The LCA mapping between a gene tree

The LCA mapping between a gene tree T and a species tree S, denoted by LCAT,S, maps every node x of T to the Lowest Common Ancestor (LCA) of C(x) in S. Formally, LCAT,S(x) = y, where y is the node of S that has the minimum cluster such that C(x) ⊆ C(y). A duplication occurs in a node x of T (or x is a duplication), if x and at least one of its children are mapped by LCAT,S in the same node y of the species tree S. If x is not a duplication node, then x is a speciation. See Fig. 1(b) for an example.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

การแม็ประหว่างต้นไม้ยีน T และต้นไม้พันธุ์ S สามารถบุ โดย LCAT, S, LCA การแมปโหนทุก x T เพื่อต่ำทั่วไปบรรพบุรุษ (LCA) ของ C(x) ใน S. อย่างเป็นกิจจะลักษณะ LCAT,S(x) = y, y อยู่ที่โหนของ S ที่มีต่ำสุดคลัสเตอร์ดังกล่าว C(x) ที่⊆ C(y) ซ้ำซ้อนเกิดขึ้นในโหนด x T (หรือ x ซ้ำซ้อน), ถ้า x และที่น้อยที่สุดหนึ่งของเด็กได้รับการแมป โดย LCATใน y โหนเดียวต้นสายพันธุ์ s ได้ ถ้า x ไม่ใช่โหนซ้ำ แล้ว x เป็นการเกิดสปีชีส์ใหม่ ดู 1(b) Fig. สำหรับตัวอย่าง

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

การทำแผนที่ LCA ระหว่าง T ต้นไม้ของยีนและต้นไม้ชนิด S, แสดงโดย LCAT, S, แม x โหนดทุก T เพื่อบรรพบุรุษร่วมกันต่ำสุด (LCA) ของ C (x) ในเอสอย่างเป็นทางการ LCAT, S (x) = y, ที่ y เป็นโหนดของ S ที่มีกลุ่มน้อยโดยที่ C (x) ⊆ C (Y) ซ้ำซ้อนที่เกิดขึ้นใน x โหนดของ T (หรือ x การทำสำเนา) ถ้า x และอย่างน้อยหนึ่งของเด็กที่ได้รับการแมปโดย LCAT, S ในปีเดียวกันโหนดของต้นไม้ชนิด S. ถ้า x ไม่โหนดการทำสำเนา แล้ว x เป็น speciation ดูรูปที่ 1 (ข) ตัวอย่างเช่น

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ใช้ LCA แผนที่ระหว่างยีนต้นไม้ T และชนิดของต้นไม้เขียนแทนด้วย lcat , S , แผนที่ทุกโหนด x t กับบรรพบุรุษต่ำสุด ( LCA ) c ( x ) ในสหรัฐอเมริกาอย่างเป็นทางการ lcat , S ( x ) = y ที่ Y เป็นโหนดที่ได้น้อยที่สุด กลุ่ม เช่น C ( x ) ⊆ C ( Y ) เป็นซ้ำซ้อนเกิดขึ้นในโหนด x T ( หรือ X เป็นเหมือนกัน ) ถ้า x และอย่างน้อย 1 ลูก โดย lcat แมป ,ในโหนดเดียวกัน Y ของชนิดต้นไม้ . ถ้า x ไม่ซ้ำซ้อนโหนดแล้ว x เป็นชนิด . เห็นรูปที่ 1 ( B ) สำหรับตัวอย่าง