Environmental fluctuations require

Environmental fluctuations require rapid adjustment of the physiology of bacteria. Anoxygenic phototrophic purple sulfur bacteria, like Allochromatium vinosum, thrive in environments that are characterized by steep gradients of important nutrients for these organisms, i.e., reduced sulfur compounds, light, oxygen and carbon sources. Changing conditions necessitate changes on every level of the underlying cellular and molecular network. Thus far, two global analyses of A. vinosum responses to changes of nutritional conditions have been performed and these focused on gene expression and protein levels. Here, we provide a study on metabolite composition and relate it with transcriptional and proteomic profiling data to provide a more comprehensive insight on the systems level adjustment to available nutrients. We identified 131 individual metabolites and compared availability and concentration under four different growth conditions (sulfide, thiosulfate, elemental sulfur, and malate) and on sulfide for a ΔdsrJ mutant strain. During growth on malate, cysteine was identified to be the least abundant amino acid. Concentrations of the metabolite classes “amino acids” and “organic acids” (i.e., pyruvate and its derivatives) were higher on malate than on reduced sulfur compounds by at least 20 and 50 %, respectively. Similar observations were made for metabolites assigned to anabolism of glucose. Growth on sulfur compounds led to enhanced concentrations of sulfur containing metabolites, while other cell constituents remained unaffected or decreased. Incapability of sulfur globule oxidation of the mutant strain was reflected by a low energy level of the cell and consequently reduced levels of amino acids (40 %) and sugars (65 %).

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ความผันผวนของสิ่งแวดล้อมต้องปรับปรุงอย่างรวดเร็วของสรีรวิทยาของแบคทีเรีย Anoxygenic phototrophic สีม่วงซัลเฟอร์แบคทีเรีย เช่น Allochromatium vinosum เจริญเติบโตในสภาพแวดล้อมที่มีลักษณะสูงชันไล่ระดับสีของสารอาหารที่สำคัญสำหรับสิ่งมีชีวิตเหล่านี้ เช่น ลดสารซัลเฟอร์ แสง ออกซิเจนและคาร์บอน เปลี่ยนแปลงเงื่อนไขรบกวนในทุกระดับของเครือข่ายเซลลูลาร์ และโมเลกุลอยู่ภายใต้การเปลี่ยนแปลง ฉะนี้ ได้ปฏิบัติวิเคราะห์โลกสอง A. vinosum ตอบสนองการเปลี่ยนแปลงสภาวะทางโภชนาการ และเหล่านี้เน้นการแสดงออกของยีนและโปรตีนระดับ ที่นี่ เราให้การศึกษาเกี่ยวกับองค์ประกอบของ metabolite และเกี่ยวข้องกับ transcriptional และ proteomic ข้อมูลการสร้างโพรไฟล์ให้เข้าใจครอบคลุมมากขึ้นในระบบระดับการปรับปรุงสารอาหารว่าง เราระบุ metabolites 131 แต่ละ และเปรียบเทียบความพร้อมและความเข้มข้นภาย ใต้เงื่อนไขการเติบโตที่แตกต่างกันได้ 4 (ซัลไฟด์ thiosulfate ธาตุกำมะถัน และมาลา) และซัลไฟด์ในต้องใช้การกลายพันธุ์ ΔdsrJ ในระหว่างการเจริญเติบโตในมาลาเต cysteine ได้ระบุให้เป็นกรดอะมิโนอย่างน้อยมาก ความเข้มข้นของ metabolite เรียน "กรดอะมิโน" และ "กรดอินทรีย์" (เช่น pyruvate และอนุพันธ์) ได้สูงขึ้นมาลากว่าบนสารลดน้อย 20 และ 50% ตามลำดับ สังเกตคล้ายถูกทำสำหรับ metabolites ที่กำหนดให้กับแอแนบอลิซึมของกลูโคส เจริญเติบโตบนสารกำมะถันนำไปเพิ่มความเข้มข้นของซัลเฟอร์ที่ประกอบด้วย metabolites ในขณะที่ยังคง constituents เซลล์อื่น ๆ ผลกระทบ หรือลดลง Incapability ของกำมะถัน globule ออกซิเดชันของสายพันธุ์กลายพันธุ์ถูกสะท้อนในระดับพลังงานต่ำของเซลล์ และลดระดับของกรดอะมิโน (40%) และน้ำตาล (65%) ดังนั้น

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ความผันผวนของสิ่งแวดล้อมจำเป็นต้องมีการปรับตัวอย่างรวดเร็วของสรีรวิทยาของเชื้อแบคทีเรีย แบคทีเรียสังเคราะห์แสง Anoxygenic กำมะถันสีม่วงเช่น Allochromatium v​​inosum, เจริญเติบโตในสภาพแวดล้อมที่มีความโดดเด่นด้วยการไล่ระดับสีที่สูงชันของสารอาหารที่สำคัญสำหรับการมีชีวิตเหล่านี้คือสารประกอบกำมะถันลดแสงออกซิเจนและแหล่งคาร์บอน เงื่อนไขการเปลี่ยนเลี่ยงการเปลี่ยนแปลงในระดับของเครือข่ายเซลล์และโมเลกุลพื้นฐานทุก ป่านนี้สองการวิเคราะห์ระดับโลกของการตอบสนองเอ vinosum การเปลี่ยนแปลงของสภาพทางโภชนาการได้รับการดำเนินการและเหล่านี้มุ่งเน้นไปที่การแสดงออกของยีนและระดับโปรตีน ที่นี่เราให้การศึกษาเกี่ยวกับองค์ประกอบของสารและความสัมพันธ์กับข้อมูลโปรไฟล์การถอดรหัสและโปรตีนที่จะให้ข้อมูลเชิงลึกที่ครอบคลุมมากขึ้นในการปรับระดับระบบสารอาหารที่มีอยู่ เราระบุสาร 131 บุคคลและเมื่อเทียบกับความพร้อมและความเข้มข้นต่ำกว่าสี่สภาวะการเจริญเติบโตที่แตกต่างกัน (ซัลไฟด์, ไทโอซัลเฟตกำมะถันธาตุและ malate) และซัลไฟด์สำหรับสายพันธุ์ที่กลายพันธุ์ΔdsrJ ในช่วงการเจริญเติบโตใน malate, cysteine​​ ถูกระบุให้เป็นกรดอะมิโนที่อุดมสมบูรณ์อย่างน้อย ความเข้มข้นของสารในชั้นเรียน "กรดอะมิโน" และ "กรดอินทรีย์" (กล่าวคือไพรูและอนุพันธ์) เป็นที่สูงขึ้นใน malate กว่าสารประกอบกำมะถันลดลงอย่างน้อย 20 และ 50% ตามลำดับ ข้อสังเกตที่คล้ายกันถูกสร้างขึ้นมาสำหรับสารที่ได้รับมอบหมายให้ anabolism ของกลูโคส การเจริญเติบโตของสารประกอบกำมะถันนำไปสู่​​การเพิ่มความเข้มข้นของกำมะถันที่มีสารในขณะที่องค์ประกอบของเซลล์อื่น ๆ ยังคงได้รับผลกระทบหรือลดลง ความไม่สามารถของการเกิดออกซิเดชันกำมะถันเม็ดของสายพันธุ์ที่กลายพันธุ์สะท้อนจากระดับพลังงานต่ำของเซลล์และจึงลดระดับของกรดอะมิโน (40%) และน้ำตาล (65%)

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ความผันผวนของสิ่งแวดล้อมต้องมีการปรับตัวอย่างรวดเร็วของสรีรวิทยาของแบคทีเรีย anoxygenic โฟโตโทรฟิกสีม่วงซัลเฟอร์แบคทีเรีย เช่น allochromatium vinosum เจริญในสภาพแวดล้อมที่มีลักษณะชันไล่สำคัญของสารอาหารสำหรับสิ่งมีชีวิตเหล่านี้ ได้แก่ การลดสารประกอบซัลเฟอร์ แสง ออกซิเจน และแหล่งคาร์บอนการเปลี่ยนแปลงเงื่อนไขจำเป็นการเปลี่ยนแปลงในทุกระดับของระดับเซลล์และโมเลกุลพื้นฐานเครือข่าย ป่านนี้ สองจากทั่วโลก . vinosum การตอบสนองต่อ การเปลี่ยนแปลงสภาพทางโภชนาการได้รับการเหล่านี้มุ่งเน้นไปที่การแสดงออกของยีนและโปรตีน ที่นี่เราให้บริการการศึกษาองค์ประกอบอาหารและเกี่ยวข้องกับ particle ส์โปรไฟล์ข้อมูลและให้ข้อมูลเชิงลึกที่ครอบคลุมมากขึ้นในระดับระบบการสารอาหารพร้อมใช้งาน เราระบุว่าสารบุคคลและเปรียบเทียบความพร้อมและความเข้มข้นภายใต้สี่เงื่อนไขการเจริญเติบโตที่แตกต่างกัน ( ซัลไฟด์ ไธโอซัลเฟต , ธาตุกำมะถันและ malate ) และซัลไฟด์สำหรับΔ dsrj กลายพันธุ์สายพันธุ์ ในระหว่างการเจริญเติบโตใน Malate , 8-12 ถูกระบุเป็นกรดอะมิโนน้อยมากมาย ความเข้มข้นของระดับชนชั้น " กรดอะมิโน " และ " กรดอินทรีย์ " ( เช่น pyruvate และอนุพันธ์ ) สูงกว่าใน Malate กว่าลดสารประกอบซัลเฟอร์อย่างน้อย 20 และ 50 ตามลำดับสังเกตที่คล้ายกันที่ทำเพื่อให้กระบวนการสร้างสารกลูโคส ของสารประกอบซัลเฟอร์ ทำให้เพิ่มความเข้มข้นของกำมะถันที่ประกอบด้วยสาร ในขณะที่องค์ประกอบเซลล์อื่น ๆยังคงได้รับผลกระทบ หรือ ลดลงนเคพะบีลกำมะถันเม็ดกลมเล็ก ออกซิเดชันของสายพันธุ์ที่กลายพันธุ์ที่สะท้อนจากระดับพลังงานของเซลล์และดังนั้นการลดระดับของกรดอะมิโน ( 40% ) และน้ำตาล ( 65% )