Transcription factors (TFs) play an

Transcription factors (TFs) play an important role in the regulation
of secondary metabolites in higher plants. The production of secondary
metabolites is under the strict control of transcription factors that coordinate the expression of biosynthetic genes in plant cells (Gantet
and Memelink, 2002). In our D. officinale 454 EST dataset, a total of
964 unique putative transcripts encoding transcription factors were
identified by comparison to the AGRIS (Arabidopsis Gene Regulatory Information
Server) database. Each of these TFs belongs to one of 48
known TF families (Table 3). The most abundant family in our dataset
is the zinc finger C2H2 TF, including 121 unigenes.
It has been reported that TFs play an important role in regulating
the activity of alkaloid biosynthesis pathways. AP2/ERF TFs are members
of a large gene family that primarily regulate genes related to the
cell cycle, growth and development, and stress-related pathways. In
Nicotiana tabacum (tobacco) and Nicotiana benthamiana, nicotine biosynthesis
is controlled by the NIC2 locus, which comprises a cluster of
AP2/ERF genes (Shoji et al., 2010). In C. roseus, ORCA2 and ORCA3 belong
to the AP2/ERF family and regulate a subset of alkaloid biosynthesis
genes (Fits and Memelink, 2000; Menke et al., 1999). A total
of 22 unique putative transcripts encoding AP2/ERF TFs were identified
in our dataset. In plants, MYB TFs have been implicated in controlling
diverse pathways and processes (Laitinen et al., 2008).
CrBPF1 is a MYB transcription factor that regulates STR expression
in C. roseus (Fits and Memelink, 2000). In our study, 36 unique putative
transcripts encoding MYB transcription factors were found. In
C. roseus, bHLH and bZIP TFs were also isolated and confirmed to regulate
camptothecin biosynthesis. CrMYC2 belongs to the bHLH TF
family and controls the expression of the ORCA genes in C. roseus
(Zhang et al., 2011). CrGBF1 and CrGBF2 belong to the bZIP TFs and
coordinately regulate STR and TDC expression (Sibéril et al., 2001).
In our work, 72 bHLH TFs were discovered, and 49 bZIPs were identified.
All TF types known to be involved in regulating alkaloid biosynthesis
were found in our dataset, and the discovery of these putative
TFs may provide useful information for future work.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ปัจจัยการถอดรหัส (TFs) มีบทบาทสำคัญในการควบคุมของสารรองในพืชสูง การผลิตของรองสารที่อยู่ภายใต้การควบคุมอย่างเข้มงวดปัจจัยถอดที่ประสานงานการแสดงออกของยีน biosynthetic ในเซลล์พืช (Gantetและ Memelink, 2002) ในเรา D. officinale 454 EST ชุดข้อมูล รวม964 เฉพาะอ้างว่าฝาใบเข้ารหัสถอดรหัสปัจจัยได้ระบุเทียบกับ AGRIS (Arabidopsis ยีนข้อมูลเกี่ยวกับกฎระเบียบฐานข้อมูลเซิร์ฟเวอร์) ของ TFs เหล่านี้เป็นหนึ่งใน 48รู้จักครอบครัว TF (ตาราง 3) ครอบครัวมากที่สุดในชุดข้อมูลของเราเป็นนิ้วสังกะสี C2H2 TF รวม 121 unigenesมีรายงานว่า TFs มีบทบาทสำคัญในการควบคุมกิจกรรมของทางการสังเคราะห์อัลคาลอย AP2/ERF TFs เป็นสมาชิกของยีนขนาดใหญ่ สำหรับครอบครัวที่เป็นหลักควบคุมยีนที่เกี่ยวข้องกับการวงจร เจริญเติบโต และการพัฒนา และทางเครียด ในNicotiana tabacum (ยาสูบ) และ Nicotiana benthamiana ชีวสังเคราะห์นิโคตินควบคุม โดยการ NIC2 โลกัสโพล ที่คลัสเตอร์ของAP2/ERF ยีน (โชจิ et al. 2010) ในฝรั่ง C., ORCA2 และ ORCA3 เป็นครอบครัว AP2/ERF และควบคุมชุดย่อยของการสังเคราะห์อัลคาลอยยีน (ตรงและ Memelink, 2000 Menke et al. 1999) ทั้งหมดของ 22 เฉพาะอ้างว่าฝาบันทึกรหัส TFs AP2/ERF ระบุในชุดข้อมูลของเรา ในพืช MYB TFs มีการเกี่ยวข้องในการควบคุมหลากหลายเส้นทางและกระบวนการ (Laitinen et al. 2008)CrBPF1 เป็นตัวถอด MYB ที่ทำ STR นิพจน์ที่ในฝรั่ง C. (ตรงและ Memelink, 2000) ในเรื่องการเรียน 36 เฉพาะอ้างว่าฝาบันทึกรหัส MYB ถอดปัจจัยพบ ในC. TFs ฝรั่ง bHLH และ bZIP ยังแยก และยืนยันในการควบคุมการสังเคราะห์ camptothecin CrMYC2 เป็นของ bHLH TFครอบครัว และควบคุมการแสดงออกของยีน ORCA ใน C. ฝรั่ง(Zhang et al. 2011) CrGBF1 และ CrGBF2 เป็นของ bZIP TFs และcoordinately ควบคุม STR และบริษัท TDC นิพจน์ (Sibéril et al. 2001)ในงานของเรา TFs 72 bHLH ถูกค้นพบ และระบุ 49 bZIPsTF ทุกรุ่นที่รู้จักกันจะเกี่ยวข้องกับการควบคุมการสังเคราะห์อัลคาลอยพบในชุดข้อมูลของเรา และการค้นพบเหล่านี้อ้างว่าฝาต้าอาจให้ข้อมูลที่เป็นประโยชน์สำหรับการทำงานในอนาคต

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ถอดความปัจจัย (TFS) มีบทบาทสำคัญในการควบคุม
ของสารทุติยภูมิในพืชที่สูงขึ้น การผลิตรอง
สารอยู่ภายใต้การควบคุมอย่างเข้มงวดของถอดความปัจจัยที่ประสานงานการแสดงออกของยีนสังเคราะห์ในเซลล์พืช (Gantet
และ Memelink, 2002) ในชุด EST D. officinale 454 ของเราทั้งหมด
964 จิตบำบัดสมมุติที่ไม่ซ้ำกันการเข้ารหัสถอดความปัจจัยที่ถูก
ระบุโดยการเปรียบเทียบกับชื่อเรื่อง: (Arabidopsis ยีนข้อมูลเกี่ยวกับข้อกำหนด
Server ฐานข้อมูล) แต่ละ TFS เหล่านี้เป็นหนึ่งใน 48
ที่รู้จักกันในครอบครัว TF (ตารางที่ 3) ครอบครัวที่มีมากที่สุดในชุดของเรา
เป็น TF สังกะสีนิ้ว C2H2 รวมทั้ง 121 unigenes.
จะได้รับการรายงานว่า TFS มีบทบาทสำคัญในการควบคุม
การทำงานของทางเดินสังเคราะห์อัลคาลอย AP2 / ERF TFS เป็นสมาชิก
ของครอบครัวขนาดใหญ่ของยีนที่เป็นหลักควบคุมยีนที่เกี่ยวข้องกับ
วัฏจักรของเซลล์เจริญเติบโตและการพัฒนาและทางเดินที่เกี่ยวข้องกับความเครียด ใน
Nicotiana tabacum (ยาสูบ) และ Nicotiana benthamiana, การสังเคราะห์สารนิโคติน
จะถูกควบคุมโดยสถานที NIC2 ซึ่งประกอบด้วยคลัสเตอร์ของ
ยีน AP2 / ERF (โชจิ et al., 2010) ใน C. roseus, ORCA2 และ ORCA3 อยู่
กับครอบครัว AP2 / ERF และควบคุมการย่อยของการสังเคราะห์สาร
ยีน (พอดีและ Memelink 2000. Menke, et al, 1999) รวม
ของ 22 จิตบำบัดสมมุติที่ไม่ซ้ำกันการเข้ารหัส AP2 / ERF TFS ถูกระบุ
ในชุดข้อมูลของเรา ในพืช MYB TFS มีส่วนเกี่ยวข้องในการควบคุม
ทางเดินที่มีความหลากหลายและกระบวนการ (Laitinen et al., 2008).
CrBPF1 เป็นปัจจัยถอดความ MYB ที่ควบคุมการแสดงออก STR
ใน C. roseus (พอดีและ Memelink, 2000) ในการศึกษาของเราที่ไม่ซ้ำกัน 36 สมมุติ
ใบรับรองผลการเข้ารหัส MYB ถอดความปัจจัยถูกพบ ใน
ซี roseus, bHLH และ bzip TFS ก็มีความโดดเดี่ยวและได้รับการยืนยันที่จะควบคุม
การสังเคราะห์ยา Camptothecin CrMYC2 เป็นของ bHLH TF
ครอบครัวและการควบคุมการแสดงออกของยีน ORCA ใน C. roseus
(Zhang et al. 2011) CrGBF1 และ CrGBF2 อยู่ใน bzip TFS และ
coordinately ควบคุม STR และการแสดงออก TDC (Sibéril et al., 2001).
ในการทำงานของเรา 72 bHLH TFS ถูกค้นพบและ 49 bZIPs ถูกระบุ.
ประเภท TF ทุกคนที่รู้จักจะมีส่วนร่วมในการควบคุมอัลคาลอย การสังเคราะห์
ถูกพบในชุดของเราและการค้นพบของสมมุติเหล่านี้
TFS อาจให้ข้อมูลที่เป็นประโยชน์สำหรับการทำงานในอนาคต

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ปัจจัยการถอดความ ( TFS ) มีบทบาทสำคัญในการควบคุมของสารประกอบทุติยภูมิในพืชสูง การผลิตทุติยภูมิสารอยู่ภายใต้การควบคุมอย่างเข้มงวดของปัจจัยการถอดความที่ประสานงานและการแสดงออกของยีนในเซลล์พืช ( gantet งานวิจัยและ memelink , 2002 ) ใน D . พะเยา 454 EST DataSet , รวมของมีเอกลักษณ์ซึ่งเป็นปัจจัยการถอดความต้นฉบับโดยระบุ โดยเปรียบเทียบกับ agris ( Arabidopsis ยีนข้อมูลกำกับเซิร์ฟเวอร์ ) ฐานข้อมูล แต่ละของ TFS เหล่านี้เป็นของหนึ่งใน 48รู้จักสมาชิกครอบครัว ( ตารางที่ 3 ) ครอบครัวที่อุดมสมบูรณ์ที่สุดในชุดข้อมูล ของเราเป็นสังกะสีนิ้ว c2h2 TF รวม 121 unigenes .มันได้รับรายงานว่า TFS มีบทบาทสำคัญในการควบคุมกิจกรรมของแอลคาลอยด์ในเส้นทาง . ap2 / TAN TFS ที่เป็นสมาชิกของครอบครัวของยีนขนาดใหญ่ที่เป็นหลักควบคุมยีนที่เกี่ยวข้องกับวัฏจักรเซลล์ การเจริญเติบโตและพัฒนาการ และความเครียดที่เกี่ยวข้องกับทางเดิน . ในการคูณ ( ยาสูบ ) และในขนะ benthamiana นิโคตินถูกควบคุมโดยความเชื่อ nic2 ซึ่งประกอบด้วยกลุ่มของap2 / TAN ยีน ( โชจิ et al . , 2010 ) C . roseus orca2 orca3 อยู่ , และกับครอบครัว ap2 / TAN และควบคุมเป็นส่วนหนึ่งของวิถีการสังเคราะห์อัลคาลอยด์ยีน ( พอดีและ memelink , 2000 ; menke et al . , 1999 ) รวม22 เฉพาะการแสดงออกถึ ap2 / TAN TFS ระบุการเข้ารหัสในวันที่ของเรา ในพืช myb TFS ได้รับเกี่ยวข้องในการควบคุมเส้นทางที่หลากหลายและกระบวนการ ( laitinen et al . , 2008 )crbpf1 เป็น myb ถอดความปัจจัยที่ควบคุมการแสดงออก STRC . roseus ( พอดีและ memelink , 2000 ) ในการศึกษาของเรา 36 เฉพาะการแสดงออกบันทึกการเข้ารหัสการถอดรหัส myb ปัจจัยพบว่า ในC . roseus bhlh Bzip , และ TFS ก็แยก และยืนยันที่จะควบคุมอื่นๆใน . crmyc2 เป็นของ bhlh TFครอบครัวและการควบคุมการแสดงออกของยีนใน roseus Orca .( Zhang et al . , 2011 ) และ crgbf1 crgbf2 เป็นของ Bzip TFS และcoordinately ควบคุม STR และการแสดงออก ( TDC ซิบé ril et al . , 2001 )ในงานของเรา แต่ bhlh TFS ถูกค้นพบและ 49 bzips ระบุ .ประเภทที่รู้จักกันทั้งหมด TF ได้มีส่วนในการควบคุมวิถีการสังเคราะห์อัลคาลอยด์พบในข้อมูล และการค้นพบของกรดอะมิโนเหล่านี้ทริสเรทติ้งอาจจะให้ข้อมูลที่เป็นประโยชน์สำหรับการทำงานในอนาคต