All PCR primers and allele-specific

All PCR primers and allele-specific primers for the multiplex primer
extension genotyping reactions used in this study were designed insilico
using PrimerPremier 5 and PrimerPlex 2 software (Premier Biosoft
International, Palo Alto, CA). Since α-chain haemoglobin (Hb) mutations
can be located in either HBA1 and/or HBA2 genes (NG_000006),
two different primer pairs were used to selectively amplify each of the
highly homologous HBA1 and HBA2 genes. The amplified HBA1 and
HBA2 gene fragments (1087 bp) flanking all 13 mutations were subsequently
used as templates for genotyping by primer extension reaction
in the presence of allele-specific primers. Oligonucleotides used as
primers and probes in the course of this study were synthesized by VBC Genomics (Wien, Austria). HBA1 and HBA2 gene allele-specific
primer sequences are available on request to the authors.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ไพรเมอร์ PCR และ allele เฉพาะไพรเมอร์สำหรับรองพื้น multiplex ทั้งหมดปฏิกิริยา genotyping นามสกุลที่ใช้ในการศึกษานี้ได้ออกแบบ insilicoโดยใช้ซอฟต์แวร์ PrimerPremier แบบ PrimerPlex (Biosoft พรีเมียร์นานาชาติ ดัลลัส CA) ตั้งแต่กลายพันธุ์ด้วยกองทัพโซ่ haemoglobin (Hb)สามารถอยู่ในยีนทั้ง HBA1 / HBA2 (NG_000006),ใช้รองพื้นแตกต่างกันสองคู่เลือกขยายแต่ละสูง homologous HBA1 และ HBA2 ยีน HBA1 เอาต์ และHBA2 ยีนบางส่วนของ (1087 bp) flanking กลายพันธุ์ 13 ทั้งหมดได้ในเวลาต่อมาใช้เป็นแม่แบบสำหรับ genotyping โดยปฏิกิริยาต่อพื้นในต่อหน้าของ allele เฉพาะไพรเมอร์ ใช้เป็น oligonucleotidesไพรเมอร์และคลิปปากตะเข้ในหลักสูตรการศึกษานี้ถูกสังเคราะห์ โดย VBC Genomics (เวน ออสเตรีย) HBA1 และ HBA2 ยีน allele เฉพาะลำดับรองพื้นมีการร้องขอให้ผู้เขียน

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ทั้งหมด PCR
และไพรเมอร์ไพรเมอร์อัลลีลที่เฉพาะเจาะจงสำหรับไพรเมอร์หลายปฏิกิริยาgenotyping ขยายใช้ในการศึกษาครั้งนี้ได้รับการออกแบบ insilico
ใช้ PrimerPremier 5 และ PrimerPlex 2 ซอฟแวร์ (พรีเมียร์ Biosoft
นานาชาติพาโลอัลโต) ตั้งแต่ฮีโมโกลαโซ่ (Hb)
การกลายพันธุ์ที่สามารถอยู่ได้ทั้งในHBA1 และ / หรือยีน HBA2 (NG_000006)
สองคู่ไพรเมอร์ที่แตกต่างกันถูกนำมาใช้เพื่อขยายการคัดเลือกแต่ละ
HBA1 คล้ายคลึงกันอย่างมากและยีน HBA2 HBA1
ขยายและชิ้นส่วนของยีนHBA2 (1087 bp) ขนาบข้างทั้ง 13
กลายพันธุ์ต่อมาถูกนำมาใช้เป็นแม่แบบสำหรับgenotyping
จากปฏิกิริยาขยายไพรเมอร์ในการปรากฏตัวของไพรเมอร์อัลลีลเฉพาะ oligonucleotides ใช้เป็นไพรเมอร์และยานสำรวจในหลักสูตรของการศึกษาครั้งนี้ได้รับการสังเคราะห์โดย VBC ฟังก์ชั่นนี้ (วงเวียนออสเตรีย)
HBA1 และอัลลีลของยีน HBA2
เฉพาะลำดับไพรเมอร์ที่มีอยู่ตามคำขอที่ผู้เขียน

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

PCR ไพรเมอร์ทั้งหมดและเฉพาะอัลลีลไพรเมอร์สำหรับรองพื้น
ปฏิกิริยา multiplex ส่งเสริมการอ่านที่ใช้ในการศึกษานี้ถูกออกแบบมา insilico
ใช้ primerpremier 5 และ primerplex 2 ซอฟต์แวร์ ( พรีเมียร์ ไบโอซอฟท์
นานาชาติ , พาโลอัลโต , แคลิฟอร์เนีย ) ตั้งแต่แอลฟาฮีโมโกลบิน ( Hb ) การกลายพันธุ์โซ่
สามารถอยู่ใน hba1 และ / หรือ hba2 ยีน ( ng_ ,
6 )สองคู่ไพรเมอร์ที่แตกต่างกันถูกนำมาใช้เพื่อเลือกขยายแต่ละ
ขอเปรียบเทียบและ hba1 hba2 ยีน การขยายยีนและ hba1
hba2 เศษ ( 1087 BP ) flanking ทั้งหมด 13 เรื่องถูกใช้เป็นแม่แบบสำหรับการอ่านในภายหลัง

โดยใช้ไพรเมอร์ต่อปฏิกิริยาต่อหน้าเฉพาะอัลลีลไพรเมอร์ . โอลิโกนิวคลีโอไทด์ใช้
ดีเอ็นเอโพรบและในหลักสูตรของการศึกษานี้ถูกสังเคราะห์โดย vbc จีโนมิกส์ ( Wien , ออสเตรีย ) hba1 hba2 ยีนยีนที่เฉพาะเจาะจงและลำดับ
รองพื้นสามารถร้องขอให้ผู้เขียน