In recent years, real-time PCR meth

In recent years, real-time PCR methods have been developed for
the rapid detection of several bacterial strains. Real-time PCR is a
promising tool for distinguishing specific sequences from a
complex mixture of DNA and therefore is useful for analyzing the
presence and quantity of pathogen-specific or other unique
sequences within a sample. With appropriate real-time PCR
primers and probes, PCR can be used to rapidly identify pure cultures
of bacteria. Several studies report the identification of
Agrobacterium sp. by PCR technique from naturally infected plants
(Cubero, Martinez, Llop, & Lopez, 1999), inoculated plants (Cubero
et al., 1999; Puopolo, Raio, & Zoina, 2007) and soils (Krimi, Petit,
Mougel, Dessaux, & Nesme, 2002; Mougel, Cournoyer, & Nesme,
2001; Yang et al., 2011). Several real-time PCR assays have been
developed to detect bacteria in plants, including Clavibacter
sepedonicus (Schaad, Berthier-Schaad, Sechler, & Knorr, 1999) and
Ralstonia solanacearum (Weller, Elphinstone, Smith, & Stead,
2000) in potato tubers, Agrobacterium strains from plants (Weller
& Stead, 2002), and Xylella fastidiosa in asymptomatic grape vines
(Schaad, Opgenorth, & Gaush, 2002). Weller, Elphinstone, Smith,
Boonham, and Stead (2000) were able to detect 100 CFU/ml of a
pure culture of R. solanacearum using TaqMan
and the 7700
sequence detection system using either a genus-specific 16S probe
or a biovar (bv) 2-specific probe. To maintain cost-effectiveness of
detection methods, the routine detection labs use generally an initial
step of ‘‘screening” which target elements present in the inserts
of numerous GMOs (Chaouachi, Ben Hafsa, Nabi, Zellama, & Said,
2014). In case of positive results, a second step of specific PCR
attempts identifies and quantifies the GMO relatively to the plant
taxon (Chaouachi et al., 2014).

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ในปีที่ผ่านมา วิธี PCR แบบเรียลไทม์ได้ถูกพัฒนาขึ้นสำหรับตรวจสอบอย่างรวดเร็วของสายพันธุ์แบคทีเรียหลาย PCR แบบเรียลไทม์เป็นการเครื่องมือสัญญาสำหรับการแยกแยะลำดับเฉพาะจากการส่วนผสมที่ซับซ้อนของดีเอ็นเอซึ่งมีประโยชน์สำหรับการวิเคราะห์สถานะและปริมาณของการศึกษาที่เฉพาะเจาะจงหรือเฉพาะอื่น ๆลำดับภายในตัวอย่าง มี PCR ที่เหมาะสมแบบเรียลไทม์ไพรเมอร์และคลิปปากตะเข้ PCR สามารถใช้ระบุวัฒนธรรมบริสุทธิ์อย่างรวดเร็วของแบคทีเรีย การศึกษาหลายรายงานที่ระบุSp.อโกรแบคทีเรียม โดยเทคนิค PCR จากพืชติดเชื้อตามธรรมชาติ(Cubero มาติ เน่ Llop, & โล เปซ 1999), พืช (Cubero inoculatedร้อยเอ็ด al., 1999 Puopolo, Raio, & Zoina, 2007) และดินเนื้อปูน (Krimi เชิญMougel, Dessaux, & Nesme, 2002 Mougel, Cournoyer, & Nesme2001 ยาง et al., 2011) หลาย assays PCR แบบเรียลไทม์ได้พัฒนาขึ้นเพื่อตรวจหาเชื้อแบคทีเรียในพืช การรวม Clavibactersepedonicus (Schaad, Berthier Schaad, Sechler และ Knorr, 1999) และRalstonia solanacearum (เวลเลอร์ Elphinstone สมิธ และ นี้มันฝรั่งใน 2000) tubers อโกรแบคทีเรียมสายพันธุ์จากพืช (เวลเลอร์และนี้ 2002), และ fastidiosa Xylella ในองุ่นนำแสดงอาการ(Schaad, Opgenorth, & Gaush, 2002) สมิธเวลเลอร์ ElphinstoneBoonham และนี้ (2000) สามารถตรวจพบ 100 CFU/ml ของการวัฒนธรรมบริสุทธิ์ของ R. solanacearum ใช้ TaqMan และ 7700ระบบการตรวจสอบลำดับที่ใช้เป็นโพรบการเฉพาะสกุล 16Sหรือโพรบ 2 เฉพาะ biovar (bv) ประหยัดค่าใช้จ่ายของการรักษาวิธีการตรวจสอบ ห้องปฏิบัติการตรวจสอบประจำใช้โดยทั่วไปเป็นต้นขั้นตอนการ "คัดกรอง" ซึ่งมีองค์ประกอบของเป้าหมายในการแทรกของการดัดแปลงพันธุกรรมจำนวนมาก (Chaouachi, Ben Hafsa, Nabi, Zellama และกล่าว ว่า2014) ในกรณีที่ผลบวก เฉพาะ PCR ขั้นที่สองความพยายามในการระบุ และ quantifies จีเอ็มโอกับพืชค่อนข้างtaxon (Chaouachi et al., 2014)

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ในปีที่ผ่านมาตามเวลาจริงวิธี PCR
ได้รับการพัฒนาสำหรับการตรวจสอบอย่างรวดเร็วของแบคทีเรียหลายสายพันธุ์ PCR แบบ Real-time เป็นเครื่องมือที่มีแนวโน้มสำหรับความแตกต่างลำดับที่เฉพาะเจาะจงจากส่วนผสมที่ซับซ้อนของดีเอ็นเอและดังนั้นจึงจะเป็นประโยชน์สำหรับการวิเคราะห์ปรากฏตัวและปริมาณของเชื้อโรคที่เฉพาะเจาะจงหรืออื่นๆ ที่ไม่ซ้ำกันวนเวียนอยู่ภายในตัวอย่าง ด้วยแบบ real-time PCR ที่เหมาะสมไพรเมอร์และโพรบPCR สามารถนำมาใช้อย่างรวดเร็วระบุเชื้อบริสุทธิ์ของเชื้อแบคทีเรีย การศึกษาหลายรายงานบัตรประจำตัวของเอสพี Agrobacterium โดยใช้เทคนิค PCR จากพืชที่ติดเชื้อตามธรรมชาติ(Cubero, มาร์ติเน Llop และโลเปซ, 1999) พืชเชื้อ (Cubero et al, 1999;. Puopolo, Raio และ Zoina 2007) และดิน (Krimi, Petit, Mougel, Dessaux, และ Nesme 2002; Mougel, Cournoyer และ Nesme, 2001; Yang et al, 2011). หลายเวลาจริงการตรวจ PCR ได้รับการพัฒนาขึ้นเพื่อตรวจหาเชื้อแบคทีเรียในพืชรวมทั้งClavibacter sepedonicus (Schaad, Berthier-Schaad, Sechler และคนอร์, 1999) และRalstonia solanacearum (เวลเลอร์ Elphinstone สมิ ธ และตัวแทน, 2000) ในหัวมันฝรั่ง , สายพันธุ์ Agrobacterium จากพืช (เวลเลอร์และตัวแทน, 2002) และ Xylella fastidiosa ในเถาองุ่นที่ไม่มีอาการ(Schaad, Opgenorth และ Gaush, 2002) เวลเลอร์ Elphinstone สมิ ธBoonham และตัวแทน (2000) มีความสามารถในการตรวจสอบ 100 CFU / ml ของวัฒนธรรมอันบริสุทธิ์ของอาร์solanacearum ใช้ TaqMan? 7700 และระบบการตรวจสอบลำดับโดยใช้สกุลเฉพาะ16S สอบสวนหรือไบโอวาร์(bv) 2 เฉพาะการสอบสวน เพื่อรักษาค่าใช้จ่ายที่มีประสิทธิภาพของวิธีการตรวจสอบที่ห้องปฏิบัติการตรวจสอบการใช้งานประจำวันโดยทั่วไปเริ่มต้นขั้นตอนของ'' คัดกรอง "ซึ่งองค์ประกอบที่กำหนดเป้าหมายในปัจจุบันแทรกของGMOs จำนวนมาก (Chaouachi เบน Hafsa, บิ Zellama และพูด2014) ในกรณีที่มีผลในเชิงบวกที่มีขั้นตอนที่สองของ PCR เฉพาะความพยายามที่ระบุและประเมินจีเอ็มโอค่อนข้างพืชแท็กซอน(Chaouachi et al., 2014)

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ใน ปี ล่าสุด วิธี PCR แบบเรียลไทม์ได้ถูกพัฒนาขึ้นสำหรับการตรวจสอบอย่างรวดเร็วของแบคทีเรีย
หลายสายพันธุ์ เวลาจริงซึ่งเป็นเครื่องมือสำหรับแยกเฉพาะสัญญา

ลำดับจากส่วนผสมที่ซับซ้อนของดีเอ็นเอและดังนั้นจึงเป็นประโยชน์สำหรับการวิเคราะห์
ตนและปริมาณของเชื้อโรคที่เฉพาะเจาะจงหรือลำดับเฉพาะ
อื่นๆภายในตัวอย่าง ด้วยวิธี PCR แบบเรียลไทม์ และใช้ที่เหมาะสม
,PCR สามารถใช้อย่างรวดเร็วระบุวัฒนธรรม
เชื้อบริสุทธิ์ การศึกษาหลายรายงานระบุ
Agrobacterium sp . โดยเทคนิค PCR จากธรรมชาติโรคพืช
( cubero มาร์ติเนซ llop & , , โลเปซ , 1999 ) จากพืช ( cubero
et al . , 1999 ; puopolo raio & , , zoina , 2007 ) และดิน ( krimi Petit mougel , dessaux & nesme
, , , 2002 ; mougel cournoyer & nesme
, , , 2001 ; ยาง et al . ,2011 ) หลายแบบ PCR ) ได้รับการพัฒนาการตรวจสอบแบคทีเรียในพืช

sepedonicus รวมทั้ง clavibacter ( schaad เบอร์แทร์ schaad sechler & , , , นอร์ , 1999 ) และ
ralstonia solanacearum ( เวลเลอร์ เอลฟินสโตน สมิธ &แทน
2000 ) ในมันฝรั่งหัวอโกรแบคทีเรียมสายพันธุ์ , จากพืช ( เวลเลอร์
&แทน , 2002 ) และ xylella fastidiosa ในเถาองุ่นหรือ
( schaad opgenorth , ,& gaush , 2002 ) เวลเลอร์ เอลฟินสโตน , สมิธ ,
boonham และแทน ( 2000 ) สามารถตรวจสอบ 100 cfu / ml ของ
เชื้อบริสุทธิ์ของ R . solanacearum โดยใช้ taqman
และ 7.700
ลำดับระบบตรวจจับโดยใช้ทั้งสกุลเฉพาะใช้โพรบ
หรือไบโอวาร์ ( BV ) 2-specific สอบสวน เพื่อรักษาต้นทุน
วิธีการตรวจหา ห้องปฏิบัติการตรวจสอบตามปกติใช้โดยทั่วไปเริ่มต้น
ขั้นตอนของ 'screening " ซึ่งเป้าหมายองค์ประกอบที่มีอยู่ในการแทรก
ของ GMOs มากมาย ( chaouachi เบน hafsa Nabi zellama & , , , กล่าวว่า ,
2014 ) ในกรณีของผลลัพธ์ที่เป็นบวก ขั้นตอนที่สองของความพยายาม PCR
เฉพาะระบุและ quantifies จีเอ็มโอค่อนข้างพืช
ชนิด ( chaouachi et al . , 2010 )