AbstractBACKGROUND:Staphylococcus a

Abstract
BACKGROUND:
Staphylococcus aureus is a pathogen that causes food poisoning and community-associated infection with antibiotic resistance. This species is an indigenous intestinal microbe found in infants and not found in adult intestine. The relatively small genome size and rapid evolution of antibiotic resistance genes in the species have been drawing an increasing attention in public health. To extend our understanding of the species and use the genome data for comparative genomic studies, we sequenced the type strain of S. aureus subsp. aureus DSM 20231T.
RESULTS:
Seventeen contigs were generated using hybrid assembly of sequences derived from the Roche 454 and Illumina systems. The length of the genome sequence was 2,902,619 bases with a G + C content of 32.8%. Among the 2,550 annotated CDSs, 44 CDSs were annotated to antibiotic resistance genes and 13 CDSs were related to methicillin resistance. It is interesting to note that this strain was first isolated in 1884 before methicillin was generally used on patients.
CONCLUSIONS:
The present study analyzed the genome sequence of S. aureus subsp. aureus type strain as the reference sequence for comparative genomic analyses of clinical isolates. Methicillin resistance genes found in the genome indicate the presence of antibiotic resistance mechanism prior to the usage of antibiotics. Further comparative genomic studies of methicillin-resistant strains based on this reference genome would help to understand the evolution of resistance mechanism and dissemination of resistance genes.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

บทคัดย่อพื้นหลัง:หมอเทศข้างลาย staphylococcus ศึกษาที่ทำให้เกิดอาหารเป็นพิษและการติดเชื้อร่วมของชุมชนกับความต้านทานยาปฏิชีวนะ ได้ นกชนิดนี้มีพื้นลำไส้ microbe พบในทารก และไม่พบในลำไส้ผู้ใหญ่ได้ ขนาดค่อนข้างเล็กจีโนมและวิวัฒนาการอย่างรวดเร็วของยีนต้านทานยาปฏิชีวนะในสายพันธุ์มีการวาดความสนใจเพิ่มขึ้นในสาธารณสุข การขยายของเราเข้าใจในสายพันธุ์ และใช้ข้อมูลจีโนม genomic ศึกษาเปรียบเทียบ เราเรียงลำดับชนิดสายพันธุ์ของ S. หมอเทศข้างลายถั่วหมอเทศข้างลาย DSM ต. 20231ผลลัพธ์:Contigs 17 ถูกสร้างโดยใช้แอสเซมบลีผสมลำดับที่ได้รับจากระบบ Roche 454 Illumina ความยาวของลำดับกลุ่มฐาน 2,902,619 G + C เนื้อหา 32.8% ระหว่างแบบอ CDSs 2,550, 44 CDSs ได้ใส่คำอธิบายประกอบกับยีนต้านทานยาปฏิชีวนะ และเกี่ยวข้องกับความต้านทานต่อ methicillin 13 CDSs เป็นที่น่าสนใจทราบว่า ต้องใช้นี้ถูกแยกต่างหากก่อนใน 1884 ก่อนใช้ methicillin ในผู้ป่วยทั่วไปบทสรุป:การศึกษาปัจจุบันวิเคราะห์ลำดับกลุ่มของ S. หมอเทศข้างลายถั่วหมอเทศข้างลายชนิดต้องใช้ตามลำดับการอ้างอิงสำหรับเปรียบเทียบวิเคราะห์ genomic ของทางคลินิกแยก ยีนต้านทาน methicillin ในจีโนมบ่งชี้สถานะของกลไกต้านทานยาปฏิชีวนะก่อนการใช้ยาปฏิชีวนะ เพิ่มเติม ศึกษา genomic เปรียบเทียบสายพันธุ์ทนทานต่อ methicillin ตามกลุ่มอ้างอิงนี้จะช่วยให้เข้าใจวิวัฒนาการของกลไกการต่อต้านและการเผยแพร่ของยีนต้านทาน

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

บทคัดย่อ
ภูมิหลัง:
Staphylococcus aureus เป็นเชื้อโรคที่ทำให้เกิดโรคอาหารเป็นพิษและการติดเชื้อในชุมชนที่เกี่ยวข้องกับการต้านทานยาปฏิชีวนะ นี่คือสายพันธุ์จุลินทรีย์ในลำไส้ของชนพื้นเมืองที่พบในเด็กทารกและไม่พบในลำไส้ของผู้ใหญ่ ขนาดจีโนมมีขนาดค่อนข้างเล็กและวิวัฒนาการอย่างรวดเร็วของยาปฏิชีวนะยีนต้านทานในสายพันธุ์ที่ได้รับการวาดภาพความสนใจเพิ่มขึ้นในสุขภาพของประชาชน ที่จะขยายความเข้าใจของเราของสายพันธุ์และใช้ข้อมูลจีโนมเพื่อการศึกษาจีโนมเปรียบเทียบเราติดใจสายพันธุ์ชนิดของเชื้อ S. aureus subsp aureus DSM 20231T
ผล
เจ็ด contigs ถูกสร้างขึ้นโดยใช้ชุดไฮบริดของลำดับมาจากโรช 454 และ Illumina ระบบ ความยาวของลำดับจีโนมเป็น 2,902,619 ฐานที่มีปริมาณ G + C 32.8% ระหว่าง 2,550 ข้อเขียน CDSs 44 CDSs ถูกข้อเขียนเพื่อปฏิชีวนะยีนต้านทานและ 13 CDSs ที่เกี่ยวข้องกับความต้านทาน methicillin เป็นที่น่าสนใจที่จะทราบว่าสายพันธุ์นี้ถูกแยกออกเป็นครั้งแรกในปี 1884 ก่อนที่จะถูกนำมาใช้ methicillin โดยทั่วไปในผู้ป่วย
สรุป
การศึกษาครั้งนี้วิเคราะห์ลำดับจีโนมของเชื้อ S. aureus subsp สายพันธุ์ชนิด aureus เป็นลำดับอ้างอิงสำหรับการเปรียบเทียบจีโนมของเชื้อวิเคราะห์ทางคลินิก ยีนต้านทาน methicillin ที่พบในจีโนมระบุตัวตนของยาปฏิชีวนะกลไกการต้านทานก่อนที่จะมีการใช้ยาปฏิชีวนะ การศึกษาจีโนมต่อไปเปรียบเทียบสายพันธุ์ methicillin ทนอยู่บนพื้นฐานของจีโนมอ้างอิงนี้จะช่วยให้เข้าใจวิวัฒนาการของกลไกการต้านทานและการเผยแพร่ของยีนต้านทาน

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

พื้นหลังนามธรรม
:
Staphylococcus aureus เป็นเชื้อโรคที่ทำให้เกิดโรคอาหารเป็นพิษ และการติดเชื้อที่เกี่ยวข้องกับการต้านทานยาปฏิชีวนะในชุมชน . สายพันธุ์นี้เป็นชนพื้นเมืองในจุลินทรีย์พบในทารกและไม่พบในลำไส้ของผู้ใหญ่จีโนมขนาดค่อนข้างเล็กและวิวัฒนาการอย่างรวดเร็วของยีนต้านทานยาปฏิชีวนะในสปีชีส์มีการเพิ่มความสนใจในสาธารณสุข เพื่อเพิ่มความเข้าใจของเราของชนิดและใช้ข้อมูลพันธุกรรมเพื่อการศึกษาจีโนมเปรียบเทียบ เราลำดับชนิดของเชื้อ S . aureus subsp . ( DSM 20231t .

ผล :อายุ 17 สูงถูกสร้างขึ้นโดยใช้ชิ้นส่วนของยีนลูกผสมที่ได้มาจากโรชและ Illumina ระบบ ความยาวของโครโมโซมลำดับคือ 2902619 ฐานกับ G C เนื้อหาของ   32.8 % ระหว่าง 2550 บันทึกย่อ cdss 44 cdss ยีนต้านทานยาปฏิชีวนะ และมีบันทึกย่อ 13 cdss เกี่ยวกับเมทิซิลลินต้านทานเป็นที่น่าสนใจที่จะทราบว่าเชื้อที่แยกได้ครั้งแรกในปี 1884 ก่อนที่เมทิซิลลิน มักใช้ในผู้ป่วย .

สรุป : การศึกษาวิเคราะห์จีโนมลำดับของ S . aureus subsp . ประเภท aureus สายพันธุ์เป็นลำดับอ้างอิงสำหรับการวิเคราะห์ทางคลินิกเปรียบเทียบจีโนมของเชื้อเมทิซิลลินยีนต้านทานที่พบในจีโนมบ่งชี้ของกลไกต้านทานยาปฏิชีวนะก่อนการใช้ยาปฏิชีวนะ การเปรียบเทียบจีโนมของสายพันธุ์ methicillin-resistant ศึกษาเพิ่มเติมตามนี้อ้างอิง ) จะช่วยให้เข้าใจวิวัฒนาการของกลไกความต้านทาน และการแพร่กระจายของยีนต้านทาน