Black pepper is one of the most popular and oldest spices in the world and valued for its
pungent constituent alkaloids. Pinerine is the main bioactive compound in pepper alkaloids,
which perform unique physiological functions. However, the mechanisms of piperine synthesis
are poorly understood. This study is the first to describe the fruit transcriptome of
black pepper by sequencing on Illumina HiSeq 2000 platform. A total of 56,281,710 raw
reads were obtained and assembled. From these raw reads, 44,061 unigenes with an average
length of 1,345 nt were generated. During functional annotation, 40,537 unigenes were
annotated in Gene Ontology categories, Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes pathways,
Swiss-Prot database, and Nucleotide Collection (NR/NT) database. In addition,
8,196 simple sequence repeats (SSRs) were detected. In a detailed analysis of the transcriptome,
housekeeping genes for quantitative polymerase chain reaction internal control,
polymorphic SSRs, and lysine/ornithine metabolism-related genes were identified. These
results validated the availability of our database. Our study could provide useful data for further
research on piperine synthesis in black pepper.
พริกไทยดำเป็นหนึ่งเทศมากที่สุดนิยม และเก่าแก่ที่สุดในโลก และมูลค่าสำหรับความหอมฉุน alkaloids ธาตุ Pinerine เป็นสารประกอบกรรมการกหลักในพริก alkaloidsซึ่งทำหน้าที่เฉพาะสรีรวิทยา อย่างไรก็ตาม กลไกของการสังเคราะห์ piperineมีงานเข้าใจ การศึกษานี้เป็นครั้งแรกเพื่ออธิบาย transcriptome ผลไม้ของพริกไทยดำ โดยลำดับบนแพลตฟอร์ม Illumina HiSeq 2000 จำนวนวัตถุดิบ 56,281,710จำนวนผู้อ่านได้รับ และรวบรวม จากเหล่านี้อ่าน raw, unigenes 44,061 โดยเฉลี่ยความยาวของ 1,345 nt สร้างขึ้น ในระหว่างการทำงานคำอธิบายประกอบ 40,537 unigenes ได้ใส่คำอธิบายประกอบในยีนภววิทยาประเภท สารานุกรม ยีนเกียวโต และ Genomes มนต์สวิส-Prot และฐานข้อมูล ฐานข้อมูลชุดนิวคลีโอไทด์ (NR/NT) นอกจากนี้ทำซ้ำลำดับ 8,196 (SSRs) ถูกตรวจพบ ในการวิเคราะห์รายละเอียดของ transcriptomeยีนของพอลิเมอเรสเชิงปริมาณปฏิกิริยาลูกโซ่การควบคุมภายใน ทำความสะอาดpolymorphic SSRs และยีนที่เกี่ยวข้องกับการเผาผลาญแอล-ไล ซีน/ornithine ได้ระบุ เหล่านี้ผลการตรวจสอบความพร้อมของฐานข้อมูลของเรา เราสามารถให้ข้อมูลที่เป็นประโยชน์สำหรับเพิ่มเติมงานวิจัยสังเคราะห์ piperine พริกไทยดำ
การแปล กรุณารอสักครู่..
