Abstract
Background: Meat quality involves many traits, such as marbling, tenderness, juiciness, and backfat thickness, all of
which require attention from livestock producers. Backfat thickness improvement by means of traditional selection
techniques in Canchim beef cattle has been challenging due to its low heritability, and it is measured late in an
animal’s life. Therefore, the implementation of new methodologies for identification of single nucleotide
polymorphisms (SNPs) linked to backfat thickness are an important strategy for genetic improvement of carcass and
meat quality.
Results: The set of SNPs identified by the random forest approach explained as much as 50% of the deregressed
estimated breeding value (dEBV) variance associated with backfat thickness, and a small set of 5 SNPs were able to
explain 34% of the dEBV for backfat thickness. Several quantitative trait loci (QTL) for fat-related traits were found in
the surrounding areas of the SNPs, as well as many genes with roles in lipid metabolism.
Conclusions: These results provided a better understanding of the backfat deposition and regulation pathways,
and can be considered a starting point for future implementation of a genomic selection program for backfat
thickness in Canchim beef cattle.
Keywords: Bovine, Lipid metabolism, Machine learning, Single nucleotide polymorphism (SNP), Subcutaneous fat,
Tropical composite cattle
AbstractBackground: Meat quality involves many traits, such as marbling, tenderness, juiciness, and backfat thickness, all ofwhich require attention from livestock producers. Backfat thickness improvement by means of traditional selectiontechniques in Canchim beef cattle has been challenging due to its low heritability, and it is measured late in ananimal’s life. Therefore, the implementation of new methodologies for identification of single nucleotidepolymorphisms (SNPs) linked to backfat thickness are an important strategy for genetic improvement of carcass andmeat quality.Results: The set of SNPs identified by the random forest approach explained as much as 50% of the deregressedestimated breeding value (dEBV) variance associated with backfat thickness, and a small set of 5 SNPs were able toexplain 34% of the dEBV for backfat thickness. Several quantitative trait loci (QTL) for fat-related traits were found inthe surrounding areas of the SNPs, as well as many genes with roles in lipid metabolism.Conclusions: These results provided a better understanding of the backfat deposition and regulation pathways,and can be considered a starting point for future implementation of a genomic selection program for backfatthickness in Canchim beef cattle.Keywords: Bovine, Lipid metabolism, Machine learning, Single nucleotide polymorphism (SNP), Subcutaneous fat,Tropical composite cattle
การแปล กรุณารอสักครู่..

พื้นหลังนามธรรม
: คุณภาพเนื้อที่เกี่ยวข้องกับคุณลักษณะต่างๆเช่นหินอ่อน , ความอ่อนโยน , ความชุ่มฉ่ำ และความหนาไขมันสันหลังทั้งหมด
ซึ่งต้องการความสนใจจากผู้ผลิตปศุสัตว์ ความหนาไขมันสันหลังการปรับปรุงโดยใช้เทคนิคการคัดเลือก
ดั้งเดิมของโคเนื้อ canchim ถูกท้าทาย เนื่องจากมีอัตราพันธุกรรมต่ำ และเป็นวัดในช่วงปลายชีวิตเป็นพยาบาลสัตว์ ดังนั้นการใช้วิธีการใหม่ในการจำแนกชนิดของความหลากหลายยีน
เดี่ยว ( snps ) ที่เชื่อมโยงกับความหนาไขมันสันหลังเป็นกลยุทธ์ที่สำคัญสำหรับการปรับปรุงคุณภาพซากและคุณภาพเนื้อผล
.
: ชุด snps ระบุโดยวิธีการสุ่มป่าอธิบายเท่าที่ 50% ของ deregressed
คุณค่าการผสมพันธุ์ ( debv ) ความแปรปรวนร่วมความหนาไขมันสันหลัง ,และชุดเล็ก 5 snps สามารถ
อธิบาย 34% ของ debv สำหรับความหนาไขมันสันหลัง . หลายลักษณะ ( QTL ) ปริมาณของไขมันที่เกี่ยวข้องกับลักษณะที่พบในบริเวณโดยรอบของ snps
, ยีนเช่นเดียวกับหลายที่มีบทบาทในการเผาผลาญไขมัน
สรุป : ผลเหล่านี้ให้ความเข้าใจที่ดีขึ้นของไขมันสันหลังและทางเดินของการควบคุม
และถือได้ว่าเป็นจุดเริ่มต้นสำหรับการดำเนินงานในอนาคตของโปรแกรมสำหรับการสร้างความหนาไขมันสันหลังในโคเนื้อ canchim
.
คำสำคัญ : วัว , ไขมันเผาผลาญการเรียนรู้ของเครื่อง , polymorphism ( SNP ) ซิงเกิลนิวคลีโอไทด์ , ไขมันใต้ผิวหนัง ,
โคผสมร้อน
การแปล กรุณารอสักครู่..
