The identification of cancer driver

The identification of cancer drivers is a major goal of current cancer research. Finding driver genes within large
chromosomal events is especially challenging because such alterations encompass many genes. Previously, we
demonstrated that zebrafish malignant peripheral nerve sheath tumors (MPNSTs) are highly aneuploid, much like human
tumors. In this study, we examined 147 zebrafish MPNSTs by massively parallel sequencing and identified both large and
focal copy number alterations (CNAs). Given the low degree of conserved synteny between fish and mammals, we reasoned
that comparative analyses of CNAs from fish versus human MPNSTs would enable elimination of a large proportion of
passenger mutations, especially on large CNAs. We established a list of orthologous genes between human and zebrafish,
which includes approximately two-thirds of human protein-coding genes. For the subset of these genes found in human
MPNST CNAs, only one quarter of their orthologues were co-gained or co-lost in zebrafish, dramatically narrowing the list of
candidate cancer drivers for both focal and large CNAs. We conclude that zebrafish-human comparative analysis represents
a powerful, and broadly applicable, tool to enrich for evolutionarily conserved cancer drivers.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

รหัสของมะเร็งเป็นเป้าหมายสำคัญของการวิจัยโรคมะเร็งปัจจุบัน ค้นหาโปรแกรมควบคุมยีนภายในขนาดใหญ่กิจกรรมโอกาสเป็นความท้าทายอย่างยิ่งเนื่องจากการเปลี่ยนแปลงดังกล่าวครอบคลุมหลายยีน ก่อนหน้านี้ เราแสดงให้เห็นว่าเนื้องอกปลอกเส้นประสาทต่อพ่วงร้ายปลาม้าลาย (MPNSTs) aneuploid สูง เหมือนมนุษย์เนื้องอก ในการศึกษานี้ เราตรวจ MPNSTs ปลาม้าลาย 147 ลำดับขนานอย่างหนาแน่น และระบุทั้งขนาดใหญ่ และการแปลงจำนวนของสำเนาโฟกัสใน (CNAs) เรากำหนดระดับต่ำ synteny นำปลาและเลี้ยงลูกด้วยนม reasonedการวิเคราะห์เปรียบเทียบของ CNAs จากปลาเมื่อเทียบกับมนุษย์ MPNSTs จะให้กำจัดขนาดพันธุ์ผู้โดยสาร โดยเฉพาะอย่างยิ่งบนใหญ่ CNAs เราสร้างรายการของยีน orthologous ระหว่างมนุษย์และปลาม้าลายซึ่งมีประมาณสองในสามของยีนมนุษย์รหัสโปรตีน สำหรับชุดย่อยของยีนเหล่านี้พบในมนุษย์MPNST CNAs เพียงหนึ่งในสี่ของ orthologues ของพวกเขาร่วมรับ หรือร่วมหายไปในปลาม้าลาย จำกัดให้แคบลงรายการอย่างมากควบคุมมะเร็งผู้สมัครสำหรับ CNAs โฟกัส และขนาดใหญ่ เราสรุปว่า มนุษย์ปลาม้าลายวิเคราะห์เปรียบเทียบแทนเครื่องมือที่มีประสิทธิภาพ และใช้ ได้อย่างกว้างขวาง บริการสำหรับ evolutionarily อนุรักษ์ควบคุมโรคมะเร็ง

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

บัตรประจำตัวของไดรเวอร์มะเร็งเป็นเป้าหมายสำคัญของการวิจัยโรคมะเร็งในปัจจุบัน หายีนขับรถขนาดใหญ่ที่อยู่ใน
เหตุการณ์โครโมโซมเป็นสิ่งที่ท้าทายอย่างยิ่งเพราะการปรับเปลี่ยนดังกล่าวครอบคลุมหลายยีน ก่อนหน้านี้เรา
แสดงให้เห็นว่า zebrafish มะเร็งเนื้องอกต่อพ่วงปลอกประสาท (MPNSTs) จะ aneuploid สูงมากเช่นมนุษย์
เนื้องอก ในการศึกษานี้เราตรวจสอบ 147 MPNSTs zebrafish โดยลำดับขนานขนาดใหญ่และมีการระบุทั้งขนาดใหญ่และ
โฟกัสการปรับเปลี่ยนจำนวนสำเนา (CNAs) ได้รับการศึกษาระดับปริญญาต่ำของ synteny อนุรักษ์ระหว่างปลาและเลี้ยงลูกด้วยนมเรามีเหตุผล
ที่จะวิเคราะห์เปรียบเทียบ CNAs จากปลาเมื่อเทียบกับ MPNSTs มนุษย์จะช่วยให้การกำจัดของเป็นสัดส่วนใหญ่ของ
การกลายพันธุ์ของผู้โดยสารโดยเฉพาะอย่างยิ่งใน CNAs ขนาดใหญ่ เราสร้างรายการของยีน orthologous ระหว่างมนุษย์และ zebrafish ให้
ซึ่งรวมถึงประมาณสองในสามของมนุษย์ยีนโปรตีนเข้ารหัส สำหรับย่อยของยีนเหล่านี้พบในมนุษย์
MPNST CNAs เพียงหนึ่งในสี่ของ orthologues ของพวกเขาร่วมรับหรือร่วมหายไปใน zebrafish ละครแคบลงรายชื่อของ
ไดรเวอร์โรคมะเร็งสำหรับผู้สมัครทั้งโฟกัสและขนาดใหญ่ CNAs เราสรุปได้ว่า zebrafish มนุษย์การวิเคราะห์เปรียบเทียบหมายถึงการ
ที่มีประสิทธิภาพและในวงกว้างซึ่งเป็นเครื่องมือเพื่อเพิ่มสำหรับไดรเวอร์มะเร็งอนุรักษ์วิวัฒนาการ

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

กำหนดไดรเวอร์มะเร็งเป็นเป้าหมายหลักของการวิจัยมะเร็งในปัจจุบัน ค้นหาไดรเวอร์ยีนภายในขนาดใหญ่เหตุการณ์ครั้งนี้ เป็นสิ่งที่ท้าทาย เพราะการเปลี่ยนแปลงดังกล่าวครอบคลุมหลายยีน ก่อนหน้านี้ , เราพบว่าปลาม้าลายเนื้อร้ายเนื้องอกเส้นประสาทส่วนปลายฝัก ( mpnsts ) ขอ aneuploid เหมือนมนุษย์เนื้องอก ในการศึกษานี้เราตรวจสอบ 147 ปลาม้าลาย mpnsts ขนาน massively ระบุโดยลำดับทั้งขนาดใหญ่และจำนวนสำเนาการเปลี่ยนแปลงโฟกัส ( CNAS ) ให้ระดับต่ำ เพื่อ synteny ระหว่างปลาและสัตว์เลี้ยงลูกด้วยนม เราใช้เหตุผลที่เปรียบเทียบวิเคราะห์ของ CNAS จากปลา กับ มนุษย์ mpnsts จะช่วยให้ขจัดสัดส่วนขนาดใหญ่ของการกลายพันธุ์ของผู้โดยสารโดย CNAS ขนาดใหญ่ เราสร้างรายการของยีน orthologous ระหว่างมนุษย์และปลาม้าลาย ,ซึ่งรวมถึงประมาณสองในสามของโปรตีนมนุษย์นะครับยีน สำหรับบางส่วนของยีนที่พบในมนุษย์mpnst CNAS เพียงหนึ่งในสี่ของพวกเขาได้รับ หรือ orthologues Co Co หายไปในปลาม้าลาย เป็นคุ้งเป็นแควลดรายการไดรเวอร์สำหรับผู้สมัครมะเร็งทั้งโฟกัสและขนาดใหญ่ CNAS . เราสรุปได้ว่าปลาม้าลายมนุษย์ การวิเคราะห์เชิงเปรียบเทียบ หมายถึงที่มีประสิทธิภาพและสามารถใช้ได้อย่างกว้างขวาง เครื่องมือเพื่อเพิ่มสำหรับ evolutionarily รักษามะเร็งไดรเวอร์