The polypeptides in gel were then digested with trypsin (Ettan Spot HandlingWorkstation User Manual 18-1153-55 Edition AC, GE HealthcareBiosciences, Uppsala, Sweden). The tryptic peptides were resus-pended with 0.1% formic acid and analyzed on a SYNAPT HDMSmass spectrometer (Waters, Milford, MA) according to Wong-wilaiwalin et al. [21]. All MS/MS spectra were searched using theMascot®search engine (Matrix Science, Boston, MA) against theNCBI-nr database using the following criteria: enzyme trypsin,static modification of cysteine (+57.05130 Da), and differentialmodification of methionine (+15.99940). The search results werefiltered by cross-correlation versus charge state (+1 ≥ 1.5, +2 ≥ 2.0,+3 ≥ 2.5) and protein probability (minimum 1.00E-3). The candi-date protein queries were mapped to the UniProt Knowledge base(UniProtKB) [22].
polypeptides ในเจลถูกย่อยแล้วกับ trypsin (Ettan จุด HandlingWorkstation คู่มือการใช้งาน 18-1153-55 รุ่น AC, GE HealthcareBiosciences, Uppsala, สวีเดน) เปปไทด์ทริปซิ resus-pended กับกรดฟอร์มิ 0.1% และวิเคราะห์ใน SYNAPT HDMSmass สเปกโตรมิเตอร์ (Waters, ฟอร์ด, แมสซาชูเซต) ตามวงศ์ wilaiwalin et al, [21] MS ทั้งหมด / MS สเปกตรัมถูกค้นหาโดยใช้theMascot®search Engine (Matrix วิทยาศาสตร์, บอสตัน) กับฐานข้อมูล theNCBI NR-โดยใช้เกณฑ์ต่อไปนี้: เอนไซม์ทริปซิดัดแปลงคงที่ของ cysteine (57.05130 ดา) และ differentialmodification ของ methionine (15.99940 ) ผลการค้นหา werefiltered โดยข้ามความสัมพันธ์เมื่อเทียบกับค่าใช้จ่ายของรัฐ (1 ≥ 1.5 2 ≥ 2.0 + 3 ≥ 2.5) และความน่าจะเป็นโปรตีน (ขั้นต่ำ 1.00E-3) แบบสอบถามโปรตีน Candi วันที่ถูกแมปไปยังฐาน UniProt ความรู้ (UniProtKB) [22]
การแปล กรุณารอสักครู่..