To ensure that individuals clustere

To ensure that individuals clustered according to their described species, we assessed nuclear genetic structure through Bayesian model-based clustering in structure v.2.3 . structure determines the most likely number of differentiated clusters (K) represented by the sample and assigns the sampled genotypes to the inferred clusters. Using a random subset of 1,000 markers, we estimated the log likelihood of the data, given different numbers of genetic clusters K, using an admixture model with correlated allele frequencies, without sampling locations as priors and with all other parameters as defaults. For each k value of 1 through 6, we ran ten replicates (50,000 burn-in cycles, 100,000 MCMC iterations), from which we calculated ΔK following . We used the program structure harvester to identify the number of populations K with the best support.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

เพื่อให้แน่ใจว่า บุคคลจับกลุ่มตามสายพันธุ์ของพวกเขาอธิบาย เราประเมินโครงสร้างทางพันธุกรรมนิวเคลียร์ผ่านทฤษฎีแบบจำลองใช้คลัสเตอร์ในโครงสร้าง v.2.3 โครงสร้างกำหนดจำนวนคลัสเตอร์ต่าง ๆ (K) แทน ด้วยตัวอย่าง และให้การศึกษาจีโนไทป์ตัวอย่างคลัสเตอร์ inferred เราใช้ชุดย่อยของ 1000 เครื่องหมายสุ่ม ประเมินโอกาสบันทึกข้อมูล กำหนดหมายเลขแตกต่างกันทางพันธุกรรมกลุ่ม K การใช้แบบจำลองการผลิตกับความถี่ของ correlated allele โดยไม่ต้องตั้ง เป็น priors และพารามิเตอร์อื่น ๆ ทั้งหมดเป็นค่าเริ่มต้นการสุ่มตัวอย่าง สำหรับค่า k แต่ละ 1 ถึง 6 เราวิ่งสิบเหมือนกับ (รอบเขียนในบัตรเข้า 50000, 100000 MCMC ซ้ำ), ซึ่งเราได้ ΔK ต่อไปนี้ เราใช้เก็บเกี่ยวโครงสร้างโปรแกรมเพื่อระบุจำนวนประชากร K ด้วยการสนับสนุนดีที่สุด

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

เพื่อให้แน่ใจว่าบุคคลคลัสเตอร์ตามสายพันธุ์อธิบายของพวกเขาเราประเมินโครงสร้างทางพันธุกรรมนิวเคลียร์ผ่านการจัดกลุ่มแบบที่ใช้ในคชกรรม v.2.3 โครงสร้าง โครงสร้างกำหนดจำนวนส่วนใหญ่ของกลุ่มที่แตกต่างกัน (K) ตัวแทนจากกลุ่มตัวอย่างและกำหนดลักษณะทางพันธุกรรมตัวอย่างกับกลุ่มสรุป ใช้ย่อยสุ่ม 1,000 เครื่องหมายเราคาดโอกาสเข้าสู่ระบบของข้อมูลที่ได้รับตัวเลขที่แตกต่างของกลุ่มพันธุกรรม K โดยใช้รูปแบบผสมที่มีความถี่อัลลีลมีความสัมพันธ์โดยไม่ต้องสุ่มตัวอย่างสถานที่เป็นไพรเออร์และพารามิเตอร์อื่น ๆ ทั้งหมดเป็นค่าเริ่มต้น สำหรับแต่ละค่า k 1 ถึง 6 เราวิ่งสิบซ้ำ (50,000 เผาไหม้ในรอบ 100,000 ซ้ำ MCMC) จากที่เราคำนวณΔKดังต่อไปนี้ เราใช้นวดโครงสร้างโปรแกรมที่จะระบุจำนวนของประชากร K ด้วยการสนับสนุนที่ดีที่สุด

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

เพื่อให้แน่ใจว่าบุคคลที่เป็นกลุ่มตามอธิบายชนิด เราประเมินโครงสร้างทางพันธุกรรมสำหรับการจัดกลุ่มใน v.2.3 นิวเคลียร์ผ่านระบบโครงสร้าง โครงสร้างกําหนดจํานวนมากที่สุดของกลุ่มที่แตกต่าง ( K ) แสดงโดยตัวอย่างและการกำหนดตัวอย่างพันธุ์ไปทั้งกลุ่ม ใช้ย่อยแบบ 1000 เครื่องหมายเราประเมินโอกาสของการบันทึกข้อมูล ระบุตัวเลขที่แตกต่างกันของยีนกลุ่ม K , ใช้ผสมกับรูปแบบความสัมพันธ์ความถี่ โดยการสุ่มตัวอย่างที่ตั้งเป็นลำดับและพารามิเตอร์อื่น ๆทั้งหมดที่เริ่มต้น สำหรับแต่ละค่า K ของ 1 ถึง 6 , เราวิ่ง 10 นาที ( 50 , 000 - เผารอบ 100000 MCMC ซ้ำ ) จากที่เราคำนวณΔ K ดังนี้เราใช้โปรแกรมโครงสร้างต่างๆเพื่อระบุจำนวนประชากร K ด้วยการสนับสนุนที่ดีที่สุด