4. Discussion
The diagnostic performance of molecular assays such as realtime RT-PCR and RT-LAMP used for the detection of FMDV are
governed by the nucleotide variability of the genome signatures
between the different serotypes and genetic lineages of the virus.
In contrast to RT-PCR, the design of RT-LAMP assays is particularly challenging because a larger number of oligo-nucleotides are
required to perform the test. Indeed, a previous study showed that
the diagnostic sensitivity of an RT-LAMP for FMDV was only 82.7%
when tested against material comprising all 7 serotypes (Dukes
et al., 2006). A further study (Shao et al., 2010) reported a higher
diagnostic sensitivity (98.3%) for another RT-LAMP assay, but testing was restricted to only the Eurasian serotypes (O, A, C Asia 1).
Another study (Chen et al., 2011) has focused on specific detection of a single FMDV serotype, Asia 1. This current work is the
first application of a multiplex approach to accommodate the high
sequence variability encountered in RNA virus genomes.
In common with other molecular tests, the 3D RNA polymeraseencoding region of the FMDV genome was chosen as a suitable
4. DiscussionThe diagnostic performance of molecular assays such as realtime RT-PCR and RT-LAMP used for the detection of FMDV aregoverned by the nucleotide variability of the genome signaturesbetween the different serotypes and genetic lineages of the virus.In contrast to RT-PCR, the design of RT-LAMP assays is particularly challenging because a larger number of oligo-nucleotides arerequired to perform the test. Indeed, a previous study showed thatthe diagnostic sensitivity of an RT-LAMP for FMDV was only 82.7%when tested against material comprising all 7 serotypes (Dukeset al., 2006). A further study (Shao et al., 2010) reported a higherdiagnostic sensitivity (98.3%) for another RT-LAMP assay, but testing was restricted to only the Eurasian serotypes (O, A, C Asia 1).Another study (Chen et al., 2011) has focused on specific detection of a single FMDV serotype, Asia 1. This current work is thefirst application of a multiplex approach to accommodate the highsequence variability encountered in RNA virus genomes.In common with other molecular tests, the 3D RNA polymeraseencoding region of the FMDV genome was chosen as a suitable
การแปล กรุณารอสักครู่..

4 . การอภิปราย
) การวินิจฉัยโมเลกุลเช่น Realtime RT-PCR และ rt-lamp ใช้สำหรับการตรวจหา fmdv เป็น
ควบคุมโดยยีนความผันแปรของลายเซ็นจีโนม
ระหว่างแตกต่างกันและพันธุกรรม ( พันธุ์ของไวรัส .
ในทางตรงกันข้ามกับ RT-PCR , การออกแบบ rt-lamp สามารถเป็นสิ่งที่ท้าทายโดยเฉพาะอย่างยิ่งเนื่องจากตัวเลขขนาดใหญ่ของโอลิโกนิวคลีโอไทด์
เป็นต้องทำการทดสอบ แน่นอน การศึกษาก่อนหน้านี้พบว่า ความไวของการวินิจฉัย
rt-lamp สำหรับ fmdv เพียง 82.7 %
เมื่อทดสอบกับวัสดุที่ประกอบด้วยทั้งหมด 7 ( ( ดุ๊ก
et al . , 2006 ) การศึกษาเพิ่มเติม ( Shao et al . , 2010 ) รายงานการวินิจฉัยความไวสูง
( ดีเอ็นเอ ) อีก rt-lamp การทดสอบ แต่การทดสอบก็จำกัดเฉพาะเอเชีย 3 ( O , A , C
เอเชีย 1 )การศึกษาอื่น ( Chen et al . , 2011 ) ได้เน้นในการตรวจสอบของ fmdv เดียวโดยเฉพาะ , เอเชีย 1 งานนี้เป็นโปรแกรมแรกของวิธีการมัลติเพล็กซ์
ลำดับสูงเพื่อรองรับความแปรปรวนพบใน RNA ไวรัสจีโนม .
เหมือนกันกับการทดสอบโมเลกุลอื่น ๆ , 3D RNA polymeraseencoding ภูมิภาคของ fmdv จีโนมถูกเลือกในฐานะที่เหมาะสม
การแปล กรุณารอสักครู่..
