The key information processing unit

The key information processing units within gene regulatory networks are enhancers. Enhancer activity is
associated with the production of tissue-specific non coding RNAs, yet the existence of such transcripts during
cardiac development has not been established. Using an integrated genomic approach, we demonstrate that
fetal cardiac enhancers generate long noncoding RNAs (lncRNAs) during cardiac differentiation and morphogenesis.
Enhancer expression correlates with the emergence of active enhancer chromatin states, the initiation
of RNA polymerase II at enhancer loci and expression of target genes. Orthologous human sequences are also
transcribed in fetal human hearts and cardiac progenitor cells. Through a systematic bioinformatic analysis,
we identified and characterized, for the first time, a catalog of lncRNAs that are expressed during embryonic
stem cell differentiation into cardiomyocytes and associated with active cardiac enhancer sequences.
RNA sequencing demonstrates that many of these transcripts are polyadenylated, multiexonic long noncoding
RNAs. Moreover, knockdown of two enhancer-associated lncRNAs resulted in the specific downregulation of
their predicted target genes. Interestingly, the reactivation of the fetal gene program, a hallmark of the stress
response in the adult heart, is accompanied by increased expression of fetal cardiac enhancer transcripts. Altogether,
these findings demonstrate that the activity of cardiac enhancers and expression of their target genes
are associated with the production of enhancer derived lncRNAs.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

หน่วยประมวลผลข้อมูลที่สำคัญภายในเครือข่ายทางยีนเพิ่ม เพิ่มกิจกรรมเกี่ยวข้องกับการผลิตเนื้อเยื่อเฉพาะเจาะจงไม่ใช่ RNAs ยังดำรงอยู่เช่นใบแสดงผลในระหว่างไม่มีการก่อตั้งพัฒนาหัวใจ เราใช้วิธีการ genomic รวม แสดงที่และทารกในครรภ์หัวใจเพิ่มสร้าง RNAs noncoding ยาว (lncRNAs) ในระหว่างการสร้างความแตกต่างที่หัวใจและ morphogenesisเพิ่มนิพจน์คู่กับการเกิดขึ้นของโครมาตินเพิ่มที่ใช้งานอยู่ประเทศอเมริกา เริ่มต้นที่ของอาร์เอ็นเอพอลิเมอเรส II เพิ่ม loci และนิพจน์ของยีนเป้าหมาย Orthologous ลำดับที่มนุษย์ยังมีทับศัพท์ในครรภ์หัวใจมนุษย์และเซลล์หัวใจ progenitor ผ่านการวิเคราะห์ผลเชิงวิวัฒนาการระบบเราระบุ และ ลักษณะ ครั้งแรก แค็ตตาล็อกของ lncRNAs ที่แสดงในช่วงตัวอ่อนเกิดดันเซลล์ cardiomyocytes และเชื่อมโยงกับลำดับงานหัวใจเพิ่มขึ้นลำดับอาร์เอ็นเอแสดงให้เห็นว่า หลายใบแสดงผลเหล่านี้จะ polyadenylated, multiexonic ยาว noncodingRNAs นอกจากนี้ knockdown ของสองสัมพันธ์เพิ่ม lncRNAs ให้ downregulation เฉพาะของยีนเป้าหมายที่คาดการณ์ของพวกเขา เป็นเรื่องน่าสนใจ การเปิดใช้งานใหม่ของโปรแกรมครรภ์ยีน จุดเด่นของความเครียดตอบสนองในผู้ใหญ่ ตามมา ด้วยค่าเพิ่มของใบแสดงผลการเพิ่มหัวใจและทารกในครรภ์ กันผลการวิจัยนี้แสดงให้เห็นที่การเพิ่มหัวใจและนิพจน์ของยีนเป้าหมายของพวกเขาเกี่ยวข้องกับการผลิตของ lncRNAs เพิ่มมา

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

หน่วยประมวลผลข้อมูลที่สำคัญภายในเครือข่ายการกำกับดูแลของยีนที่เพิ่ม กิจกรรม Enhancer เป็น
ที่เกี่ยวข้องกับการผลิตของเนื้อเยื่อเฉพาะ RNAs เข้ารหัสไม่ แต่การดำรงอยู่ของเทปดังกล่าวในระหว่าง
การพัฒนาของหัวใจยังไม่ได้รับการจัดตั้งขึ้น โดยใช้วิธีการที่จีโนมแบบบูรณาการที่เราแสดงให้เห็นว่า
เพิ่มการเต้นของหัวใจของทารกในครรภ์สรยาว noncoding RNAs (lncRNAs) ในระหว่างความแตกต่างหัวใจและ morphogenesis
แสดงออก Enhancer มีความสัมพันธ์กับการเกิดขึ้นของการใช้งานรัฐเพิ่มโครมาติเริ่มต้น
ของ RNA polymerase II ที่เพิ่มสถานะและการแสดงออกของเป้าหมาย ยีน ลำดับของมนุษย์ Orthologous นี้ยังมีการ
คัดลอกในหัวใจของทารกในครรภ์ของมนุษย์และเซลล์ต้นกำเนิดการเต้นของหัวใจ ผ่านการวิเคราะห์ทางชีววิทยาระบบ
เราระบุและโดดเด่นเป็นครั้งแรก, แคตตาล็อกของ lncRNAs ที่จะแสดงในช่วงตัวอ่อน
แตกต่างเซลล์ต้นกำเนิดเป็น cardiomyocytes และที่เกี่ยวข้องกับลำดับเพิ่มการเต้นของหัวใจที่ใช้งาน
RNA ลำดับแสดงให้เห็นว่าส่วนมากของยีนเหล่านี้จะ polyadenylated, multiexonic noncoding นาน
RNAs นอกจากนี้ทั้งสองล้มลง lncRNAs เพิ่มที่เกี่ยวข้องส่งผลให้ downregulation เฉพาะของ
ยีนเป้าหมายของพวกเขาที่คาดการณ์ไว้ ที่น่าสนใจของโปรแกรมการฟื้นฟูยีนของทารกในครรภ์, ตราของความเครียด
การตอบสนองในหัวใจผู้ใหญ่จะมาพร้อมกับการแสดงออกที่เพิ่มขึ้นของทารกในครรภ์เพิ่มบันทึกการเต้นของหัวใจ พรึบ
การค้นพบนี้แสดงให้เห็นว่าการทำงานของหัวใจเพิ่มและการแสดงออกของยีนเป้าหมายของพวกเขา
ที่เกี่ยวข้องกับการผลิตเพิ่มมา lncRNAs

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

คีย์ข้อมูลหน่วยประมวลผลภายในยีนควบคุมเครือข่ายเป็น enhancers . กิจกรรมเสริมคือ
เกี่ยวข้องกับการผลิตไม่ tissue-specific รหัส RNAs ยังคงอยู่ของต้นฉบับในการพัฒนาหัวใจไม่ได้รับการจัดตั้งขึ้น โดยใช้วิธีการแบบบูรณาการจีโนม เราแสดงให้เห็นว่า
การเต้นของหัวใจเพิ่มสร้างนาน noncoding RNAs ( lncrnas ) ในระหว่างการเต้นของหัวใจและการเปลี่ยนแปลงทางสัณฐานวิทยา .
การแสดงออกมีความสัมพันธ์กับการเพิ่มการเพิ่มการระบุ , การเริ่มต้น
ของอาร์เอ็นเอพอลิเมอเรส II ที่สถานะภาพและการแสดงออกของยีนเป้าหมาย ลำดับของมนุษย์ orthologous ยังมี
และหัวใจมนุษย์หัวใจทารกในครรภ์ และเซลล์ต้นกำเนิด .ผ่านระบบไบโอ นฟ ์เมติกการวิเคราะห์
เราระบุและลักษณะ , ครั้งแรก , แคตตาล็อกของ lncrnas ที่แสดงออกในช่วงตัวอ่อนเซลล์ต้นกำเนิดใน cardiomyocytes
ความแตกต่างและที่เกี่ยวข้องกับงานของหัวใจเพิ่ม ลำดับ ลำดับซึ่งแสดงให้เห็นว่าหลาย
ยีนเหล่านี้จะ polyadenylated multiexonic ยาว , noncoding
RNAs . นอกจากนี้น็อคดาวน์สองภาพที่เกี่ยวข้อง lncrnas ส่งผลให้เกิด downregulation เฉพาะ
ของพวกเขาคาดการณ์เป้าหมายยีน น่าสนใจ สถานะของโปรแกรมยีน fetal จุดเด่นของความเครียด
คำตอบในหัวใจผู้ใหญ่คือพร้อม ด้วยการเพิ่มการแสดงออกของการเต้นของหัวใจเพิ่มรายงาน ทั้งหมด
การค้นพบนี้แสดงให้เห็นว่า กิจกรรมการเต้นของหัวใจและเพิ่มการแสดงออกของยีนเป้าหมายของพวกเขา
เกี่ยวข้องกับการผลิตเพิ่มได้มา lncrnas .