In this study, the six different polypeptide substrates used were the capsid, intNS3, 2A/2B, 2B/3, 3/4A and 4B/5. The polypeptide cleavage region of the capsid (N5RRRR1S1′AGMI5′) complexed with DV2 NS2B/NS3pro (Fig. 1) was generated as follows. The three dimensional-structure of the capsid's cleavage region was built based on the X-ray structure of WNV residues 11–20 (TGPCLARIIR) as the template (2IJO.pdb [12]), using homology modeling in the module implemented in Discovery Studio 2.5. (DS2.5, Accelrys Software Inc., San Diego, CA, USA).
พื้นผิว polypeptide ต่างหกที่ใช้ได้ในการศึกษานี้ capsid, intNS3, 2A/2B, 2B 3, 3/4A และ 4B/5 สร้างความแตกแยกภูมิภาค polypeptide ของใน capsid (N5RRRR1S1′AGMI5′) complexed กับ DV2 NS2B/NS3pro (1 รูป) ดังนี้ สามมิติโครงสร้างของภูมิภาคความแตกแยกของ capsid ถูกสร้างขึ้นตามโครงสร้างของ WNV ตก 11-20 (TGPCLARIIR) เป็นแม่แบบ (2IJO.pdb [12]), X-ray ใช้ homology โมเดลในโมดูใน Discovery Studio 2.5 (DS2.5, Accelrys ซอฟต์แวร์ Inc., San Diego, CA, USA)
การแปล กรุณารอสักครู่..
ในการศึกษานี้หกพื้นผิวที่แตกต่างกัน polypeptide ใช้คือ capsid ที่ intNS3, 2A / 2B, 2B / 3, 3 / 4A และ 4B / 5 ภูมิภาค polypeptide ความแตกแยกของ capsid (N5RRRR1S1'AGMI5 ') complexed กับ DV2 NS2B / NS3pro (รูปที่ 1). ถูกสร้างขึ้นดังต่อไปนี้ สามมิติโครงสร้างของภูมิภาคแตกแยก capsid ที่ถูกสร้างขึ้นบนพื้นฐานโครงสร้าง X-ray ของสารตกค้าง WNV 11-20 (TGPCLARIIR) เป็นแม่แบบ (2IJO.pdb [12]) โดยใช้การสร้างแบบจำลองที่คล้ายคลึงกันในโมดูลนำมาใช้ในการค้นพบสตูดิโอ 2.5 (DS2.5, Accelrys ฟแวร์อิงค์, San Diego, CA, USA)
การแปล กรุณารอสักครู่..
ในการศึกษานี้ หกที่แตกต่างกันใช้เป็น polypeptide พื้นผิวเปลือก intns3 , 2A , 2B / 2B / 3 และ 3 / 4A 4B / 5 การแยกเขตของแคปซิด ( polypeptide n5rrrr1s1 นั้น agmi5 School ) ซับซ้อนกับ dv2 โปรตีเอส / ns3pro ( รูปที่ 1 ) ถูกสร้างขึ้น ดังนี้ สามมิติโครงสร้างของเปลือกลึกภูมิภาคถูกสร้างขึ้นบนพื้นฐานของเอกซเรย์โครงสร้างของเลือดตกค้าง 11 20 – ( tgpclariir ) เป็นแม่แบบ ( 2ijo.pdb [ 12 ] ) , ใช้เป็นแบบจำลองในโมดูลที่ใช้ในการค้นพบสตูดิโอ 2.5 ( ds2.5 accelrys ซอฟต์แวร์ , Inc . , San Diego , CA , USA )
การแปล กรุณารอสักครู่..