. [4]

วิธีไฮบริดเป็นที่รู้จัก semiglobal หรือ "glocal" (ย่อมาจากทั่วโลกท้องถิ่น) วิธีการพยายามที่จะหาแนวร่วมที่ดีที่สุดที่มีการเริ่มต้น และจุดสิ้นสุดของหนึ่งหรืออื่น ๆ ตามลำดับ ซึ่งจะเป็นประโยชน์โดยเฉพาะอย่างยิ่งเมื่อส่วนปลายน้ำของลำดับหนึ่งคาบเกี่ยวกับส่วนต้นน้ำของลำดับอื่น ๆ ในกรณีนี้การจัดตำแหน่งทั่วโลกค่ามิได้ในท้องถิ่นมีความเหมาะสมทั้งหมด: a. การจัดตำแหน่งทั่วโลกจะพยายามที่จะบังคับให้จัดตำแหน่งที่จะขยายเกินภูมิภาคของการทับซ้อนในขณะที่การจัดตำแหน่งในท้องถิ่นอาจจะไม่ครอบคลุมพื้นที่ของการทับซ้อน [6] กรณีที่การจัดตำแหน่ง semiglobal เป็นประโยชน์อีกประการหนึ่งคือเมื่อหนึ่งลำดับสั้น (เช่นยีน) และอื่น ๆ ที่มีความยาวมาก (เช่นลำดับโครโมโซม) ในกรณีที่ลำดับสั้นควรจะสอดคล้องทั่วโลก แต่เพียงการจัดตำแหน่งในท้องถิ่นเป็นที่ต้องการสำหรับลำดับยาว

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

Global System ซึ่งพยายามที่จะจัดทุกตกค้างในทุกลำดับ เป็นประโยชน์ที่สุดเมื่อลำดับในการตั้งค่าที่คล้ายกันและขนาดประมาณเท่ากับ ( ไม่ได้หมายความว่าสากล การไม่สามารถเริ่มต้นและ / หรือสิ้นสุดในช่องว่าง ) เทคนิคแนวสากลทั่วไปคือสโมสรฟุตบอลอัตเลตีโกมาดริด ซึ่งอยู่บนพื้นฐานของการเขียนโปรแกรมแบบไดนามิก การจัดแนวท้องถิ่นจะเป็นประโยชน์สำหรับลำดับไม่เหมือนกัน ที่สงสัยว่ามีความเหมือนหรือคล้ายกันของภูมิภาคสำคัญลำดับภายในขนาดใหญ่ลำดับบริบท ที่สโมสรฟุตบอลลีดส์ยูไนเต็ดอยู่ทั่วไปในท้องถิ่นจัดวิธีการขึ้นอยู่กับพลวัต [ 5 ]วิธีผสม เรียกว่า semiglobal หรือ " โกลคอล " ( ย่อมาจาก Global ท้องถิ่น ) วิธีการพยายามที่จะหาที่ดีที่สุดที่เป็นไปได้ที่มีการเริ่มต้นและจุดสิ้นสุดของหนึ่งหรือลำดับอื่น ๆ นี้จะมีประโยชน์โดยเฉพาะอย่างยิ่งเมื่อประโยชน์ส่วนหนึ่งของหนึ่งลำดับ ทับซ้อนกับส่วนต้นของรหัสอื่น ๆ ในกรณีนี้ไม่จัดเป็นส่วนกลางหรือท้องถิ่น ทั้งหมดที่เหมาะสม : แนวร่วมทั่วโลกก็พยายามบังคับแนวที่จะขยายเกินพื้นที่ทับซ้อน ในขณะที่แนวท้องถิ่นอาจไม่เต็มที่ครอบคลุมพื้นที่ทับซ้อนกัน . [ 6 ] กรณีอื่นที่ semiglobal สอดคล้องเป็นประโยชน์เมื่อลำดับสั้น ( เช่นยีน ลำดับ ) และอีกยาวมาก ( ตัวอย่างเช่นลำดับของโครโมโซม ) ในกรณีที่ลำดับสั้นควรจะสอดคล้องทั่วโลกแต่เพียงท้องถิ่นจัดเป็นที่ต้องการสำหรับลำดับที่ยาวนาน