Limitations
It should be noted that the source data and our analytical approaches
are subject to some limitations. First, our current study relies on the records
of SNP-trait associations extracted from the GWA catalog
(Hindorff et al., 2009). Although it contains the most comprehensive
list of SNP associations of complex traits, the number and quality of
the reported associations in the GWA catalog vary among published
GWA studies. To assure the quality of extracted records, we only included
GWA SNPs with stringent p-value (b5 × 10−8
) reported by large
studies (sample size N 1000). Because of the large number of extracted
records (nearly 1500), we could not check the original reports to verify
the accuracy of the records. More importantly, the reported GWA SNPs
were mostly detected using commercial genotyping chips in samples
usually of European origin and in combination the identified SNPs
only explain a very small fraction of the phenotypic variance. Thus,
the GWA SNPs may not provide a representative picture of the entire
underlying genetic architecture of complex traits. Consequently, the selection
signatures of complex traits detected in our current study are incomplete
and probably biased in certain ways. For example, a negative
result based on the known SNPs of a complex trait does not necessarily
mean there is no polygenic adaptation of the trait. With the accumulation
of extended sets of GWA SNPs of complex traits by larger studies
in diverse populations, we will obtain a more complete picture of polygenic
adaption of complex traits.
Second, our approaches to detect natural selection were based on
the comparison of allele frequency differences between populations
and therefore cannot capture signals of selection before the human migration
out of Africa (50,000 to 75,000 years ago) (Sabeti et al., 2006).
Future investigation using other statistical methods
ข้อ จำกัดมันควรจะสังเกตว่าแหล่งข้อมูลและแนวทางการวิเคราะห์ของเราอาจมีบางข้อจํากัด ก่อนการศึกษาในปัจจุบันของเราต้องอาศัยประวัติของสมาคมคุณลักษณะ SNP ที่สกัดได้จากแคตตาล็อกกวา( hindorff et al . , 2009 ) ถึงแม้ว่ามันมี ครอบคลุมมากที่สุดรายชื่อสมาคมคุณลักษณะ SNP ซับซ้อน จำนวน และคุณภาพของรายงานสมาคมในแคตตาล็อกกวาแตกต่างกันระหว่างเผยแพร่กวา ศึกษา เพื่อรับประกันคุณภาพของบันทึกที่เราเท่านั้น ได้แก่snps กวาก่อน ( B5 × 10 − 8 ที่เข้มงวด) รายงานโดยขนาดใหญ่การศึกษา ( ขนาดตัวอย่าง n 1000 ) เพราะจำนวนมากของการสกัดประวัติ ( เกือบ 1 , 500 ) เราสามารถตรวจสอบรายงานการตรวจสอบต้นฉบับความถูกต้องของข้อมูล ที่สำคัญ รายงาน snps กวาส่วนใหญ่ที่ตรวจพบในตัวอย่างที่ใช้ชิปเขตพาณิชย์ปกติของประเทศยุโรปและในการระบุ snpsอธิบายเฉพาะส่วนเล็กๆ ของความแปรปรวนของเซลล์ . ดังนั้นการ snps กวาอาจให้ตัวแทนของรูปภาพทั้งหมดพื้นฐานทางพันธุกรรมของลักษณะสถาปัตยกรรมที่ซับซ้อน จากนั้น เลือกลายเซ็นของซับซ้อนลักษณะที่ตรวจพบในการศึกษาในปัจจุบันของเราจะไม่สมบูรณ์และอาจจะลำเอียงในบางวิธี ตัวอย่างเช่น , ลบผลตามของที่รู้จักกัน snps คุณลักษณะที่ไม่จำเป็นหมายถึงไม่มีการปรับตัว polygenic ของคุณลักษณะที่ กับการสะสมขยายชุดของกวา snps ลักษณะซับซ้อน โดยการศึกษาขนาดใหญ่ในกลุ่มประชากรที่หลากหลาย เราจะได้ภาพที่สมบูรณ์มากขึ้นของ polygenicดับเพลิงที่เหมาะสมของลักษณะที่ซับซ้อนประการที่สอง แนวทางของเราที่จะตรวจสอบจากการคัดเลือกตามธรรมชาติการเปรียบเทียบความแตกต่างของความถี่ของอัลลีลระหว่างประชากรดังนั้นจึงไม่สามารถจับสัญญาณของการเลือกก่อนการอพยพของมนุษย์ออกมาจากแอฟริกา ( 50 , 000 - 75 , 000 ปีมาแล้ว ) ( sabeti et al . , 2006 )การสอบสวนการใช้วิธีการทางสถิติอื่น ๆ
การแปล กรุณารอสักครู่..
