Staphylococcus aureus is an importa

Staphylococcus aureus is an important food-borne pathogen that causes a diverse diseases ranging from minor infections to life threatening conditions in humans and animals. To further understand its pathogenesis, the genome of the strain S. aureus FORC_001 was isolated from a contaminated food. Its genome consists of 2,886,017bp double-stranded DNA with a GC content of 32.8%. It is predicted to contain 2,728 open reading frames (ORFs), 57 tRNAs, and 6 rRNA operons, including 1 additional 5S rRNA gene. Comparative phylogenetic tree analysis of 40 complete S. aureus genome sequences using average nucleotide identity (ANI) revealed that the strain FORC_001 belonged to Group I. The closest phylogenetic match was S. aureus MRSA252 according to a whole genome ANI (99.87%), suggesting that they might share a common ancestor. Comparative genome analysis of FORC_001 and MRSA252 revealed two non-homologous regions: Regions I and II. The presence of various antibiotic resistance genes, including the SCCmec cluster in Region I of MRSA252, suggests that this strain might have acquired the SCCmec cluster to adapt to specific environments containing methicillin. Region II of both genomes contains prophage regions but their DNA sequence identity is very low, suggesting that the prophages might differ. This is the first report of the complete genome sequence of S. aureus isolated from a real food-borne outbreak in South Korea. This report would be helpful to extend our understanding about genome, general characteristics, and virulence factors of S. aureus for further studies of pathogenesis, rapid detection, and epidemiological investigation in food-borne outbreak.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

หมอเทศข้างลาย staphylococcus การศึกษาสำคัญที่เชื่อว่าอาหารที่เป็นสาเหตุของโรคมีความหลากหลายตั้งแต่การติดเชื้อเล็กน้อยสภาพคุกคามชีวิตมนุษย์และสัตว์ ได้ เพิ่มเติม เข้าใจพยาธิกำเนิดของ กลุ่มของสายพันธุ์ S. หมอเทศข้างลาย FORC_001 ได้แยกต่างหากจากอาหารปนเปื้อน กลุ่มของจำนวน 2886, 017bp ขนคู่ดีเอ็นเอ ด้วยเนื้อหา GC 32.8% คาดว่า มี 2,728 อ่านเปิดเฟรม (ORFs), 57 tRNAs และ 6 rRNA operons รวม 1 เติม 5S rRNA ยีน วิเคราะห์เปรียบเทียบแผนภูมิ phylogenetic 40 สมบูรณ์ S. หมอเทศข้างลายจีโนมลำดับโดยใช้ข้อมูลประจำตัวของนิวคลีโอไทด์โดยเฉลี่ย (เอนิ) เปิดเผยว่า พันธุ์ FORC_001 เป็นสมาชิกกลุ่มผม ตรง phylogenetic สุดถูกหมอเทศ S. MRSA252 ข้างลายตามจีโนมทั้งเอนิ (99.87%), แนะนำว่า พวกเขาอาจใช้บรรพบุรุษร่วมกัน วิเคราะห์เปรียบเทียบกลุ่มของ FORC_001 และ MRSA252 เปิดเผยไม่ใช่ homologous ภาคสอง: ภูมิภาคดาว ของยีนต้านทานยาปฏิชีวนะต่าง ๆ รวมถึง SCCmec คลัสเตอร์ในภาคพระ MRSA252 แนะนำว่า ต้องใช้นี้อาจได้รับ SCCmec คลัสเตอร์เพื่อปรับให้เข้ากับสภาพแวดล้อมเฉพาะประกอบด้วย methicillin ภาค II genomes ทั้งประกอบด้วย prophage ภูมิภาค แต่ตัวลำดับดีเอ็นเอจะต่ำมาก แนะนำที่ prophages ที่อาจแตกต่างกัน นี้เป็นรายงานแรกของลำดับกลุ่มสมบูรณ์ของหมอเทศข้างลาย S. ที่แยกต่างหากจากการระบาดจริงอาหารเชื่อว่าประเทศเกาหลีใต้ รายงานนี้จะเป็นประโยชน์ต่อความเข้าใจของเราเกี่ยวกับจีโนม ลักษณะทั่วไป และปัจจัย virulence ของ S. หมอเทศข้างลายเพิ่มเติมศึกษาพยาธิกำเนิด ตรวจสอบอย่างรวดเร็ว และตรวจสอบความเชื่อว่าอาหารระบาดใน

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

Staphylococcus aureus เป็นเชื้อโรคอาหารเป็นพิษที่สำคัญที่ทำให้เกิดโรคที่หลากหลายตั้งแต่การติดเชื้อเล็กน้อยเพื่อชีวิตสภาพคุกคามในคนและสัตว์ เพื่อทำความเข้าใจการเกิดโรคของจีโนมของสายพันธุ์เชื้อ S. aureus FORC_001 แยกได้จากอาหารที่ปนเปื้อน จีโนมที่ประกอบด้วย 2,886,017bp ดีเอ็นเอเกลียวคู่ที่มีเนื้อหา GC 32.8% เป็นที่คาดการณ์ว่าจะมี 2,728 เฟรมเปิดอ่าน (ORFs) 57 tRNAs และ 6 operons rRNA รวมทั้งเพิ่มเติม 1 ยีน 5S rRNA การวิเคราะห์เปรียบเทียบต้นไม้สายวิวัฒนาการของ 40 ที่สมบูรณ์ S. aureus ลำดับจีโนมโดยใช้ตัวตนเบื่อหน่ายเฉลี่ย (ANI) เปิดเผยว่า FORC_001 ความเครียดเป็นกลุ่ม I. การแข่งขันสายวิวัฒนาการที่ใกล้เคียงที่สุดคือเชื้อ S. aureus MRSA252 ตาม ANI ทั้งจีโนม (99.87%) แสดงให้เห็นว่า ว่าพวกเขาจะแบ่งปันบรรพบุรุษร่วมกัน การวิเคราะห์จีโนมเปรียบเทียบ FORC_001 และ MRSA252 เปิดเผยสองภูมิภาคท​​ี่ไม่คล้ายคลึงกัน: ภูมิภาค I และ II การปรากฏตัวของยีนต้านทานยาปฏิชีวนะต่าง ๆ รวมทั้งกลุ่ม SCCmec ในภาคผม MRSA252 แสดงให้เห็นว่าสายพันธุ์นี้อาจจะได้รับกลุ่ม SCCmec ปรับให้เข้ากับสภาพแวดล้อมเฉพาะที่มี methicillin ภาคสองของจีโนมของทั้งสองภูมิภาคมี prophage แต่ตัวตนของลำดับดีเอ็นเอของพวกเขาอยู่ในระดับต่ำมากบอกว่า prophages อาจแตกต่างกัน รายงานนี้เป็นรายงานแรกของลำดับจีโนมที่สมบูรณ์ของเชื้อ S. aureus ที่แยกได้จากการระบาดของโรคอาหารเป็นพิษที่แท้จริงในประเทศเกาหลีใต้ รายงานฉบับนี้จะเป็นประโยชน์ในการขยายความเข้าใจของเราเกี่ยวกับจีโนมและลักษณะทั่วไปและปัจจัยความรุนแรงของเชื้อ S. aureus สำหรับการศึกษาเพิ่มเติมของการเกิดโรค, ตรวจสอบอย่างรวดเร็วและการสืบสวนทางระบาดวิทยาในการระบาดอาหารเป็นพิษ

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

เชื้อ Staphylococcus aureus เป็นอาหารสำคัญพาหะเชื้อโรคที่ทำให้เกิดโรคที่หลากหลายตั้งแต่เชื้อเล็กน้อยในภาวะคุกคามชีวิตในมนุษย์และสัตว์ เพื่อเพิ่มเติมความเข้าใจพยาธิกำเนิด จีโนมของเชื้อ S . aureus forc_001 ถูกแยกจากการปนเปื้อนในอาหาร ของโครโมโซมประกอบด้วย 2886017bp คู่เกลียวดีเอ็นเอกับ GC ปริมาณ 32.8 %มันเป็นที่คาดการณ์ว่าจะมี 2728 open reading frames ( orfs ) , 57 trnas และ 6 operons rRNA ยีน 5S rRNA เพิ่มเติม ได้แก่ 1 . การวิเคราะห์เปรียบเทียบชนิดของต้นไม้สมบูรณ์ 40 S . aureus จีโนมลำดับนิวคลีโอไทด์ของใช้ตัวตนเฉลี่ย ( ANI ) พบว่าสายพันธุ์ forc_001 เป็นของกลุ่มผมที่ใกล้ชนิดราคาคือ S . aureus mrsa252 ตามในจีโนมทั้งหมด ( 99.87 % )ชี้ให้เห็นว่าพวกเขาอาจแบ่งปันบรรพบุรุษ การวิเคราะห์จีโนมเปรียบเทียบและ forc_001 mrsa252 เปิดเผยสองไม่ใช่โฮโมโลกัส ภูมิภาค : ภาค I และ II การปรากฏตัวของยีนต้านทานยาปฏิชีวนะต่าง ๆ รวมทั้ง sccmec กลุ่มในเขตของ mrsa252 แนะนําว่า ความเครียดนี้อาจได้รับ sccmec กลุ่มเพื่อปรับให้เข้ากับสภาพแวดล้อมที่เฉพาะเจาะจงที่มีเมทิซิลลิน .เขต 2 ทั้งจีโนมมี prophage ภูมิภาคแต่ของดีเอ็นเอลำดับฐานะต่ำมาก แนะนำว่า prophages อาจแตกต่างกัน นี่คือรายงานแรกของสมบูรณ์จีโนมลำดับของ S . aureus ที่แยกได้จากอาหารจริงที่เกิดการระบาดในเกาหลีใต้ รายงานนี้จะเป็นประโยชน์เพื่อเพิ่มความเข้าใจของเราเกี่ยวกับพันธุกรรม ลักษณะทั่วไป และปัจจัยของความรุนแรง .) ในการศึกษาระบาดวิทยา พยาธิกำเนิด การตรวจสอบและสอบสวนในอาหาร borne ระบาด