Table 2. Summary of genetic variati

Table 2. Summary of genetic variation across 151 isolates of the L. donovani complex for previously described loci involved in resistance or treatment failure of antimonial drugs and Miltefosine.Figure 9. Copy number variation of putative drug resistance genes. (A) Copy numbers (CNs) for all four genes on the H-locus are shown for all 151 samples across all 10 different (sub-)groups. (B) Genome coverage in the genomic regions surrounding the MSL in all six samples showing a deletion and one sample with no CN reduction. Genome coverage for 50 bp windows is normalised by the haploid chromosome coverage and colours indicate the somy equivalent coverage of the respective window. The genes, LinJ.31.2370, LinJ.31.2380, LinJ.31.2390 and LinJ.31.2400, are marked as black horizontal lines. Colours of the sample names indicate group colours used throughout this study. The online version of this article includes the following figure supplement(s) for figure 9:Figure supplement 1. Copy number increase at the H-locus.Figure supplement 2. Copy number variation of putative drug resistance genes.Figure supplement 3. Measures of adaptive evolution.Figure supplement 4. Gene ontology enrichment of marker genes with putative biological impact.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ตารางที่ 2 สรุปความแปรปรวนทางพันธุกรรมใน 151 ไอโซเลทของ L. donovani complex สำหรับตำแหน่งที่อธิบายไว้ก่อนหน้านี้ที่เกี่ยวข้องกับการดื้อยาหรือความล้มเหลวในการรักษาของยาต้านโมเนียลและมิลเทโฟซีน รูปที่ 9 คัดลอกการเปลี่ยนแปลงจำนวนยีนดื้อยาสมมุติ ( A ) หมายเลขการคัดลอก (CNs) สำหรับยีนทั้งสี่ยีนบน H-locus จะแสดงสำหรับตัวอย่างทั้งหมด 151 ตัวอย่างในกลุ่ม (ย่อย) ทั้งหมด 10 กลุ่ม (B) การครอบคลุมจีโนมในบริเวณจีโนมรอบๆ MSL ในตัวอย่างทั้งหกตัวอย่างที่แสดงการลบออก และหนึ่งตัวอย่างที่ไม่มีการลด CN การครอบคลุมจีโนมสำหรับหน้าต่าง 50 bp นั้นถูกทำให้เป็นมาตรฐานโดยการครอบคลุมของโครโมโซมเดี่ยวและสีบ่งบอกถึงความครอบคลุมที่เทียบเท่าของโซมีของหน้าต่างที่เกี่ยวข้อง ยีน LinJ.31.2370, LinJ.31.2380, LinJ.31.2390 และ LinJ.31.2400 มีการทำเครื่องหมายเป็นเส้นแนวนอนสีดำ สีของชื่อตัวอย่างบ่งบอกถึงสีของกลุ่มที่ใช้ในการศึกษานี้ เวอร์ชันออนไลน์ของบทความนี้มีส่วนเสริมรูปภาพต่อไปนี้สำหรับรูปที่ 9: ส่วนเสริมรูปภาพ 1. จำนวนสำเนาเพิ่มขึ้นที่ H-locus รูปที่ 2 เพิ่มเติม คัดลอกการเปลี่ยนแปลงจำนวนยีนดื้อยาสมมุติ รูปที่ 3 เพิ่มเติม มาตรการวิวัฒนาการแบบปรับตัว รูปที่ 4 เสริม การเพิ่มคุณค่าอภิปรัชญาของยีนของยีนมาร์กเกอร์ที่มีผลกระทบทางชีวภาพสมมุติ

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ตารางที่ 2 สรุปการกลายพันธุ์ทางพันธุกรรมของโลคัสที่อธิบายไว้ก่อนหน้านี้โดย 151 สายพันธุ์ donovani lactobacterium complex ที่เกี่ยวข้องกับยาต้านพลวงและความต้านทาน miltefosine หรือความล้มเหลวในการรักษา
รูปที่ 9 สมมติว่าการกลายพันธุ์ของจำนวนสำเนาของยีนที่ดื้อยา (A) แสดงจำนวนสำเนา (CN) ของยีนทั้งสี่ในโลคัส H ของตัวอย่างทั้งหมด 151 กลุ่มจากทั้งหมด 10 กลุ่ม (ย่อย) ที่แตกต่างกัน (B) ครอบคลุมจีโนมในพื้นที่จีโนมรอบ MSL จากทั้งหกตัวอย่างที่แสดงการขาดหายไปและหนึ่งตัวอย่างที่ไม่มีการลด CN ความครอบคลุมของจีโนมของหน้าต่าง 50bp จะถูกทำให้เป็นปกติโดยความครอบคลุมของโครโมโซมเดี่ยวและสีบ่งชี้ความครอบคลุมเทียบเท่าของเซลล์ร่างกายของหน้าต่างที่สอดคล้องกัน ยีน LinJ.31.2370, LinJ.31.2380, LinJ.31.2390 และ LinJ.31.2400 ถูกทำเครื่องหมายด้วยเส้นแนวนอนสีดำ สีของชื่อตัวอย่างบ่งบอกสีของกลุ่มที่ใช้ในการศึกษาทั้งหมด เวอร์ชันออนไลน์ของบทความนี้ประกอบด้วยภาพด้านล่างเพิ่มเติมจากรูปที่ 9:
กราฟเสริม 1 หมายเลขในการคัดลอก

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ตารางที่ 2. ใน151สายพันธุ์ที่แยกได้ของdustleishmaniasis complexความแปรปรวนทางพันธุกรรมของยีนที่อธิบายไว้ก่อนหน้านี้ซึ่งเกี่ยวข้องกับความต้านทานต่อยาใหม่หรือความล้มเหลวในการรักษา
รูปที่ 9 . ความแปรปรวนของจํานวนสําเนาของยีนความต้านทานที่สันนิษฐาน ( a )แสดงจํานวนสําเนา( CNs )ของยีนทั้งหมด4ยีนในกลุ่มย่อยทั้งหมด151ตัวอย่างในกลุ่มย่อยทั้งหมด10กลุ่ม ( b )ความครอบคลุมของจีโนมในพื้นที่จีโนมรอบMSLในตัวอย่างทั้งหกตัวอย่างแสดงให้เห็นว่าขาดหายไปและไม่มีการลดลงของCNในตัวอย่างหนึ่ง ความครอบคลุมของจีโนมของหน้าต่าง50 bpจะถูกกําหนดให้เป็นมาตรฐานโดยการครอบคลุมโครโมโซมaploidและสีจะแสดงให้เห็นถึงความครอบคลุมที่เทียบเท่าของหน้าต่างที่เกี่ยวข้อง ยีนlinj.31.2370,linj.31.2380,linj.31.2390และlinj.31.2400ถูกทําเครื่องหมายด้วยเส้นแนวนอนสีดํา สีของชื่อตัวอย่างแสดงสีของกลุ่มที่ใช้ในการศึกษานี้ ฉบับออนไลน์ของบทความนี้ประกอบด้วยกราฟเสริมสําหรับรูปที่9ด้านล่าง:
ส่วนเสริมรูปที่1 จํานวนสําเนาของตําแหน่งhเพิ่มขึ้น
เพิ่มรูปที่2 ความแปรปรวนของจํานวนสําเนาของยีนความต้านทานที่สันนิษฐาน
รูปที่3 การวัดวิวัฒนาการแบบปรับตัว
แผนภูมิเสริม4 การเสริมสร้างยีนของยีนที่มีเครื่องหมายที่มีผลกระทบทางชีวภาพที่สันนิษฐาน