The relative expression data from t

The relative expression data from the three years of the study were combined for analysis for all available time points and treatments. The relative expression levels were transformed by taking the natural logarithm of the relative expression levels after they had been multiplied by 1.0 ? 10 9 to allow for the absence of negative values in the data set. Log transformation was used to compensate for variation among the yearly replications of the experiment. Examination of significant interactions between fixed effects and the determination of averages and standard error of the three-way interactions of inbred line, treatment, and time point were done using a factorial analysis of variance (ANOVA) using Proc
Mixed in SAS (SAS Institute, Cary, NC, USA) for both the gene expression analyses as well as the biomass assay. Compensations in Proc Mixed were made to correct for any non-normal distributions using the Kenwarde Rogers adjustment tothe denominator degrees of freedom [40]. These analyses used modified marginal means to compensate for any missing points that would confound least square means calculations for type III fixed effects [41,42]. For aflatoxin level analysis, an ANOVA with modified marginal means in conjunctionwith Tukey's Least Standard Difference (LSD) test for post-hoc analysis was used [41]. For fungal biomass analysis, specific comparisons between treatments were performed using the Student's t-test. Significance in this study was defined by a confidence interval ?95% ( a ¼ 0.05). Results were defined as marginally significant if the analysis produced a p-value near the standard level yet exceeding it bya small degree (Approx. Range: 0.05e0.08). ANOVA tables for the type III fixed effects of the relative expression levels of the genes examined in this study can be found in Tables S2eS10.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ข้อมูลนิพจน์แบบย่อจากสามปีการศึกษาที่รวมสำหรับการวิเคราะห์สำหรับเวลาว่างคะแนนและรักษา ระดับสัมพัทธ์นิพจน์ถูกแปลง โดยใช้ลอการิทึมธรรมชาติของระดับนิพจน์ญาติหลังจากที่พวกเขามีการคูณ ด้วย 1.0 10 9 ให้ขาดค่าลบค่าในชุดข้อมูล การแปลงแฟ้มบันทึกถูกใช้เพื่อชดเชยสำหรับการเปลี่ยนแปลงในระยะปีที่ทดลอง ทำการตรวจสอบการโต้ตอบอย่างมีนัยสำคัญระหว่างผลถาวรและความมุ่งมั่นของค่าเฉลี่ยและความคลาดเคลื่อนมาตรฐานของการโต้ตอบที่สามบรรทัด inbred รักษา และเวลาจุดใช้เป็นแฟกวิเคราะห์ของความแปรปรวน (การวิเคราะห์ความแปรปรวน) โดยใช้กระบวนการผสมใน SAS (SAS สถาบัน แครีแกรนต์ NC, USA) สำหรับทั้งวิเคราะห์นิพจน์ยีนตลอดจนวิเคราะห์ชีวมวล ค่าตอบแทนในกระบวนการผสมได้ทำการแก้ไขสำหรับการไม่ปกติการกระจายโดยใช้การปรับปรุง Kenwarde โรเจอร์ตัวหารองศาความเป็นอิสระ [40] วิเคราะห์เหล่านี้ใช้ปรับเปลี่ยนหมายถึงกำไรเพื่อชดเชยจุดใด ๆ ขาดที่จะ confound น้อยหมายความว่าตารางคำนวณสำหรับชนิด III คงผล [41,42] สำหรับการวิเคราะห์ระดับ aflatoxin การวิเคราะห์ความแปรปรวน ด้วยวิธีแก้ไขกำไรที่ทดสอบอย่างน้อยมาตรฐานความแตกต่าง (LSD) conjunctionwith Tukey สำหรับการวิเคราะห์แบบเฉพาะกิจลงได้ใช้ [41] สำหรับการวิเคราะห์ชีวมวลเชื้อรา เปรียบเทียบเฉพาะผลการรักษาก็ทำโดยใช้ t-ทดสอบของนักเรียน ความสำคัญในการศึกษานี้ถูกกำหนด โดยช่วงความเชื่อมั่น? 95% (¼ 0.05) ผลลัพธ์ที่กำหนดไว้เป็นดีสำคัญถ้าวิเคราะห์ผลิตค่า p ใกล้ระดับมาตรฐานที่ยัง เกินกว่าระดับเล็ก bya (ช่วงประมาณ: 0.05e0.08) ตารางวิเคราะห์ความแปรปรวนชนิด III คงผลของนิพจน์สัมพัทธ์ที่ระดับของยีนในการศึกษานี้สามารถพบได้ในตาราง S2eS10

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ข้อมูลการแสดงออกของญาติจากสามปีของการศึกษาร่วมกันในการวิเคราะห์หาจุดเวลาที่มีอยู่ทั้งหมดและการรักษา ระดับการแสดงออกของญาติถูกเปลี่ยนโดยการลอการิทึมธรรมชาติของระดับการแสดงออกญาติหลังจากที่พวกเขาได้รับการคูณด้วย 1.0? 10 9 เพื่อให้กรณีที่ไม่มีค่าลบในชุดข้อมูล การเปลี่ยนแปลงเข้าสู่ระบบถูกใช้ในการชดเชยการเปลี่ยนแปลงในหมู่ซ้ำเป็นประจำทุกปีของการทดลอง การตรวจสอบของการมีปฏิสัมพันธ์อย่างมีนัยสำคัญระหว่างผลกระทบคงที่และความมุ่งมั่นของค่าเฉลี่ยและข้อผิดพลาดมาตรฐานของการมีปฏิสัมพันธ์สามทางของสายพันธุ์การรักษาและการจุดเวลาได้ทำโดยใช้การวิเคราะห์ปัจจัยความแปรปรวน (ANOVA)
โดยใช้พรผสมในSAS (SAS Institute, แครี, NC, USA) สำหรับทั้งการวิเคราะห์การแสดงออกของยีนเช่นเดียวกับการทดสอบชีวมวล ค่าตอบแทนในพรผสมทำให้ถูกต้องสำหรับการกระจายใด ๆ ที่ไม่ปกติโดยใช้การปรับ Kenwarde โรเจอร์ส tothe หารองศาอิสระ [40] การวิเคราะห์เหล่านี้ใช้วิธีการปรับเปลี่ยนเล็กน้อยเพื่อชดเชยการขาดหายไปจุดใด ๆ ที่จะทำลายน้อยวิธีการคำนวณตารางสำหรับประเภทที่สามผลกระทบคงที่ [41,42] สำหรับการวิเคราะห์ระดับอะฟลาท็อกซินการวิเคราะห์ความแปรปรวนที่มีการปรับเปลี่ยนวิธีการเล็กน้อยใน conjunctionwith Tukey มาตรฐานน้อยของความแตกต่าง (LSD) การทดสอบสำหรับการวิเคราะห์ post-hoc ถูกใช้ [41] สำหรับการวิเคราะห์ชีวมวลเชื้อราเปรียบเทียบระหว่างการรักษาที่เฉพาะเจาะจงได้ดำเนินการโดยใช้นักศึกษาเสื้อทดสอบ ความสำคัญในการศึกษานี้ได้รับการกำหนดโดยช่วงความเชื่อมั่นหรือไม่ 95% (เป็น¼ 0.05) ผลลัพธ์ที่ได้กำหนดไว้เป็นอย่างมีนัยสำคัญเล็กน้อยถ้าการวิเคราะห์การผลิต p-value ใกล้ระดับมาตรฐาน แต่มันเกิน bya ระดับเล็ก (ประมาณช่วง:. 0.05e0.08) ANOVA ตารางสำหรับประเภทที่สามผลกระทบคงที่ของระดับการแสดงออกของยีนที่สัมพันธ์กันตรวจสอบในการศึกษานี้สามารถพบได้ในตาราง S2eS10

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

เทียบข้อมูลการแสดงออกจากสามปีของการศึกษารวมสำหรับการวิเคราะห์ทั้งหมดของเวลาจุด และการรักษา ระดับการแสดงออกของญาติถูกเปลี่ยนโดยการลอการิทึมธรรมชาติของระดับการแสดงออกญาติหลังจากที่พวกเขาถูกคูณโดย ? 10 9 เพื่อให้สำหรับการลบค่าในชุดข้อมูลการเปลี่ยนแปลงเข้าสู่ระบบถูกใช้เพื่อชดเชยการเปลี่ยนแปลงในหมู่ซ้ำปีของการทดลอง การปฏิสัมพันธ์อย่างมีนัยสำคัญระหว่างการแก้ไขผลกระทบและการหาค่าเฉลี่ยและค่าคลาดเคลื่อนมาตรฐานของแบบปฏิสัมพันธ์ของบรรทัดการรักษาสายพันธุ์แท้ และจุดเวลา ทำโดยใช้การวิเคราะห์ความแปรปรวน ( ANOVA ) โดยใช้วิธีการของ proc SAS ( SAS
ผสมในสถาบัน แครี่ , NC ,สหรัฐอเมริกา ) สำหรับการวิเคราะห์การแสดงออกของยีนทั้งสองเป็นชีวมวล ตามลำดับ ค่าตอบแทนใน proc ผสมให้ถูกต้องสำหรับการใด ๆที่ไม่ใช่การแจกแจงปกติใช้ kenwarde โรเจอร์การปรับตัวกับตัวส่วนองศาอิสระ [ 40 ]การวิเคราะห์ หมายถึง การใช้ส่วนนี้เพื่อชดเชยใด ๆที่ขาดหายไปจุดที่จะอัปยศกำลังสองน้อยที่สุดหมายถึงการคำนวณสำหรับสามประเภทคงที่ ผล [ 41,42 ] สำหรับการวิเคราะห์ระดับอะฟลาทอกซิน , ANOVA ดัดแปลงเพิ่มวิธีการใน conjunctionwith ทดสอบมาตรฐานต่างกันน้อยที่สุด ( LSD ) สำหรับการทดสอบตูกีการวิเคราะห์ใช้ [ 41 ] สำหรับการวิเคราะห์มวลชีวภาพของเชื้อราการเปรียบเทียบระหว่างการรักษาแบบเฉพาะเจาะจงจำนวนของนักเรียน ความสำคัญในการศึกษานี้ถูกกำหนดโดยความเชื่อมั่น ? 95% ( ¼ 0.05 ) ผลลัพธ์ที่ได้กำหนดไว้เล็กน้อย ) ถ้าวิเคราะห์ผลิตและใกล้ระดับมาตรฐาน แต่เกินได้ด้วยระดับเล็ก ( ประมาณช่วง : 0.05e0.08 )