Background: Alpha-thalassaemia is a

Background: Alpha-thalassaemia is an autosomal recessive disorder characterized by defective production of the
alpha chain of haemoglobin. It is caused mainly by deletions of one or both of the duplicated alpha-globin genes
on chromosome 16, and/or by nucleotide variations, known as “nondeletion” mutations. Definition of the alpha
globin genotype in carriers supports genetic counselling, and in patients with Hb H disease is useful to predict
prognosis and management options. Here, we report a method that facilitates direct detection by naked eye of
the 13 most common “nondeletion” alpha-globin gene mutations in populations around the Mediterranean
and Middle East.
Methods and results: Themethod comprises (i) PCR amplification of a single 1087 bp fragment for each HBA1 and
HBA2 gene (separately); (ii)multiplex primer extension reaction of just 10 cycles, using unpurified amplification
product as a template, to incorporate biotin into those allele-specific primers that extend and, finally, (iii) visual
detection of the reaction products within minutes by the dipstick biosensor. The method was evaluated by
analysing 105 samples of known genotypes and the results were found fully concordant with those obtained
by the reference methods.
Conclusions: The proposed assay is particularly suited for small molecular-diagnostic laboratories with a limited
budget and a low-to-medium sample volume. In addition this platform represents a very simple and useful
genotyping tool to support gene scanning methods whenever nucleotide variations have to be specified.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

พื้นหลัง: thalassaemia อัลฟามีราคาดีเป็น autosomal recessive โรคโดยผลิตสินค้าที่มีตำหนิห่วงโซ่ที่อัลฟาของ haemoglobin เกิดขึ้น โดยการลบหนึ่งหรือทั้งสองของยีนอัลฟา-globin ที่ซ้ำกันบนโครโมโซม 16 และ/หรือ โดยการเปลี่ยนแปลงของนิวคลีโอไทด์ เรียกว่ากลายพันธุ์ "nondeletion" คำจำกัดความของตัวอักษรลักษณะทางพันธุกรรม globin ในสายสนับสนุนให้คำปรึกษาทางพันธุกรรม และในผู้ป่วยที่มี Hb H โรคเป็นประโยชน์ในการทำนายตัวเลือกการคาดคะเนและการจัดการ ที่นี่ เรารายงานวิธีการที่ช่วยตรวจจับโดยตรง ด้วยตาเปล่าที่ 13 มากที่สุด "nondeletion" ยีนอัลฟ่า-globin กลายพันธุ์ในประชากรสถานเมดิเตอร์เรเนียนและตะวันออกกลางวิธีการและผลลัพธ์: Themethod ประกอบด้วย (i) ขยาย PCR ของส่วน bp 1087 เดียวสำหรับแต่ละ HBA1 และยีน HBA2 (ต่างหาก); (ii) multiplex ปฏิกิริยาต่อรองพื้นของรอบ 10 ใช้ขยาย unpurifiedผลิตภัณฑ์อย่าง รวมไบโอตินที่ไพรเมอร์เฉพาะ allele ที่ขยายและ สุดท้าย visual (iii)ตรวจสอบผลิตภัณฑ์ปฏิกิริยาภายในนาที dipstick biosensor วิธีการถูกประเมินโดยวิเคราะห์ 105 ตัวอย่างรู้จักศึกษาจีโนไทป์และผลลัพธ์พบ concordant เต็มที่กับผู้รับโดยวิธีอ้างอิงบทสรุป: วิเคราะห์เสนอจะเหมาะอย่างยิ่งสำหรับห้องปฏิบัติการวินิจฉัยระดับโมเลกุลขนาดเล็กด้วยการจำกัดงบประมาณและเสียงต่ำปานกลางตัวอย่าง นอกจากนี้ แพลตฟอร์มนี้แทนง่ายมาก และมีประโยชน์เครื่องมือ genotyping สนับสนุนวิธีสแกนยีนเมื่อมีการเปลี่ยนแปลงของนิวคลีโอไทด์มีการระบุ

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

พื้นหลัง: อัลฟาธาลัสซีเป็นความผิดปกติของ autosomal
ถอยโดดเด่นด้วยการผลิตที่มีข้อบกพร่องของห่วงโซ่อัลฟาของเม็ดเลือดแดง มันเป็นส่วนใหญ่เกิดจากการลบหนึ่งหรือทั้งสองของยีนอัลฟาโกลบินที่ซ้ำกันบนโครโมโซม 16 และ / หรือเบื่อหน่ายรูปแบบที่เรียกว่า "nondeletion" การกลายพันธุ์
ความหมายของอัลฟาจีโนไทป์ globin ในผู้ให้บริการที่สนับสนุนคำปรึกษาทางพันธุกรรมและในผู้ป่วยที่มีโรค Hb H จะเป็นประโยชน์ที่จะคาดการณ์ตัวเลือกการพยากรณ์โรคและการจัดการ ที่นี่เรารายงานวิธีการที่อำนวยความสะดวกในการตรวจสอบโดยตรงด้วยตาเปล่าของ13 ที่พบมากที่สุด "nondeletion" อัลฟาโกลบินการกลายพันธุ์ของยีนในประชากรทั่วทะเลเมดิเตอร์เรเนียนและตะวันออกกลาง. วิธีการและผล: Themethod ประกอบด้วย (i) การขยาย PCR ของซิงเกิ้ล 1087 ส่วน bp สำหรับแต่ละ HBA1 และยีนHBA2 (แยกต่างหาก); (ii) ไพรเมอร์หลายปฏิกิริยาการขยายตัวของเพียง 10 รอบโดยใช้เครื่องขยายเสียง unpurified สินค้าที่เป็นแม่แบบในการรวมไบโอตินลงไปในผู้ไพรเมอร์อัลลีลเฉพาะที่ขยายและในที่สุด (iii) ภาพการตรวจสอบของผลิตภัณฑ์ปฏิกิริยาภายในไม่กี่นาทีโดย dipstick ไบโอเซนเซอร์ . วิธีการที่ถูกประเมินโดยการวิเคราะห์ตัวอย่าง 105 ของสายพันธุ์ที่รู้จักกันและผลที่ได้รับพบว่าสอดคล้องอย่างเต็มที่กับผู้ที่ได้รับโดยวิธีการอ้างอิง. สรุปผลการวิเคราะห์ที่นำเสนอเหมาะอย่างยิ่งสำหรับห้องปฏิบัติการวินิจฉัยโมเลกุลขนาดเล็กที่มีจำนวน จำกัดงบประมาณและต่ำ-to- ปริมาณตัวอย่างขนาดกลาง นอกจากนี้ในเวทีนี้แสดงให้เห็นถึงมากง่ายและมีประโยชน์เครื่องมือ genotyping เพื่อสนับสนุนวิธีการสแกนยีนเมื่อใดก็ตามที่เบื่อหน่ายการเปลี่ยนแปลงจะต้องมีการระบุไว้

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ประวัติ : เป็นยีนด้อยแอลฟาทาลัสซีเมียโรคลักษณะการผลิตของห่วงโซ่ของฮีโมโกลบิน
เราบกพร่อง มันเป็นสาเหตุหลัก โดยลบของหนึ่งหรือทั้งสองของอัลฟาโกลบินยีนๆ
บนโครโมโซมคู่ที่ 16 และ / หรือการเปลี่ยนแปลงนิวคลีโอไทด์ เรียกว่า " nondeletion " การกลายพันธุ์ คำนิยามของอัลฟาโกลบินยีนพันธุกรรมในผู้ให้บริการ
สนับสนุนให้คำปรึกษาและในผู้ป่วยโรคฮีโมโกลบินเอชเป็นประโยชน์ที่จะทำนาย
พยากรณ์โรคและการจัดการเลือก ที่นี่เรารายงานวิธีการที่อำนวยความสะดวกในการตรวจสอบโดยตรงด้วยตาเปล่าของ
13 ที่พบมากที่สุด " nondeletion " แอลฟาโกลบินยีนกลายพันธุ์ในประชากรรอบทะเลเมดิเตอร์เรเนียนและตะวันออกกลาง
.
วิธีการและผลลัพธ์ : วิธีการประกอบด้วย ( 1 ) PCR แบบเดี่ยวและคู่เบสแต่ละ hba1 และ
hba2 ยีน ( แยก ) ; ( 2 ) ปฏิกิริยา multiplex รองพื้นขยายเพียง 10 รอบ ใช้ผลิตภัณฑ์ (
unpurified เป็นแม่แบบรวม biotin ในอัลลีลไพรเมอร์ที่จำเพาะต่อและสุดท้าย ( 3 ) ภาพ
ตรวจจับผลิตภัณฑ์ปฏิกิริยาภายในไม่กี่นาที โดยชนิดไบโอเซนเซอร์ . วิธีการประเมินโดย
วิเคราะห์ 105 คนรู้จักสายพันธุ์ และพบความสอดคล้องกันอย่างเต็มที่กับผู้รับโดยอ้างอิง

สรุป : เสนอวิธี ทดสอบ เหมาะอย่างยิ่งสำหรับการวินิจฉัยโมเลกุลขนาดเล็กที่มีงบประมาณ จำกัด ห้องปฏิบัติการ
และต่ำปริมาณตัวอย่างขนาดกลาง นอกจากนี้แพลตฟอร์มนี้เป็นง่ายมากและมีประโยชน์
ส่งเสริมเครื่องมือสนับสนุนการสแกนวิธีการลำดับเบสยีนที่เปลี่ยนแปลงจะต้องระบุ