Diversity of the nifH gene in the rhizosphere of
M. malabathricum in three soil types
Although there have been many attempts to describe the
diversity of nifH gene pools in environmental samples (6, 7,
9, 12, 19, 30, 31, 33), few studies have simultaneously displayed
both qualitative and quantitative differences in nifH
gene composition (18, 26, 27, 32). Phylogenetic trees have
been frequently used to describe visually the microbial diversity
in diverse environments. However, in this study, we tried
to illustrate visually the difference in diversity of the nifH
gene among soil types. Therefore, we assembled nifH reads
into OTUs based on homology, characterized each OTU
from the composition of reads, and analyzed the diversity of
nifH in samples using a data matrix (Table 1).
Diversity of the nifH gene in the rhizosphere ofM. malabathricum in three soil typesAlthough there have been many attempts to describe thediversity of nifH gene pools in environmental samples (6, 7,9, 12, 19, 30, 31, 33), few studies have simultaneously displayedboth qualitative and quantitative differences in nifHgene composition (18, 26, 27, 32). Phylogenetic trees havebeen frequently used to describe visually the microbial diversityin diverse environments. However, in this study, we triedto illustrate visually the difference in diversity of the nifHgene among soil types. Therefore, we assembled nifH readsinto OTUs based on homology, characterized each OTUfrom the composition of reads, and analyzed the diversity ofnifH in samples using a data matrix (Table 1).
การแปล กรุณารอสักครู่..

ความหลากหลายของยีน nifH
บริเวณรากของเอ็ม malabathricum
ในสามประเภทดินแม้ว่าจะมีความพยายามมากมายที่จะอธิบายความหลากหลายของ
nifH สระว่ายน้ำของยีนในตัวอย่างด้านสิ่งแวดล้อม (6, 7,
9, 12, 19, 30, 31, 33)
การศึกษาน้อยได้พร้อมกันแสดงทั้งความแตกต่างของคุณภาพและเชิงปริมาณใน nifH
องค์ประกอบของยีน (18, 26, 27, 32) ต้นไม้ที่ได้ถูกนำมาใช้บ่อยในการอธิบายถึงการมองเห็นความหลากหลายของจุลินทรีย์ในสภาพแวดล้อมที่มีความหลากหลาย อย่างไรก็ตามในการศึกษาครั้งนี้เราพยายามที่จะแสดงให้เห็นถึงการมองเห็นความแตกต่างในความหลากหลายของ nifH ยีนในประเภทดิน ดังนั้นเราจึงรวมตัวกัน nifH อ่านเข้าOtus คล้ายคลึงกันขึ้นอยู่กับลักษณะของแต่ละ OTU จากองค์ประกอบของการอ่านและวิเคราะห์ความหลากหลายของnifH ในตัวอย่างโดยใช้ข้อมูลที่เมทริกซ์ (ตารางที่ 1)
การแปล กรุณารอสักครู่..

ความหลากหลายของยีน nifh ในรากของดิน 3 ชนิด malabathricum
m
แม้จะมีความพยายามมากมายที่จะอธิบาย
ความหลากหลายของ nifh ยีนสระว่ายน้ำในตัวอย่างสิ่งแวดล้อม ( 6 , 7
9 , 12 , 19 , 30 , 31 , 33 ) , การศึกษาน้อยได้แสดงผลพร้อมกัน
ทั้งเชิงปริมาณและเชิงคุณภาพ ความแตกต่างในองค์ประกอบของยีน nifh
( 18 , 26 , 27 , 32 ) ต้นไม้ซึ่งมี
ถูกใช้บ่อยเพื่ออธิบายถึงความหลากหลายของจุลินทรีย์ในสายตา
สภาพแวดล้อมที่หลากหลาย อย่างไรก็ตาม ในการศึกษานี้เราพยายามที่จะแสดงให้เห็นถึงความแตกต่างในสายตา
nifh ความหลากหลายของยีนระหว่างชนิดของดิน ดังนั้นเราจึงประกอบ nifh อ่าน
เป็นในจากเป็น ลักษณะ แต่ละ otu
จากการอ่านและวิเคราะห์ความหลากหลายของ
nifh ในตัวอย่างโดยใช้ Data Matrix ( ตารางที่ 1 )
การแปล กรุณารอสักครู่..
