A polyphasic taxonomic study, using

A polyphasic taxonomic study, using phenotypic, phylogenetic and genotypic characterization,
was performed on five Gram-stain-positive, catalase-negative, coccus-shaped Vagococcus-like
bacteria isolated from the spoilage microbiota of cooked shrimp. Comparative 16S rRNA gene
sequence analysis indicated that the isolates belonged to the genus Vagococcus. The five isolates
shared 100% 16S rRNA gene sequence similarity, and representative strain CD276T formed a
branch that was distinct from the type strains of the six recognized species of the genus
Vagococcus (Vagococcus fluvialis CCUG 32704T, V. salmoninarum NCFB 2777T, V. lutrae
CCUG 39187T, V. fessus M2661/98/1T, V. carniphilus ATCC BAA-340T and V. elongatus
PPC9T). The taxonomic position of strain CD276T was clarified using DNA–DNA hybridization,
pulsed-field gel electrophoresis of whole-genome DNA, G+C content determination, cell-wall
peptidoglycan typing, fatty acid analysis and biochemical characterization. On the basis of this
evidence, a novel species, Vagococcus penaei sp. nov., is proposed. The type strain is CD276T
(5LMG 24833T 5CIP 109914T).

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

การศึกษาอนุกรมวิธาน polyphasic ใช้ฟีโนไทป์, สายวิวัฒนาการและพันธุกรรมตัวละคร
ได้ดำเนินการในห้าแบคทีเรียกรัมคราบบวกลบ catalase, ค็อกคัสรูป vagococcus เหมือน
ที่แยกได้จากการเน่าเสียของ microbiota กุ้งสุก การวิเคราะห์เปรียบเทียบ 16s rRNA ยีน
ลำดับแสดงให้เห็นว่าสายพันธุ์เป็นชนิด vagococcus ห้าแยก
ที่ใช้ร่วมกัน 16s 100% rrna เหมือนลำดับยีนและ cd276t ความเครียดที่เกิดขึ้นตัวแทน
สาขาที่แตกต่างจากสายพันธุ์ชนิดของสายพันธุ์ที่ได้รับการยอมรับหกชนิด
vagococcus (vagococcus fluvialis ccug 32704t, โว salmoninarum ncfb 2777t, โว lutrae
ccug 39187t, โว fessus m2661/98/1t, โว carniphilus ATCC Baa-340T และโวลต์ elongatus
ppc9t)ตำแหน่งการจัดหมวดหมู่ของสายพันธุ์ที่ได้รับการชี้แจง cd276t ใช้ dna-dna ผสมพันธุ์
สนามพัลซิ่งเจลข่าวคราวของทั้งจีโนมดีเอ็นเอการกำหนดเนื้อหา GC, ผนังเซลล์
พิมพ์ peptidoglycan การวิเคราะห์กรดไขมันและลักษณะทางชีวเคมี บนพื้นฐานของการนี​​้
หลักฐานสายพันธุ์ใหม่ vagococcus penaei เอสพี พฤศจิกายนจะนำเสนอ สายพันธุ์ชนิดที่ cd276t
(5lmg 24833t 5cip 109914t)

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

การ polyphasic ศึกษาอนุกรมวิธาน ใช้จำแนกไทป์ phylogenetic และจีโนไทป์,
ทำตาม 5 กรัมคราบบวก ลบ catalase รูป coccus Vagococcus-เหมือน
แบคทีเรียที่แยกต่างหากจาก microbiota เน่าเสียของกุ้งปรุงสุก ยีนเปรียบเทียบ 16S rRNA
วิเคราะห์ระบุว่า isolates การเป็นสมาชิกสกุล Vagococcus Isolates 5
100% 16S rRNA ยีนลำดับความคล้ายคลึงกันที่ใช้ร่วมกัน และพนักงานต้องใช้ CD276T เกิดเป็น
สาขาที่แตกต่างจากสายพันธุ์ชนิดพันธุ์รู้จักหกของตระกูลนี้
Vagococcus (Vagococcus fluvialis CCUG 32704T, V. salmoninarum NCFB 2777T, V. lutrae
CCUG 39187T, V. fessus M2661/98/1T, V. carniphilus ATCC บา 340T และ V. elongatus
PPC9T) ต้องใช้ CD276T ไม่ขึ้ DNA–DNA hybridization ใช้ตำแหน่งอนุกรมวิธาน
electrophoresis ฟิลด์สูงเจลของดีเอ็นเอจีโนมรวม G C กำหนดเนื้อหา ผนังเซลล์
เปบทิโดไกลแคนพิมพ์ วิเคราะห์กรดไขมันและสมบัติเชิงชีวเคมี ตามนี้
เสนอหลักฐาน ชนิดนวนิยาย Vagococcus sp. penaei พฤศจิกายน สายพันธุ์ชนิดเป็น CD276T
(5LMG 24833T 5CIP 109914T)

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

การศึกษา taxonomic polyphasic ที่ใช้แสดงลักษณะ phylogenetic และ genotypic phenotypic
ได้ดำเนินการใน 5 กรัม - ขจัดรอยเปื้อน catalase ในเชิงบวก - ลบค๊ - รูปทรง vagococcus - เหมือน
แบคทีเรียแยกออกจาก microbiota spoilage ของกุ้งต้มสุก การวิเคราะห์ 16 S rrna ยีน
ตามลำดับความได้เปรียบเชิงเปรียบเทียบระบุว่าแยกเป็นเจ้าของ vagococcus กะที่ ห้าแยก
ตามมาตรฐานใช้ร่วมกัน 100% 16 S rrna ยีนตามลำดับความเหมือนและตัวแทนความเมื่อยล้า CD 276 T จัดตั้ง
สาขาที่แตกต่างจากที่พิมพ์พันธุ์ของที่หกรู้จักสายพันธุ์ของพืช
vagococcus ( vagococcus fluvialis CCUG )ทัน 32704 T , V salmoninarum ncfb 2777 T , V lutrae
CCUG )ทัน 39187 T , V fessus M 2661/98 / 1 T , V carniphilus atcc Baa - 340 J T และ V elongatus
สัมมนา 9 T )ที่ taxonomic ตำแหน่งของความเมื่อย ล้า 276 T เป็นแผ่นซีดีชี้แจงรายละเอียดการใช้ดีเอ็นเอ - ดีเอ็นเอ hybridization ,
Pulsed Light - ฟิลด์เจล electrophoresis ของทั้งหมด - ยีนดีเอ็นเอ, G C เนื้อหาความมุ่งมั่น,เซลล์ - ผนัง
peptidoglycan การพิมพ์,ไขมันชนิดตะกั่วกรดแบบซีลและการวิเคราะห์ทางชีวเคมีคุณลักษณ์. บนพื้นฐานของ
หลักฐานนี้สายพันธุ์ใหม่ที่ vagococcus penaei sp .พ.ย..ขอเสนอ ดึงพิมพ์เป็นแผ่น ซี 276 T
( 5 แอลเอ็มจี 24833 T 5 CIP 109914 T )