Different from the results reported in colorectal cancer (Campbell
et al., 2009; Whiffin et al., 2011), we failed to found a significant association
between rs1800734 and MSI status in GC. However, our analysis
had been limited by the sample size of the MSI subgroup, and the
rs1800734 G-allele seemed to mainly decrease risk of MSI GC, indicating
the necessity of further validation. On the other hand, MSI in GC could
be induced by multiple factors. For example, Hp, one of the major etiologic
factors for GC, induces MSI by down-regulated both the expression
and the activity of MMR genes (Machado et al., 2009). And alcohol intake
leads to altered DNA methylation patterns, which may induce
genomic instability (Varela-Rey et al., 2013). These findings suggest a
potential combined effect of risk factors on MSI phenotype of GC.
MSH2 protein plays a key role in recognizing the base-base mismatches
and initializes the MMR process (Li, 2008). The rs2303428 is located
in the intronic splice acceptor site of exon 13 of this gene, whose
variant allele may thus impact the definition of exon boundaries, potentially
leading to alternative splicing. Function assay in vitro has found
that the rs2303428 C allele induced 40% exon exclusion in the splicing
of exon 13 of MSH2 (Tournier et al., 2008). The association of
rs2303428 with the risk of several tumors has already been reported, including
lung cancer, colorectal cancer, breast cancer, leukemia, and nonHodgkin's
lymphoma (Wu et al., 2011b).
In this study, we found no association between rs2303428 and GC
risk, which is consistent with the result from another study (Xiao
et al., 2012). However, in a smaller sample, we previously showed that
the rs2303428 CC genotype significantly increased GC risk relative to
the TT genotype (Wang et al., 2012). It should be cautioned that the
early study was based on subjects from a high-prevalence region
which have been suggested to have special genetic characteristics and
environmental backgrounds (Zhang et al., 2006; Wu et al., 2011a; Fan
et al., 2006). Nevertheless, we observed a substantially elevated risk of
MSI GC in those with the rs2303428 CC genotype, which is needed to
be further investigated in larger studies.
TREX1 is a 3′ to 5′ exonuclease, and TREX1-deficiency causes the intracellular
accumulation of single stranded DNA, leading to chronic activation
of the DNA damage response network (Yang et al., 2007). The
rs11797 is located at 3′ UTR of TREX1. This region is crucial for mRNA
stability, transcription regulation, the binding of microRNA, and cellular
localization of the mRNA (Mazumder et al., 2003). EXO1 is a 5′to 3′ exonuclease
that can interact physically with the MLH1, MSH2, and MSH3
proteins, and is important for stabilizing higher-order complexes of
MMR proteins (Genschel et al., 2002). EXO1-deficiency mice have reduced
survival time and increased tumor risk (Tran et al., 2001). The
EXO1 gene rs735943 polymorphism is a missense variant in which the
transversion of the allele C to T results in an alkaline His residue being
mutated into an acidic Asp residue. Similar substitutions have been suggested
to influence protein function and the pre-mRNA splicing (Fan
et al., 2006; Palhais et al., 2015). Although the functional significance
of these two polymorphisms remains unclear, a study in pancreatic cancer
has found that they were significant predictors of overall survival,
indicating their potential roles in cancer (Chen et al., 2007). However,
our study shows that their main effects were not related to GC risk. Further
functional assays would be required to test their etiological
potentials.
Cancer risk is determined by multiple genetic variants under a polygenic
model. Thus, we further analyzed the combined effect of MMR
polymorphisms we studied. We found that GC risk increased with increasing
numbers of at-risk genotypes, indicating an additive or multiplicative
combined effect of these polymorphisms on GC risk. More
importantly, we observed a similar result in MSI GC and an inverse
result in MSS GC, suggesting that the combined effect of at-risk MMR
genotypes may specifically increase the likelihood of an MSI phenotype
and diminish the likelihood of an MSS phenotype, which support partly
the functional significance of the relevant polymorphisms.
GC is also an environment-induced cancer, thus we further
examined gene–exposure interactions. Both green tea drinking and
soy foods consumption were found to modify the effect of the TREX1
gene rs11797 variant allele, decreasing GC risk. Recently, these two exposures
have been shown to help prevent DNA damage and to improve
DNA repair, owing to the biological effects of components contained in
these items as polyphenols in green tea and phytoestrogens and
isoflavones in soy foods (Tan et al., 2009; Delgado et al., 2008;
Karsli-Ceppioglu et al., 2015; Iovine et al., 2014). Therefore, the interactions
we found indicate a joint effect between antigenotoxic exposures
and particu
แตกต่างจากผลการรายงานในโรคมะเร็งลำไส้ใหญ่ (แคมป์เบล
et al, 2009;.. Whiffin et al, 2011) เราล้มเหลวที่จะพบความสัมพันธ์อย่างมีนัยสำคัญ
ระหว่าง rs1800734 และสถานะของ MSI ในประชาคมโลก อย่างไรก็ตามการวิเคราะห์ของเรา
ได้รับการ จำกัด ด้วยขนาดของกลุ่มตัวอย่างของกลุ่มย่อย MSI และ
rs1800734 G-อัลลีลส่วนใหญ่ดูเหมือนจะลดความเสี่ยงของ MSI GC แสดงให้เห็น
ความจำเป็นของการตรวจสอบต่อไป บนมืออื่น ๆ , MSI ใน GC อาจ
จะเกิดจากหลายปัจจัย ตัวอย่างเช่น, HP, หนึ่งในสาเหตุที่สำคัญ
ปัจจัย GC เจือจาง MSI โดยควบคุมลงทั้งการแสดงออก
และการทำงานของยีน MMR (การ Machado et al., 2009) และบริโภคเครื่องดื่มแอลกอฮอล์
นำไปสู่การเปลี่ยนแปลงรูปแบบ methylation ดีเอ็นเอซึ่งอาจก่อให้เกิด
ความไม่แน่นอนของจีโนม (Varela-Rey et al., 2013) การค้นพบนี้แนะนำ
ผลกระทบโดยรวมที่มีศักยภาพของปัจจัยเสี่ยงในฟีโนไทป์ของ MSI GC.
MSH2 โปรตีนมีบทบาทสำคัญในการตระหนักถึงความไม่ตรงกันฐานฐาน
และเริ่มต้นกระบวนการ MMR (Li, 2008) rs2303428 ตั้งอยู่
ในเว็บไซต์ประกบใบเสร็จ INTRONIC ของเอกซ์ซอน 13 ของยีนนี้ที่มี
อัลลีลที่แตกต่างกันจึงอาจส่งผลกระทบความหมายของขอบเขตเอกซ์ซอนซึ่งอาจ
นำไปสู่การประกบทางเลือก ฟังก์ชั่นการทดสอบในหลอดทดลองพบ
ว่าอัลลีล rs2303428 C เหนี่ยวนำให้เกิดการยกเว้นเอกซ์ซอน 40% ในการประกบ
ของเอกซ์ซอน 13 MSH2 (Tournier et al., 2008) สมาคม
rs2303428 กับความเสี่ยงของหลายเนื้องอกได้รับการรายงานรวมทั้ง
มะเร็งปอดมะเร็งลำไส้ใหญ่มะเร็งเต้านมมะเร็งเม็ดเลือดขาวและ nonHodgkin ของ
โรคมะเร็งต่อมน้ำเหลือง (Wu et al., 2011b).
ในการศึกษานี้เราพบความสัมพันธ์ระหว่าง rs2303428 และไม่มีการ GC
ความเสี่ยงซึ่งสอดคล้องกับผลจากการศึกษาอื่น (Xiao
et al., 2012) อย่างไรก็ตามในตัวอย่างที่มีขนาดเล็กเราก่อนหน้านี้แสดงให้เห็นว่า
จีโนไทป์ rs2303428 CC เพิ่มขึ้นอย่างมีนัยสำคัญความเสี่ยง GC เทียบกับ
จีโนไทป์ TT (Wang et al., 2012) มันควรจะเตือนว่า
การศึกษาในช่วงต้นอยู่บนพื้นฐานของวิชาจากภูมิภาคสูงชุก
ซึ่งได้รับการแนะนำให้มีลักษณะทางพันธุกรรมและพิเศษ
ภูมิหลังด้านสิ่งแวดล้อม (Zhang et al, 2006;.. วู, et al, 2011a; Fan
., et al, 2006) แต่เราตั้งข้อสังเกตว่ามีความเสี่ยงสูงขึ้นอย่างมีนัยสำคัญของ
MSI GC ในผู้ที่มียีน rs2303428 CC ซึ่งเป็นสิ่งจำเป็นที่จะ
ต้องมีการสอบสวนเพิ่มเติมในการศึกษาขนาดใหญ่.
TREX1 เป็น 3 '5' exonuclease และ TREX1 ขาดทำให้เซลล์
เกิดการสะสมของเดี่ยว ควั่นดีเอ็นเอที่นำไปสู่การเปิดใช้งานเรื้อรัง
ของเครือข่ายการตอบสนองต่อความเสียหายของดีเอ็นเอ (Yang et al., 2007)
rs11797 ตั้งอยู่ที่ 3 'UTR ของ TREX1 ภูมิภาคนี้เป็นสิ่งสำคัญสำหรับ mRNA
เสถียรภาพการควบคุมการถอดความผูกพันของ microRNA และโทรศัพท์มือถือ
แปลของ mRNA (Mazumder et al., 2003) EXO1 เป็น 5'to 3 'exonuclease
ที่สามารถโต้ตอบกับร่างกาย MLH1, MSH2 และ MSH3
โปรตีนและเป็นสิ่งสำคัญสำหรับการรักษาเสถียรภาพคอมเพล็กซ์สูงใบสั่งของ
โปรตีน MMR (Genschel et al., 2002) หนู EXO1 ขาดมีการลด
เวลาการอยู่รอดและความเสี่ยงที่เพิ่มขึ้นของเนื้องอก (Tran et al., 2001)
EXO1 ยีน rs735943 polymorphism เป็นตัวแปร missense ที่
transversion ของอัลลีล C ถึงผล T ในด่างสารตกค้างของเขาเป็น
กลายพันธุ์เป็นกรดเป็นสารตกค้างงูเห่า แทนที่คล้ายกันได้รับการแนะนำ
ที่มีอิทธิพลต่อการทำงานของโปรตีนและ pre-mRNA ประกบ (Fan
et al, 2006;.. Palhais et al, 2015) แม้ว่าการทำหน้าที่สำคัญ
ของทั้งสองหลากหลายยังไม่ชัดเจนในการศึกษาโรคมะเร็งตับอ่อน
ได้พบว่าพวกเขาทำนายอย่างมีนัยสำคัญของการอยู่รอดโดยรวม
แสดงให้เห็นศักยภาพของพวกเขามีบทบาทสำคัญในการรักษามะเร็ง (Chen et al., 2007) อย่างไรก็ตาม
การศึกษาของเราแสดงให้เห็นว่าผลกระทบหลักของพวกเขาไม่ได้เกี่ยวข้องกับความเสี่ยง GC นอกจากนี้
การตรวจการทำงานจะต้องทดสอบสาเหตุของพวกเขา
มีศักยภาพ.
ความเสี่ยงโรคมะเร็งจะถูกกำหนดโดยพันธุกรรมสายพันธุ์หลายภายใต้ polygenic
รุ่น ดังนั้นเรายังวิเคราะห์ผลรวมของ MMR
หลากหลายเราศึกษา เราพบว่ามีความเสี่ยง GC เพิ่มขึ้นตาม
ตัวเลขของยีนที่มีความเสี่ยงที่ระบุสารเติมแต่งหรือคูณ
ผลรวมของความหลากหลายเหล่านี้เกี่ยวกับความเสี่ยง GC อื่น ๆ
ที่สำคัญเราสังเกตผลที่คล้ายกันใน MSI GC และผกผัน
ผลใน MSS GC ชี้ให้เห็นว่าผลกระทบโดยรวมที่มีความเสี่ยง MMR
สายพันธุ์โดยเฉพาะอาจจะเพิ่มโอกาสในการฟีโนไทป์ของ MSI
และลดโอกาสของฟีโนไทป์ MSS ที่สนับสนุน ส่วนหนึ่งเป็น
ความสำคัญการทำงานของความหลากหลายที่เกี่ยวข้อง.
GC ยังเป็นมะเร็งสภาพแวดล้อมที่เกิดขึ้นทำให้เราต่อ
การตรวจสอบการมีปฏิสัมพันธ์ของยีนสัมผัส ทั้งสีเขียวดื่มชาและ
อาหารจากถั่วเหลืองบริโภคพบว่ามีการปรับเปลี่ยนผลกระทบของ TREX1
ยีน rs11797 ตัวแปรอัลลีล, ลดความเสี่ยง GC เมื่อเร็ว ๆ นี้ทั้งสองความเสี่ยง
ได้รับการแสดงเพื่อช่วยป้องกันการเสียหายของดีเอ็นเอและเพื่อปรับปรุง
ซ่อมแซมดีเอ็นเอเนื่องจากการผลกระทบทางชีวภาพของส่วนประกอบที่มีอยู่ใน
รายการเหล่านี้เป็นโพลีฟีนในชาเขียวและ phytoestrogens และ
คุณสมบัติคล้ายในอาหารจากถั่วเหลือง (Tan et al, 2009. . เดลกาโด et al, 2008;
Karsli-Ceppioglu et al, 2015;.. มี่ et al, 2014) ดังนั้นการมีปฏิสัมพันธ์
ที่เราพบบ่งชี้ถึงผลกระทบร่วมกันระหว่างความเสี่ยง antigenotoxic
และ particu
การแปล กรุณารอสักครู่..

แตกต่างจากผลรายงานในมะเร็งลำไส้ใหญ่ ( แคมป์เบลet al . , 2009 ; whiffin et al . , 2011 ) , เราล้มเหลวที่จะพบความสัมพันธ์ระหว่าง rs1800734 และสถานะล่าสุดใน GC . อย่างไรก็ตาม การวิเคราะห์ของเราถูก จำกัด โดยขนาดตัวอย่างของ MSI กลุ่มย่อย และrs1800734 g-allele ดูเหมือนส่วนใหญ่ลดความเสี่ยงของ MSI GC , ระบุความจำเป็นของการตรวจสอบต่อไป บนมืออื่น ๆ , MSI ใน GC สามารถจะเกิดจากปัจจัยหลาย ๆ ตัวอย่างเช่น , HP , หนึ่งหลัก etiologicปัจจัยสำหรับ GC ) MSI โดยลงระเบียบ ทั้งการแสดงออกและกิจกรรมของ MMR ยีน ( มาร์ชาโด et al . , 2009 ) การบริโภคเครื่องดื่มแอลกอฮอล์และนำไปสู่การเปลี่ยนแปลงรูปแบบ methylation ดีเอ็นเอ ซึ่งอาจชักจูงที่มีเสถียรภาพ ( วาเรลา Rey et al . , 2013 ) การค้นพบนี้ขอแนะนำศักยภาพรวมผลของปัจจัยเสี่ยงใน MSI ฟีโนไทป์ของ GC .โปรตีน msh2 เล่นบทบาทสำคัญในความไม่ตระหนักถึงฐานฐานและ initializes กระบวนการ MMR ( Li , 2008 ) การ rs2303428 ตั้งอยู่ใน intronic ดามพระนาสิก เว็บไซต์ของ exon 13 ของยีนนี้ของใครตัวแปรในกลุ่มดังนั้นจึงอาจส่งผลกระทบต่อนิยามของ exon ขอบเขต ซ่อนเร้นนำไปสู่การ splicing . การทดสอบในหลอดทดลอง พบว่ามีฟังก์ชันที่ rs2303428 C จาก 40% ใน exon ยกเว้นใน splicingของ exon 13 msh2 ( tournier et al . , 2008 ) สมาคมrs2303428 กับความเสี่ยงของมะเร็งหลาย ได้รับรายงานแล้ว ได้แก่มะเร็งปอด , มะเร็ง , มะเร็งเต้านม , โรคมะเร็งลำไส้ใหญ่ และ nonhodgkin คือมะเร็งต่อมน้ำเหลือง ( Wu et al . , 2011b )ในการศึกษานี้ไม่พบความสัมพันธ์ระหว่าง rs2303428 GC และความเสี่ยง ซึ่งสอดคล้องกับผลที่ได้จากการศึกษาอื่น ( เสี่ยวet al . , 2012 ) แต่ในตัวอย่างที่มีขนาดเล็กลง เราก่อนหน้านี้ พบว่าการ rs2303428 CC กับ GC ที่สัมพันธ์กับความเสี่ยงมากขึ้นทีทีจีโนไทป์ ( Wang et al . , 2012 ) มันควรจะเตือนว่าศึกษาก่อนใช้วิชาจากเขตการศึกษาสูงซึ่งได้รับการแนะนำให้มีลักษณะทางพันธุกรรมที่พิเศษ และพื้นหลังสิ่งแวดล้อม ( Zhang et al . , 2006 ; Wu et al . , 2011a ; แฟนet al . , 2006 ) อย่างไรก็ตาม เราสังเกตการยกระดับความเสี่ยงอย่างมากMSI GC ในผู้ที่มี rs2303428 ซีซี พันธุกรรม ซึ่งเป็นต้องการมีการศึกษาเพิ่มเติมในการศึกษาขนาดใหญ่trex1 เป็น 3 ได้รับ 5 ได้รับเอกโซนิวคลีเอส และขาด trex1 สาเหตุภายในการสะสมของเดียวควั่นดีเอ็นเอ นำไปสู่การกระตุ้นเรื้อรังของความเสียหายของดีเอ็นเอการตอบสนองเครือข่าย ( หยาง et al . , 2007 ) ที่rs11797 ตั้งอยู่ที่ 3 ได้รับ UTR ของ trex1 . ภูมิภาคนี้เป็นสิ่งสำคัญสำหรับยีนเสถียรภาพการควบคุมการถอดรหัส , ผูกพันของ MIC และเซลล์จำกัดของ mRNA ( mazumder et al . , 2003 ) exo1 เป็น 5 ’’เอกโซนิวคลีเอส 3ที่สามารถมีปฏิสัมพันธ์ทางกายภาพกับ mlh1 msh2 และ msh3 ,โปรตีน , และเป็นสิ่งสำคัญสำหรับรักษาเสถียรภาพของสารประกอบเชิงซ้อนขั้นสูงโปรตีน MMR ( genschel et al . , 2002 ) exo1 ขาดหนูได้ลดลงเวลาการอยู่รอดและเพิ่มความเสี่ยงมะเร็ง ( Tran et al . , 2001 ) ที่exo1 ยีน rs735943 polymorphism คือ มิ ซ็นต์ตัวแปรที่transversion ของอัลลีล c t ผลในด่างกากของเขาถูกกลายพันธุ์เป็นกาก ASP ที่เป็นกรด เปลี่ยนที่คล้ายกันมีการแนะนำมีอิทธิพลต่อการทำงานของโปรตีนและ pre mRNA splicing พัดลมet al . , 2006 ; palhais et al . , 2015 ) แม้ว่าความสำคัญการทำงานความหลากหลายของทั้งสองยังคงไม่ชัดเจน การศึกษาในมะเร็งตับอ่อนพบว่า มีตัวแปรสำคัญของการอยู่รอดโดยรวมแสดงบทบาทศักยภาพในมะเร็ง ( Chen et al . , 2007 ) อย่างไรก็ตามการศึกษาของเราแสดงให้เห็นว่าผลกระทบหลักของพวกเขาไม่ได้เกี่ยวข้องกับความเสี่ยง GC . เพิ่มเติมทดสอบการทำงานจะต้องทดสอบทราบของพวกเขาศักยภาพความเสี่ยงของโรคมะเร็งจะถูกกำหนดโดยพันธุกรรมหลากหลายภายใต้ polygenicนางแบบ ดังนั้น เราเพิ่มเติมวิเคราะห์ผลรวมของคางทูมลเราเรียน เราพบความเสี่ยงเพิ่มขึ้นที่ GCตัวเลขที่เลือกพันธุ์ ซึ่งเป็นสารเติมแต่งหรือการคูณผลรวมของความหลากหลายเหล่านี้บนความเสี่ยง GC . เพิ่มเติมที่สำคัญ เราสังเกตที่คล้ายกันส่งผลให้ MSI GC และผกผันผลในการจัดซื้อ GC , ชี้ให้เห็นว่าผลรวมของ MMR กลุ่มเสี่ยงโดยเฉพาะบางพันธุ์ อาจเพิ่มโอกาสของ MSI ฟีโนไทป์และลดโอกาสของการจัดซื้อการซึ่งสนับสนุนบางส่วนโดยการทำงานของความหลากหลายที่เกี่ยวข้องGC เป็นสภาพแวดล้อมที่กระตุ้นให้เกิดมะเร็ง ดังนั้นเราเพิ่มเติมการตรวจสอบยีน และการมีปฏิสัมพันธ์ ดื่มชาทั้งสีเขียวและถั่วเหลืองอาหารบริโภค พบว่า ผลของ trex1 ปรับเปลี่ยนยีน rs11797 ตัวแปรใน การลดความเสี่ยง GC . เมื่อเร็วๆ นี้ ทั้งสองรูปได้รับการแสดงเพื่อช่วยป้องกันความเสียหายของดีเอ็นเอและการปรับปรุงซ่อมแซมดีเอ็นเอ อันเนื่องมาจากผลกระทบทางชีวภาพขององค์ประกอบที่มีอยู่ในรายการเหล่านี้เป็น Polyphenols ในชาเขียว และไฟโตเอสโตรเจนและไอโซฟลาโวนในอาหารถั่วเหลือง ( Tan et al . , 2009 ; เดลกาโด et al . , 2008 ;karsli ceppioglu et al . , 2015 ; iovine et al . , 2010 ) ดังนั้น การปฏิสัมพันธ์เราพบแสดงผลร่วมระหว่าง antigenotoxic รูป
การแปล กรุณารอสักครู่..
