quence homology with known fungal L

quence homology with known fungal L-tubulin genes. The
partial gene sequences obtained were composed of ¢ve
exons and ¢ve introns. The same number and arrangement
of introns and exons are found in homologous L-tubulin
gene fragments from ascomycetes such as the Colletotrichum
gloeosporioides TUB2 gene (GenBank U14138) as
well as the Aspergillus £avus (GenBank M38265) and Neurospora
crassa (GenBank M13630) L-tubulin genes. The
longer length of the Ceratocystis L-tubulin gene fragments,
about 450 bp, is attributed to longer introns. The L-tubulin
sequences from C. adiposa as well as published Ophiostoma
species have, in addition to shorter introns, one less
intron compared with Ceratocystis species. Comparison of
the deduced L-tubulin protein sequences showed that the
seven Ceratocystis species shared 98^100% sequence identity
with each other.
A branch and bound search of the aligned DNA sequence
data generated three most parsimonious trees,
one of which is shown in Fig. 1. Neighbor-joining analysis
using uncorrected (‘p’) distances produced a single tree
with topology similar to Fig. 1. C. adiposa was chosen
for the outgroup taxon because phylogenetic analysis
based on rDNA showed it to reside on a separate clade
from the other Ceratocystis species under consideration. A
step matrix that weighted transversions as three times
transitions did not have any e¡ect on tree topology. The
analysis identi¢ed two groups within the conifer associated
Ceratocystis species. A most parsimonious tree generated
using the ITS1/5.8S/ITS2 sequences also demonstrated the
same two groups within the conifer associated Ceratocystis
species [15]. C. resinifera and C. ru¢penni were closely
related and formed a single group. A second group was

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

homology quence กับยีน L tubulin เชื้อราชื่อดัง ที่ลำดับยีนบางส่วนได้ถูกประกอบ¢ veexons และ¢ ve introns หมายเลขเดียวกันและจัดของ introns และ exons พบใน homologous L tubulinบางส่วนของยีนจาก ascomycetes เช่น Colletotrichumยีน gloeosporioides TUB2 (GenBank U14138) เป็นดีเป็น avus £ Aspergillus (GenBank M38265) และ Neurosporacrassa (GenBank M13630) L tubulin ยีน ที่ความยาวนานของบางส่วนของยีน Ceratocystis L tubulinประมาณ 450 เป็นบันทึก bp, introns อีกต่อไป L-tubulinลำดับจาก C. adiposa รวมทั้งเผยแพร่ Ophiostomaชนิดได้ นอกจากนี้ introns สั้น หนึ่งintron เปรียบเทียบกับพันธุ์ Ceratocystis การเปรียบเทียบลำดับโปรตีน L tubulin deduced ชี้ให้เห็นว่าการพันธุ์ Ceratocystis เจ็ดร่วม 98 ^ 100% ลำดับรหัสประจำตัวกันสาขาและผูกค้นหาลำดับดีเอ็นเอจัดตำแหน่งข้อมูลสร้างต้นไม้สุด parsimonious 3ที่จะแสดงใน Fig. 1 เพื่อนบ้านเข้าร่วมวิเคราะห์ใช้ระยะทาง ("p') uncorrected ผลิตต้นไม้เดียวมีโครงสร้างคล้ายกับ Fig. 1 เลือก C. adiposaสำหรับ outgroup taxon เนื่องจากวิเคราะห์ phylogeneticตาม rDNA พบมันอยู่ใน clade แยกต่างหากจากอื่น ๆ Ceratocystis พันธุ์ภายใต้การพิจารณา Aเมทริกซ์ขั้นที่ถ่วงน้ำหนักที่ transversions เป็นครั้งที่สามเปลี่ยนได้ไม่มี e¡ect ใด ๆ ในโครงสร้างแผนภูมิ ที่การวิเคราะห์ identi เลข ed 2 กลุ่มภายในสนที่เกี่ยวข้องสายพันธ์ Ceratocystis สร้างต้นไม้สุด parsimoniousใช้ลำดับที่ ITS1/5.8S/ITS2 นอกจากนี้ยัง แสดงให้เห็นว่าการกลุ่มเดียวกันสองภายในสนเกี่ยวข้อง Ceratocystisชนิด [15] C. resinifera และ C. ru penni ลอกได้อย่างใกล้ชิดเกี่ยวข้อง และจัดเป็นกลุ่มเดียวกัน กลุ่มที่สอง

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ที่คล้ายคลึงกันกับลําดับที่รู้จักกันเชื้อรายีน L-tubulin
ลำดับยีนบางส่วนที่ได้รับประกอบด้วย¢และ
exons และ¢และ introns หมายเลขเดียวกันและการจัดเรียง
ของ introns และ exons ที่พบในคล้ายคลึงกัน L-tubulin
ชิ้นส่วนของยีนจาก ascomycetes เช่น Colletotrichum
gloeosporioides ยีน TUB2 (GenBank U14138) รวม
ทั้งเชื้อรา Aspergillus £ AVUS (GenBank M38265) และ Neurospora
crassa (GenBank M13630) L ยีน -tubulin
ความยาวของ Ceratocystis L-tubulin เศษยีน
ประมาณ 450 bp เป็นประกอบกับ introns อีกต่อไป L-tubulin
ลำดับจาก C. adiposa เช่นเดียวกับการตีพิมพ์ Ophiostoma
ชนิดได้นอกเหนือไปจาก introns สั้นน้อย
Intron เมื่อเทียบกับสายพันธุ์ Ceratocystis เปรียบเทียบ
อนุมานลำดับโปรตีน L-tubulin แสดงให้เห็นว่า
เจ็ดชนิด Ceratocystis ที่ใช้ร่วมกัน 98 ^ ลำดับบัตร 100%
กับแต่ละอื่น ๆ .
สาขาและค้นหาผูกพันของลำดับดีเอ็นเอชิด
ข้อมูลที่สร้างขึ้นสามต้นเค็มมากที่สุด
คนหนึ่งซึ่งแสดงในรูป . 1. การวิเคราะห์เพื่อนบ้านเข้า
ใช้ไม่ได้แก้ไข ('p') ระยะทางผลิตต้นไม้ต้นเดียว
ที่มีโครงสร้างคล้ายกับรูป 1. C. adiposa ได้รับเลือก
สำหรับแท็กซอน outgroup เพราะ phylogenetic วิเคราะห์
บนพื้นฐานของ rDNA พบว่ามันไปอยู่ใน clade แยก
จากสายพันธุ์ Ceratocystis อื่น ๆ ภายใต้การพิจารณา
เมทริกซ์ขั้นตอนที่ถ่วงน้ำหนัก transversions เป็นครั้งที่สาม
เปลี่ยนไม่ได้มีe¡ectใน topology ต้นไม้ใด ๆ
การระบุวิเคราะห์¢เอ็ดสองกลุ่มภายในต้นสนที่เกี่ยวข้อง
ชนิด Ceratocystis ต้นไม้ประหยัดที่สุดสร้างขึ้น
โดยใช้ ITS1 / 5.8S / ITS2 ลำดับนอกจากนี้ยังแสดงให้เห็น
เหมือนกันสองกลุ่มภายในต้นสนที่เกี่ยวข้อง Ceratocystis
สปีชีส์ [15] C. resinifera และ C ru ¢เพนนีเป็นอย่างใกล้ชิด
ที่เกี่ยวข้องกันและกลายเป็นกลุ่มเดียว กลุ่มที่สองคือ

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

quence homology กับรู้จักเชื้อรา l-tubulin ยีน
ส่วนลำดับยีนที่ได้รับ ได้แก่ ¢ได้
โค¢ introns และได้ . หมายเลขเดียวกัน และจัดเรียง
ของ introns ที่มีความคล้ายคลึงและพบใน l-tubulin
ยีนเศษจากแอ คไมซีตีส เช่นเชื้อรา Colletotrichum
tub2 ยีน ( ขนาด u14138 )
เป็น Aspergillus ง avus ( ขนาดบอด
m38265 ) และcrassa ( ขนาด m13630 ) l-tubulin ยีน
อีกต่อไปความยาวของ ceratocystis l-tubulin ยีนเศษ
ประมาณ 450 คู่เบส จาก introns อีกต่อไป การ l-tubulin
ลำดับจาก adiposa ตลอดจนเผยแพร่ ophiostoma
ชนิดนอกจาก introns สั้นกว่าหนึ่งน้อย
iNtRON เมื่อเทียบกับ ceratocystis ชนิด การอนุมาน l-tubulin

ลำดับพบว่าโปรตีนชนิดที่ 7 ceratocystis 98
100% ดับตัวตน
กับแต่ละอื่น ๆ .
สาขาและจำกัดการค้นหาของชิดดีเอ็นเอลำดับ
ข้อมูลสร้างสามต้นไม้ตระหนี่ที่สุด
หนึ่งซึ่งแสดงไว้ในรูปที่ 1 เพื่อนบ้านร่วมวิเคราะห์
ใช้ uncorrected ( 'p ' ) ระยะทางผลิต
ต้นไม้เดียวกับโครงสร้างคล้ายกับรูปที่ 1 C .
adiposa ถูกเลือกสำหรับกลุ่ม เพราะการวิเคราะห์ phylogenetic หมวดหมู่
ตามด้วยให้อยู่ในแยก clade
จากชนิดอื่น ๆ ceratocystis ภายใต้การพิจารณา เป็นขั้นตอนที่หนัก transversions เป็นเมทริกซ์

เปลี่ยนสามครั้งไม่ได้มี E ¡ ect ในโครงสร้างต้นไม้
วิเคราะห์ identi ¢เอ็ดสองกลุ่มภายในคอนนิเฟอร์ ceratocystis ชนิดเกี่ยวข้อง

ต้นไม้สร้าง
ตระหนี่ที่สุดการใช้ its1 / 5.8s/its2 ลำดับเช่นเดียว
เดียวกันสองกลุ่มในที่จำพวกสน ceratocystis
ชนิด [ 15 ] C . resinifera . ru ¢ penni เป็นอย่างใกล้ชิด
ที่เกี่ยวข้องและก่อตั้งกลุ่มเดียว กลุ่มที่สอง คือ