Hepatitis C virus (HCV) genotype 3a

Hepatitis C virus (HCV) genotype 3a accounts for ∼80% of HCV infections in Pakistan, where ∼10 million people are HCV-infected. Here, we report analysis of the genetic heterogeneity of HCV NS3 and NS5b subgenomic regions from genotype 3a variants obtained from Pakistan. Phylogenetic analyses showed that Pakistani genotype 3a variants were as genetically diverse as global variants, with extensive intermixing. Bayesian estimates showed that the most recent ancestor for genotype 3a in Pakistan was last extant in ∼1896–1914 C.E. (range: 1851–1932). This genotype experienced a population expansion starting from ∼1905 to ∼1970 after which the effective population leveled. Death/birth models suggest that HCV 3a has reached saturating diversity with decreasing turnover rate and positive extinction. Taken together, these observations are consistent with a long and complex history of HCV 3a infection in Pakistan.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ลักษณะทางพันธุกรรมโรคไวรัส (สายของ) ผู้ใหญ่ 3 คนบัญชี ∼80% ของเชื้อสายของในปากีสถาน ∼10 ล้านคนติดเชื้อสายของ ที่นี่ เรารายงานวิเคราะห์ heterogeneity ทางพันธุกรรมของสายของ NS3 และ NS5b ภาค subgenomic จากย่อย 3a ลักษณะทางพันธุกรรมที่ได้รับจากปากีสถาน Phylogenetic วิเคราะห์พบว่า ลักษณะทางพันธุกรรมที่ปากีสถาน 3a ย่อยได้หลากหลายเป็นแปลงพันธุกรรมเป็นตัวแปรส่วนกลาง มี intermixing มากมาย ทฤษฎีการประเมินแสดงให้เห็นว่า บรรพบุรุษที่ล่าสุดสำหรับผู้ใหญ่ 3 คนลักษณะทางพันธุกรรมในปากีสถานล่าสุดยังใน ∼1896 – 1914 C.E. (ช่วง: 1851 – 1932) ลักษณะทางพันธุกรรมนี้มีประสบการณ์ขยายประชากรที่เริ่มต้นจาก ∼1905 เพื่อ ∼1970 ที่ประชากรมีประสิทธิภาพจำกัด แบบจำลองการเกิด/ตายแนะนำว่า สายของ 3a แล้ว saturating ความหลากหลาย ด้วยการลดอัตราการหมุนเวียนและบวกดับ ปวง สังเกตเหล่านี้จะสอดคล้องกับเชื้อสายของ 3a ในปากีสถานประวัติยาวนาน และซับซ้อน

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

บัญชีไวรัสตับอักเสบซี (HCV) 3a จีโนไทป์สำหรับ ~80% ของการติดเชื้อไวรัสตับอักเสบซีในปากีสถานที่ ~ 10 ล้านคนที่ติดเชื้อไวรัสตับอักเสบซี ที่นี่เรารายงานการวิเคราะห์ความแตกต่างทางพันธุกรรมของไวรัสตับอักเสบซีภูมิภาค subgenomic NS3 และ NS5b จากจีโนไทป์ 3a สายพันธุ์ที่ได้รับจากประเทศปากีสถาน การวิเคราะห์ phylogenetic แสดงให้เห็นว่าสายพันธุ์ 3a จีโนไทป์ปากีสถานมีความหลากหลายทางพันธุกรรมเป็นสายพันธุ์ระดับโลกที่มีการผสมผสานอย่างกว้างขวาง ประมาณการแบบเบย์แสดงให้เห็นว่าบรรพบุรุษล่าสุดสำหรับ 3a จีโนไทป์ในปากีสถานที่ยังหลงเหลืออยู่เป็นครั้งสุดท้ายใน ~1896-1914 CE (ช่วง: 1851-1932) พันธุ์นี้มีประสบการณ์การขยายตัวของประชากรที่เริ่มต้นจากการ ~1905 ~1970 หลังจากที่ประชากรที่มีประสิทธิภาพระดับ รุ่นความตาย / เกิดชี้ให้เห็นว่าไวรัสตับอักเสบซี 3a ได้ถึง saturating ความหลากหลายที่มีอัตราการหมุนเวียนลดลงและการสูญเสียเชิงบวก ที่ร่วมกันสังเกตเหล่านี้มีความสอดคล้องกับประวัติศาสตร์อันยาวนานและความซับซ้อนของการติดเชื้อไวรัสตับอักเสบซี 3a ในปากีสถาน

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ไวรัสตับอักเสบซีจีโนทัยป์∼ 3A บัญชีสำหรับ 80% ของการติดเชื้อไวรัสตับอักเสบซีในปากีสถาน ซึ่ง∼ 10 ล้านคน เป็นเชื้อไวรัสที่ติดเชื้อ ที่นี่เรารายงานการวิเคราะห์ความหลากหลายทางพันธุกรรมของเชื้อไวรัสและภูมิภาค subgenomic สร้าง ns5b จากพันธุกรรม 3A สายพันธุ์ที่ได้จากปากีสถาน วิเคราะห์ ซึ่งพบว่าชาวปากีสถานกับ 3A เป็นพันธุกรรมที่หลากหลายทั่วโลก ได้แก่ ตัวแปรครอบคลุมความแตกต่าง . ประมาณแบบเบส์พบว่าบรรพบุรุษล่าสุดสำหรับ genotype 3A ในปากีสถานล่าสุดเท่าที่มีอยู่ใน∼ 1896 – 1914 ใช้ ( ช่วง : 1851 – 1932 ) กับประสบการณ์นี้ประชากรการขยายตัวเริ่มจาก∼ 1905 เพื่อ∼ 1970 หลังจากที่ประชากรที่มีระดับรูปแบบการตาย / เกิดแนะนำไวรัสตับอักเสบซี 3A ได้ถึงความหลากหลายสูงลดอัตราการหมุนเวียนและการสูญพันธุ์เป็นบวก ถ่ายด้วยกันการสังเกตเหล่านี้สอดคล้องกับประวัติศาสตร์ที่ยาวและซับซ้อนของการติดเชื้อไวรัสตับอักเสบซี 3A ในปากีสถาน