Complete nucleotide sequences of th

Complete nucleotide sequences of the type isolate of Grapevine leafroll-associated virus 4 (GLRaV-4) and of an isolate of GLRaV-6 from cv ‘Estellat’ (GLRaV-6Est) were generated and compared mutually and with related viruses. The genome organization of both viruses resembled that of members of Subgroup I in the genus Ampelovirus (fam. Closteroviridae). The availability of these sequences, along with previously existing data on related GLRaVs, allowed critical review of the taxonomy and nomenclature of these viruses. In phylogenetic analyses, GLRaV-4 and -6Est consistently grouped with GLRaV-5, -9, and -Pr forming a poorly resolved sub-cluster (“GLRaV-4 group”) within the genus Ampelovirus. In-depth study showed that genetic distances between these viruses do not exceed the intra-species diversity observed in other closteroviruses. In Western blots, partially purified preparations of GLRaVs -4, -5, -6 and -9 reacted only with homologous monoclonal antibodies, but were all recognized by polyclonal antisera to GLRaV-5 and GLRaV-9. Serological relatedness among these viruses was further confirmed in DAS-ELISA. In immuno-electron microscopy, GLRaV-6 particles appeared uniformly decorated with homologous monoclonal antibodies, whereas GLRaV-2, used as a control, showed “bipolar” morphology of the virion. Results of this study challenge taxonomy and nomenclature of several GLRaVs suggesting that they are divergent isolates of Grapevine leafroll-associated virus 4 and not, as has been assumed, distinct species (definitive and/or putative) in the genus Ampelovirus.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ลำดับของนิวคลีโอไทด์ที่สมบูรณ์ของชนิดแยก Grapevine สัมพันธ์ leafroll ไวรัส 4 (GLRaV-4) และการแยก GLRaV-6 จาก cv 'Estellat' (GLRaV-6Est) ถูกสร้าง และเปรียบเทียบกัน และไวรัสที่เกี่ยวข้อง องค์กรจีโนมของไวรัสทั้งสองคล้ายกับที่สมาชิกของกลุ่มย่อยของฉันใน Ampelovirus (fam. Closteroviridae) พร้อมลำดับเหล่านี้ พร้อมกับก่อนหน้านี้ที่มีอยู่ข้อมูลที่เกี่ยวข้อง GLRaVs อนุญาตให้ทบทวนความสำคัญของระบบภาษีและระบบการตั้งชื่อของไวรัสเหล่านี้ ในวิเคราะห์ phylogenetic, GLRaV 4 และ - 6Est เราจัดกับ GLRaV-5, -9 และ -Pr ขึ้นรูปเป็นงานแก้ไขคลัสเตอร์ย่อย ("GLRaV 4 กลุ่ม") ในสกุล Ampelovirus ศึกษาเชิงลึกพบว่า ระยะทางพันธุกรรมระหว่างไวรัสเหล่านี้เกินความหลากหลายภายในชนิดใน closteroviruses อื่น ๆ ในตะวันตกกันบล็อท เตรียมบริสุทธิ์บางส่วนของ GLRaVs -4, -5, -6 และ-9 ปฏิกิริยาที่เกิดขึ้นเฉพาะกับแอนตี้ monoclonal homologous แต่เลยรู้จัก antisera polyclonal GLRaV-5 และ GLRaV-9 Relatedness สภาวะระหว่างไวรัสเหล่านี้ได้รับการยืนยันเพิ่มเติมใน DAS ELISA ใน microscopy immuno อิเล็กตรอน อนุภาค GLRaV-6 ปรากฏตกแต่งอย่างสม่ำเสมอเมื่อเทียบเคียงกับแอนตี้ monoclonal homologous ในขณะที่ GLRaV-2 ใช้เป็นตัวควบคุม แสดงให้เห็นว่า "ไฟที่ไบโพลาร์" สัณฐานวิทยาของ virion ผลการศึกษานี้ท้าทายระบบภาษี และระบบการตั้งชื่อของ GLRaVs หลายที่แนะนำว่า เป็นขันติธรรมแยก Grapevine สัมพันธ์ leafroll ไวรัส 4 และไม่ เป็น สันนิษฐาน แตกต่างสายพันธุ์ (ทั่วไป / putative) ในสกุล Ampelovirus

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ลำดับเบสที่สมบูรณ์ของการแยกประเภทของเกรปไวน์ไวรัส leafroll ที่เกี่ยวข้อง 4 (GLRaV-4) และการแยกของ GLRaV-6 จากพันธุ์ 'Estellat (GLRaV-6Est) ถูกสร้างขึ้นและร่วมกันและเมื่อเทียบกับไวรัสที่เกี่ยวข้อง องค์กรจีโนมของไวรัสทั้งสองคล้ายกับที่สมาชิกของกลุ่มย่อยฉันในประเภท Ampelovirus (Fam. Closteroviridae) ความพร้อมใช้งานของลำดับเหล่านี้พร้อมกับข้อมูลที่มีอยู่ก่อนหน้านี้ใน GLRaVs ที่เกี่ยวข้องกับการได้รับอนุญาตให้ตรวจสอบที่สำคัญของอนุกรมวิธานและการเรียกชื่อของไวรัสเหล่านี้ ในการวิเคราะห์สายวิวัฒนาการ, GLRaV-4 และ -6Est จัดกลุ่มอย่างต่อเนื่องกับ GLRaV-5, -9 และ -Pr ขึ้นรูปได้รับการแก้ไขได้ไม่ดีกลุ่มย่อย ("GLRaV-4 กลุ่ม") ภายในสกุล Ampelovirus การศึกษาในเชิงลึกพบว่าระยะทางพันธุกรรมระหว่างไวรัสเหล่านี้ไม่เกินความหลากหลายภายในสายพันธุ์ตั้งข้อสังเกตใน closteroviruses อื่น ๆ ใน blots ตะวันตกเตรียมบริสุทธิ์บางส่วนของ GLRaVs -4, -5 -6 -9 และปฏิกิริยาเฉพาะกับโคลนอลแอนติบอดีคล้ายคลึงกัน แต่ทุกคนได้รับการยอมรับโดยการฉีดโพลี GLRaV-5 และ GLRaV-9 ความสัมพันธ์ทางภูมิคุ้มกันในหมู่ไวรัสเหล่านี้ได้รับการยืนยันต่อไปใน DAS-ELISA ในกล้องจุลทรรศน์อิเล็กตรอนภูมิคุ้มกันอนุภาค GLRaV-6 ปรากฏได้รับการตกแต่งอย่างสม่ำเสมอด้วยโคลนอลแอนติบอดีคล้ายคลึงกันในขณะที่ GLRaV-2 ที่ใช้ในการควบคุมการแสดงให้เห็นว่า "สองขั้ว" สัณฐานวิทยาของ virion ผลการศึกษาอนุกรมวิธานความท้าทายนี้และเรียกชื่อของ GLRaVs หลายบอกว่าพวกเขาเป็นสายพันธุ์ที่แตกต่างกันของเกรปไวน์ไวรัส leafroll ที่เกี่ยวข้องที่ 4 และไม่ได้ตามที่ได้รับการสันนิษฐานชนิดที่แตกต่างกัน (ที่ชัดเจนและ / หรือสมมุติ) ในสกุล Ampelovirus

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ลำดับนิวคลีโอไทด์ที่สมบูรณ์ของชนิดแยกขององุ่น leafroll เกี่ยวข้องไวรัส 4 ( glrav-4 ) และการแยกของ glrav-6 จาก estellat CV ' ' ( glrav-6est ) ถูกสร้างขึ้นเมื่อแก่กันและกัน และที่เกี่ยวข้องกับไวรัส จีโนมองค์กรของไวรัสที่คล้ายกับที่ของสมาชิกของกลุ่มย่อยในสกุล ampelovirus ( FAM closteroviridae ) ความพร้อมของลำดับนี้พร้อมกับข้อมูลที่เกี่ยวข้องที่มีอยู่ก่อนหน้านี้ glravs อนุญาติให้มีการทบทวนอนุกรมวิธานและระบบการตั้งชื่อของไวรัสเหล่านี้ ในการวิเคราะห์ ซึ่ง glrav-4 - 6est อย่างต่อเนื่อง , และการจัดกลุ่มกับ glrav-5 , - 9 - ประชาสัมพันธ์งานขึ้นรูปและแก้ไขกลุ่มย่อย ( " กลุ่ม glrav-4 " ) ภายในสกุล ampelovirus .ในการศึกษาเชิงลึก พบว่า ความแตกต่างทางพันธุกรรมระหว่างไวรัสเหล่านี้จะไม่เกินภายในความหลากหลายของชนิดที่พบใน closteroviruses อื่น ๆ ในการเตรียมการ blots ตะวันตกบริสุทธิ์บางส่วนของ glravs - 4 - 5 - 6 - 9 มีปฏิกิริยาเฉพาะกับโฮโมโลกัส โมโนโคลนอลแอนติบอดี แต่ทั้งหมดได้รับการยอมรับโดยการใช้แอนติและ glrav-5 glrav-9 .สัมพันธ์ทางของไวรัสเหล่านี้ยังยืนยันใน das-elisa . มมูโนในกล้องจุลทรรศน์อิเล็กตรอนอนุภาคที่ปรากฏขึ้น glrav-6 , ตกแต่งด้วยโฮโมโลกัส โมโนโคลนอลแอนติบอดี ในขณะที่ glrav-2 ใช้เป็นชุดควบคุม พบ " ไบโพลาร์ " โครงสร้างของสภาพแวดล้อมการโฮสต์ .จากการศึกษาอนุกรมวิธานและการเรียกชื่อของความท้าทายหลาย glravs บอกว่าพวกเขาเป็นอเนกสายพันธุ์ขององุ่น leafroll เกี่ยวข้องไวรัส 4 และไม่ได้ถือว่าเป็นชนิดที่แตกต่างกัน ( ที่ชัดเจนและ / หรือการแสดงออก ) ในสกุล ampelovirus .