3.1.2. Sensitivity and specificity

3.1.2. Sensitivity and specificity of the new MCPyV quantitative
assay
The qPCR assay developed for the quantification of MCPyV was
shown to be specific both by “in silico” sequence analysis of the
primers and the probe considering nucleotide sequence databases
(NCBI BLAST) and by experimental assays. No false positive results
were detected due to cross-reactivity with non-target DNA from
the viruses contained in the different plasmid constructs assayed
(human polyomaviruses JCPyV, BKPyV, KIPyV and WUPyV and
animal polyomaviruses OPyV and BPyV). A total of 20 and 10 DNA
genome copies were detected in 100% and 80% of the performed
qPCR reactions, respectively. Sensitivity did not vary even when
high levels of exogenous but related viral DNA (samples with high
levels of JCPyV) were added to the test tubes.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

3.1.2 ไวและ specificity MCPyV ใหม่เชิงปริมาณวิเคราะห์ถูกทดสอบ qPCR พัฒนานับของ MCPyVแสดงเป็นเฉพาะทั้ง "ใน silico" ลำดับของการไพรเมอร์และโพรบการพิจารณาฐานข้อมูลลำดับของนิวคลีโอไทด์(NCBI ระเบิด) และ assays ทดลอง ไม่มีผลบวกเท็จพบเนื่องจาก cross-reactivity มีเป้าหมายไม่ใช่ดีเอ็นเอจากไวรัสที่มีอยู่ในโครงสร้างต่าง ๆ plasmid ที่ assayed(มนุษย์ polyomaviruses JCPyV, BKPyV, KIPyV และ WUPyV และสัตว์ polyomaviruses OPyV และ BPyV) จำนวนดีเอ็นเอ 20 และ 10คัดลอกกลุ่มพบ 100% และ 80% ของการดำเนินปฏิกิริยา qPCR ตามลำดับ ความไวก็ไม่แตกต่างกันแม้ระดับสูงบ่อยแต่ที่เกี่ยวข้องกับดีเอ็นเอไวรัส (ตัวอย่างที่ มีสูงมีเพิ่มระดับของ JCPyV) กับหลอดทดสอบ

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

3.1.2 ความไวและความจำเพาะของปริมาณใหม่ MCPyV
ทดสอบ
ทดสอบ qPCR การพัฒนาสำหรับปริมาณของ MCPyV ได้
แสดงให้เห็นว่าทั้งสองโดยเฉพาะ "ใน silico" การวิเคราะห์ลำดับของ
ไพรเมอร์และสอบสวนพิจารณาฐานข้อมูลลำดับเบส
(NCBI BLAST) และการวิเคราะห์การทดลอง ไม่มีผลบวกปลอม
ที่ตรวจพบเนื่องจากปฏิกิริยาข้ามกับดีเอ็นเอไม่ใช่เป้าหมายจาก
ไวรัสที่มีอยู่ในโครงสร้างที่แตกต่างกันพลาสมิด assayed
(มนุษย์ polyomaviruses JCPyV, BKPyV, KIPyV และ WUPyV และ
สัตว์ polyomaviruses OPyV และ BPyV) รวมเป็น 20 และ 10 ดีเอ็นเอ
จีโนมสำเนาถูกตรวจพบใน 100% และ 80% ของการดำเนินการ
เกิดปฏิกิริยา qPCR ตามลำดับ ความไวแสงไม่ได้แตกต่างกันแม้ในขณะที่
ระดับสูงของดีเอ็นเอของเชื้อไวรัสจากภายนอก แต่ที่เกี่ยวข้อง (ตัวอย่างที่มีสูง
ระดับของ JCPyV) ถูกเพิ่มเข้าไปในหลอดทดลอง

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

3.1.2 . ความไวของใหม่ mcpyv

ใช้วิธีเชิงปริมาณ qpcr พัฒนาสำหรับปริมาณของ mcpyv คือ
เป็นทั้งสองโดยเฉพาะในการวิเคราะห์ลำดับน " ของ
ไพรเมอร์และการสอบสวนพิจารณาฐานข้อมูลลำดับนิวคลีโอไทด์ต่อ
( ncbi ระเบิด ) และ โดยวิธีการทดลอง ไม่พบผลบวกเท็จ
เนื่องจากปฏิกิริยาข้ามกับดีเอ็นเอเป้าหมายไม่ใช่จาก
ไวรัสที่มีอยู่ในสายพันธุ์ที่แตกต่างกันของโครงสร้าง assayed
( มนุษย์ polyomaviruses jcpyv bkpyv kipyv , และ , wupyv และ
polyomaviruses และสัตว์ opyv bpyv ) ทั้งหมด 20 และ 10 ชุดจีโนมดีเอ็นเอ
พบว่า 100% และ 80% ของการ
qpcr ปฏิกิริยาตามลำดับ ความไวไม่แตกต่างกันแม้ว่า
ระดับภายนอกแต่เกี่ยวข้องกับไวรัสดีเอ็นเอสูง
( ตัวอย่างระดับของ jcpyv ) มีการเพิ่มหลอดทดสอบ