The ddLMS PCR combines a simple PCR

The ddLMS PCR combines a simple PCR used for species or genus identification and the LM PCR strategy for strain differentiation. The bacterial identification is confirmed in the form of the PCR product(s), while the length of the PCR product makes it possible to differentiate between bacterial strains. If there is a single copy of the target sequence within genomic DNA, one specific PCR product is created (simplex ddLMS PCR), whereas for multiple copies of the gene the fingerprinting patterns can be obtained (multiplex ddLMS PCR). The described ddLMS PCR method is designed for rapid and specific strain differentiation in medical and microbiological studies. In comparison to other LM PCR it has substantial advantages: enables specific species' DNA-typing without the need for pure bacterial culture selection, is not sensitive to contamination with other cells or genomic DNA, and gives univocal "band-based" results, which are easy to interpret. The utility of ddLMS PCR was shown for Acinetobacter calcoaceticus-baumannii (Acb) complex, the genetically closely related and phenotypically similar species and also important nosocomial pathogens, for which currently, there are no recommended methods for screening, typing and identification. In this article two models are proposed: 3' recA-ddLMS PCR-MaeII/RsaI for Acb complex interspecific typing and 5' rrn-ddLMS PCR-HindIII/ApaI for Acinetobacter baumannii intraspecific typing. ddLMS PCR allows not only for DNA-typing but also for confirmation of species in one reaction. Also, practical guidelines for designing a diagnostic test based on ddLMS PCR for genotyping different species of bacteria are provided

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

DdLMS PCR รวม PCR ได้อย่างง่าย ๆ ที่ใช้สำหรับชนิด หรือสกุลรหัส และกลยุทธ์การสร้างความแตกต่างต้องใช้ LM PCR คุณสามารถยืนยันรหัสแบคทีเรียในรูปแบบของผลิตภัณฑ์ PCR ในขณะที่ความยาวของผลิตภัณฑ์ PCR ทำให้สามารถแยกความแตกต่างระหว่างสายพันธุ์เชื้อแบคทีเรีย ถ้ามีสำเนาเดียวของลำดับเป้าหมายภายใน genomic DNA ผลิตภัณฑ์ PCR เฉพาะหนึ่งจะสร้าง (simplex โดย ddLMS PCR), ในขณะที่สำหรับหลายสำเนาของยีนใน รูปแบบ fingerprinting ได้ (multiplex ddLMS PCR) วิธี PCR ddLMS อธิบายไว้ถูกออกแบบเพื่อสร้างความแตกต่างต้องใช้อย่างรวดเร็ว และเฉพาะในการศึกษาทางจุลชีววิทยา และทางการแพทย์ โดย PCR LM อื่นๆ มันมีข้อดีที่พบ: ให้เฉพาะชนิด DNA-พิมพ์โดยไม่ต้องเลือกวัฒนธรรมเชื้อแบคทีเรียบริสุทธิ์ ไม่ไวต่อการปนเปื้อนกับเซลล์อื่น ๆ หรือ genomic DNA และ univocal "จากวง" ผลลัพธ์ ซึ่งง่ายต่อการตีความให้ โปรแกรมอรรถประโยชน์ ddLMS PCR ถูกแสดงสำหรับ Acinetobacter calcoaceticus-baumannii (Acb) ซับซ้อน การแปลงพันธุกรรมอย่างใกล้ชิดที่เกี่ยวข้อง และคล้ายคลึงกัน phenotypically พันธุ์ และ nosocomial สำคัญโรค ที่อยู่ มีไม่แนะนำวิธี การคัดกรอง พิมพ์รหัส ในบทความนี้ เสนอสองรุ่น: 3 recA-ddLMS PCR-MaeII/RsaI สำหรับ Acb ซับซ้อน interspecific พิมพ์และ 5' rrn-ddLMS PCR-HindIII/ApaI สำหรับ Acinetobacter baumannii intraspecific พิมพ์ ddLMS PCR ได้ไม่เพียงแต่ สำหรับการ พิมพ์ดีเอ็นเอ แต่ยังยืนยันของสปีชีส์ในปฏิกิริยาหนึ่ง ยัง แนวทางปฏิบัติสำหรับการออกแบบทดสอบวินิจฉัยตามที่ ddLMS PCR สำหรับ genotyping ต่างชนิดของแบคทีเรียที่มี

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

PCR ddLMS รวม PCR ง่ายใช้สำหรับสายพันธุ์หรือการระบุประเภทและกลยุทธ์ PCR LM สำหรับความแตกต่างสายพันธุ์ บัตรประจำตัวของเชื้อแบคทีเรียได้รับการยืนยันในรูปแบบของผลิตภัณฑ์ PCR (s) ในขณะที่ความยาวของผลิตภัณฑ์ PCR ทำให้มันเป็นไปได้ที่จะแยกความแตกต่างระหว่างสายพันธุ์ของเชื้อแบคทีเรีย หากมีสำเนาเดียวของลำดับเป้าหมายภายในดีเอ็นเอผลิตภัณฑ์ PCR หนึ่งที่เฉพาะเจาะจงจะถูกสร้างขึ้น (ddLMS เริม PCR) ในขณะที่สำหรับหลายสำเนาของยีนรูปแบบการพิมพ์ลายนิ้วมือสามารถรับได้ (multiplex PCR ddLMS) อธิบายวิธี PCR ddLMS ถูกออกแบบมาสำหรับความแตกต่างของสายพันธุ์อย่างรวดเร็วและเฉพาะเจาะจงในการศึกษาทางการแพทย์และทางจุลชีววิทยา เมื่อเปรียบเทียบกับวิธี PCR LM อื่น ๆ ก็มีข้อได้เปรียบที่สำคัญ: ช่วยให้เฉพาะสายพันธุ์ 'ดีเอ็นเอพิมพ์โดยไม่จำเป็นต้องเลือกวัฒนธรรมแบคทีเรียบริสุทธิ์ที่ไม่ไวต่อการปนเปื้อนกับเซลล์อื่น ๆ หรือดีเอ็นเอและให้ univocal "วงตาม" ผลที่ เป็นเรื่องง่ายที่จะตีความ ยูทิลิตี้ ddLMS PCR ก็แสดงให้เห็นสำหรับ Acinetobacter calcoaceticus-baumannii (Acb) ที่ซับซ้อนทางพันธุกรรมที่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดชนิดและลักษณะภายนอกที่คล้ายกันและเชื้อโรคในโรงพยาบาลที่สำคัญซึ่งขณะนี้ยังไม่มีวิธีการที่แนะนำสำหรับการคัดกรองการพิมพ์และบัตรประจำตัว ในบทความนี้ทั้งสองรุ่นมีการเสนอ: 3 'recA ddLMS-PCR-MaeII / RsaI สำหรับ Acb ซับซ้อนพิมพ์ interspecific และ 5' rrn ddLMS-PCR-HindIII / อภัยสำหรับ Acinetobacter baumannii พิมพ์สำนวน ddLMS PCR ช่วยให้ไม่เพียง แต่สำหรับการพิมพ์ดีเอ็นเอ แต่ยังสำหรับการยืนยันของสปีชีส์หนึ่งในการเกิดปฏิกิริยา นอกจากนี้แนวทางปฏิบัติสำหรับการออกแบบการทดสอบการวินิจฉัยขึ้นอยู่กับวิธี PCR ddLMS genotyping สำหรับสายพันธุ์ที่แตกต่างกันของเชื้อแบคทีเรียที่มีให้

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ddlms PCR รวมง่าย PCR ที่ใช้สำหรับระบุชนิดหรือสกุล และกลยุทธ์สำหรับการเพิ่มซอฟต์แวร์สายพันธุ์ การจำแนกแบคทีเรียได้รับการยืนยันในรูปแบบของผลิตภัณฑ์ PCR ( s ) , ในขณะที่ความยาวของผลิตภัณฑ์ซึ่งทำให้มันเป็นไปได้ที่จะแยกความแตกต่างระหว่างสายพันธุ์แบคทีเรีย หากมีสำเนาเดียวของรหัสดีเอ็นเอเป้าหมายภายใน ,หนึ่งโดยเฉพาะเป็นผลิตภัณฑ์ที่สร้างขึ้น ( เริม ddlms PCR ) ในขณะที่หลายสำเนาของยีนลายรูปแบบได้ ( ddlms multiplex PCR ) อธิบาย ddlms วิธีพีซีอาร์แบบรวดเร็วและเฉพาะสายพันธุ์แยกย่อยในทางการแพทย์และทางจุลชีววิทยาศึกษา ในการเปรียบเทียบกับเทคนิคอื่น ๆมันมีข้อดีอย่างมาก : โดยช่วยให้เฉพาะชนิดดีเอ็นเอพิมพ์โดยไม่ต้องบริสุทธิ์จากวัฒนธรรมการไม่ไวต่อมลภาวะกับเซลล์อื่น ๆหรือดีเอ็นเอ และให้ univocal " วงดนตรีจากผล " ซึ่งง่ายต่อการตีความ ประโยชน์ของ ddlms PCR ถูกแสดงสำหรับ Accipitriformes baumannii ( ACB ) ที่ซับซ้อนทางพันธุกรรมเกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดและ phenotypically ชนิดที่คล้ายกัน และที่สำคัญการติดเชื้อเชื้อโรค ซึ่งขณะนี้ไม่มีแนะนำวิธีการพิมพ์และระบุ ในบทความนี้จะเสนอสองแบบ : 3 ' รีก้า ddlms PCR maeii / rsai สำหรับ ACB ซับซ้อน interspecific พิมพ์และ 5 ' rrn ddlms PCR อภัยสำหรับ Acinetobacter baumannii สายพันธุ์ / เซ็นต์พิมพ์ddlms PCR ช่วยให้ไม่เพียง แต่สำหรับรูปแบบดีเอ็นเอ แต่ยังสำหรับการยืนยันชนิดในปฏิกิริยาหนึ่ง นอกจากนี้ แนวทางการปฏิบัติแบบทดสอบวินิจฉัยตาม ddlms PCR เพื่อส่งเสริมชนิดของแบคทีเรียไว้