Sequence analysis of the region D1/

Sequence analysis of the region D1/D2 of the 26S rRNA gene: A
representative number of isolates in each PCR-RFLP profile obtained
were treated to perform sequence analysis of the domains
D1 and D2 of the 26S rRNA gene (In the RFLP profiles containing up
to six isolates all the yeasts were sequenced. In the case of RFLP
profiles containing between 11 or 12 isolates, 50% of the isolates
were sequenced and in the groups containing more than 60 isolates,
20 percent of them were sequenced). PCR amplification of the
referred region in the 26S rRNA gene with the primers NL1 (50
GCATATCAATAAGCGGAGGAAAAG-30) and NL4 (50-GGTCCGT
GTTTCAAGACGG-30) (Kurtzman and Robnett, 1998) was performed.
The amplification reaction and PCR conditions were described in
Santo et al. (2012). Amplified products were sequenced by LGC
Genomics (Germany) and sequences were compared to those
available in GenBank database at the National Center for Biotechnology
Information (NCBI) using BLAST (http://www.ncbi.nlm.nih.
gov/BLAST/) to be identified by sequence homology with
described type species.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ลำดับวิเคราะห์ภาคง 1/D2 ของยีนใน rRNA 26S: Aหมายเลขพนักงานของแยกในแต่ละโพรไฟล์ PCR-RFLP ที่ได้รับได้รับการรักษาเพื่อทำการวิเคราะห์ลำดับของโดเมนง 1 และ D2 26S rRNA ยีน (ใน RFLP โพรไฟล์ที่ประกอบด้วยค่าyeasts ทั้งหมดถูกเรียงลำดับการแยก 6 ในกรณีของ RFLPโพรไฟล์ที่ประกอบด้วยระหว่าง 11 หรือ 12 ล 50% ของการแยกตามลำดับและ ในกลุ่มที่ประกอบด้วยมากกว่าแยก 60ร้อยละ 20 นั้นถูกเรียงลำดับ) ขยาย PCR ของอ้างอิงในการ 26S rRNA ยีนกับไพรเมอร์ NL1 (50GCATATCAATAAGCGGAGGAAAAG-30) และ NL4 (50-GGTCCGTGTTTCAAGACGG-30) (Kurtzman และ Robnett, 1998) ดำเนินการปฏิกิริยาขยายและเงื่อนไข PCR ได้อธิบายไว้ในซานโต et al. (2012) มีการเรียงลำดับผลิตภัณฑ์เอาต์ โดย LGCGenomics (เยอรมนี) และลำดับเปรียบเทียบในฐานข้อมูลของ GenBank ที่ศูนย์เทคโนโลยีชีวภาพแห่งชาติข้อมูล (NCBI) ใช้ระเบิด (ส่วน http://www.ncbi.nlm.nihgov/ระเบิด /) จะต้องระบุ โดยลำดับ homology กับอธิบายชนิดของพันธุ์

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

การวิเคราะห์ลำดับของภูมิภาค D1 / D2 ของยีน 26S rRNA:
เป็นจำนวนตัวแทนของสายพันธุ์ในแต่ละPCR-RFLP
รายละเอียดที่ได้รับได้รับการรักษาที่จะดำเนินการวิเคราะห์ลำดับของโดเมน
D1 และ D2 ของยีน 26S rRNA (ในรูปแบบ RFLP มีขึ้น
หกสายพันธุ์ยีสต์ทั้งหมดที่มีลำดับขั้นตอน. ในกรณีที่ RFLP
โปรไฟล์ที่มีระหว่างวันที่ 11 หรือ 12 สายพันธุ์, 50%
ของเชื้อมีลำดับขั้นตอนและในกลุ่มที่มีมากกว่า60 สายพันธุ์,
ร้อยละ 20 ของพวกเขามีลำดับขั้นตอน) ขยาย PCR
ของภูมิภาคเรียกใน26S rRNA ยีนกับไพรเมอร์ NL1 (50
GCATATCAATAAGCGGAGGAAAAG-30) และ NL4 (50 GGTCCGT
GTTTCAAGACGG-30) (เคิร์ทซ์และ Robnett, 1998) ได้ดำเนินการ.
ปฏิกิริยาการขยายและเงื่อนไข PCR ถูกอธิบายไว้ใน
Santo et al, (2012) ผลิตภัณฑ์ขยายมีลำดับขั้นตอนโดย LGC
ฟังก์ชั่น (เยอรมนี)
และลำดับเมื่อเทียบกับผู้ที่อยู่ในฐานข้อมูลของGenBank
ที่ศูนย์เทคโนโลยีชีวภาพแห่งชาติสารสนเทศ(NCBI) โดยใช้ระเบิด (http:. //www.ncbi.nlm.nih
gov / ระเบิด /)
ที่จะระบุลำดับที่คล้ายคลึงกันกับชนิดพันธุ์อธิบาย

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

การวิเคราะห์ลำดับเบสของภูมิภาค D1 / D2 ของ 26 rRNA ยีน :
หมายเลขตัวแทนของสายพันธุ์ในแต่ละโปรไฟล์ได้ว่า
ได้รับแสดงการวิเคราะห์ลำดับของโดเมน
D1 และ D2 ของ 26 rRNA ยีนใน RFLP โปรไฟล์ที่มีขึ้น
6 สายพันธุ์ยีสต์ ทั้งหมดนี้ ในกรณีของการติดเชื้อ
โปรไฟล์ที่มีระหว่าง 11 หรือ 12 ไอโซเลท , 50% ของไอโซ
เป็นลำดับ และในกลุ่มที่มีมากกว่า 60 สายพันธุ์
20 เปอร์เซ็นต์ของพวกเขาเป็นลำดับ ) PCR แบบ
หมายถึงภูมิภาคใน 26 rRNA ยีนกับดีเอ็นเอ nl1 ( 50
gcatatcaataagcggaggaaaag-30 ) และ nl4 ( 50-ggtccgt
gtttcaagacgg-30 ) ( เคิร์ทแมน และ robnett , 1998 ) กำหนด แบบและเงื่อนไข
ปฏิกิริยา PCR ได้ถูกอธิบายไว้ใน
Santo et al . ( 2012 )ขยายผลิตภัณฑ์โดยลำดับ lgc
จีโนมิกส์ ( เยอรมนี ) และลำดับเปรียบเทียบกับที่มีอยู่ในฐานข้อมูลขนาดนั้น

ที่ศูนย์ข้อมูลเทคโนโลยีชีวภาพแห่งชาติ ( ncbi ) ใช้ระเบิด ( http : / / www.ncbi . nlm . nih gov .
/ ระเบิด / ) จะระบุลำดับ homology กับ
อธิบายชนิด ประเภท