2.7. Molecular identification of th

2.7. Molecular identification of the isolates
Pure cultures of potential FOC antagonistic actinomycetes were
grown in starch casein broth until log phase (four days) and genomic
DNA was isolated according to Bazzicalupo and Fani (1995). Theamplification of 16S rDNA gene was done using universal primers
1492R (50-TAC GGY TAC CTT GTT ACG ACT T-30) and 27F (50-AGA GTT
TGA TCMTGG CTC AG-30) as per the conditions described by Pandey
et al. (2005). The PCR product was sequenced at Macrogen Inc.
Seoul, Korea. The sequences obtained were compared with those
from the GenBank using the BLAST program (Alschul et al., 1990),
aligned using the ClustalW software (Thompson et al., 1997), and
phylogenetic trees inferred using the neighbor-joining method
(Saitou and Nei,1987). Bootstrap analysiswas performed to estimate
statistical stability of the branches in the cluster with 1000 replicates
using MEGA version 4 program (Tamura et al., 2007).

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

2.7 บัตรประจำตัวโมเลกุลของเชื้อ
วัฒนธรรมบริสุทธิ์ของแอคติโนมัยศักยภาพฟรีปฏิปักษ์ถูก
ปลูกในน้ำซุปแป้งเคซีนจนถึงขั้นตอนการเข้าสู่ระบบ (สี่วัน) และจีโนม
ดีเอ็นเอที่แยกได้ตาม Bazzicalupo และ Fani (1995) Theamplification ของยีน 16S rDNA ที่ได้กระทำโดยใช้ไพรเมอร์สากล
1492R (50-TAC GGY TAC CTT GTT ACG ACT T-30) และ 27 (50 AGA GTT
TGA TCMTGG CTC AG-30) ตามเงื่อนไขที่อธิบายโดย Pandey
et al, (2005) สินค้าที่ได้รับการจัดลำดับวิธี PCR ที่ Macrogen อิงค์
กรุงโซลประเทศเกาหลี ลำดับที่ได้ถูกนำมาเปรียบเทียบกับผู้ที่
จาก GenBank โดยใช้โปรแกรม BLAST (Alschul et al., 1990)
สอดคล้องโดยใช้ซอฟต์แวร์ ClustalW (ธ อมป์สัน et al., 1997) และ
ต้นไม้สรุปโดยใช้วิธีเพื่อนบ้านเข้า
(Saitou และ Nei, 1987) บูต analysiswas ดำเนินการเพื่อประเมิน
ความมั่นคงทางสถิติของสาขาในคลัสเตอร์ 1000 ซ้ำ
ใช้รุ่น MEGA 4 โปรแกรม (ทามูระ et al., 2007)

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

2.7 . การจำแนกสายพันธุ์ระดับโมเลกุลของเชื้อบริสุทธิ์ของศักยภาพฟรี

โตด้วยกัน คือปฏิปักษ์ในซุปแป้ง , จนกว่า log phase ( สี่วัน ) และดีเอ็นเอจีโนม
แยกตาม bazzicalupo และแฟน ( 1995 ) theamplification ของ 16S rDNA ยีนโดยใช้ไพรเมอร์
1492r สากล ( พระราชบัญญัติ 50-tac G และทั่วโลก gtt ACG ลบ 30 ) และ 27f ( 50-aga gtt
และ tcmtgg CTC ag-30 ) ตามเงื่อนไขที่อธิบายไว้โดยเดย์
et al . ( 2005 ) ผลิตภัณฑ์ PCR เป็นลำดับที่ macrogen อิงค์
โซล , เกาหลีใต้ ลำดับเปรียบเทียบกับ
จากขนาดการใช้โปรแกรมระเบิด ( alschul et al . , 1990 ) ,
ชิดใช้ clustalw ซอฟต์แวร์ ( Thompson et al . , 1997 ) ซึ่งได้ใช้ต้นไม้และ

( ไซโตะ และเพื่อนบ้านมาร่วมสอนเนย ,1987 ) บูทแสดงประมาณการ
เสถียรภาพและสถิติของสาขาในกลุ่มที่มี 1 , 000 ซ้ำ
ใช้โปรแกรมเวอร์ชั่น 4 เมก ( ทามูระ et al . , 2007 )