AbstractBackground:Malaria has been

AbstractBackground:Malaria has been a major life threatening mosquito borne disease from long since. Unavailability ofany effective vaccine and recent emergence of multi drug resistant strains of malaria pathogenPlasmodiumfalciparumcontinues to cause persistent deaths in the tropical and sub-tropical region. As a result, demands fornew targets for more effective anti-malarial drugs are escalating. Transketolase is an enzyme of the pentosephosphate pathway; a novel pathway which is involved in energy generation and nucleic acid synthesis. Moreover,significant difference in homology betweenPlasmodium falciparumtransketolase (Pftk) and human (Homo sapiens)transketolase makes it a suitable candidate for drug therapy. Our present study is aimed to predict the 3D structure ofPlasmodium falciparumtransketolase and design an inhibitor against it.Results:The primary and secondary structural features ofthe protein is calculated by ProtParam and SOPMArespectively which revealed the protein is composed of 43.3 % alpha helix and 33.04 % random coils along with15.62 % extended strands, 8.04 % beta turns. The three dimensional structure of the transketolase is constructedusing homology modeling tool MODELLAR utilizing several available transketolase structures as templates. Thestructure is then subjected to deep optimization and validated by structure validation tools PROCHECK, VERIFY3D, ERRAT, QMEAN. The predicted model scored 0.74 for global model reliability in PROCHECK analysis, whichensures the quality of the model. According to VERIFY 3D the predicted model scored 0.77 which determinesgood environmental profile along with ERRAT score of 78.313 which is below 95 % rejection limit. Protein-proteinand residue–residue interaction networks are generated by STRING and RING server respectively. CASTp serverwas used to analyze active sites and His 109, Asn 108 and His 515 are found to be more positive site to dock thesubstrate, in addition molecular docking simulation with Autodock vina determined the estimated free energy ofmolecular binding was of−6.6kcal/molformostfavorablebindingof6′-Methyl-Thiamin Diphosphate.Conclusion:This predicted structure of Pftk will serve firsthandinthefuturedevelopmentofeffectivePftkinhibitors with potential anti-malarial activity. However, this is a preliminary study of designing an inhibitoragainstPlasmodium falciparum3D7; the results await justification byin vitroandin vivoexperimentations.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

AbstractBackground:Malaria ได้รับอันตรายถึงยุงพาหะโรคจากนานตั้งแต่ชีวิตสำคัญ วัคซีนมีประสิทธิภาพกำกับไม่พร้อมใช้งานและการเกิดขึ้นของหลายสายพันธุ์ที่ทนยาของมาลาเรีย pathogenPlasmodiumfalciparumcontinues ทำให้เกิดการตายแบบถาวรในภูมิภาคเขตร้อน และกึ่งเขตร้อน เป็นผล จะเพิ่มเป้าหมาย fornew ความต้องการยาต้านมาเลเรียที่มีประสิทธิภาพมากขึ้น Transketolase เป็นเอนไซม์ของทางเดิน pentosephosphate ทางเดินใหม่ที่มีส่วนเกี่ยวข้องในการสังเคราะห์กรดนิวคลีอิกและสร้างพลังงาน นอกจากนี้ ความแตกต่างสำคัญใน homology betweenPlasmodium falciparumtransketolase (Pftk) และ transketolase มนุษย์ (ตุ๊ด sapiens) ทำให้ผู้สมัครที่เหมาะสมสำหรับการรักษาด้วยยา เราศึกษามีวัตถุประสงค์เพื่อทำนายการ falciparumtransketolase ofPlasmodium โครงสร้าง 3 มิติ และออกแบบตัวยับยั้งกับมัน ผลลัพธ์: คำนวณคุณสมบัติโครงสร้างหลัก และรองของโปรตีน โดย ProtParam และ SOPMArespectively ซึ่งโปรตีนประกอบด้วย 43.3% เกลียวอัลฟาและ 33.04% สุ่มขดลวดตาม with15.62% ขยายเส้น 8.04% เบต้าจะ สามมิติของ transketolase เป็น homology constructedusing โมเดลเครื่องมือ MODELLAR ใช้ transketolase มีโครงสร้างหลายเป็นแม่แบบ Thestructure เป็นการเพิ่มประสิทธิภาพลึก แล้วตรวจสอบ โดยโครงสร้างการตรวจสอบเครื่องมือการบ VERIFY3D, ERRAT, QMEAN แบบจำลองการคาดการณ์ทำประตู 0.74 แบบสากลความน่าเชื่อถือในการวิเคราะห์ PROCHECK, whichensures คุณภาพของรูปแบบ ตามตรวจสอบ 3 มิติ แบบจำลองการคาดการณ์คะแนน 0.77 ซึ่งประวัติ determinesgood สิ่งแวดล้อมพร้อม ด้วยคะแนน ERRAT ของ 78.313 ซึ่งเป็นขีดจำกัดของการปฏิเสธ 95% เครือข่าย proteinand โปรตีนตกค้างสารตกค้างการโต้ตอบสร้างขึ้น โดยเซิร์ฟเวอร์อักขระและวงแหวนตามลำดับ Serverwas CASTp ที่ใช้ในการวิเคราะห์การใช้งานไซต์ และพระ 109, Asn 108 และ 515 พระที่พบจะ เพิ่มไซต์ไปที่ท่า thesubstrate นอกจากนี้ โมเลกุลจำลองเทียบกับวีนา Autodock กำหนดการประเมินพลังงานฟรี ofmolecular รวมเป็น of−6.6kcal / molformostfavorablebindingof6′-เมธิลวิตามินบี Diphosphate.Conclusion:This ทำนายโครงสร้างของ Pftk จะให้บริการ firsthandinthefuturedevelopmentofeffectivePftkinhibitors มีกิจกรรมต้านมาเลเรียที่มีศักยภาพ อย่างไรก็ตาม นี้เป็นการศึกษาเบื้องต้นการออกแบบ falciparum3D7 inhibitoragainstPlasmodium ผลรอเหตุผล byin vitroandin vivoexperimentations

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

AbstractBackground: มาลาเรียเป็นโรคที่สำคัญที่คุกคามชีวิตของยุงพาหะจากความยาวตั้งแต่ unavailability ofany วัคซีนที่มีประสิทธิภาพและเกิดขึ้นเมื่อเร็ว ๆ นี้สายพันธุ์ที่ทนยาเสพติดหลายของ pathogenPlasmodiumfalciparumcontinues มาลาเรียที่จะทำให้เกิดการเสียชีวิตถาวรในภูมิภาคเขตร้อนและกึ่งเขตร้อน เป็นผลให้ความต้องการ fornew เป้าหมายสำหรับยาต้านมาลาเรียที่มีประสิทธิภาพมากขึ้นจะทวีความรุนแรง Transketolase เป็นเอนไซม์ของทางเดิน pentosephosphate นั้น นวนิยายทางเดินซึ่งมีส่วนเกี่ยวข้องในการผลิตพลังงานและการสังเคราะห์กรดนิวคลีอิก นอกจากนี้ยังมีความแตกต่างอย่างมีนัยสำคัญในการที่คล้ายคลึงกัน betweenPlasmodium falciparumtransketolase (Pftk) และมนุษย์ (Homo sapiens) transketolase ทำให้ผู้สมัครที่เหมาะสมสำหรับการบำบัดยาเสพติด การศึกษาในปัจจุบันของเรามีจุดมุ่งหมายที่จะทำนายโครงสร้าง ofPlasmodium falciparumtransketolase 3D และการออกแบบตัวยับยั้งต่อต้าน it.Results: ประถมศึกษาและมัธยมศึกษาลักษณะโครงสร้างโปรตีน ofthe คำนวณโดย ProtParam และ SOPMArespectively ซึ่งเผยให้เห็นโปรตีนที่ประกอบด้วยส่วนที่เป็นเกลียวอัลฟา 43.3% และ 33.04% แบบสุ่ม ขดลวดเส้นพร้อมขยาย with15.62%, 8.04% จะเบต้า โครงสร้างสามมิติของ transketolase จะ constructedusing เครื่องมือสร้างแบบจำลองที่คล้ายคลึงกัน MODELLAR ใช้โครงสร้างหลาย transketolase ใช้ได้เป็นแม่แบบ Thestructure อยู่ภายใต้แล้วถึงการเพิ่มประสิทธิภาพลึกและตรวจสอบโดยเครื่องมือการตรวจสอบโครงสร้าง PROCHECK, VERIFY3D, ERRAT, QMEAN รูปแบบที่คาดการณ์ได้คะแนน 0.74 สำหรับความน่าเชื่อถือระดับโลกรูปแบบในการวิเคราะห์ PROCHECK, whichensures คุณภาพของรูปแบบ ตามการตรวจสอบรูปแบบ 3 มิติที่คาดการณ์ได้คะแนน 0.77 ซึ่ง determinesgood รายละเอียดสิ่งแวดล้อมพร้อมกับคะแนนของ ERRAT 78.313 ซึ่งต่ำกว่า 95% วงเงินปฏิเสธ โปรตีน proteinand ตกค้างสารตกค้างเครือข่ายการทำงานร่วมกันจะมีการสร้างด้วยเชือกและแหวนเซิร์ฟเวอร์ตามลำดับ CASTp serverwas ใช้ในการวิเคราะห์การใช้งานและเว็บไซต์ของเขา 109 Asn 108 และ 515 ของเขาจะพบว่ามีเว็บไซต์ที่เป็นบวกมากขึ้นไปที่ท่าเรือ thesubstrate นอกเหนือจากการจำลองโมเลกุลเชื่อมต่อกับ Autodock Vina กำหนดพลังงานประมาณ ofmolecular ผูกพันเป็นของ 6.6kcal / molformostfavorablebindingof6 ' Diphosphate.Conclusion -Methyl-วิตามินบี: นี้โครงสร้างการคาดการณ์ของ Pftk จะทำหน้าที่ firsthandinthefuturedevelopmentofeffectivePftkinhibitors กับกิจกรรมต้านมาเลเรียที่มีศักยภาพ แต่นี้คือการศึกษาเบื้องต้นของการออกแบบ inhibitoragainstPlasmodium falciparum3D7; ผลการรอคอยเหตุผล byin vitroandin vivoexperimentations

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

abstractbackground : มาลาเรียมีชีวิตขู่โรคที่นำโดยยุง หลักจากได้ตั้งนานแล้ว พร้อมแก้ไขปัญหาประสิทธิภาพวัคซีนและวิวัฒนาการล่าสุดของหลายสายพันธุ์ของเชื้อมาลาเรียดื้อยา pathogenplasmodiumfalciparumcontinues ให้ถาวรตายในเขตร้อนและย่อยภูมิภาคเขตร้อน เป็นผลให้ความต้องการเป้าหมาย fornew สำหรับมีประสิทธิภาพต่อต้านมาลาเรีย ยาที่เพิ่มขึ้น transketolase เป็นเอนไซม์ของ pentosephosphate ทางเดิน ; เส้นทางใหม่ซึ่งเกี่ยวข้องกับการผลิตพลังงานและการสังเคราะห์กรดนิวคลีอิก . นอกจากนี้ ความแตกต่างในตัว betweenplasmodium falciparumtransketolase ( pftk ) และมนุษย์ ( Homo sapiens ) transketolase ทำให้ผู้สมัครที่เหมาะสมสำหรับการบำบัดด้วยยา . การศึกษาครั้งนี้มีวัตถุประสงค์เพื่อทำนายโครงสร้างของเรา ofplasmodium falciparumtransketolase 3D และการออกแบบตัวยับยั้งกับมัน ผลลัพธ์ : ประถมศึกษาและมัธยมศึกษา มีโครงสร้างของโปรตีนและคำนวณโดย protparam sopmarespectively ซึ่งพบโปรตีนประกอบด้วย 43.3 % เป็นเกลียวอัลฟาและตู้ % สุ่มม้วนตาม with15.62 % ขยายเส้น 8.04 % เบต้า . สามมิติโครงสร้างของ transketolase constructedusing ซึ่งเป็นเครื่องมือแบบจำลอง modellar ใช้โครงสร้าง transketolase ใช้ได้หลายเป็นแม่แบบ แล้วต้องเพิ่มประสิทธิภาพโครงสร้างลึกและตรวจสอบ โดยโครงสร้างเครื่องมือตรวจสอบ ปตท. verify3d errat qmean , , , . ทำนายรูปแบบคะแนน 0.74 เพื่อความน่าเชื่อถือโกลบอลโมเดลในการวิเคราะห์ ปตท. whichensures , คุณภาพของแบบจำลอง ตามการตรวจสอบรูปแบบ 3D ที่คาดการณ์คะแนน 0.77 ซึ่ง determinesgood สิ่งแวดล้อมพร้อมกับคะแนน errat โปรไฟล์ของ 78.313 ซึ่งต่ำกว่า 95% ปฏิเสธจำกัด โปรตีน proteinand กากกากและปฏิสัมพันธ์เครือข่ายจะสร้างสตริงและแหวนเซิร์ฟเวอร์ตามลำดับ castp serverwas ใช้วิเคราะห์การใช้งานเว็บไซต์และ 109 , asn 108 และถ้าพบเป็นบวกมากขึ้นเว็บไซต์ไปยังท่าเรือ thesubstrate นอกจากนี้โมเลกุล docking จำลองกับ autodock Vina กำหนดประมาณการฟรี ofmolecular พลังงานผูกพันเป็น− 6.6kcal / molformostfavorablebindingof6 ได้รับวิตามินบี 1 - เมทิลไดฟอสเฟต สรุป : โครงสร้างของ pftk คาดการณ์นี้จะใช้ firsthandinthefuturedevelopmentofeffectivepftkinhibitors ที่มีศักยภาพต่อต้าน ซึ่งกิจกรรม อย่างไรก็ตาม การศึกษาเบื้องต้นของการออกแบบ inhibitoragainstplasmodium falciparum3d7 ; ผลลัพธ์ที่รอคอยที่จะ byin vitroandin vivoexperimentations .