3.4. 16S ribosomal sequence detecti

3.4. 16S ribosomal sequence detection
The selected potential isolate were identified by 16S rDNA
sequencing and PCR parameters were optimized for
maximum amplification of 16S rDNA gene. BLAST was performed
for obtained sequences in order to find out homology
with the sequence in GenBank in which 99% similarity was
found with B. subtilis JX573541. Following BLAST, the best five
sequences were selected. All ambiguous position were
removed for each sequence pair was assessed by using
BOOTSTRAP program in sets of 100 re-samplings (MEGA-5).
The phylogenetic tree was constructed from the sequence
data by neighbor joining methods phylogenetic analysis, and
was identified as Bacillus sp. scale bar indicates 0.0001 substitutions
per nucleotide position

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

3.4 การตรวจลำดับ 16S ribosomalวางแยกอาจเลือกระบุ โดย 16S rDNAจัดลำดับและพารามิเตอร์ PCR ได้เหมาะขยายสูงสุดของยีน 16S rDNA ทำการระเบิดสำหรับลำดับที่ได้รับเพื่อค้นหา homologyมีลำดับใน GenBank ใน 99% ที่มีความคล้ายคลึงกันพบกับ subtilis เกิด JX573541 ต่อไปนี้ระเบิด 5 ดีที่สุดลำดับถูกเลือก ตำแหน่งไม่ชัดเจนทั้งหมดได้เอาในลำดับแต่ละคู่ถูกประเมิน โดยใช้โปรแกรมเริ่มต้นระบบในชุด 100 เรื่อง-samplings (เม-5)ต้น phylogenetic ถูกสร้างจากลำดับข้อมูลจากเพื่อนบ้านเข้าร่วมวิธี phylogenetic วิเคราะห์ และระบุเป็นคัด sp.ขนาดแถบแสดงแทน 0.0001ต่อนิวคลีโอไทด์ตำแหน่ง

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

3.4 การตรวจสอบลำดับ 16S โซมอล
ที่มีศักยภาพแยกเลือกถูกระบุ 16S ​​rDNA
ลำดับและพารามิเตอร์พีซีอาร์ถูกปรับให้เหมาะสมกับ
การขยายสูงสุดของยีน 16S rDNA ระเบิดถูกดำเนินการ
สำหรับลำดับที่ได้รับในเพื่อที่จะหาที่คล้ายคลึงกัน
กับลำดับใน GenBank ที่คล้ายคลึงกัน 99% ได้รับการ
พบกับ B. subtilis JX573541 ต่อไปนี้การระเบิดที่ดีที่สุดห้า
ลำดับได้รับการคัดเลือก ทุกตำแหน่งไม่ชัดเจนถูก
ลบออกแต่ละคู่ลำดับได้รับการประเมินโดยใช้
โปรแกรมบูตในชุด 100 กลุ่มตัวอย่างอีกครั้ง (MEGA-5).
phylogenetic ต้นไม้ถูกสร้างขึ้นจากลำดับ
ข้อมูลจากเพื่อนบ้านมาร่วมงานกับวิธีการวิเคราะห์สายวิวัฒนาการและ
ถูกระบุว่าเป็น Bacillus SP . บาร์ขนาดบ่งชี้ 0.0001 แทน
ต่อตำแหน่งเบื่อหน่าย

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

3.4 . ลำดับ 16S ไรโบโซมอล ตรวจจับ
ศักยภาพเลือกแยกกลุ่ม 16S rDNA และลำดับค่า

) เหมาะสำหรับขยายสูงสุดของ 16S rDNA ยีน ระเบิดทำ
สำหรับได้ลำดับในการค้นหาเป็นลำดับ
กับบริเวณที่ 99% ความเหมือนคือ
พบ B . subtilis jx573541 . ต่อไปนี้ระเบิดที่ดีที่สุด 5
,ลําดับที่ . ทุกตำแหน่งที่
ลบออกสำหรับแต่ละลำดับคู่ถูกประเมินโดยใช้โปรแกรมบู
ชุด 100 อีกครั้ง ( mega-5 )
phylogenetic ต้นไม้ถูกสร้างขึ้นจากลำดับ
ข้อมูลโดยวิธีการวิเคราะห์และเพื่อนบ้านร่วมยืนยัน
ถูกระบุว่าเป็น Bacillus sp . ขนาดบาร์แสดงแทน =
ต่อตำแหน่งนิวคลีโอไทด์