Aims: The aim of this study was to

Aims: The aim of this study was to evaluate the performance of a
commercially available multiplex RT-PCR assay for the rapid detection and
identification of dermatophytes directly from clinical samples and cultures.
Methods and Results: The multiplex RT-PCR assay was used to evaluate 118
clinical isolates from various specimen types and a total of 140 known specimens
were compared with both conventional methods, commercially available PCRREBA,
and ITS sequence analysis. In this study, multiplex RT-PCR assay yield
significantly more positive results than culture (91
9 vs 39
5%) and conventional
methods including KOH microscopy (91
9 vs 71
3%). Although the results
among the multiplex RT-PCR, PCR-REBA and ITS sequence analysis were
concordant (100%) in 118 clinical isolates, concordant results between multiplex
RT-PCR assay and culture were at 66% (78/118). The overall positive rates for
the PCR-REBA, multiplex RT-PCR assay and ITS sequence analysis were 98
8,
91
9, and 52
9% respectively. In addition, the concordance rate of multiplex RTPCR
assay and the PCR-REBA assay was 93% (95% confidence interval (CI),
89
9–96
1, P < 0
0001), 93
7% (95% CI, 90
5–96
4, P < 0
0001) sensitivity,
100% (95% CI, 80
0–100, P < 0
0001) specificity, and 99
6% positive and 81%
negative predictive values, respectively. Among the 258 samples, the most
frequently identified dermatophyte species were Trichophyton rubrum (n = 199,
77
1%) and Trichophyton mentagrophytes (n = 28, 10
9%).
Conclusions: The entire multiplex RT-PCR procedure takes about 3 h, while
results from culture can take up to 2–3 weeks. The use of the multiplex RT-PCR
molecular diagnostic assay was rapid and reliable for detecting pathogen infections.
Significance and Impact of the Study: Even though the use of molecular
diagnostic technology is more expensive than conventional methods, the
clinical and economic benefit of saving time relative to expense remains to be
elucidated. Therefore, the multiplex RT-PCR assay may provide the essential
information to accelerate therapeutic decisions for earlier and adequate
antibiotic treatment in the acute phase of fungal pathogen infections.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

เป้าหมาย: จุดมุ่งหมายของการศึกษานี้คือการ ประเมินประสิทธิภาพของการจำหน่าย multiplex RT-PCR assay การตรวจจับอย่างรวดเร็ว และการระบุของ dermatophytes โดยตรงจากตัวอย่างทางการแพทย์และวัฒนธรรมวิธีการและผล: ใช้ RT-PCR assay มัลติเพล็กซ์เพื่อประเมิน 118ที่แยกได้จากชิ้นงานต่าง ๆ และรวม 140 ตัวอย่างที่รู้จักกันทางคลินิกเปรียบเทียบกับวิธีการแบบเดิมทั้ง จำหน่าย PCRREBAและการวิเคราะห์ลำดับ ในการศึกษานี้ multiplex RT-PCR assay ผลตอบแทนผลบวกมากขึ้นอย่างมีนัยสำคัญกว่าวัฒนธรรม (91 9 vs 39 5%) และทั่วไปวิธีรวมทั้งเกาะกล้องจุลทรรศน์ (vs 91 9 71 3%) แม้ว่าผลการระหว่าง multiplex RT PCR, PCR REBA และการวิเคราะห์ลำดับความได้แยก concordant (100%) ในทางคลินิก 118, concordant ผลการมัลติเพล็กซ์RT-PCR assay และวัฒนธรรมถูก 66% (78/118) ราคาพิเศษในเชิงบวกโดยรวมสำหรับPCR-REBA, multiplex RT-PCR assay และการวิเคราะห์ลำดับ 98 891 9 และ 52 9% ตามลำดับ นอกจากนี้ อัตราสอดคล้องการ multiplex RTPCRทดสอบและทดสอบ PCR REBA คือ 93% (95% ช่วงความเชื่อมั่น (CI),89 1 9 – 96, P < 0 0001), 93 7% (95% CI, 90 4 5 – 96, P < 0 0001) ไว100% (95% CI, 0 80 – 100, P < 0 0001) ความ จำเพาะ และ 99 6% บวก และ 81%ลบค่าคาดการณ์ ตามลำดับ จากตัวอย่าง 258 มากที่สุดสายพันธุ์ระบุบ่อย dermatophyte ถูก Trichophyton rubrum (n = 19977 1%) และ Trichophyton mentagrophytes (n = 28, 10 9%)สรุป: ทั้ง multiplex RT-PCR ขั้นตอนใช้เวลาประมาณ 3 ชั่วโมง ในขณะที่ผลจากวัฒนธรรมสามารถใช้เวลาถึง 2 – 3 สัปดาห์ การใช้การมัลติเพล็กซ์ RT-PCRทดสอบวินิจฉัยโมเลกุลได้อย่างรวดเร็ว และเชื่อถือได้สำหรับการตรวจหาเชื้อโรคติดเชื้อความสำคัญและผลกระทบของการศึกษา: แม้ว่าการใช้โมเลกุลเทคโนโลยีการตรวจวินิจฉัยจะแพงกว่าวิธีการแบบเดิม การประโยชน์ทางคลินิก และทางเศรษฐกิจของการบันทึกเวลาเมื่อเทียบกับค่าใช้จ่ายยัง ไม่อธิบาย ดังนั้น การ RT-PCR assay มัลติเพล็กซ์อาจให้สำคัญข้อมูลการเร่งตัดสินใจรักษาก่อนหน้า และเพียงพอรักษาด้วยยาปฏิชีวนะในระยะเฉียบพลันของการติดเชื้อของเชื้อโรคเชื้อรา

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

วัตถุประสงค์ : วัตถุประสงค์ของการศึกษานี้เพื่อประเมินประสิทธิภาพของอาด multiplex RT-PCR วิเคราะห์ตรวจหาอย่างรวดเร็วและการจำแนก dermatophytes โดยตรงจากตัวอย่างทางคลินิกและวัฒนธรรมวิธีการและผลการทดสอบ multiplex RT-PCR ประเมินผล 118ที่แยกได้จากตัวอย่างทางคลินิกชนิดต่าง ๆและรวม 140 , รู้จักเปรียบเทียบกับวิธีปกติที่ใช้ในเชิงพาณิชย์ pcrreba , ,และลำดับการวิเคราะห์ ในการศึกษานี้วิธี multiplex RT-PCR ผลผลิตผลทางบวกมากกว่าวัฒนธรรม ( 919 , 395 ล้านบาท และแบบปกติวิธีการรวมทั้งเกาะ / 919 , 713 ล้านบาท แม้ว่าผลลัพธ์ระหว่างนี้ pcr-reba multiplex และวิเคราะห์ลำดับความสอดคล้องกัน ( 100% ) ในคลินิกจำนวน 118 ผลลัพธ์ที่สอดคล้องกันระหว่างมัลติเพล็กซ์วิธี RT-PCR และวัฒนธรรมที่ 66% ( 78 / 0 ) โดยรวมบวกอัตราสำหรับการ pcr-reba วิธี multiplex RT-PCR และการวิเคราะห์ พบว่าลำดับ ,919 และ 529 ตามลำดับ นอกจากนี้ อัตรา rtpcr เป็นมัลติเพล็กซ์การทดสอบและการทดสอบ pcr-reba 93% ( ช่วงความเชื่อมั่น 95% ( CI )899 - 961 , p < 00001 ) , 937 เท่า ( 95% CI , 905 – 964 , p < 00001 ) ไว100% ( 95% CI , 800 – 100 , p < 00001 ) ความจำเพาะ และ 996 % บวก และ 81%ลบค่าทำนาย ) ระหว่าง 258 ตัวอย่างที่สุดบ่อยครั้งที่ระบุชนิด rubrum Trichophyton เดอมาโตไฟต์ ( n = 199 ,771 ) และ Trichophyton mentagrophytes ( n = 28 , 109 ล้านบาทสรุป : ทั้งหมด ขั้นตอนนี้ใช้เวลาประมาณ 3 ชั่วโมง มัลติเพล็กซ์ ขณะที่ผลจากวัฒนธรรมอาจใช้เวลาถึง 2 - 3 สัปดาห์ ใช้ multiplex RT-PCRการทดสอบการวินิจฉัยระดับโมเลกุลเป็นรวดเร็วและเชื่อถือได้สำหรับการตรวจหาการติดเชื้อเชื้อโรคความสำคัญและผลกระทบของการศึกษา : ถึงแม้ว่าการใช้โมเลกุลเทคโนโลยีการวินิจฉัยที่แพงมากขึ้นกว่าวิธีการปกติทางคลินิกและผลประโยชน์ทางเศรษฐกิจของการประหยัดเวลา เทียบกับค่าใช้จ่ายยังคงเป็นพยนต์ . ดังนั้น วิธี multiplex RT-PCR อาจให้สำคัญข้อมูลเพื่อเร่งการตัดสินใจเพื่อการบำบัดรักษาก่อนหน้านี้ และเพียงพอยาปฏิชีวนะรักษาในระยะเฉียบพลันของการติดเชื้อเชื้อโรคเชื้อรา