Abstract
In order to analyze the genes related to the histamine production, a strain of histamine producing halophilic bacteria, referred to as strain H, was isolated using enrichment culture and dilution-to-extinction methods with histidine broth inoculated from the fish sauce mashes. The two Japanese fish sauce mashes used, accumulate over 1000 mg/l of histamine. Phenotypic and 16 S rRNA gene sequence analyses identified strain H as Tetragenococcus halophilus, the predominant histamine producing bacteria present during fish sauce fermentation. Genetic analyses (PCR and Southern blot) of the histamine producing strain confirmed that the strain harbored a 30 kbp plasmid (pHDC) encoding a single copy of the pyruvoyl dependent histidine decarboxylase gene (hdc). A comparison of hdcA that is a structural gene of histidine decarboxylase among strain H, Lactobacillus hilgardii 0006, L. sakei LTH2076, Oenococcus oeni 9204, T. halophilus and T. muriaticus JCM10006 T indicated > 99% sequence similarity. The hdc gene cluster consisted of 4 ORFs, hdcP, hdcA, hdcB, and hdcRS, and were almost identical to that of L. hilgardii 0006 with 99% sequence similarity including the structural hdc spacer region. However, the approximately 500 bp regions upstream and downstream of the hdc gene were different between that of strain H and L. hilgardii 0006. The complete sequence of pHDC revealed 29,924 nucleotides including 28 ORFs, two pairs of IR (inverted repeat), similar sequence of plasmid conjugative elements, and a theta-type replicon. These results suggested that hdc could be encoded on transformable elements among lactic acid bacteria
บทคัดย่อการวิเคราะห์ยีนที่เกี่ยวข้องกับการผลิตฮิสตามีน ต้องใช้ของฮิสตามีนที่ผลิตแบคทีเรียที่ชอบเกลือ เรียกว่าเป็นสายพันธุ์ H ถูกแยกโดยใช้วิธีเจือจางสูญพันธุ์และวัฒนธรรมที่โดดเด่นกับ histidine ซุป inoculated จาก mashes ซอสปลา สองปลาญี่ปุ่นซอส mashes ใช้ สะสมกว่า 1000 mg/l การฮิสตามีน ฟีโนไทป์ และ 16 S rRNA ยีนลำดับวิเคราะห์ระบุต้องใช้ H เป็น Tetragenococcus halophilus แบคทีเรียผลิตฮิสตามีนกันนำเสนอในระหว่างการหมักน้ำปลา พันธุกรรมวิเคราะห์ (PCR และคืนในใต้ตา) ของฮิสตามีนที่ผลิตต้องใช้ยืนยันว่า พันธุ์ harbored plasmid 30 kbp (pHDC) รหัสสำเนาเดียวของยีน decarboxylase histidine ขึ้น pyruvoyl (hdc) การเปรียบเทียบ hdcA ที่มียีนโครงสร้างของ decarboxylase histidine นี่ต้องใช้ H แลคโตบาซิลลัส hilgardii 0006, L. sakei LTH2076, Oenococcus oeni 9204 ต. halophilus และต. muriaticus JCM10006 T ระบุ > 99% ลำดับความคล้ายคลึงกัน คลัสเตอร์ hdc ยีนประกอบด้วย 4 ORFs, hdcP, hdcA, hdcB และ hdcRS และเกือบเหมือนกับที่ L. hilgardii 0006 มี 99% ลำดับความคล้ายคลึงกันรวมทั้งภูมิภาคโครงสร้าง hdc เป็นตัวเว้นวรรค อย่างไรก็ตาม ภูมิภาคของ bp ประมาณ 500 ขั้นต้นน้ำ และปลายน้ำของยีน hdc แตกต่างกันระหว่างที่ต้องใช้ H และ L. hilgardii 0006 ลำดับที่สมบูรณ์ของ pHDC เปิดเผยรวมถึง 28 ORFs, IR (กลับซ้ำ) สองคู่ ลำดับคล้ายคลึงกันขององค์ประกอบ conjugative plasmid, replicon ทีตาชนิดนิวคลีโอไทด์ 29,924 ผลลัพธ์เหล่านี้แนะนำ hdc ที่สามารถเข้ารหัสส่วนประกอบ transformable ระหว่างแบคทีเรียกรดแลกติก
การแปล กรุณารอสักครู่..

บทคัดย่อเพื่อวิเคราะห์ยีนที่เกี่ยวข้องกับการผลิตฮีสตามีที่สายพันธุ์ของฮีสตามีแบคทีเรียที่ผลิตชอบเกลือที่เรียกว่าสายพันธุ์เอชที่แยกได้โดยใช้วัฒนธรรมการเพิ่มคุณค่าและวิธีการลดสัดส่วนต่อการสูญพันธุ์ด้วยน้ำซุปจากเชื้อฮิสติดีนน้ำปลา mashes
ทั้งสองน้ำปลาญี่ปุ่น mashes ใช้สะสมกว่า 1,000 มิลลิกรัม / ลิตรของฮีสตามี และฟีโนไทป์ 16 S rRNA วิเคราะห์ยีนเอชระบุว่าเป็นสายพันธุ์ Tetragenococcus halophilus ที่เด่นฮีสตามีแบคทีเรียที่ผลิตอยู่ในระหว่างการหมักน้ำปลา การวิเคราะห์ทางพันธุกรรม (PCR และภาคใต้ของดวง) สายพันธุ์การผลิตฮีสตายืนยันว่าความเครียดเก็บงำพลาสมิด KBP 30 (pHDC) การเข้ารหัสสำเนาเดียวของฮิสทิดี pyruvoyl ขึ้นอยู่กับยีน decarboxylase (HDC) เปรียบเทียบ hdcA ที่เป็นโครงสร้างของยีน decarboxylase ฮิสติดีนในหมู่สายพันธุ์ H A, แลคโตบาซิลลัส hilgardii 0006 ลิตร sakei LTH2076, Oenococcus oeni 9204, T. halophilus ตันและ muriaticus JCM10006 T ระบุ> ลำดับความคล้ายคลึงกัน 99% กลุ่มยีน HDC ประกอบด้วย 4 ORFs, HDCP, hdcA, hdcB และ hdcRS และเกือบจะเหมือนกันกับที่ของแอล hilgardii 0006 ที่มีความคล้ายคลึงกันลำดับที่ 99% รวมทั้งภูมิภาค spacer HDC โครงสร้าง อย่างไรก็ตามประมาณ 500 bp ภูมิภาคต้นน้ำและปลายน้ำของยีน HDC ที่แตกต่างกันระหว่างสายพันธุ์เอชแอลและ hilgardii 0006. ลำดับที่สมบูรณ์ของ pHDC เปิดเผย 29924 นิวคลีโอรวมทั้ง ORFs 28, คู่ที่สองของ IR (ซ้ำคว่ำ) ลำดับที่คล้ายกัน ของพลาสมิดองค์ประกอบ conjugative และ Replicon ทีชนิด ผลการศึกษานี้ชี้ให้เห็นว่าอาจจะมีการ HDC เข้ารหัสบนองค์ประกอบ transformable หมู่แบคทีเรียกรดแลคติก
การแปล กรุณารอสักครู่..

นามธรรม
เพื่อวิเคราะห์ยีนที่เกี่ยวข้องกับการลดการผลิต สายพันธุ์ของแบคทีเรียชอบเค็มลดการผลิต เรียกว่าสายพันธุ์ H , แยกและการใช้วัฒนธรรมเพื่อการเจือจางด้วยน้ำซุปวิธีเมื่อเชื้อจากปลา mashes . คนญี่ปุ่น 2 น้ำปลา mashes ใช้สะสมมากกว่า 1 , 000 มก. / ล. histamine .ฟีโนไทป์และ 16 s rRNA ลำดับยีนการวิเคราะห์ระบุสายพันธุ์ H เป็น tetragenococcus halophilus , โดด histamine แบคทีเรียที่ผลิตในปัจจุบัน ในการหมักน้ำปลาการวิเคราะห์ทางพันธุกรรม ( ดีเอ็นเอ ) และ Southern blot ) ของฮีสตามีการผลิตสายพันธุ์ยืนยันว่าสายพันธุ์ harbored 30 สายพันธุ์ kbp ( phdc ) สำเนาเดียวของ pyruvoyl ขึ้นเมื่อใช้ยีน ( HDC ) การเปรียบเทียบ hdca นั่นคือยีนโครงสร้างของเมื่อใช้ระหว่างสายพันธุ์ H , Lactobacillus hilgardii 0006 L sakei lth2076 oenococcus oeni , 9204 Thalophilus และ ต. muriaticus jcm10006 T ( > 99% ดับที่คล้ายคลึงกัน และยีนกลุ่ม HDC จำนวน 4 orfs HDCP hdca hdcb , , , , และ hdcrs และเกือบจะเหมือนกันกับที่ของ L . hilgardii 0006 กับความเหมือนลำดับ 99% รวมทั้งโครงสร้าง HDC สเปเซอร์ ) อย่างไรก็ตามประมาณ 500 BP ภูมิภาคตามน้ำทวนน้ำ และของ HDC ยีนแตกต่างกันระหว่างสายพันธุ์ H และ L . hilgardii 0006 . ลำดับนิวคลีโอไทด์ที่สมบูรณ์ของ phdc เปิดเผย 29924 รวม 28 orfs , IR สองคู่ ( คว่ำซ้ำ ) , ลำดับที่คล้ายกันขององค์ประกอบ conjugative พลาสมิด และ replicon ประเภทกีฬา .ผลลัพธ์เหล่านี้ชี้ให้เห็นว่า HDC สามารถเข้ารหัสในองค์ประกอบหม้อแปลงของแบคทีเรียกรดแล็กติก
การแปล กรุณารอสักครู่..
