There is accumulating evidence to s

There is accumulating evidence to suggest that the environmental microbiome plays a significant role in asthma development. The very low prevalence of asthma in populations highly exposed to microbial environments (farm children and Amish populations) highlights its preventive potential. This microbial diversity might be necessary to instruct a well-adapted immune response and regulated inflammatory responses to other inhaled and ingested environmental elements, such as allergens, particles, and viruses. Like the internal gut microbiome, which is increasingly recognized as an important instructor of immune maturation, the external environmental microbiome might shape immune responses on the skin, airway mucosal surfaces, and potentially also the gut early in life. The diversity of the external microbial world will ensure that of the many maladapted pathways leading to asthma development, most, if not all, will be counterbalanced. Likewise, important contributors to asthma, such as allergen sensitization and allergic manifestations early in life, are being suppressed. Thus the facets of innate immunity targeted by microbes and their compounds and metabolites might be the master switch to asthma and allergy protection, which has been found in environments rich in microbial exposures.

Key words
•Microbiome;
•asthma;
•environment;
•children;
•epidemiology

Abbreviations used
•ALEX, Protection Against the Development of Atopy: Relevant Factors from Farming Environments;
•aOR, Adjusted odds ratio;
•EPS, Extracellular polysaccharide;
•PAMP, Pathogen-associated molecular pattern;
•PARSIFAL, Prevention of Allergy–Risk Factors for Sensitisation in Children Related to Farming and Anthroposophic Lifestyle



The microbial world is a vast universe with innumerable species. Microbes have been found in the deep sea, caverns, hot springs, and other places not inhabitable by human subjects. However, microbes also populate our daily indoor and outdoor environments in urban and rural areas in great abundance.1 This abundance had been underestimated as long as culture methods were the only possible means of investigation. Yet isolation and cultivation have strong limitations because for many microbes, it is unknown under which conditions they grow.2 For certain environments, only about 1% of all microbes can be cultured. Furthermore, cultivation methods are tedious and personnel intensive, which hampers their application to large population-based surveys.

Alternatively, exposure to microbes can indirectly be assessed by detecting substances derived from their cell walls, such as LPS and peptidoglycan. Although LPS or endotoxin is found on the cell walls of gram-negative bacteria, peptidoglycan is a component of the cell wall of gram-positive and also, to a smaller extent, gram-negative bacteria. The most commonly used test (the limulus amebocyte lysate test) to detect endotoxin in dust samples has been largely applied in epidemiologic surveys. Others have measured levels of 3-hydroxy fatty acids from LPS, but levels correlate poorly with limulus amebocyte lysate assay measurements. The same problem applies to different methods detecting muramic acid, a component of peptidoglycan.3 Other compounds reflecting exposure to fungi, such as extracellular polysaccharides (EPSs) and β- glucans, have also been measured.4 However, the specificity of these individual markers is limited.

The advent of DNA-based high-throughput analyses has revolutionized the field. These novel study instruments are comparable with the invention of the microscope, which also allowed making the invisible world seen. In 1977, Woese and colleagues5 discovered that the nucleotide sequence of 16S ribosomal RNA (16S rRNA) is present in every bacterial and archaeal cell but not in human or animal cells. 16S rRNA contains highly conserved regions among all bacteria. Thus detection of 16S rRNA signals the presence of bacteria and archaea but not protozoa, virus, vertebrate, and other animals or human subjects. These conserved regions flank sequence regions that are variable among different bacterial species and thus allow phylogenetic classification. Several techniques combining high-throughput methods, such as microarrays or next-generation sequencing, with 16S rRNA gene analysis are being increasingly applied to microbial investigations of environmental and human samples.6 The taxonomic classification of the bacteria is obtained by comparing the sequences against databases, such as the National Center for Biotechnology Information (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nucleotide), the Ribosomal Database Project (http://rdp.cme.msu.edu), Greengenes (http://greengenes.lbl.gov/cgi-bin/nph-index.cgi), or SILVA (http://www.arb-silva.de). These techniques are advancing fast, and it is now possible to study all genetic material (human, animal, plant, microbes, and protozoa) recovered from environmental samples by using metagenomic shotgun sequencing. Given the expone

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

มีหลักฐานที่ accumulating แนะนำว่า microbiome สิ่งแวดล้อมมีบทบาทสำคัญในการพัฒนาโรคหอบหืด โรคหอบหืดในประชากรสูงสัมผัสกับสภาพแวดล้อมที่จุลินทรีย์ฟาร์มเด็กและประชากร Amish) ส่วนมากเน้นป้องกันความเป็นไปได้ ความหลากหลายทางชีวภาพจุลินทรีย์นี้อาจจำเป็นต้องแนะนำการตอบสนองภูมิคุ้มกันอย่างดีดัดแปลง และตอบสนองการอักเสบควบคุมอื่น ๆ ช่วยใน และองค์ประกอบของสิ่งแวดล้อม สารก่อภูมิแพ้ อนุภาค และไวรัสกิน เช่น microbiome ลำไส้ภายใน ที่มีมากขึ้นการรับรู้เป็นอาจารย์สำคัญของภูมิคุ้มกันแก่ microbiome สิ่งแวดล้อมภายนอกอาจรูปร่างในการตอบสนองภูมิคุ้มกันผิวหนัง ผิว mucosal จำกัด(มหาชน) และอาจไส้ก่อนในชีวิต ความหลากหลายของจุลินทรีย์โลกภายนอกจะให้แน่ใจว่ามนต์ maladapted หลายที่นำไปสู่การพัฒนาโรคหอบหืด ที่สุด ถ้า ไม่ทั้งหมด จะถ่วงดุล ทำนองเดียวกัน ผู้ให้การสนับสนุนสำคัญโรคหืด allergen sensitization และลักษณะแพ้ในชีวิต ช่วงจะถูกปราบพยศ ดังนั้น ในแง่มุมของภูมิคุ้มกันโดยธรรมชาติโดยจุลินทรีย์ และสาร และ metabolites อาจจะสลับหลักโรคหอบหืดและโรคภูมิแพ้ป้องกัน ซึ่งถูกพบในสภาพแวดล้อมที่อุดมไปด้วยจุลินทรีย์ไงคำสำคัญ•Microbiome •asthma •environment •children •epidemiologyใช้คำย่อ•ALEX ป้องกันการพัฒนาของ Atopy: ปัจจัยที่เกี่ยวข้องจากเกษตรสภาพแวดล้อม •aOR ปรับปรุงอัตราราคา •EPS, extracellular polysaccharide •PAMP เชื่อมโยงการศึกษาโมเลกุลรูปแบบ •PARSIFAL ป้องกันโรคภูมิแพ้ – เสี่ยงปัจจัย Sensitisation ในเด็กที่เกี่ยวข้องกับการทำฟาร์มและชีวิต Anthroposophicโลกจุลินทรีย์มีจักรวาลมากมายกับชนิดนับไม่ถ้วน จุลินทรีย์ถูกพบ ในทะเลลึก ถ้ำ น้ำพุร้อน สถานอื่น ๆ ไม่ inhabitable โดยเรื่องมนุษย์ อย่างไรก็ตาม จุลินทรีย์ยังใส่เราทุกวัน และสภาพแวดล้อมในพื้นที่เขตเมือง และชนบทใน abundance.1 มากมีการ underestimated ความอุดมสมบูรณ์นี้ตราบใดที่วัฒนธรรมวิธีมีวิธีการตรวจสอบเท่านั้น ยัง แยกและเพาะปลูกได้จำกัดแข็งแรงเนื่องจากกลุ่มจุลินทรีย์มาก มันเป็นที่รู้จักภายใต้ซึ่งเงื่อนไขจะ grow.2 สำหรับสภาพแวดล้อมบางอย่าง เพียงประมาณ 1% ของจุลินทรีย์ทั้งหมดสามารถอ่าง นอกจากนี้ วิธีการเพาะปลูกจะน่าเบื่อ และเจ้าหน้าที่เร่งรัด ซึ่ง hampers สมัครแบบสำรวจจากประชากรขนาดใหญ่หรือ สัมผัสกับจุลินทรีย์สามารถอ้อมถูกประเมิน โดยการตรวจหาสารที่มาจากผนังของเซลล์ LPS และเปบทิโดไกลแคน แม้ว่า LPS หรือ endotoxin พบในผนังเซลล์ของแบคทีเรียแบคทีเรียแกรมลบ เปบทิโดไกลแคนเป็นส่วนประกอบของผนังเซลล์ ของแบคทีเรียแกรมบวก และ ขนาดเล็ก แบคทีเรียแบคทีเรียแกรมลบ โดยทั่วไปที่ใช้ทดสอบ (limulus amebocyte lysate ทดสอบ) ตรวจ endotoxin ในตัวอย่างฝุ่นส่วนใหญ่ใช้ในการสำรวจ epidemiologic อื่น ๆ มีวัดระดับของกรดไขมัน 3 hydroxy จาก LPS แต่ระดับความสัมพันธ์ไม่ดี limulus amebocyte lysate ทดสอบวัด ปัญหาเดียวกันใช้วิธีตรวจหาสารอื่น ๆ สะท้อนให้เห็นถึงการสัมผัสกับเชื้อรา เช่น polysaccharides extracellular (EPSs) กรด muramic ส่วนประกอบของ peptidoglycan.3 และβ-glucans นอกจากนี้ยังมี measured.4 อย่างไรก็ตาม specificity ของเครื่องหมายเหล่านี้แต่ละตัวถูกจำกัดการมาถึงของดีเอ็นเอที่ใช้วิเคราะห์อัตราความเร็วสูงมี revolutionized ฟิลด์ เครื่องมือศึกษานวนิยายเหล่านี้เปรียบเทียบกับการประดิษฐ์กล้องจุลทรรศน์ ซึ่งยัง สามารถทำให้โลกมองเห็นได้ ใน 1977, Woese และ colleagues5 พบว่า ลำดับนิวคลีโอไทด์ของอาร์เอ็นเอ 16S ribosomal (16S rRNA) มีอยู่ในทุกเซลล์แบคทีเรียและ archaeal แต่ไม่ได้อยู่ในเซลล์มนุษย์ หรือสัตว์ 16S rRNA ประกอบด้วยภูมิภาคนำสูงระหว่างแบคทีเรียทั้งหมด ดังนั้น ของ 16S rRNA สัญญาณของแบคทีเรีย และอาร์เคีย แต่ไม่โพรโทซัว ไวรัส กระดูก สันหลัง และอื่น ๆ สัตว์ หรือเรื่องมนุษย์ ภูมิภาคเหล่านี้นำอยู่ขนาบข้างภูมิภาคลำดับที่ผันแปรระหว่างสายพันธุ์แบคทีเรียต่าง ๆ และจึง อนุญาตให้จัดประเภท phylogenetic เทคนิคต่าง ๆ รวมวิธีการอัตราความเร็วสูง เช่น microarrays หรือจัดลำดับรุ่นต่อไป ด้วย 16S rRNA วิเคราะห์ยีนถูกดึงขึ้นมาเพื่อตรวจสอบจุลินทรีย์ของมนุษย์ และสิ่งแวดล้อม samples.6 การจัดประเภทอนุกรมวิธานของแบคทีเรียได้รับ โดยการเปรียบเทียบลำดับจากฐานข้อมูล เช่นแห่งชาติศูนย์ ข้อมูลเทคโนโลยีชีวภาพ (ส่วน http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nucleotide), โครงการฐานข้อมูล Ribosomal (ส่วน http://rdp.cme.msu.edu) Greengenes (ส่วน http://greengenes.lbl.gov/cgi-bin/nph-index.cgi) หรือ SILVA (ส่วน http://www.arb-silva.de) เทคนิคเหล่านี้มีความก้าวหน้าอย่างรวดเร็ว และก็ตอนนี้ไปเรียนพันธุกรรมทั้งหมดวัสดุ (มนุษย์ สัตว์ พืช จุลินทรีย์ และโพรโทซัว) กู้คืนจากตัวอย่างสิ่งแวดล้อมโดยจัดลำดับปืน metagenomic ให้ expone

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

มีการสะสมหลักฐานที่จะชี้ให้เห็นว่าสิ่งแวดล้อม microbiome มีบทบาทสำคัญในการพัฒนาโรคหอบหืด ความชุกที่ต่ำมากของโรคหอบหืดในประชากรสูงสัมผัสกับสภาพแวดล้อมของจุลินทรีย์ (เด็กฟาร์มและประชากร Amish) ไฮไลท์ของการป้องกันที่มีศักยภาพ ความหลากหลายของจุลินทรีย์อาจมีความจำเป็นที่จะสั่งการเป็นอย่างดีปรับตัวตอบสนองของภูมิคุ้มกันและควบคุมการตอบสนองการอักเสบอื่น ๆ สูดดมและกินองค์ประกอบสิ่งแวดล้อมเช่นสารก่อภูมิแพ้อนุภาคและไวรัส เช่นเดียวกับ microbiome ลำไส้ภายในที่ได้รับการยอมรับมากขึ้นในฐานะที่เป็นผู้สอนที่สำคัญของการเจริญเติบโตของระบบภูมิคุ้มกันที่ microbiome สิ่งแวดล้อมภายนอกอาจรูปร่างการตอบสนองภูมิคุ้มกันบนผิวพื้นผิวทางเดินหายใจเยื่อเมือกและอาจยังลำไส้ในช่วงต้นชีวิต ความหลากหลายของจุลินทรีย์โลกภายนอกที่จะให้แน่ใจว่าของทางเดิน maladapted จำนวนมากที่นำไปสู่การพัฒนาโรคหอบหืดมากที่สุดหากไม่ได้ทั้งหมดจะได้รับการยก ในทำนองเดียวกันผู้ให้ข้อมูลสำคัญที่จะเป็นโรคหอบหืดเช่นอาการแพ้สารก่อภูมิแพ้และอาการแพ้ในช่วงต้นชีวิตจะถูกระงับ ดังนั้นทุกแง่มุมของการสร้างภูมิคุ้มกันโดยธรรมชาติกำหนดเป้าหมายโดยจุลินทรีย์และสารประกอบและสารของพวกเขาอาจจะมีสวิทช์ต้นแบบที่จะเป็นโรคหอบหืดและการป้องกันโรคภูมิแพ้ซึ่งถูกพบในสภาพแวดล้อมที่เต็มไปด้วยความเสี่ยงของจุลินทรีย์. คำสำคัญ• microbiome; •โรคหอบหืด; สภาพแวดล้อม•; •เด็ก•วิทยาย่อที่ใช้•อเล็กซ์, การป้องกันการพัฒนา Atopy: ปัจจัยที่เกี่ยวข้องจากสภาพแวดล้อม Farming; • aOR อัตราส่วนราคาต่อรองปรับ; •กำไรต่อหุ้น polysaccharide นอก; • PAMP, เชื้อโรคที่เกี่ยวข้องรูปแบบโมเลกุล• Parsifal, การป้องกันโรคภูมิแพ้มีความเสี่ยง ปัจจัยในการแพในเด็กที่เกี่ยวข้องกับการเกษตรและไลฟ์สไตล์มนุษยโลกจุลินทรีย์เป็นจักรวาลอันกว้างใหญ่กับสายพันธุ์นับไม่ถ้วน ได้รับจุลินทรีย์ที่พบในทะเลน้ำลึก, ถ้ำน้ำพุร้อนและสถานที่อื่น ๆ ไม่ได้อาศัยอยู่โดยมนุษย์ แต่ยังเติมจุลินทรีย์สภาพแวดล้อมในร่มและกลางแจ้งของเราในชีวิตประจำวันในเขตเมืองและชนบทใน abundance.1 ดีอุดมสมบูรณ์นี้ได้รับการประเมินตราบใดที่วัฒนธรรมวิธีการเป็นวิธีการที่เป็นไปได้ของการสืบสวน แต่การแยกและการเพาะปลูกมีข้อ จำกัด ที่แข็งแกร่งเพราะจุลินทรีย์จำนวนมากก็ไม่เป็นที่รู้จักภายใต้เงื่อนไขที่พวกเขา grow.2 สำหรับสภาพแวดล้อมบางอย่างเพียงประมาณ 1% ของจุลินทรีย์ทั้งหมดสามารถเพาะเลี้ยง นอกจากนี้วิธีการเพาะปลูกเป็นที่น่าเบื่อและบุคลากรอย่างเข้มข้นซึ่ง hampers โปรแกรมของพวกเขากับประชากรที่มีขนาดใหญ่ตามการสำรวจ. อีกวิธีหนึ่งคือการสัมผัสกับเชื้อจุลินทรีย์ทางอ้อมสามารถประเมินได้โดยการตรวจสอบสารที่ได้มาจากผนังเซลล์ของพวกเขาเช่น LPS และ peptidoglycan แม้ว่า LPS หรือสารพิษพบในผนังเซลล์ของแบคทีเรียแกรมลบที่ peptidoglycan เป็นส่วนประกอบของผนังเซลล์ของแกรมบวกและยังในระดับที่เล็กกว่าแบคทีเรียแกรมลบ การทดสอบที่ใช้กันมากที่สุด (คน limulus amebocyte lysate ทดสอบ) ในการตรวจสอบสารพิษในตัวอย่างฝุ่นได้ถูกนำมาใช้ส่วนใหญ่ในการสำรวจทางระบาดวิทยา คนอื่น ๆ ได้วัดระดับของกรดไขมัน 3 ไฮดรอกซีจาก LPS แต่ระดับความสัมพันธ์กับคุณภาพ limulus amebocyte วัดทดสอบ lysate ปัญหาที่เกิดขึ้นเช่นเดียวกับวิธีการที่แตกต่างกันการตรวจหากรด muramic ส่วนประกอบของสาร peptidoglycan.3 อื่น ๆ สะท้อนให้เห็นถึงการสัมผัสกับเชื้อราเช่น polysaccharides extracellular (EPSs) และกลูแคนβ-ที่ยังได้รับการ measured.4 อย่างไรก็ตามความจำเพาะของแต่ละเครื่องหมายเหล่านี้ จะถูก จำกัด . การปรากฎตัวของดีเอ็นเอที่ใช้วิเคราะห์สูง throughput มีการปฏิวัติสนาม เครื่องมือนี้ศึกษานวนิยายที่มีการเทียบเคียงกับการประดิษฐ์กล้องจุลทรรศน์ซึ่งยังได้รับอนุญาตให้ทำมองไม่เห็นโลกเห็น ในปี 1977 และ Woese colleagues5 พบว่าลำดับเบสของ 16S โซมอลอาร์เอ็นเอ (16S rRNA) มีอยู่ในทุกเซลล์ของแบคทีเรียและ archaeal แต่ไม่ได้อยู่ในเซลล์ของมนุษย์หรือสัตว์ 16S rRNA ภูมิภาคมีการอนุรักษ์อย่างมากในหมู่แบคทีเรียทั้งหมด ดังนั้นการตรวจสอบของ 16S rRNA สัญญาณการปรากฏตัวของเชื้อแบคทีเรียและเคี แต่ไม่โปรโตซัวไวรัสเลี้ยงลูกด้วยนมและสัตว์อื่น ๆ หรือวิชามนุษย์ ภูมิภาคป่าสงวนเหล่านี้ปีกภูมิภาคลำดับที่เป็นตัวแปรในหมู่สายพันธุ์แบคทีเรียที่แตกต่างกันจึงช่วยให้การจำแนกสายวิวัฒนาการ เทคนิคหลายประการรวมวิธีการส่งผ่านข้อมูลสูงเช่น microarrays หรือลำดับรุ่นต่อไปที่มีการวิเคราะห์ยีน 16S rRNA จะถูกนำมาใช้มากขึ้นในการสืบสวนของจุลินทรีย์ samples.6 ด้านสิ่งแวดล้อมและมนุษย์จำแนกอนุกรมวิธานของเชื้อแบคทีเรียที่จะได้รับโดยการเปรียบเทียบลำดับฐานข้อมูล เช่นศูนย์แห่งชาติสำหรับข้อมูลเทคโนโลยีชีวภาพ (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nucleotide) ซึ่งเป็นโครงการฐานข้อมูลยีน ribosomal (http://rdp.cme.msu.edu) Greengenes (http: / /greengenes.lbl.gov/cgi-bin/nph-index.cgi) หรือ SILVA (http://www.arb-silva.de) เทคนิคเหล่านี้จะก้าวหน้าได้อย่างรวดเร็วและตอนนี้มันเป็นไปได้ที่จะศึกษาสารพันธุกรรมทั้งหมด (มนุษย์สัตว์พืชจุลินทรีย์และโปรโตซัว) หายจากตัวอย่างด้านสิ่งแวดล้อมโดยใช้ปืนลูกซองลำดับ Metagenomic ได้รับ expone

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

มีการรวบรวมหลักฐานเพื่อแสดงให้เห็นว่าไมโครไบโสิ่งแวดล้อมมีบทบาทสำคัญในการพัฒนาของโรคหอบหืด ความชุกของโรคค่อนข้างต่ำมากในประชากรสูงสัมผัสกับสภาพแวดล้อมของจุลินทรีย์ ( เด็กฟาร์มและ Amish ประชากร ) เน้นศักยภาพของการป้องกัน ความหลากหลายของจุลินทรีย์นี้อาจจะจำเป็นต้องสั่งให้ปรับตัวได้ดี และควบคุมการอักเสบภูมิคุ้มกันตอบสนองอื่น ๆสูดดมกลืนกิน และองค์ประกอบแวดล้อม เช่น สารก่อภูมิแพ้ อนุภาค และไวรัส ชอบไมโครไบโไส้ภายใน ซึ่งได้รับการยอมรับมากขึ้นเป็นผู้สอนที่สำคัญของระบบภูมิคุ้มกันปกติ , ไมโครไบโสิ่งแวดล้อมภายนอก อาจจะรูปร่างการตอบสนองทางภูมิคุ้มกันที่ผิวหนัง เยื่อบุผิวทางเดินหายใจ และอาจยังท้องก่อนในชีวิต ความหลากหลายของโลกจุลินทรีย์ภายนอกจะให้แน่ใจว่าของหลาย maladapted เส้นทางสู่การพัฒนา โรคหอบหืด ส่วนใหญ่ ถ้าไม่ทั้งหมด จะเป็น counterbalanced . อนึ่ง บุคคลสำคัญ โรคหืด และอาการแพ้สารก่อภูมิแพ้ เช่น พบในช่วงต้นของชีวิต มีการปราบปราม ดังนั้นทางแหล่งภูมิคุ้มกันเป้าหมายโดยจุลินทรีย์และสารประกอบและสารอาจเป็นหลักสลับกับโรคหอบหืดและป้องกันโรคภูมิแพ้ ซึ่งถูกพบในสภาพแวดล้อมที่อุดมไปด้วยจุลินทรีย์ด้านคำสำคัญ- ไมโครไบโ ;- โรคหอบหืด ;สิ่งแวดล้อม - ;เด็กแต่ละ ;- ระบาดวิทยาคำย่อที่ใช้- อเล็กซ์ ป้องกันการพัฒนา : จากสภาพแวดล้อมได้ ปัจจัยที่เกษตร ;- อ้อ ปรับอัตราต่อรอง ;- EPS extracellular polysaccharide ;บริการ pamp เชื้อโรคที่เกี่ยวข้องรูปแบบโมเลกุล ;- พาร์ซิฟาล ป้องกันโรคภูมิแพ้ และปัจจัยเสี่ยง sensitisation ในเด็กที่เกี่ยวข้องกับการเกษตร และ anthroposophic ไลฟ์สไตล์โลกของจุลินทรีย์ คือ จักรวาลอันกว้างใหญ่ที่มีนับไม่ถ้วนชนิด จุลินทรีย์ที่ถูกค้นพบในทะเลลึก , ถ้ำ , น้ำพุร้อน , และไม่ใช่สถานที่ inhabitable โดยคน อื่น ๆ อย่างไรก็ตาม จุลินทรีย์ที่ยังอาศัยของเราทุกวัน ในร่มและกลางแจ้งสภาพแวดล้อมในชุมชนเมืองและชนบทมากมาย ที่ 1 นี้อุดมสมบูรณ์มี underestimated ตราบใดที่วิธีการวัฒนธรรมเป็นเพียงวิธีที่เป็นไปได้ของการสอบสวน การแยกและเพาะเลี้ยง ยังแข็งแรง เพราะมีข้อจำกัดมาก จุลินทรีย์ก็จะไม่รู้จักภายใต้เงื่อนไขที่พวกเขาเติบโต 2 สภาพแวดล้อมบางอย่าง เพียงประมาณ 1 เปอร์เซ็นต์ของจุลินทรีย์ที่สามารถเลี้ยง นอกจากนี้ วิธีการเพาะปลูกจะน่าเบื่อและบุคลากรอย่างเข้มข้น ซึ่ง hampers การประยุกต์ใช้กับการสำรวจสุขภาพของประชากรขนาดใหญ่อีกวิธีหนึ่งคือ การได้รับจุลินทรีย์สามารถทางอ้อมโดยการตรวจสอบสารสกัดจากผนังเซลล์ เช่น สเปรย์หล่อลื่น และเปปติโดไกลแคน . แม้ว่าหล่อลื่นหรือชีวพิษภายในตัวพบบนผนังเซลล์ของแบคทีเรียแกรมลบแบคทีเรีย เปปติโดไกลแคน เป็นส่วนประกอบของผนังเซลล์ของแบคทีเรียแกรมบวกและในขอบเขตเล็ก แบคทีเรียแกรมลบ การทดสอบที่ใช้บ่อยที่สุด ( limulus การครอบครองแบบสิทธิสมบูรณ์ทดสอบ ) เพื่อตรวจหานโดท็อกซินในตัวอย่างฝุ่นได้รับส่วนใหญ่ที่ใช้ในการสำรวจทางระบาดวิทยา . คนอื่นจะวัดระดับของ 3-hydroxy กรดไขมันจาก LPs , แต่ระดับความสัมพันธ์ที่ไม่ดีกับ limulus การครอบครองแบบสิทธิสมบูรณ์โดยการวัด ปัญหาเดียวกันกับวิธีการตรวจหา muramic กรดเป็นส่วนประกอบของสารประกอบเปบทิโดไกลแคน 3 อื่น ๆสะท้อนให้เห็นถึงการเปิดรับเชื้อรา เช่น พบว่า โพลีแซคคาไรด์ ( EPSS ) และบีตา - กลูแคน , นอกจากนี้ยังมีวัดที่ 4 อย่างไรก็ตาม ความจำเพาะของเครื่องหมายแต่ละรายการเหล่านี้จะถูก จำกัดการมาถึงของดีเอ็นเอที่ใช้ช่วยวิเคราะห์ได้ปฏิวัติฟิลด์ การศึกษาเปรียบเทียบนวนิยายเครื่องมือเหล่านี้มีการประดิษฐ์กล้องจุลทรรศน์ ซึ่งยัง อนุญาตให้โลกมองเห็น ในปี 1977 และ โวเซ่ colleagues5 พบว่าลำดับนิวคลีโอไทด์ของ 16S ไรโบโซมอล อาร์เอ็นเอ ( 16S rRNA ) เป็นปัจจุบันในทุกเซลล์แบคทีเรียและ archaeal แต่ไม่ในมนุษย์หรือสัตว์เซลล์ เบส 16S rRNA มีสูงบริเวณอนุรักษ์ของแบคทีเรีย ดังนั้นการตรวจหา 16S rRNA สัญญาณการปรากฏตัวของแบคทีเรียและอาร์เคียแต่โปรโตซัว , ไวรัส , สัตว์มีกระดูกสันหลังและสัตว์อื่นหรือคน เหล่านี้บริเวณอนุรักษ์ปีกซ้ายดับภูมิภาคที่เป็นตัวแปรของสายพันธุ์แบคทีเรียที่แตกต่างกันและจึงช่วยให้จำแนกชนิด . รวมวิธีการเทคนิคต่างๆช่วย เช่น การแสดง หรือลำดับเบส 16S rRNA ( กับการวิเคราะห์ยีนจะถูกใช้มากขึ้นเพื่อตรวจสอบจำนวนจุลินทรีย์ในสิ่งแวดล้อมและมนุษย์ การจำแนกทางอนุกรมวิธานของแบคทีเรีย 6 ได้มาจากการเปรียบเทียบลำดับกับฐานข้อมูล เช่น ศูนย์ข้อมูลเทคโนโลยีชีวภาพแห่งชาติ ( http : / / www.ncbi . nlm . NIH . gov / เบส ) , โครงการฐานข้อมูลไรโบโซม ( http : / / RDP . CME . หน้าหลัก . edu ) greengenes ( http : / / greengenes . lbl . gov / cgi bin / nph CGI Index ) หรือ ซิลวา ( http : / / www.arb-silva . de ) เทคนิคเหล่านี้จะก้าวหน้าอย่างรวดเร็ว และมันคือตอนนี้สามารถที่จะศึกษาสารพันธุกรรม ( มนุษย์ สัตว์ พืช จุลินทรีย์ และโปรโตซัว ) หายจากตัวอย่างสิ่งแวดล้อมโดยใช้เมตาจีโนมิค ปืนลูกซอง ซีเคว้น