Since the exact evolutionary pathwa

Since the exact evolutionary pathways of extant organisms are usually unknown,
it is not suitable to use real data for examining the efficiency of a tree-making method.
Therefore, we employed a computer simulation, comparing reconstructed trees with
their model trees. In this study we compared the efficiency of the NJ method with
that of five other methods: UPGMA (Sokal and Sneath 1963), the DW method, the
ST method, Li’s (LI; 198 1) method, and the MF method. The LI method is a transformed
distance method (see Nei [ 1987, pp. 302-3051 for the explanation of the transformed
distance method), and the MF method is a modification of Farris’s (1972)
method. All these methods produce a unique parsimonious tree from distance data.
We considered both cases of constant and varying (expected) rates of nucleotide substitution.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ตั้งแต่หลักวิวัฒนาการแน่นอนของชีวิตยังไม่รู้จักมักจะไม่เหมาะสมกับใช้ข้อมูลที่แท้จริงสำหรับการตรวจสอบประสิทธิภาพของวิธีการทำแผนภูมิดังนั้น เราทำงานแบบจำลองคอมพิวเตอร์ เปรียบเทียบต้นไม้ที่สร้างขึ้นใหม่ด้วยต้นไม้ของรูปแบบการ ในการศึกษานี้ เราเปรียบเทียบประสิทธิภาพของวิธี NJ ด้วยที่ต่าง ๆ ห้า: UPGMA (Sokal และ Sneath 1963), วิธี DW การเซนต์วิธี Li ของ (LI; 198 1) วิธี และวิธี MF วิธี LI เป็นตัวแปรห่างจากที่พักวิธี (ดู Nei [1987, 302 พีพีอ่าวมาหยา-3051 สำหรับคำอธิบายของตัวแปรห่างจากที่พักวิธี), และวิธี MF เป็นการปรับเปลี่ยนของ Farris (1972)วิธีการ วิธีการเหล่านี้ทั้งหมดผลิตต้นไม้ parsimonious เฉพาะจากข้อมูลระยะทางเราถือว่าทั้งสองกรณีค่าคงที่และแตกต่างกันที่อัตราทดแทนนิวคลีโอไทด์ (คาดไว้)

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ตั้งแต่ทางเดินที่แน่นอนวิวัฒนาการของสิ่งมีชีวิตที่ยังหลงเหลืออยู่มักจะไม่ทราบว่ามันไม่เหมาะที่จะใช้ข้อมูลที่แท้จริงสำหรับการตรวจสอบประสิทธิภาพของวิธีการทำต้นไม้. ดังนั้นเราจึงว่าจ้างจำลองคอมพิวเตอร์เมื่อเปรียบเทียบกับต้นไม้ที่สร้างขึ้นใหม่ด้วยต้นไม้แบบของพวกเขา ในการศึกษานี้เราเมื่อเทียบกับประสิทธิภาพของวิธีการที่นิวเจอร์ซีย์กับที่ห้าวิธีการอื่น ๆ : UPGMA (Sokal และ Sneath 1963) วิธี DW ที่วิธีST, หลี่ (LI; 198 1) วิธีการและวิธี MF วิธี LI คือเปลี่ยนวิธีการระยะทาง(ดู Nei [1987 ได้ pp. 302-3051 สำหรับคำอธิบายของเปลี่ยนวิธีการระยะทาง) และ MF วิธีการคือการปรับเปลี่ยนของ Farris ของ (1972) ต่อวิธีการ วิธีการทั้งหมดเหล่านี้ผลิตต้นไม้เค็มไม่ซ้ำกันจากข้อมูลระยะทาง. เราได้พิจารณากรณีทั้งสองอย่างต่อเนื่องและที่แตกต่างกัน (คาดว่า) อัตราการทดแทนเบื่อหน่าย

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ตั้งแต่วิวัฒนาการของสิ่งมีชีวิตมักมีเส้นทางที่แน่นอนยังไม่ทราบ
มันไม่เหมาะที่จะใช้ข้อมูลที่แท้จริงสำหรับการตรวจสอบประสิทธิภาพของต้นไม้ทำให้วิธี .
ดังนั้นเราจึงใช้คอมพิวเตอร์จำลองการสร้างต้นไม้
ต้นแบบของพวกเขา การศึกษาเปรียบเทียบประสิทธิภาพของ NJ ด้วยวิธี
ที่ 5 วิธีอื่น : UPGMA ( และ Sokal สเนท 1963 )DW วิธีการ
เซนต์วิธี หลี่ ( Li ; 198 1 ) แบบ MF และวิธี วิธีหลีเป็นแปลง
ระยะห่างวิธีการ ( ดูเนย [ 1987 , pp . 302-3051 สำหรับคำอธิบายของวิธีการแปลง
ระยะทาง ) และ MF วิธีคือการแก้ไข ฟาร์ริส ( 1972 )
วิธี วิธีการทั้งหมดนี้ผลิตเฉพาะตระหนี่ต้นไม้จากข้อมูลระยะทาง
เราพิจารณาทั้งกรณีคงที่และแตกต่างกัน ( คาดว่า ) อัตราการแทนที่นิวคลีโอไทด์ .